- 5
- 2
- 1
- 1
Valérie LABAS
9
Documents
Identifiants chercheurs
- valerie-labas
- 0000-0002-5094-6844
Présentation
Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI).
J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa).
Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics).
En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up).
Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques :
1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ;
2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ;
3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ;
4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI).
I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled).
My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics).
I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project).
To carry out these projects, I use different analytical strategies:
1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence;
2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections;
3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and
4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.
Publications
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 1
- 9
- 9
- 9
- 9
- 9
- 9
- 7
- 4
- 4
- 3
- 2
- 1
- 1
- 1
- 2
- 2
- 4
Qualitative and quantitative peptidomic and proteomic approaches to phenotyping chicken semenJournal of Proteomics, 2015, 112, pp.313-335. ⟨10.1016/j.jprot.2014.07.024⟩
Article dans une revue
hal-01129861v1
|
|
|
Data for chicken semen proteome and label free quantitative analyses displaying sperm quality biomarkersData in Brief, 2014, 1, pp.37-41. ⟨10.1016/j.dib.2014.08.008⟩
Article dans une revue
hal-01129880v1
|
Chicken sperm cells MALDI-TOF profiling and TOP-DOWN protein identification3. Annual Meeting of the GDR 3545, Groupement de Recherche (GDR3545). FRA., Oct 2014, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-02738809v1
|
|
Analyse protéomique du sperme de coq: profil MALDI-TOF du plasma séminal et des spermatozoïdes congelés/décongelés afin de caractériser des biomarqueurs de la qualité de la semence et les interactions entre cellules et fluides29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.98
Communication dans un congrès
hal-02750185v1
|
|
Analyse protéomique par ICM-MS des semences de coqs Gallus gallus: comparaison entre sperme frais et congelé/décongelé29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.63
Communication dans un congrès
hal-02749522v1
|
|
|
Semen chicken phenotype using MALDI-TOF profiling of seminal plasma or ejaculated spermatozoa to display quality semen biomarkers and interactions between cells and fluids.29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans, France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-02748673v1
|
|
Intact cells MALDI-TOF mass spectrometry profiling of male chicken Gallus gallus semen: comparison between fresh and frozen sperm.29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans (FRA), France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-02745049v1
|
Phénotypage moléculaire de la semence de poulet par différentes approches protéomiques26. Colloque Biotechnocentre, Oct 2013, Seillac, France. 2013, 26ème Colloque Biotechnocentre
Poster de conférence
hal-02744593v1
|
|
Chicken spermatozoa and seminal plasma proteomic using MALDI-TOF profiling, top down and bottom-up proteomic approaches in order to phenotype semen7. European Proteomics Association Eupa 2013, Oct 2013, Saint Malo, France. 2013, EuPA. Scientific Meeting
Poster de conférence
hal-02744888v1
|