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Valérie LABAS

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Identifiants chercheurs

Présentation

Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI). J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa). Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics). En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up). Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques : 1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ; 2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ; 3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ; 4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI). I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled). My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics). I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project). To carry out these projects, I use different analytical strategies: 1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence; 2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections; 3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and 4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.

Publications

nadine-gerard
"elisabeth-blesbois"

Chicken sperm cells MALDI-TOF profiling and TOP-DOWN protein identification

Valérie Labas , Isabelle Grasseau , Karine Cahier , Audrey Gargaros , Grégoire Harichaux
3. Annual Meeting of the GDR 3545, Groupement de Recherche (GDR3545). FRA., Oct 2014, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02738809v1

Analyse protéomique du sperme de coq: profil MALDI-TOF du plasma séminal et des spermatozoïdes congelés/décongelés afin de caractériser des biomarqueurs de la qualité de la semence et les interactions entre cellules et fluides

Valérie Labas , Marie-Christine Bourin , Karine Cahier , Isabelle Grasseau , Ana Paula Teixeira
29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.98
Communication dans un congrès hal-02750185v1
Image document

Semen chicken phenotype using MALDI-TOF profiling of seminal plasma or ejaculated spermatozoa to display quality semen biomarkers and interactions between cells and fluids.

Valérie Labas , Marie-Christine Bourin , Karine Cahier , Isabelle Grasseau , Ana-Paula Teixeira-Gomes
29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans, France. 256 p
Communication dans un congrès hal-02748673v1
Image document

Intact cells MALDI-TOF mass spectrometry profiling of male chicken Gallus gallus semen: comparison between fresh and frozen sperm.

Marie-Christine Bourin , Karine Cahier , Isabelle Grasseau , Valérie Labas , Grégoire Harichaux
29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans (FRA), France. 256 p
Communication dans un congrès hal-02745049v1

Analyse protéomique par ICM-MS des semences de coqs Gallus gallus: comparaison entre sperme frais et congelé/décongelé

Marie-Christine Bourin , Karine Cahier , Isabelle Grasseau , Valérie Labas , Grégoire Harichaux
29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.63
Communication dans un congrès hal-02749522v1

Intact cell MALDI-TOF mass spectrometry and top-down proteomic to identify biomarkers

Valérie Labas , Elisabeth Blesbois , Véronique Cadoret , Xavier Druart , Audrey Gargaros
29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). PALAISEAU, FRA., Sep 2012, Orléans, France. pp.69
Communication dans un congrès hal-02744407v1

Biomarkers of chicken sperm quality displayed by intact cells MALDI-TOF mass spectrometry

Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Isabelle Grasseau , Jean-Didier Terlot , Ana-Paula Teixeira-Gomes
Congrès Français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP), Sep 2011, Avignon, France
Communication dans un congrès hal-02749466v1

Phénotypage moléculaire de la semence de poulet par différentes approches protéomiques

Valérie Labas , Isabelle Grasseau , Marie-Christine Bourin , Karine Cahier , Audrey Gargaros
26. Colloque Biotechnocentre, Oct 2013, Seillac, France. 2013, 26ème Colloque Biotechnocentre
Poster de conférence hal-02744593v1

Chicken spermatozoa and seminal plasma proteomic using MALDI-TOF profiling, top down and bottom-up proteomic approaches in order to phenotype semen

Valérie Labas , Isabelle Grasseau , Sabine Alves , Marie-Christine Bourin , Karine Cahier
7. European Proteomics Association Eupa 2013, Oct 2013, Saint Malo, France. 2013, EuPA. Scientific Meeting
Poster de conférence hal-02744888v1

Peptide markers of chicken sperm quality displayed by Intact Cells MALDI-TOF mass spectrometry

Valérie Labas , Isabelle Grasseau , Grégoire Harichaux , Sabine Alves , Jean-Didier Terlot
24. World's Poultry Congress, Aug 2012, Salvador, Bahia, Brazil. Cambridge University Press, World's Poultry Science Journal, (Supplément 1), 2012, XXIV World's Poultry Congress
Poster de conférence hal-02744426v1

Biomarqueurs protéiques de la qualité du sperme de coq caractérisés par ICM-MS (Intact Cells MALDI-TOF Mass Spectrometry)

Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Isabelle Grasseau , Jean-Didier Terlot , Ana-Paula Teixeira-Gomes
24. Colloque Biotechnocentre, Oct 2011, Seillac, France. 2011, 24ème Colloque Biotechnocentre
Poster de conférence hal-02749912v1