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88

Yvan Rahbé @ HAL


Hello,

I am a researcher at INRAE (ex INRA :-) since 1983.

Agricultural engineer and biochemist by training, I am an insect physiologist (INA-PG PhD thesis, currently AgroParisTech, in 1984) having worked at INSA Lyon since that date, with a few forays elsewhere: INRA Guadeloupe in 1985-1986 , U. Valencia in 2007.

I worked in 4 main areas of interaction biology, related to Plant Health, my scientific Department at INRAE.

- Plant-insect interactions and the mechanisms of resistance of plants to insects

- The biology of the bacterial trophic symbiosis  in insects, mainly on the Aphid / Buchnera model

- The biology of anti-insect toxins, mainly of plant origin

- The biology of the bacterial transmission by Hemiptera and aphids

Currently working in a CNRS Microbiology unit (MAP, UMR5240)

I will fill-in this page more completely another day :-)

Please direct yourself to my official short-CV page

http://cvscience.aviesan.fr/cv/1525/yvan-rahbe

 


Federica Calevro   

Journal articles16 documents

  • Claude Rispe, Fabrice Legeai, Paul Nabity, Rosa Fernández, Arinder Arora, et al.. The genome sequence of the grape phylloxera provides insights into the evolution, adaptation, and invasion routes of an iconic pest. BMC Biology, BioMed Central, 2020, 18 (1), pp.90. ⟨10.1186/s12915-020-00820-5⟩. ⟨hal-02917617⟩
  • Stefano Colella, Nicolas Parisot, Pierre Simonet, Karen Gaget, Gabrielle Duport, et al.. Bacteriocyte Reprogramming to Cope With Nutritional Stress in a Phloem Sap Feeding Hemipteran, the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum. Frontiers in Physiology, Frontiers, 2018, 9, pp.1498. ⟨10.3389/fphys.2018.01498⟩. ⟨hal-01905508⟩
  • Panagiotis Sapountzis, Gabrielle Duport, Severine Balmand, Karen Gaget, Stéphanie Jaubert-Possamai, et al.. New insight into the RNA interference response against cathepsin-L gene in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum: Molting or gut phenotypes specifically induced by injection or feeding treatments.. Insect Biochemistry and Molecular Biology, Elsevier, 2014, 51, to be published. ⟨10.1016/j.ibmb.2014.05.005⟩. ⟨hal-01002574⟩
  • Andréane Rabatel, Gérard Febvay, Karen Gaget, Gabrielle Duport, Patrice Baa-Puyoulet, et al.. Tyrosine pathway regulation is host-mediated in the pea aphid symbiosis during late embryonic and early larval development. BMC Genomics, BioMed Central, 2013, 14 (1), pp.235. ⟨10.1186/1471-2164-14-235⟩. ⟨hal-00824527⟩
  • Hubert Charles, Severine Balmand, Araceli Lamelas, Ludovic Cottret, Vicente Pérez-Brocal, et al.. A genomic reappraisal of symbiotic function in the aphid/buchnera symbiosis: reduced transporter sets and variable membrane organisations.. PLoS ONE, Public Library of Science, 2011, 6 (12), pp.e29096. ⟨10.1371/journal.pone.0029096⟩. ⟨hal-00659506⟩
  • José Viñuelas, Gérard Febvay, Gabrielle Duport, Stefano Colella, Jean-Michel Fayard, et al.. Multimodal dynamic response of the Buchnera aphidicola pLeu plasmid to variations in leucine demand of its host, the pea aphid Acyrthosiphon pisum.. Molecular Microbiology, Wiley, 2011, 81 (5), pp.1271-1285. ⟨10.1111/j.1365-2958.2011.07760.x⟩. ⟨hal-00746846⟩
  • Augusto F Vellozo, Amélie S Véron, Patrice Baa-Puyoulet, Jaime Huerta-Cepas, Ludovic Cottret, et al.. CycADS: an annotation database system to ease the development and update of BioCyc databases.. Database - The journal of Biological Databases and Curation, Oxford University Press, 2011, 2011, pp.bar008. ⟨10.1093/database/bar008⟩. ⟨hal-00632965⟩
  • Iagc The International Aphid Genomics Consortium, Federica Calevro, Hubert Charles, Stefano Colella, Gérard Febvay, et al.. Genome Sequence of the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum. PLoS Biology, Public Library of Science, 2010, 8 (2), pp.e1000313. ⟨10.1371/journal.pbio.1000313⟩. ⟨hal-00459970⟩
  • yvan Rahbé, Gérard Febvay, Stefano Colella, Hubert Charles, Federica Calevro. Un vieux couple inséparable à la conquête des plantes vasculaires : le puceron et Buchnera, sa bactérie symbiotique. Comptes Rendus de l'Académie d'Agriculture de France, Académie d'agriculture de France, 2009, 95 (5), pp.78-78. ⟨hal-02657684⟩
  • Lilia Brinza, José Viñuelas, Ludovic Cottret, Federica Calevro, yvan Rahbé, et al.. Systemic analysis of the symbiotic function of Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid Acyrthosiphon pisum.. Comptes Rendus Biologies, Elsevier, 2009, 332 (11), pp.1034-49. ⟨10.1016/j.crvi.2009.09.007⟩. ⟨hal-00445861⟩
  • José Viñuelas, Federica Calevro, Didier Remond, Jacques Bernillon, yvan Rahbé, et al.. Conservation of the links between gene transcription and chromosomal organization in the highly reduced genome of Buchnera aphidicola.. BMC Genomics, BioMed Central, 2007, 8, pp.143. ⟨10.1186/1471-2164-8-143⟩. ⟨hal-00373371⟩
  • yvan Rahbé, H. Charles, Federica Calevro, Jean-Christophe Simon, C. Rispe. Unis pour survivre : les pucerons et leurs bactéries symbiotiques. Biofutur, Elsevier - Cachan : Lavoisier, 2007, 279, pp.49-52. ⟨hal-00391504⟩
  • H. Charles, Federica Calevro, J. Vinuelas, J.M. Fayard, yvan Rahbé. Codon usage bias and tRNA over-expression in Buchnera aphidicola after aromatic amino acid nutritional stress on its host Acyrthosiphon pisum. Nucleic Acids Research, Oxford University Press, 2006, 34 (16), pp.4583-4592. ⟨10.1093/nar/gkl597⟩. ⟨hal-00391277⟩
  • N. Reymond, Federica Calevro, J. Vinuelas, N. Morin, yvan Rahbé, et al.. Different levels of transcriptional regulation due to trophic constraints in the reduced genome of Buchnera aphidicola APS. Applied and Environmental Microbiology, American Society for Microbiology, 2006, 72 (12), pp.7760-7766. ⟨10.1128/AEM.01118-06⟩. ⟨hal-00391509⟩
  • H. Charles, Federica Calevro, N. Reymond, yvan Rahbé, G. Febvay, et al.. Bioinformatique des puces à ADN et application à l'analyse du transcriptome de Buchnera aphidicola. L'Echo des Puys, INRA Clermont-Ferrand, 2005, 79, pp.6. ⟨hal-00391275⟩
  • Federica Calevro, Hubert Charles, Nancie Reymond, Vincent Dugas, Jean-Pierre Cloarec, et al.. Assessment of 35mer amino-modified oligonucleotide based microarray with bacterial samples.. Journal of Microbiological Methods, Elsevier, 2004, 57 (2), pp.207-18. ⟨10.1016/j.mimet.2004.01.009⟩. ⟨hal-00402180⟩

Conference papers54 documents

  • Federica Calevro, Nicolas Parisot, Mélanie Ribeiro Lopes, Stefano Colella, Karen Gaget, et al.. Rôle clé du bactériocyte dans la résilience du puceron aux stress nutritionnels. 11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France. ⟨hal-03514026⟩
  • Mélanie Ribeiro Lopes, Pierre Simonet, Karen Gaget, Marie-Gabrielle Duport, Severine Balmand, et al.. Effecteurs et inhibiteurs de l’apoptose chez le puceron du pois : annotation et implication dans la mort cellulaire bactériocytaire. 10. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2017, Colmar, France. ⟨hal-03506807⟩
  • Nicolas Parisot, Pierre Simonet, Karen Gaget, Marie-Gabrielle Duport, Patrice Baa-Puyoulet, et al.. Life history traits and tissue-specific gene expression changes underlying the symbiotic pea aphid resilience to a tyrosine and phenylalanine depleted diet. 9. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2016, Amiens, France. ⟨hal-03506796⟩
  • Patrice Baa-Puyoulet, Mathieu Labernardiere, Nicolas Parisot, Jean-Pierre Gauthier, Gérard Febvay, et al.. From SymbAphidBase to SymbAphidCyc: two companion databases to study and compare aphid symbionts from genomes to metabolic pathways. JOBIM 2015 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA). FRA., Jul 2015, Clermont-Ferrand, France. 1 p. ⟨hal-01208786⟩
  • Mathieu Labernardiere, Patrice Baa-Puyoulet, Jean-Pierre Gauthier, Gérard Febvay, Federica Calevro, et al.. SymbAphidBase : une base de données nouvelle dédiée aux symbiotes de pucerons pour stocker et visualiser les génomes séquencés en standardisant leurs annotations. 7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). Le Rheu, FRA., Nov 2014, Avignon, France. 1 p. ⟨hal-01208785⟩
  • yvan Rahbé, Denis Tagu, Guy Condemine, E Guiderdoni, Federica Calevro, et al.. Aphicibles - Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticides. ANR - Colloque Plant Genomics 2012, Apr 2012, Pont Royal en Provence, France. ⟨hal-03506701⟩
  • Hubert Charles, Severine Balmand, Araceli Lamelas, Ludovic Cottret, Vicente Pérez-Brocal, et al.. Réévaluation génomique de la fonction de transport chez Buchnera, endocytobiote des pucerons : une faible diversité de transporteurs et une organisation membranaire variable. 4. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés, Réseau Biologie Adaptative des Pucerons et des Organismes Associés (BAPOA). FRA., Nov 2011, Paris, France. ⟨hal-02808863⟩
  • Andréane Rabatel, Gérard Febvay, Karen Gaget, Marie-Gabrielle Duport, yvan Rahbé, et al.. Transcriptome analysis of embryo development in a parthenogenetic and symbiotic insect model, the pea aphid. IPG'10 Integrative Post-Genomics, Centre Jacques Cartier. Lyon, FRA., Nov 2011, Lyon, France. ⟨hal-02814211⟩
  • Andréane Rabatel, Gérard Febvay, Karen Gaget, Gabrielle Duport, Nadia Bendridi, et al.. Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic development. Sixth International Symposium on Molecular Insect Science, 2011, Amsterdam, Netherlands. ⟨hal-00748785⟩
  • Andréane Rabatel, Gérard Febvay, Karen Gaget, Marie-Gabrielle Duport, yvan Rahbé, et al.. Caractérisation transcriptomique du développement embryonnaire et larvaire du puceron du pois Acyrthosiphon pisum. 16. Colloque de Biologie de l’Insecte, Oct 2010, Lyon, France. 126 p. ⟨hal-02755293⟩
  • yvan Rahbé, Denis Tagu, Guy Condemine, Emmanuel Guiderdoni, Federica Calevro, et al.. Aphicibles : Symbiosis, digestion and reproduction as aphid physiological processes to identify new targets for insecticides. Genoplante 2010, Agence Nationale de la Recherche (ANR). Paris, FRA., Mar 2010, Avignon, France. 40 diapos. ⟨hal-02824684⟩
  • Andréane Rabatel, Gérard Febvay, Karen Gaget, Marie-Gabrielle Duport, yvan Rahbé, et al.. Characterization of partenogenetic embryo development in the context of symbiosis using transcriptome analysis in the pea aphid model. EMBO Workshop on Systems Biology of Development, EMBO. Heidelberg, DEU., Aug 2010, Ascona, Switzerland. 1 p. ⟨hal-01231279⟩
  • Hubert Charles, Stefano Colella, Federica Calevro, Gérard Febvay, yvan Rahbé, et al.. Exploration génomique et fonctionnelle des insectes et de leurs partenaires symbiotiques. Journée Sciences Croisées "Modélisation et Sciences Numériques : nouveaux instruments et opportunités", Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon). Conseil Scientifique de l'INSA, Villeurbanne, FRA., Oct 2010, Villeurbanne, France. n. p. ⟨hal-02804281⟩
  • Nicolas Parisot, Karen Gaget, Stefano Colella, Andréane Rabatel, Federica Calevro, et al.. Annotation et évolution des familles de transporteurs chez le puceron du pois (Acyrthosiphon pisum). 3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France. n. p. ⟨hal-02818835⟩
  • Panagiotis Sapountzis, Marie-Gabrielle Duport, Karen Gaget, Severine Balmand, Gérard Febvay, et al.. Individual and compartment specific response to RNAi in aphids: each individual matters. 3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France. ⟨hal-02821530⟩
  • yvan Rahbé, Nicolas Parisot, Karen Gaget, Stefano Colella, Andréane Rabatel, et al.. Genomic analysis of the transport function in the symbiotic system of the pea aphid Acyrthosiphon pisum. 5. Meeting GDRE-RA "Comparative genomics", Institut d'Estudis Catalans (IEC). Barcelona, ESP., Nov 2010, Barcelone, Spain. n. p. ⟨hal-02823073⟩
  • A. Vellozo, Patrice Baa-Puyoulet, A. Veron, Jaime Huerta-Cepas, Ludovic Cottret, et al.. CycADS: an annotation management system for the development and update of BioCyc metabolic network databases. 1st International Workshop on Information Systems for Insect Pests, Rennes, FRANCE, 2009, France. ⟨hal-00496032⟩
  • A. Rabatel, N. Bendridi, G. Duport, Stefano Colella, J. Bermingham, et al.. Metabolic requirements in essential amino acids in parthenogenetic pea aphid embryos. 8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1. ⟨hal-00391499⟩
  • Stefano Colella, A. Vellozo, L. Cottret, G. Febvay, Federica Calevro, et al.. AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) and CycADS (Cyc Annotation Database System): moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses. 8th International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania (Italie), juin 2009, France. pp.1-1. ⟨hal-00391280⟩
  • Andréane Rabatel, Nadia Bendridi, - Duport, G., Marjolaine Rey, Stefano Colella, et al.. Metabolic requirements in essential amino acids in parthenogenetic pea aphid embryos. 8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania, juin 2009, Italy. ⟨hal-02820893⟩
  • Stefano Colella, Augusto Vellozo, Ludovic Cottret, Gérard Febvay, Federica Calevro, et al.. AcypiCyc (Acyrthosiphon pisum Cyc database) : a model database to visualize and study the metabolic network underlying the pea aphid-Buchnera symbiosis. 6. International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2009, Madison, août 2009, United States. ⟨hal-02814342⟩
  • Stefano Colella, Augusto Vellozo, Ludovic Cottret, Gérard Febvay, Federica Calevro, et al.. AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses. 8. International Symposium on Aphids (8 ISA 2009), 2009, Catania, juin 2009, Italy. ⟨hal-02814863⟩
  • Stefano Colella, A. Vellozo, Ludovic Cottret, Gérard Febvay, Federica Calevro, et al.. The Acyrthosiphon pisum Cyc database (AcypiCyc) created using a novel BioCyc Annotation Database System (CycADS): a useful tool to explore and study the pea aphid metabolism. 5th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 2, Barcelona, Espagne, juin 2009, Jun 2009, France. ⟨hal-00498411⟩
  • Andréane Rabatel, Nadia Bendridi, Gabrielle Duport, Marjolaine Rey, Stefano Colella, et al.. Besoins en acides aminés des embryons de femelles parthénogénétiques du puceron du pois.. Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Jun 2009, PARIS, France. ⟨hal-00511624⟩
  • Stefano Colella, Augusto Vellozo, Ludovic Cottret, Gérard Febvay, Federica Calevro, et al.. AcypiCyc (Acyrthosiphon pisumCyc database) and CycADS (CycAnnotation Database System) : moving from genome sequence annotation to metabolic network analyses. Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2009, Paris, juin 2009, France. ⟨hal-02815123⟩
  • J. Pompon, yvan Rahbé, Federica Calevro, D. Quiring, C. Goyer, et al.. Xylem consumption response to osmotic stress in aphids. Annual meeting, Entomological Society of Canada, Winnipeg - Canada, 2009, Canada. ⟨hal-00496044⟩
  • Federica Calevro, Stefano Colella, Gérard Febvay, Hubert Charles, yvan Rahbé. Un vieux couple à la conquête des plantes vasculaires : le puceron et sa bactérie symbiotique. Séance commune Académie Agriculture et Académie des Sciences, Académie d'Agriculture de France (AAF). Paris, FRA., Dec 2009, Paris, France. 23 diapos. ⟨hal-02824438⟩
  • A. Vellozo, Stefano Colella, L. Cottret, G. Febvay, Federica Calevro, et al.. Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc): from genome sequence to metabolic network analyses. Integrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon (France), novembre 2008, France. pp.1-1. ⟨hal-00391519⟩
  • Stefano Colella, A. Vellozo, L. Cottret, G. Febvay, Federica Calevro, et al.. Annotation of metabolism genes: towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses. 4th Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1", 2008, Princetown (USA), juillet 2008, France. pp.1-1. ⟨hal-00391279⟩
  • Hubert Charles, Guillaume Beslon, Federica Calevro, J.F. Boulicaut, Jean-Michel Fayard, et al.. Les réseaux métaboliques et génétiques. Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne, juillet 2008, France. ⟨hal-02818952⟩
  • J.F. Boulicaut, Federica Calevro, Hubert Charles, Jean-Michel Fayard, Gérard Febvay, et al.. Transcriptomique. Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne, juillet 2008, France. ⟨hal-02823302⟩
  • Jean-François Boulicaut, Federica Calevro, H. Charles, J.M. Fayard, G. Febvay, et al.. Transcriptomique. Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1. ⟨hal-00391255⟩
  • H. Charles, Federica Calevro, Stefano Colella, J.M. Fayard, G. Febvay, et al.. Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisum. Séminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux (France), décembre 2008, France. pp.1-1. ⟨hal-00391273⟩
  • Federica Calevro, H. Charles, J.M. Fayard, G. Febvay, yvan Rahbé, et al.. Interactions trophiques dans la symbiose puceron - Buchnera : Régulations transcriptionnelles de la réponse à la carence en acides aminés essentiels. Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, 2008, Paris (France), janvier 2008, France. pp.1-1. ⟨hal-00391259⟩
  • H. Charles, G. Beslon, Federica Calevro, Jean-François Boulicaut, J.M. Fayard, et al.. Les réseaux métaboliques et génétiques. Journée INSA de Lyon "BioIngénierie / Sciences et Ingénierie du Vivant", 2008, Villeurbanne (France), juillet 2008, France. pp.1-1. ⟨hal-00391271⟩
  • Augusto Vellozo, Stefano Colella, Ludovic Cottret, Gérard Febvay, Federica Calevro, et al.. Development of the Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) : from genome sequence to metabolic network analyses. Integrative Post-Genomics - IPG'08, 2008, Lyon, novembre 2008, France. ⟨hal-02821711⟩
  • Hubert Charles, Federica Calevro, Stefano Colella, Jean-Michel Fayard, Gérard Febvay, et al.. Caractérisation et modélisation de la « fonction symbiotique » de Buchnera aphidicola chez le puceron du pois Acyrthosiphon pisum. Séminaire INRA AgroBI, 2008, Bordeaux, décembre 2008, France. ⟨hal-02824972⟩
  • J. Vinuelas, Federica Calevro, D. Remond, J. Bernillon, yvan Rahbé, et al.. Conservation de la relation entre niveau d'expression des gènes et organisation du chromosome chez Buchnera aphidicola, symbiote primaire des pucerons : exemple d'un génome réduit mais non dégénéré. XVème Colloque de Physiologie de l'Insecte, Jul 2007, Rennes, France. pp.1-1. ⟨hal-00373311⟩
  • yvan Rahbé, H. Charles, J. Vinuelas, N. Reymond, Federica Calevro, et al.. Regulation of expression following nutritional stresses in the reduced genome of Buchnera aphidicola, "Is there any life left?". Seminarios del Institut Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva (ICBiBE) - Univ. Valencia (ESP), 2007, Valencia (Espagne), juin 2007, France. pp.1-1. ⟨hal-00391505⟩
  • L. Cottret, L. Brinza, J. Vinuelas, G. Duport, Federica Calevro, et al.. Régulation génétique et métabolique chez Buchnera aphidicola (AgroBi 2006). Journée INRA-INRIA "Insertion des mathématiques dans les approches biologiques : du gène à l'organisme", 2006, Lyon (France), décembre 2006, France. pp.1-1. ⟨hal-00391289⟩
  • Federica Calevro, N. Reymond, J. Vinuelas, A. Groppi, A. Barre, et al.. Buchnera aphidicola: evidences for transcriptional regulation in a degenerated genome. Colloque INRA "Apports de la génomique à la physiologie et la pathologie de l'insecte", 2006, Montpellier (France), mars 2006, France. pp.1-1. ⟨hal-00391267⟩
  • J. Vinuelas, Federica Calevro, J. Bernillon, D. Remond, yvan Rahbé, et al.. Relationship between gene expression and genome properties in Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid Acyrthosiphon pisum. 5th International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2006, Vienna (Autriche), août 2006, France. pp.1-1. ⟨hal-00391524⟩
  • J. Vinuelas, Federica Calevro, Didier Remond, J. Bernillon, yvan Rahbé, et al.. Spatial transcriptomic patterns in the genome of the endosymbiotic bacterium Buchnera aphidicola. Theoretical Approaches for the Genome Workshop, Nov 2006, France. ⟨hal-00506911⟩
  • J. Vinuelas, Federica Calevro, J. Bernillon, Didier Remond, yvan Rahbé, et al.. Relationships between gene expression and genome properties in Buchnera aphidicola, the primary endosymbiont of the pea aphid. 5th International of Symbiosis Society Congress, Aug 2006, Autriche. ⟨hal-00506826⟩
  • H. Charles, Federica Calevro, J. Vinuelas, G. Febvay, yvan Rahbé, et al.. Buchnera aphidicola, endocytobiote du puceron : transcriptome d'un génome "dégénéré". Rencontres 2006 des Microbiologistes de l'INRA, 2006, Dourdan (France), juin 2006, France. pp.1-1. ⟨hal-00391278⟩
  • Federica Calevro, N. Reymond, J. Vinuelas, G. Febvay, yvan Rahbé, et al.. Metabolic interactions between the bacterium Buchnera aphidicola and its obligate symbiotic partner, the pea aphid: nutritional studies combined with transcriptome analyses. 5th International Symbiosis Society (ISS) Congress, 2006, Vienna (Autriche), août 2006, France. pp.1-1. ⟨hal-00391262⟩
  • J. Vinuelas, Federica Calevro, D. Remond, J. Bernillon, yvan Rahbé, et al.. Spatial transcriptomic patterns in the genome of the endosymbiotic bacterium Buchnera aphidicola. Workshop "Theoretical Approaches for the Genome", 2006, Annecy-le-Vieux (France), novembre 2006, France. pp.1-1. ⟨hal-00391525⟩
  • Federica Calevro, N. Reymond, J. Vinuelas, A. Groppi, A. Barre, et al.. Buchnera aphidicola: evidences for transcriptional regulation in a degenerated genome. Integrative Post-Genomics - IPG'05, 2005, Lyon (France), novembre-décembre 2005, France. pp.1-1. ⟨hal-00391266⟩
  • H. Charles, Federica Calevro, N. Reymond, N. Morin, yvan Rahbé, et al.. Genomewide transcriptional changes associated with nutritional alterations affecting phenylalanine and tyrosine metabolism in Buchnera aphidicola. Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), 2005, Lyon (France), juillet 2005, France. pp.1-1. ⟨hal-00391274⟩
  • yvan Rahbé, Federica Calevro, H. Charles, G. Febvay, Denis Tagu. Of lice and plants: metabolite flows in the trophic pathway of phloem feeding insects as analysed through genomic and EST data from the aphid symbiosis. Society of Experimental Biology Annual Main Meeting 2005 (SEB 2005), 2005, Barcelona (Espagne), juillet 2005, France. pp.S233. ⟨hal-00391503⟩
  • Federica Calevro, N. Reymond, N. Morin, A. Dumitru, yvan Rahbé, et al.. Analyse transcriptomique de la réponse de Buchnera aphidicola à un stress métabolique subi par son hôte le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum. Journées Reseau Ecologie et Interactions Durables (REID), 2005, Lyon (France), janvier 2005, France. pp.1-1. ⟨hal-00391260⟩
  • Federica Calevro, N. Reymond, N. Morin, yvan Rahbé, J. Bernillon, et al.. Global transcriptional responses of Buchnera aphidicola to aromatic amino acid limitation in the diet of its symbiotic partner, the phloem sap feeding insect Acyrthosiphon pisum. Society of Experimental Biology Annual Main Meeting 2005 (SEB 2005), 2005, Barcelona (Espagne), juillet 2005, France. pp.S226. ⟨hal-00391261⟩
  • yvan Rahbé, Z Al Ayoubi, Federica Calevro, Hubert Charles, Jean-Michel Fayard, et al.. Buchnera aphidicola, bactérie endosymbiotique des pucerons : génomes et physiologie symbiotique. 4. Colloque de Physiologie de l’Insecte, Apr 2003, Amiens, France. ⟨hal-03506623⟩
  • Federica Calevro, Hubert Charles, Nancie Reymond, Vincent Dugas, J.P. P Cloarec, et al.. Analyse du transcriptome de Buchnera, la bactérie symbiotique intracellulaire des pucerons : une approche méthodologique. 14. Colloque de Physiologie de l’Insecte, Apr 2003, Amiens, France. ⟨hal-03506495⟩

Poster communications17 documents

  • Nicolas Parisot, Stefano Colella, Pierre Simonet, Karen Gaget, Marie-Gabrielle Duport, et al.. Bacteriocyte reprogramming to maintain organismal homeostasis under nutritional stress in aphid symbiosis. UK-France joint Meeting Aphid Special Interest Group – BAPOA, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom. ⟨hal-03513048⟩
  • Nicolas Parisot, Stefano Colella, Pierre Simonet, Karen Gaget, Marie-Gabrielle Duport, et al.. Bacteriocyte reprogramming to maintain organismal homeostasis under nutritional stress in aphid symbiosis. XIth European Congress of Entomology, Jul 2018, Naples, Italy. ⟨hal-03509885⟩
  • Pierre Simonet, Panagiotis Sapountzis, Marie-Gabrielle Duport, Severine Balmand, Karen Gaget, et al.. Implication de la cathepsine-L dans le remodelage cuticulaire durant le processus de mue chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum. 7. Rencontres du réseau Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2014, Avignon, France. 2014. ⟨hal-02795332⟩
  • Pierre Simonet, Panagiotis Sapountzis, Marie-Gabrielle Duport, Severine Balmand, Karen Gaget, et al.. Cathepsin-L proteinase is involved in cuticle remodeling during the molting process in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum. 7. International Symposium on Molecular Insect Science, Jul 2014, Amsterdam, Netherlands. 1 p., 2014. ⟨hal-02797200⟩
  • Mathieu Labernardiere, Patrice Baa-Puyoulet, Jean-Pierre Gauthier, Gérard Febvay, Federica Calevro, et al.. SymbAphidBase: a new database dedicated to aphid symbionts to store novel sequenced genomes and standardize their annotations. 13. European Conference on Computational Biology (ECCB), Sep 2014, Strasbourg, France. 1 p., 2014. ⟨hal-02798649⟩
  • Andréane Rabatel, Gérard Febvay, Karen Gaget, Marie-Gabrielle Duport, Nadia Bendridi, et al.. Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic development. 6. International Symposium on Molecular Insect Science, Oct 2011, Amsterdam, Netherlands. Elsevier, 2011,  . ⟨hal-02747829⟩
  • Andréane Rabatel, Gérard Febvay, Karen Gaget, Marie-Gabrielle Duport, Nadia Bendridi, et al.. Integration of metabolic pathways and host regulation in symbiosis: tyrosine and cuticular protein biosynthesis during the pea aphid embryonic development. 4. Réunion Réseau BAPOA, Nov 2011, Paris, France. 1 p., 2011. ⟨hal-02805925⟩
  • Nicolas Parisot, Karen Gaget, Stefano Colella, Andréane Rabatel, Federica Calevro, et al.. Analyse génomique de la fonction de transport dans le système symbiotique du puceron du pois Acyrthosiphon pisum. 16. Colloque de Biologie de l’Insecte, Oct 2010, Lyon, France. 126 p., 2010, CBI-2010 : 16ème Colloque de Biologie de l’Insecte, Lyon, 18 au 20 octobre 2010. ⟨hal-02755294⟩
  • Panagiotis Sapountzis, Marie-Gabrielle Duport, Karen Gaget, Severine Balmand, Stéphanie Jaubert-Possamai, et al.. Réponse tissu-spécifique au traitement par RNAi chez le puceron du pois : une étude cinétique à l’échelle de l’individu. 16. Colloque de Biologie de l’Insecte, Oct 2010, Lyon, France. 126 p., 2010, CB-2010 : 16ème Colloque de Biologie de l'Insecte, Lyon, 18 au 20 octobre 2010. ⟨hal-02755004⟩
  • Augusto Vellozo, Patrice Baa-Puyoulet, Jaime Huerta-Cepas, Gérard Febvay, Federica Calevro, et al.. Using the “CycADS” annotation management system to develop a BioCyc metabolic network database for sequenced arthropods genomes: first steps towards “ArthropodsCyc”. 4. Annual Arthropod Genomics Symposium on “Arthropod Genomics: New Approaches and Outcomes”, Jun 2010, Kansas City, United States. 45 p., 2010, Fourth Annual Arthropod Genomics Symposium. ⟨hal-02753908⟩
  • Panagiotis Sapountzis, Marie-Gabrielle Duport, Karen Gaget, Thomas Horn, Michael Boutros, et al.. Single insect and tissue compartment specific response to RNAi microinjection in aphids: each individual matters. 4. Annual Arthropod Genomics Symposium on “Arthropod Genomics: New Approaches and Outcomes”, Jun 2010, Kansas City, United States. 1 p., 2010. ⟨hal-02820936⟩
  • Lilia Brinza, Federica Calevro, Marie-Gabrielle Duport, yvan Rahbé, Pedro da Silva, et al.. Evolution of the regulatory network in Buchnera aphidicola, the obligate intracellular symbiotic bacteria of aphids. 18. Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution, Apr 2010, Lyon, France. 1 p., 2010. ⟨hal-02811608⟩
  • Stefano Colella, Augusto Vellozo, L. Cottret, Gérard Febvay, Federica Calevro, et al.. Annotation of metabolism genes : towads the implementation of an Acyrthosiphon pisum Cyc database (ApsCyc) to perform metabolic network analyses. 4. Meeting of the International Aphid Genomics Consortium "Pea Aphid Genome Annotation Workshop 1", 2008, Princetown, juillet 2008, United States. 2008. ⟨hal-02818508⟩
  • J. Vinuelas, Federica Calevro, J. Bernillon, yvan Rahbé, G. Febvay, et al.. Genomic DNA: an attractive candidate for microarray data normalization. Integrative Post-Genomics - IPG'05, 2005, Lyon (France), novembre-décembre 2005, France. pp.1-1, 2005. ⟨hal-00391523⟩
  • Federica Calevro, Hubert Charles, Nancie Reymond, Vincent Dugas, J.P. P Cloarec, et al.. A preliminary methodological approach to study the transcriptome of Buchnera, the intracellular symbiotic bacteria of aphids. Journées de Post-Génomique de la Doua - JPGD'03, May 2003, Villeurbanne, France. ⟨hal-03506498⟩
  • Hubert Charles, Federica Calevro, Nancie Reymond, Frederique Laforest, Anne Tchounikine, et al.. Bioinformatique du transcriptome de Buchnera, symbiote intracellulaire des pucerons. Rencontres 2003 des Microbiologistes de l'INRA, May 2003, Dourdan, France. ⟨hal-03506503⟩
  • Federica Calevro, Hubert Charles, Nancie Reymond, J.P. P Cloarec, yvan Rahbé, et al.. Analyse du transcriptome de Buchnera: développement d'une première puce à ADN. Journées de Post-Génomique de la Doua - JPGD'02, Mar 2002, Villeurbanne, France. ⟨hal-03506459⟩

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  • Marie-Paule Voïta, Aline Bel-Brunon, Federica Calevro, Julien Castellani, Jean-Philippe Farrugia, et al.. Biomimétique, l’imitation sans limitation @ INSA-Lyon: Rapport résumé d'exposition. [Rapport de recherche] INSA-Lyon. 2019. ⟨hal-02123536⟩