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johann confais

16
Documents
Affiliations actuelles
  • 1068954
  • 1002240
Identifiants chercheurs
  • IdHAL johann-confais
  • ORCID 0000-0003-2945-5036
  • Google Scholar : https://scholar.google.fr/citations?user=s6B4qnYAAAAJ

Présentation

Activité INRAE : ---------------- - **Février 2018 :** UR Génomique Info (URGI) 1164 INRAE, Université Paris-Saclay dans l'équipe Analyse des génomes (ANAGEN) - **Octobre 2012 :** UMR Biologie et gestion des risques en agriculture (BIOGER) 1290 AgroParisTech, INRAE, Université Paris-Saclay dans l'équipe Evolution et Génomique des Interactions plantes Pathogènes (EGIP) - **Octobre 2006 :** UMR Biologie et gestion des risques en agriculture (BIOGER) 1290 AgroParisTech, INRAE, Université Paris-Saclay dans l'équipe Antifongiques, Mode d'Action et Résistance (AMAR)

Publications

hadi-quesneville

Evolutionary Dynamics of Transposable Elements in Brachypodium distachyon Based on a Pangenomic Approach

Somia Saidi , Johann Confais , Hadi Quesneville
International Plant & Animal Genome (PAG 31), Jan 2024, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-04419364v1

REPET novelties : a versatile and modular package

Johann Confais , Mariène Wan , Somia Saidi , Hadi H. Quesneville
CNET 2023 : 24th National Congress on Transposable Elements 2023, French research community working on transposable elements (CNET), Jul 2023, Perpignan, France
Communication dans un congrès hal-04156193v1

Characterization of Transposable Elements in Pangenomes

Somia Saidi , Johann Confais , Hadi Quesneville
24th National Congress on Transposable Elements 2023 (CNET 2023), French research community working on transposable elements (CNET), Jul 2023, Perpignan, France
Communication dans un congrès hal-04158362v1

Characterization of Transposable Elements in Pangenomes

Somia Saidi , Johann Confais , Hadi Quesneville
Journées du PEPI IBIS 2023, PEPI Ingénierie Bio Informatique et Statistique pour les données haut-débit (IBIS), Sep 2023, Paris, France
Communication dans un congrès hal-04283863v1

How to use REPET for de novo TE annotation

Johann Confais , Mariène Wan , Somia Saidi , Hadi Quesneville
11th RepeatExplorer Workshop on the Application of Next Generation Sequencing to Repetitive DNA Analysis, Laboratory of Molecular Cytogenetics of the Biology Centre CAS, May 2023, České Budějovice, Czech Republic
Communication dans un congrès hal-04117937v1

Transposable elements, from their annotation to their integration into knowledge graphs

Johann Confais , Mariène Wan , Somia Saidi , Nicolas Francillonne , Hadi Quesneville
Journée thématique - Annotation, Intelligence Artificielle et Text-mining, PEPI IBIS, Nov 2022, Jouy-en-Josas, France
Communication dans un congrès hal-03876510v1

Characterization of Transposable Elements in Pangenomes

Somia Saidi , Johann Confais , Hadi Quesneville
23rd National Congress on Transposable Elements (CNET 2022), French research community working on transposable elements (CNET), Jul 2022, Gif-Sur-Yvette, France
Communication dans un congrès hal-03819044v1

REPET evolutions: faster and easier

Johann Confais , Mariène Wan , Hadi Quesneville
23rd National Congress on Transposable Elements (CNET 2022), French research community working on transposable elements (CNET), Jul 2022, Gif-Sur-Yvette, France
Communication dans un congrès hal-03815061v1

Characterization of Transposable Elements in Pangenomes

Somia Saidi , Johann Confais , Hadi Quesneville
GDR CNRS 3546 Mobil-ET Annual Meeting, Mobil-ET GDR CNRS 3546, Dec 2022, Paris, France
Communication dans un congrès hal-03890780v1

panREPET: A Pipeline to characterize Transposable Elements in Pangenomes on de novo assembled genomes

Somia Saidi , Johann Confais , Hadi Quesneville
International Plant & Animal Genome (PAG 31), Jan 2024, San Diego (CA), United States
Poster de conférence hal-04516410v1

REPET evolutions: faster and easier

Johann Confais , Mariène Wan , Hadi Quesneville
Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution (SMBE), Jul 2023, Ferrara, Italy.
Poster de conférence hal-04169996v1

Characterization of Transposable Elements in Pangenomes

Somia Saidi , Johann Confais , Hadi Quesneville
JOBIM 2023, Jun 2023, Tours, France
Poster de conférence hal-04158902v1

Characterization of Transposable Elements in Pangenomes

Somia Saidi , Johann Confais , Hadi Quesneville
SMBE23, Jul 2023, Ferrara, Italy
Poster de conférence hal-04516434v1

REPET evolutions: faster and easier

Johann Confais , Mariène Wan , Hadi Quesneville
6th Uppsala Transposon Symposium, Oct 2022, Uppsala, Sweden.
Poster de conférence hal-03838081v1

REPET evolutions: faster and easier

Mariène WAN , Johann Confais , Hadi Quesneville
Jobim 2022, Jul 2022, Rennes, France.
Poster de conférence hal-03819511v1