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Valérie LABAS
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Documents
Identifiants chercheurs
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Présentation
Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI).
J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa).
Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics).
En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up).
Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques :
1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ;
2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ;
3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ;
4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI).
I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled).
My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics).
I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project).
To carry out these projects, I use different analytical strategies:
1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence;
2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections;
3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and
4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.
Publications
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French avian cryobank: development of reproductive biotechnologies based on primordial germ cells (PGCs) and investigation of the impact of in vitro steps on PGCs integrity and reproductive capacity26è World's Poultry Congress,, May 2022, Webinar, France
Communication dans un congrès
hal-04276115v1
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About the avian UF proteome: exosomes significance and biological processes in regard to eggshell mineralization, immunity and reproduction25. World's Poultry Congress 2016, World's Poultry Science Association (WPSA). INT., Sep 2016, Beijing, China
Communication dans un congrès
hal-02739212v1
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Sperm storage in female reproductive tract: study of molecules involved41. Annual Conference of the International Embryo Transfer Society, International Embryo Transfer Society (IETS). USA., Jan 2015, Versailles, France
Communication dans un congrès
hal-02741083v1
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Chicken sperm cells MALDI-TOF profiling and TOP-DOWN protein identification3. Annual Meeting of the GDR 3545, Groupement de Recherche (GDR3545). FRA., Oct 2014, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-02738809v1
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Sperm storage in female reproductive tract: study of molecules involved12. International Symposium on Spermatology, Association for Animal Andrology. AUS., Aug 2014, Newcastle, Australia
Communication dans un congrès
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Analyse du fluide utérin de Gallus gallus par spectrométrie de masse ''bottom up'' : comparaison de deux lignées de poules et effet de l'insémination artificielle26. Colloque Biotechnocentre, Association pour le Développement des Biotechnologies en Région Centre (Biotechnocentre). FRA., Oct 2013, Seillac, France
Communication dans un congrès
hal-02749802v1
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Analyse protéomique du plasma séminal par Bottom-up, Profiling MALDI-TOF et Top-down pour la caractérisation de biomarqueurs de la fertilité29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.99
Communication dans un congrès
hal-02746042v1
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MALDI-TOF profiling of follicular fluids from various mammalian species.29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans, France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-01191276v1
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Intact cell MALDI-TOF mass spectrometry and top-down proteomic to identify biomarkers29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). PALAISEAU, FRA., Sep 2012, Orléans, France. pp.69
Communication dans un congrès
hal-02744407v1
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Analyse protéomique par ICM-MS des semences de coqs Gallus gallus: comparaison entre sperme frais et congelé/décongelé29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.63
Communication dans un congrès
hal-02749522v1
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Analyse différentielle et quantitative du plasma de verrat et caractérisation de biomarqueurs protéiques liés à la fertilité25. Colloque Biotechnocentre, Biotechnocentre. FRA., Oct 2012, Seillac, France. pp.59
Communication dans un congrès
hal-02744497v1
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Intact cells MALDI-TOF mass spectrometry profiling of male chicken Gallus gallus semen: comparison between fresh and frozen sperm.29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans (FRA), France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-02745049v1
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MALDI-TOF profiling des fluides folliculaires de diverses espèces de mammifères29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.133
Communication dans un congrès
hal-01019051v1
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Semen chicken phenotype using MALDI-TOF profiling of seminal plasma or ejaculated spermatozoa to display quality semen biomarkers and interactions between cells and fluids.29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans, France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-02748673v1
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Seminal plasma-spermatozoa interactions in the boar16. Annual Conference of the European Society for Domestic Animal, European Society for Domestic Animals. Dublin, IRL., Aug 2012, Dublin, Ireland. ⟨10.1111/j.1439-0531.2012.02110.x⟩
Communication dans un congrès
hal-02747004v1
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Differential and quantitative analysis of seminal plasma using bottom-up, MALDI-TOF profiling and top-down approaches.29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans (FRA), France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-02744391v1
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Analyse protéomique du sperme de coq: profil MALDI-TOF du plasma séminal et des spermatozoïdes congelés/décongelés afin de caractériser des biomarqueurs de la qualité de la semence et les interactions entre cellules et fluides29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.98
Communication dans un congrès
hal-02750185v1
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Post-epididymal maturation of boar spermatozoa7. International Conference on Boar Semen Preservation, Aug 2011, Bonn, Germany
Communication dans un congrès
hal-02746261v1
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Biomarkers of chicken sperm quality displayed by intact cells MALDI-TOF mass spectrometryCongrès Français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP), Sep 2011, Avignon, France
Communication dans un congrès
hal-02749466v1
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ICM-MS analysis to display specific protein interactions between cells (spermatozoa) and biologic fluid (seminal plasma)Congrès Français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP), Sep 2011, Avignon, France
Communication dans un congrès
hal-02747162v1
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Steroid content and proteomic analysis of canine follicular fluid during the preovulatory period7. Congress of the European Veterinary Society for Small Animal Reproduction (EVSSAR), May 2010, Louvain-la-Neuve, Belgium. 1 p
Communication dans un congrès
hal-02816499v1
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Proteomic analysis of equine follicular fluid during late follicle development61. Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Aug 2010, Heraklion, Greece
Communication dans un congrès
hal-02752401v1
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Seminal plasma and spermatozoa quality in the boar: identification of novel biomarkers61. Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Aug 2010, Heraklion, Greece
Communication dans un congrès
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Maturation post épididymaire du spermatozoide de verratJournées d’Animation des Crédits Incitatifs du Département de Physiologie Animale et Systèmes d’Elevage (JACI Phase), Oct 2010, Tours, France. 2 p
Communication dans un congrès
hal-02819592v1
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2D-PAGE analysis of mammalian follicular fluid after depletion or enrichment methods22. Colloque Biotechnocentre, Oct 2009, Seillac, France
Communication dans un congrès
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Recherche de biomarqueurs de la maturation ovocytaire par spectrométrie de masse sur cellules folliculaires entières : apport d'une analyse comparative multi-espèces22. Colloque Biotechnocentre, Oct 2009, Seillac, France
Communication dans un congrès
hal-02758119v1
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ICM-MS profiling of cumulus cells as a non-invasive method to access potential markers of oocyte maturation in bovine, equine and humanCongrès de Spectrométrie de Masse et Analyse Protéomique, Sep 2009, Dijon, France. n.p
Communication dans un congrès
hal-02816804v1
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About the avian UF proteome: exosomes significance and biological processes in regard to eggshell mineralization, immunity and reproduction2. Journées du GdR 3606 Repro, Apr 2017, Tours, France. 75 p., 2017, 2èmes Journées Scientifiques du GdR Repro
Poster de conférence
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Projet OVISPERM : conservation des gamètes mâles dans l'oviducte de poule29e Colloque Biotechnocentre, Oct 2016, Seillac, France. , 97 p., 2016, 29e Colloque Biotechnocentre
Poster de conférence
hal-01602196v1
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Sperm storage in hens: comprehensive proteomic analysis of uterine fluid and SST in relation to fertility lenght2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group", Dec 2016, Brugge, Belgium. 2016, 2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group"
Poster de conférence
hal-01608737v1
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About the avian UF proteome: exosomes significance and biological processes in regard to eggshell mineralization, immunity and reproduction2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group", Dec 2016, Brugge, Belgium. 2016, 2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group"
Poster de conférence
hal-01602972v1
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Comprehensive proteomic analysis of Gallus gallus uterine fluid31. Scientific Meeting of the AETE, Sep 2015, Ghent, Belgium. Brazilian College of Animal Reproduction, Animal Reproduction, 12 (3), 2015, 31st Scientific Meeting of the AETE
Poster de conférence
hal-02740039v1
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Sperm storage in female reproductive tract: study of molecules involved1 Journées du GdR 3606 Repro, Apr 2015, Rennes, France. 105 p., 2015, 1ères Journées Scientifiques du GdR Repro
Poster de conférence
hal-02739803v1
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Proteomic and bioinformatic analysis of avian uterine fluidCongrès français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP 2015), Sep 2015, Ajaccio, France. , 2015, SMAP 2015
Poster de conférence
hal-02738695v1
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Proteomic analysis of fluids from the genital tract of ewes during the oestrous cycle12. International Symposium on Spermatology, Aug 2014, Newcastel, Australia. 2014, 12th International Symposium on Spermatology
Poster de conférence
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Proteomic analysis of fluids from the genital tract of ewes during the oestrous cycle26. Colloque Biotechnocentre, Oct 2013, Seillac, France. 2013, 26ème Colloque Biotechnocentre
Poster de conférence
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Phénotypage moléculaire de la semence de poulet par différentes approches protéomiques26. Colloque Biotechnocentre, Oct 2013, Seillac, France. 2013, 26ème Colloque Biotechnocentre
Poster de conférence
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Chicken spermatozoa and seminal plasma proteomic using MALDI-TOF profiling, top down and bottom-up proteomic approaches in order to phenotype semen7. European Proteomics Association Eupa 2013, Oct 2013, Saint Malo, France. 2013, EuPA. Scientific Meeting
Poster de conférence
hal-02744888v1
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Proteomic analysis of fluids from the genital tract of ewes during the oestrous cycle7. Congrès Annuel de Protéomique (EuPA), Oct 2013, Saint Malo, France. 2013, EuPA 2013. Scientific Meeting
Poster de conférence
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Bottom-up analysis of Gallus gallus uterine fluid: comparison of two lines of hens and effect of artificial insemination7. European Proteomics Association Eupa 2013, Oct 2013, Saint Malo, France. 2013, EuPA 2013. Scientific Meeting
Poster de conférence
hal-02745845v1
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Peptide markers of chicken sperm quality displayed by Intact Cells MALDI-TOF mass spectrometry24. World's Poultry Congress, Aug 2012, Salvador, Bahia, Brazil. Cambridge University Press, World's Poultry Science Journal, (Supplément 1), 2012, XXIV World's Poultry Congress
Poster de conférence
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Biomarqueurs protéiques de la qualité du sperme de coq caractérisés par ICM-MS (Intact Cells MALDI-TOF Mass Spectrometry)24. Colloque Biotechnocentre, Oct 2011, Seillac, France. 2011, 24ème Colloque Biotechnocentre
Poster de conférence
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Apport de l'ICM-MS dans l'étude des protéines impliquées dans les interactions cellules (spermatozoïdes) et fluide biologique (plasma séminal)24. Colloque Biotechnocentre, Oct 2011, Seillac, France. 2011, 24ème Colloque Biotechnocentre
Poster de conférence
hal-02749354v1
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Improvement of 2D-PAGE resolution of mammalian follicular fluid8. Annual World Congress of Human Proteome Organisation (HUPO), Sep 2009, Toronto, Canada. n.p., 2009
Poster de conférence
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Studying bio markers of ovulation by proteomic analysisCongrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique, Oct 2006, Saint-Malo, France. n.p., 2006
Poster de conférence
hal-02812338v1
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