Samuel Alizon
Directeur de Recherche CNRS, responsable de l'équipe Écologie et évolution de la santé
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Affiliations actuelles
- 139750
Identifiants chercheurs
samuel-alizon- IdRef : 111298334
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0000-0002-0779-9543
Site web
- https://www.college-de-france.fr/personne/samuel-alizon
Présentation
Je suis Directeur de recherche au CNRS, affecté au [Centre Interdisciplinaire de Recherches en Biologie (CIRB)](https://www.college-de-france.fr/site/en-cirb/center-for-interdisciplinary-research-in-biology.htm) au Collège de France à Paris.
Mes travaux portent sur l'écologie et l'évolution de la santé, notamment les virus humains tels que les papillomavirus humains (HPV), le VIH ou le SARS-CoV-2. Je développe en particulier des modèles mathématiques et des simulations numériques.
Je suis l'auteur d'un livre grand public intitulé [Évolution, écologie et pandémies](https://www.editionspoints.com/ouvrage/evolution-ecologie-et-pandemies-samuel-alizon/9782757887233), publié en 2020 au Points Seuil.
Pour plus de détails, voir mon [site internet personnel](https://alizon.ouvaton.org/index_fr.html).
CNRS research director, based at the [Centre for Interdisciplinary Research in Biology (CIRB)](https://www.college-de-france.fr/site/en-cirb/center-for-interdisciplinary-research-in-biology.htm) in Paris.
Theoretical evolutionary ecologist specialised in the study of infectious diseases, with a particular interest in human viruses such as HIV, HCV, SARS-CoV-2, or HPV.
For further details, see my [personal](https://alizon.ouvaton.org/) website.
Publications
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Évolution, écologie et pandémiesPoints Sciences, 2020, 2757887238
Ouvrages
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Ecologie de la santéEdition du Cherche Midi CNRS, 176 p., 2017, Documents (Cherche Midi), ISBN: 9782749154251 9782749154251
Ouvrages
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C'est grave Dr Darwin ? L'évolution, les microbes et nousLe Seuil, 2016, 2021102920
Ouvrages
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Épidémiologie et évolution du SARS-CoV-2Chapitre d'ouvrage hal-04184205v1 |
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PhylodynamiqueISTE. Modèles et méthodes pour l’évolution biologique, , 2022, 9781789480696. ⟨10.51926/ISTE.9069.ch11⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-02884408v1
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Invasions of Host-Associated Microbiome NetworksResearch, BT - Advances in Ecological. Networks of Invasion: Empirical Evidence and Case Studies, 57, Academic Press, 2017, Advances in Ecological Research, ⟨10.1016/bs.aecr.2016.11.002⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-01567903v1
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L’être vivant dans son environnementCNRS Editions. Etonnant vivant. Découvertes et promesses du XXIème siècle (Livre blanc)., 2017
Chapitre d'ouvrage
hal-01923240v1
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Emerging diseases and the evolution of virulence: the case of the Spanish influenza pandemicMarc Silberstein and Gérard Lambert and Philippe Huneman. Disease, Classification, and Evidence. New Essays in the Philosophy of Medicine, 7, Springer, pp.93-130, 2015, History, Philosophy and Theory of the Life Sciences, ⟨10.1007/978-94-017-8887-8_5⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-01567906v1
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Evolution of Infectious Disease VirulenceJonathan Losos. Evolutionary biology, Oxford Bibliographies, 2014, ⟨10.1093/OBO/9780199941728-0018⟩
Chapitre d'ouvrage
hal-01567916v1
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TiPS: rapidly simulating trajectories and phylogenies from compartmental models2022
Pré-publication, Document de travail
hal-03872312v1
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Optimal COVID-19 epidemic control until vaccine deployment2020
Pré-publication, Document de travail
hal-02533223v1
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Rt2: computing and visualising COVID-19 epidemics temporal reproduction number2020
Pré-publication, Document de travail
hal-03045490v1
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Epidemiological monitoring and control perspectives: application of a parsimonious modelling framework to the COVID-19 dynamics in France2020
Pré-publication, Document de travail
hal-02619546v1
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De Delta à Omicron, scénarios de tendances hospitalières pour l'hiver 2021-2022[Rapport de recherche] 16, CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique; IRD - Institut de recherche pour le developpement; Université de Montpellier. 2021
Rapport
hal-03502127v1
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SARS-CoV-2 Through the Lens of Computational Biology: How bioinformatics is playing a key role in the study of the virus and its origins[Research Report] CNRS. 2021, pp.1-35
Rapport
hal-03170023v1
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Les effets sexe spécifiques de COVID-19 en France et l’implication potentielle des déficits en G6PD[Rapport de recherche] 11, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
hal-02950702v1
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Analyse de l’épidémie de COVID-19 en France et scénarios de contrôle[Rapport de recherche] 9, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
hal-02950665v1
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Immunité de groupe et contrôle de l’épidémie de COVID-19[Rapport Technique] 2, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de Recherche pour le Développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
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Stochasticité et épidémie de COVID-19[Rapport de recherche] 8, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de Recherche pour le Développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
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|
Limites et délais dans l’estimation du nombre de reproduction[Rapport de recherche] 5, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
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Évolution de la virulence et COVID-19[Rapport de recherche] 12, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
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Modéliser l'épidémie de COVID-19 (résumé)[Rapport de recherche] 7, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
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Phylodynamique du COVID-19 en France[Rapport de recherche] 4, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de Recherche pour le Développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
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Estimation du nombre de reproduction de l’épidémie de COVID-19 en France[Rapport de recherche] 1, Centre national de la recherche scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
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Phylodynamique du COVID-19 en France : variations temporelles de la croissance épidémique[Rapport de recherche] 6, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de Recherche pour le Développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
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Les effets sexe spécifiques de COVID-19 en France pourraient-ils être expliqués par des comorbidités ?[Rapport de recherche] 10, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Institut de recherche pour le développement (IRD); Université de Montpellier (UM), FRA. 2020
Rapport
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Modélisation de l’épidémie de COVID-19 : modèle SEAIR[Rapport de recherche] 3, Centre national de la recherche scientifique (CNRS); Institut de Recherche pour le Développement (IRD); Université de Montpellier. 2020
Rapport
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Évolution de la virulence des parasites : apports des modèles emboîtésEvolution [q-bio.PE]. Université Pierre et Marie Curie (Paris VI), 2006. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse
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Dynamics and evolution of infectious diseasesPopulations and Evolution [q-bio.PE]. Université Montpellier 2, 2013
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Modelling parasitoid virulence evolution with seasonality2021, pp.100129. ⟨10.24072/pci.evolbiol.100129⟩
Autre publication scientifique
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