Samuel Alizon
Directeur de Recherche CNRS, responsable de l'équipe Écologie et évolution de la santé
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Documents
Affiliations actuelles
- 139750
Identifiants chercheurs
- samuel-alizon
- IdRef : 111298334
- 0000-0002-0779-9543
Site web
- https://www.college-de-france.fr/personne/samuel-alizon
Présentation
Je suis Directeur de recherche au CNRS, affecté au [Centre Interdisciplinaire de Recherches en Biologie (CIRB)](https://www.college-de-france.fr/site/en-cirb/center-for-interdisciplinary-research-in-biology.htm) au Collège de France à Paris.
Mes travaux portent sur l'écologie et l'évolution de la santé, notamment les virus humains tels que les papillomavirus humains (HPV), le VIH ou le SARS-CoV-2. Je développe en particulier des modèles mathématiques et des simulations numériques.
Je suis l'auteur d'un livre grand public intitulé [Évolution, écologie et pandémies](https://www.editionspoints.com/ouvrage/evolution-ecologie-et-pandemies-samuel-alizon/9782757887233), publié en 2020 au Points Seuil.
Pour plus de détails, voir mon [site internet personnel](https://alizon.ouvaton.org/index_fr.html).
CNRS research director, based at the [Centre for Interdisciplinary Research in Biology (CIRB)](https://www.college-de-france.fr/site/en-cirb/center-for-interdisciplinary-research-in-biology.htm) in Paris.
Theoretical evolutionary ecologist specialised in the study of infectious diseases, with a particular interest in human viruses such as HIV, HCV, SARS-CoV-2, or HPV.
For further details, see my [personal](https://alizon.ouvaton.org/) website.
Publications
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COVFlow: phylodynamics analyses of viruses from selected SARS-CoV-2 genome sequencesPeer Community Journal, 2023, 3, pp.e101. ⟨10.24072/pcjournal.333⟩
Article dans une revue
hal-04246696v1
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TiPS : Rapidly simulating trajectories and phylogenies from compartmental modelsMethods in Ecology and Evolution, 2022, 14 (2), pp.487-495. ⟨10.1111/2041-210X.14038⟩
Article dans une revue
hal-03903561v1
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Early phylodynamics analysis of the COVID-19 epidemic in FrancePeer Community Journal, 2021, 1, pp.e45. ⟨10.24072/pcjournal.40⟩
Article dans une revue
hal-03001114v2
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Quantifying transmission dynamics of acute hepatitis C virus infections in a heterogeneous population using sequence dataPLoS Pathogens, 2021, 17 (9), pp.e1009916. ⟨10.1371/journal.ppat.1009916⟩
Article dans une revue
hal-03357552v1
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TiPS: rapidly simulating trajectories and phylogenies from compartmental models2022
Pré-publication, Document de travail
hal-03872312v1
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Rt2: computing and visualising COVID-19 epidemics temporal reproduction number2020
Pré-publication, Document de travail
hal-03045490v1
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Phylodynamique du COVID-19 en France : variations temporelles de la croissance épidémique[Rapport de recherche] 6, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de Recherche pour le Développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
hal-02882698v1
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Phylodynamique du COVID-19 en France[Rapport de recherche] 4, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de Recherche pour le Développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
hal-02882688v1
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Estimation du nombre de reproduction de l’épidémie de COVID-19 en France[Rapport de recherche] 1, Centre national de la recherche scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
hal-02882680v1
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