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Valérie LABAS
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Identifiants chercheurs
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- 0000-0002-5094-6844
Présentation
Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI).
J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa).
Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics).
En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up).
Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques :
1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ;
2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ;
3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ;
4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI).
I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled).
My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics).
I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project).
To carry out these projects, I use different analytical strategies:
1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence;
2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections;
3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and
4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.
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Phénotypage de la maturation hypophysaire. Impact de l'allaitement artificielJournées d’animation scientifiques du Département Physiologie Animale et Systèmes d’Elevage, May 2022, Poitiers, France
Communication dans un congrès
hal-03752742v1
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The PPILOW project: Innovations improving welfare in low input and organic pig and poultry farms73. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), EAAP, Sep 2022, Porto, Portugal. pp.350
Communication dans un congrès
hal-04128847v1
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Proteomic changes associated with sperm fertilizing ability in meat type roostersSRF Fertility 2021, Jan 2021, London, United Kingdom
Communication dans un congrès
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Molecular And Functional Characterization Of Extracellular Vesicles Released By A Lymphocyte Line Transformed By Marek's Disease Virus13. International Symposium on Marek’s Disease and Avian Herpes Virus -Congrès virtuel, University of Guelph, Jun 2021, Guelph - Ontario, Canada
Communication dans un congrès
hal-04221114v1
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Proteomic changes associated with sperm fertilizing ability in meat type roostersFertility 2021, Jan 2021, Online, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-03760276v1
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Predicting mycotoxin toxicity using mass-spectrometry profiling42. Mycotoxin Workshop, May 2021, Toulouse, France
Communication dans un congrès
hal-03354731v1
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Molecular phenotyping of intestinal epithelial cells exposed to mycotoxins34. Réunion annuelle du Club d'Etudes des Cellules Epithéliales Digestives (CECED), Mar 2019, Toulouse, France
Communication dans un congrès
hal-02791539v1
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Caractérisation moléculaire et fonctionnelle des vésicules extracellulaires libérées par une lignée lymphocytaire transformée par le virus de la maladie de Marek7. Journée scientifique HerPAs 2018, Mar 2018, Tours, France. 22 p
Communication dans un congrès
hal-02737877v1
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Lipidomique de l’ovaireJournées d'Animation Scientifique du département Phase, Apr 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-02737816v1
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Comparison of lipid profiles and gene expression in granulosa and cumulus cells in bovine33. Annual Meeting of the European Embryo Transfer Association (AETE), Association Européenne de Transfert Embryonnaire - European Embryo Transfer Association (AETE). FRA., Sep 2017, Bath, United Kingdom. 541 p
Communication dans un congrès
hal-01605433v1
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A new molecular test for male fertility diagnosis: Intact cell MALDI-TOF MS on sperm25. World's Poultry Congress, World's Poultry Science Association (WPSA). INT., Sep 2016, Beijing, China
Communication dans un congrès
hal-02741433v1
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ICM-MS phenotyping in applied animal sciences: Two examplesBruker Life Sciences User Meeting 2015, Bruker. FRA., Dec 2015, Paris, France. 18 diapositives
Communication dans un congrès
hal-02793238v1
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Avancée dans les technologies de la reproduction aviaire à travers des méthodes peptido-protéomiques/Proteome differences between male and female chicken primordial germ cells (PGCs)Annual Meeting of CRB-Anim WP 2.2, Centre de Ressources Biologiques pour la Génomique des Animaux d'Elevages et d'Intérêt Economique. FRA., Dec 2015, Nouzilly, France. 24 diapositives
Communication dans un congrès
hal-02801921v1
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Whole sheep brain lipidomic analysis using MALDI-TOF mass spectrometry profiling and imaginCongrès français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP 2015), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). FRA., Sep 2015, Ajaccio, France
Communication dans un congrès
hal-02740513v1
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New proteomic tools for Reproductive Phenotyping, the male fowl fertility exampleCRB-Anim Biennal Seminar 2015, Centre de Ressources Biologiques pour la Génomique des Animaux d'Elevages et d'Intérêt Economique. FRA., Feb 2015, Paris, France. 17 diapositives
Communication dans un congrès
hal-02741867v1
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Accurate male fertility phenotyping is possible ! : The sperm intact cell MALDI-TOF MS approachCongrès français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP 2015), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). FRA., Sep 2015, Ajaccio, France
Communication dans un congrès
hal-02743142v1
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Lipid metabolism and female reproduction: role at the ovary level1 Journées du GdR 3606 Repro, Université de Haute Bretagne ( Rennes 2 ) (UR 2). Rennes, FRA., Apr 2015, Rennes, France. 105 p
Communication dans un congrès
hal-02739043v1
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Neutrophils in cystic fibrosis. Are they intrinsically defective?Journées d'Animation Scientifique de la Fédération de Recherche d'Infectiologie (FéRI), Oct 2015, Orléans, France. 2 p
Communication dans un congrès
hal-02799967v1
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Chicken sperm cells MALDI-TOF profiling and TOP-DOWN protein identification3. Annual Meeting of the GDR 3545, Groupement de Recherche (GDR3545). FRA., Oct 2014, Montpellier, France
Communication dans un congrès
hal-02738809v1
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Intact Cell MALDI-TOF MS : a male chicken fertility phenotypic toolFinal Showcase Meeting of Farm Animal Proteomics, Università degli studi di Milano [Milano]. Milan, ITA., Nov 2014, Milan, Italy
Communication dans un congrès
hal-02796244v1
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Analyses différentielles et quantitatives des protéomes de cellules de cumulus bovines en relation avec la compétence de l'ovocyte au développement29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.136
Communication dans un congrès
hal-02745073v1
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Intact cells MALDI-TOF mass spectrometry profiling of male chicken Gallus gallus semen: comparison between fresh and frozen sperm.29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans (FRA), France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-02745049v1
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Analyse protéomique du sperme de coq: profil MALDI-TOF du plasma séminal et des spermatozoïdes congelés/décongelés afin de caractériser des biomarqueurs de la qualité de la semence et les interactions entre cellules et fluides29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.98
Communication dans un congrès
hal-02750185v1
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Differential and quantitative analysis of bovine cumulus cells proteomes in relation to developmental potential of enclosed oocyte29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Sep 2012, Orléans, France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-02745234v1
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Differential and quantitative analysis of seminal plasma using bottom-up, MALDI-TOF profiling and top-down approaches.29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans (FRA), France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-02744391v1
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Analyse protéomique du plasma séminal par Bottom-up, Profiling MALDI-TOF et Top-down pour la caractérisation de biomarqueurs de la fertilité29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.99
Communication dans un congrès
hal-02746042v1
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Adherence phenotype of HBHA produced by Mycobacterium avium subsp paratuberculosis type C and SPhD Day, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Infectiologie et Santé Publique (1282)., Sep 2012, Nouzilly, France. 1 page
Communication dans un congrès
hal-02805944v1
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MALDI-TOF profiling of follicular fluids from various mammalian species.29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans, France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-01191276v1
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Analyse différentielle et quantitative du plasma de verrat et caractérisation de biomarqueurs protéiques liés à la fertilité25. Colloque Biotechnocentre, Biotechnocentre. FRA., Oct 2012, Seillac, France. pp.59
Communication dans un congrès
hal-02744497v1
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Comparison of two label-free quantitative methods on ewe cerebrospinal fluid (CSF) proteome in regard with the control of seasonal reproduction29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). orléans, FRA., Sep 2012, Orléans (FRA), France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-02746177v1
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Profiling MALDI-TOF de cellules entières et identification de biomarqueurs de la qualité ovocytaire par Top Down29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.100
Communication dans un congrès
hal-02749864v1
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MALDI-TOF profiling des fluides folliculaires de diverses espèces de mammifères29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.133
Communication dans un congrès
hal-01019051v1
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Intact cell MALDI-TOF mass spectrometry and top-down proteomic to identify biomarkers29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). PALAISEAU, FRA., Sep 2012, Orléans, France. pp.69
Communication dans un congrès
hal-02744407v1
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Analyse protéomique par ICM-MS des semences de coqs Gallus gallus: comparaison entre sperme frais et congelé/décongelé29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.63
Communication dans un congrès
hal-02749522v1
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Semen chicken phenotype using MALDI-TOF profiling of seminal plasma or ejaculated spermatozoa to display quality semen biomarkers and interactions between cells and fluids.29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans, France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-02748673v1
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Top-down proteomic strategy to identify oocyte quality biomarkers revealed by intact cells MALDI-TOF profiling.29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans, France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-02745646v1
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Seminal plasma-spermatozoa interactions in the boar16. Annual Conference of the European Society for Domestic Animal, European Society for Domestic Animals. Dublin, IRL., Aug 2012, Dublin, Ireland. ⟨10.1111/j.1439-0531.2012.02110.x⟩
Communication dans un congrès
hal-02747004v1
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Comparaison de deux méthodes quantitatives de spectrométrie de masse pour l'étude du protéome du liquide céphalo-rachidien de la brebis en relation avec le contrôle de la reproduction saisonnée29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). St Orens de Gameville, FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.93
Communication dans un congrès
hal-02746205v1
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From single cell MALDI-TOF profiling to protein identification in mammalian egg: integrative approach to study the oocyte qualityCongrès Français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP), Sep 2011, Avignon, France
Communication dans un congrès
hal-02745939v1
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ICM-MS analysis to display specific protein interactions between cells (spermatozoa) and biologic fluid (seminal plasma)Congrès Français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP), Sep 2011, Avignon, France
Communication dans un congrès
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Post-epididymal maturation of boar spermatozoa7. International Conference on Boar Semen Preservation, Aug 2011, Bonn, Germany
Communication dans un congrès
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Biomarkers of chicken sperm quality displayed by intact cells MALDI-TOF mass spectrometryCongrès Français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP), Sep 2011, Avignon, France
Communication dans un congrès
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Proteomic ICM-MS profiling of single bovine oocytes and surrounding cumulus cells as a novel approach to access potential biomarkers of oocyte quality4. General Meeting of GEMINI, Sep 2011, Gijon, Spain
Communication dans un congrès
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Seminal plasma and spermatozoa quality in the boar: identification of novel biomarkers61. Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Aug 2010, Heraklion, Greece
Communication dans un congrès
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Maturation post épididymaire du spermatozoide de verratJournées d’Animation des Crédits Incitatifs du Département de Physiologie Animale et Systèmes d’Elevage (JACI Phase), Oct 2010, Tours, France. 2 p
Communication dans un congrès
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PAIB: Plate-forme d'analyse intégrative des biomarqueurs cellulaires et moléculaires22. Colloque Biotechnocentre, Oct 2009, Seillac, France
Communication dans un congrès
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Plate-forme de Protéomique Analytique et Fonctionnelle20. Colloque Biotechnocentre, Oct 2007, Seillac, France
Communication dans un congrès
hal-02758486v1
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Base de données protéomiques Top down en reproduction animaleFrance, N° de brevet: Déclaration d'invention DI-RV-16-0009. 2016
Brevet
hal-01606433v1
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