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Vanina BENOIT

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Documents

Présentation

A l’Inra depuis 2001, d’abord en CDD sur des projets scientifiques en rapport avec les biotechnologies, j’ai été recrutée en 2003. Je suis actuellement en charge des activités de **génotypage** conduites dans l’unité. A ce titre, je développe et mets au point les protocoles pour détecter plusieurs types de **marqueurs moléculaires** sur différentes espèces forestières et à partir de différents tissus. J’interviens également dans la coordination des activités de génotypage réalisées sur des plateformes externes pour le compte de l’UMR BioForA. En pratique, j’organise les campagnes de marquage réalisées dans l’unité. Avec l’aide d’une technicienne, [Corinne Buret](https://www6.val-de-loire.inra.fr/biofora/Personnel/Permanents/BURET-Corinne), nous récoltons sur le terrain les tissus à analyser, stockons et préparons les échantillons au laboratoire, réalisons les manipulations et validons les résultats obtenus. Ensuite, j’effectue les premières étapes d’analyse des données : **validation de génotypes, recherche de paternité, calculs de diversité génétique.** Les marqueurs moléculaires que nous utilisons en routine sont majoritairement des marqueurs de type **[microsatellites](https://www.gnis-pedagogie.org/biotechnologie-amelioration-marqueur-microsatellite.html)**. Après amplification de l’ADN, la détection de ces marqueurs est réalisée à l’aide d’un séquenceur Applied Biosystem 3500. Nous travaillons principalement sur le peuplier, le mélèze, le frêne, le pin sylvestre et le merisier. Nous avons obtenu pour ces espèces de nombreuses données de référence. Au laboratoire, j’encadre les stagiaires de tous niveaux : BTS, Master, thèse. Je suis aussi impliquée dans la mise en place d’un TD de génétique auprès des Master 1 Agrosciences de l’université d’Orléans. Je suis également la **personne référente qualité** de notre unité. Dans ce cadre, j’assure l’animation de groupes de travail, l’accès aux différents documents qualité et le suivi des appareils soumis à métrologie.

Publications

"vincent-segura"

Epigenetics in forest trees : role in plasticity, adaptation and potential implications for breeding in a context of climate change (EPITREE).

Stéphane Maury , Régis Fichot , M.D. D Sow , Alain Delaunay , I Le Jan
IUFRO Tree Biotechnology, Jun 2019, Raleigh NC, United States
Communication dans un congrès hal-03523238v1
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Survey of genetic diversity in European Populus breeding programs

Véronique Jorge , Arnaud Dowkiw , Patricia Faivre-Rampant , Marc Villar , Marie Pegard
INUPRAG Meeting 2018, Jun 2018, Barcelone, Spain
Communication dans un congrès hal-02789044v1
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Genetic mapping of resistance factors to Melamspora sp in Populus sp: a review

Véronique Jorge , Alois Bresson , Arnaud Dowkiw , Patricia Faivre-Rampant , Brigitte Viguier
Séminaire interne de l'Université d'Helsinki, Apr 2018, Helsinki, Finland
Communication dans un congrès hal-02787407v1
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Napoleonian legacy in Populus nigra populations

Véronique V. Jorge , Patricia P. Faivre-Rampant , Vanina Guérin , Marie-Christine Le Paslier , Aurélie A. Berard
IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics, May 2016, Arcachon, France
Communication dans un congrès hal-02742776v1
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A new Genomic resource for Populus nigra and its deployment for genetic studies

Patricia P. Faivre-Rampant , Véronique V. Jorge , Giusi Zaina , Stefania Giacomello , Vincent Segura
IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics, May 2016, Arcachon, France
Communication dans un congrès hal-02743801v1
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Intérêts d’approches génomiques complémentaires pour l’analyse de la diversité génétique fonctionnelle de populations naturelles de Peuplier Noir

Catherine Bastien , Véronique V. Jorge , Vincent Segura , Christelle Aluome , Vanina Guérin
Colloque EPGV 2014 "Détection, Gestion et Analyse du Polymorphisme des Génomes Végétaux", Jun 2014, Evry, France. 17 p
Communication dans un congrès hal-02801095v1
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Diversité moléculaire de la région chromosomique contrôlant la résistance à la rouille foliaire dans les collections de peupliers

Patricia P. Faivre-Rampant , Alois Bresson , Véronique V. Jorge , Arnaud A. Dowkiw , Redouane R. El-Malki
Colloque FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France. 84 p
Communication dans un congrès hal-02750107v1
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Development of a new tool (4TREE) for adapted genome selection in European tree species

Romane Guilbaud , Chiara Biselli , Joukje Buiteveld , Luigi Cattivelli , Paul Copini
GenTree, Jan 2020, Avignon, France.
Poster de conférence hal-02928391v1

Valorisation des ressources forestières régionales pour la production de moules de cuisson en bois déroulé

Anne Lavalette , Olivier de Bussac , Nathalie Boizot , Jean-Paul Charpentier , Vanina Guerin
8e journées du GDR 3544 Sciences du bois, Nov 2019, Epinal, France
Poster de conférence hal-03557306v1
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BSA-Seq : an efficient method to decipher a complex trait on Poplar, a highly heterozygous diploid genome

Aurelie Canaguier , Véronique Jorge , Vanina Guérin , Odile Rogier , Vincent Segura
PAG XXVI - Plant and Animal Genome Conference, Jan 2018, San Diego, United States. , 1 p., 2018
Poster de conférence hal-02736419v1
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BSA-Seq : An efficient tool to characterize loci involved in the Poplar leaf rust resistance.

Aurelie Canaguier , Véronique Jorge , Vanina Guérin , Odile Rogier , Isabelle Le Clainche
7. International Poplar Symposium (IPS VII), Oct 2018, Buenos Aires, Brazil. , 2018, IPS VII Poster Presentations
Poster de conférence hal-02737648v1
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A systems biology approach for identifying candidate genes involved in the natural variability of biomass yield and chemical properties in black poplar

Vincent Segura , Marie-Claude Lesage Descauses , Jean-Paul Charpentier , Kévin Kinkel , Claire Mandin
IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics, May 2016, Arcachon, France. , 2016, IUFRO Genomics and Forest Tree Genetics. Book of Abstract
Poster de conférence hal-01456004v1
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Back to the wild: identification and genetic mapping of resistance factors to Melampsora larici-populina in Populus nigra

Véronique Jorge , Arnaud Dowkiw , Redouane El Malki , Elise Albert , Marie Pégard
5. International Workshop on the Genetics of Tree-Parasite Interactions, Aug 2015, Orléans, France. , 2015, 5th International Workshop on the Genetics of Tree-Parasite Interactions. Book of abstracts
Poster de conférence hal-01269239v1

Genetic architecture of quantitative Melampsora larici-populina leaf rust resistance in poplars

Véronique Jorge , Arnaud Dowkiw , Redouane El Malki , Vincent Segura , Vanina Guérin
IUFRO Joint conference: Genetics of Five-Needle Pines, Rusts of Forest Trees, & Strobusphere, Jun 2014, Fort Collins, Colorado, United States. 2014
Poster de conférence hal-01268622v1
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Identification, cibles et diversité de régulateurs expressionnels majeurs impliqués dans la production de biomasse chez le peuplier

Véronique V. Jorge , Jean-Charles Leplé , Vincent Segura , Marie-Claude Lesage Descauses , Redouane El Malki
Séminaire AIP Bio-ressources, Feb 2013, Paris, France. 2013, ⟨10.13140/RG.2.1.3449.0403⟩
Poster de conférence hal-02807304v1
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Development and validation of a 12K SNP chip genotyping array for association genetics in Populus nigra using genome‐wide resequencing data

Patricia Faivre-Rampant , Giusi Zaina , Simone Scalabrin , Véronique Jorge , Vincent Segura
Final Conference Noveltree "Tree Breeding, Genomics and Evolutionary Biology", Oct 2012, Helsinki, Finland. , 2012, Final Conference Noveltree "Tree Breeding, Genomics and Evolutionary Biology : new synergies to tackle the impact of climate change in the 21st century"
Poster de conférence hal-01268730v1
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Diversité moléculaire de la région chromosomique contrôlant la résistance à la rouille foliaire dans les collections de peupliers

Alois Bresson , Véronique V. Jorge , Arnaud A. Dowkiw , Redouane R. El-Malki , Vincent Segura
Colloque FRB : Les Ressources Génétiques (RG) face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociétaux, Sep 2011, Montpellier, France. Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité, 84 p., 2011, Les ressources génétiques face aux nouveaux enjeux environnementaux, économiques et sociaux
Poster de conférence hal-02749127v1