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Vanina BENOIT

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Présentation

A l’Inra depuis 2001, d’abord en CDD sur des projets scientifiques en rapport avec les biotechnologies, j’ai été recrutée en 2003. Je suis actuellement en charge des activités de **génotypage** conduites dans l’unité. A ce titre, je développe et mets au point les protocoles pour détecter plusieurs types de **marqueurs moléculaires** sur différentes espèces forestières et à partir de différents tissus. J’interviens également dans la coordination des activités de génotypage réalisées sur des plateformes externes pour le compte de l’UMR BioForA. En pratique, j’organise les campagnes de marquage réalisées dans l’unité. Avec l’aide d’une technicienne, [Corinne Buret](https://www6.val-de-loire.inra.fr/biofora/Personnel/Permanents/BURET-Corinne), nous récoltons sur le terrain les tissus à analyser, stockons et préparons les échantillons au laboratoire, réalisons les manipulations et validons les résultats obtenus. Ensuite, j’effectue les premières étapes d’analyse des données : **validation de génotypes, recherche de paternité, calculs de diversité génétique.** Les marqueurs moléculaires que nous utilisons en routine sont majoritairement des marqueurs de type **[microsatellites](https://www.gnis-pedagogie.org/biotechnologie-amelioration-marqueur-microsatellite.html)**. Après amplification de l’ADN, la détection de ces marqueurs est réalisée à l’aide d’un séquenceur Applied Biosystem 3500. Nous travaillons principalement sur le peuplier, le mélèze, le frêne, le pin sylvestre et le merisier. Nous avons obtenu pour ces espèces de nombreuses données de référence. Au laboratoire, j’encadre les stagiaires de tous niveaux : BTS, Master, thèse. Je suis aussi impliquée dans la mise en place d’un TD de génétique auprès des Master 1 Agrosciences de l’université d’Orléans. Je suis également la **personne référente qualité** de notre unité. Dans ce cadre, j’assure l’animation de groupes de travail, l’accès aux différents documents qualité et le suivi des appareils soumis à métrologie.

Publications

sylvie-augustin

Consequences of fluvial maintenance operations on the sediment morphodynamic and the associated BIOdiversity in the mosaic of MAREAU-aux-prés islands.

Marc Villar , Sylvie Augustin , Michel Chantereau , Richard Chevalier , Olivier Denux
International Long-Term Ecological Research Network ILTER 1ST Open Science Meeting, Oct 2016, Skukuza Kruger National Park, South Africa. pp.41
Communication dans un congrès hal-01595189v1

Conséquences des travaux d'entretien du lit de la Loire sur plusieurs composantes de la biodiversité au sein de la mosaïque des îles de Mareau-aux-Prés (Loiret).

Marc Villar , Sylvie Augustin , Michel Chantereau , Richard Chevalier , Olivier Denux
3e Colloque des Zones Ateliers « Les sciences à la rencontre de l’aménagement des territoires », Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). FRA., Oct 2015, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01583805v1
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Conséquences des travaux d'entretien du lit de la Loire sur plusieurs composantes de la biodiversité au sein de la mosaïque des îles de Mareau-aux-Prés (Loiret).

Marc M. Villar , Sylvie Augustin , Michel Chantereau , Richard Chevalier , Olivier Denux
I.S. Rivers, 2e conférence internationale "recherches et actions au service des fleuves et grandes rivières", Jun 2015, Lyon, France. 168 p
Communication dans un congrès hal-02740183v1

Conséquences des travaux d'entretien du lit de la Loire sur plusieurs composantes de la biodiversité au sein de la mosaïque des îles de Mareau-aux-Prés (Loiret)

Marc Villar , Sylvie Augustin , Chantereau Michel , Richard Chevalier , Olivier Denux
I.S. Rivers, 2e conférence internationale « recherches et actions au service des fleuves et grandes rivières, Jun 2015, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-01423445v1

Consequences of fluvial maintenance operations on the biodiversity and landscape in the Mareau-aux-Prés islands (National Reserve of Saint-Mesmin, Loire River, France)

Marc M. Villar , Sylvie Augustin , Michel Chantereau , M. Baltzinger , Jean Menanteau
Science and management co-learning to navigate social-ecological issues, Oct 2018, Sedgefield, South Africa. pp.1, 2018
Poster de conférence hal-02608517v1
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Five-year study of consequences of fluvial maintenance operations on the biodiversity in the Mareau-aux-Prés islands (National Reserve of Saint-Mesmin, Loire River, France)

Marc Villar , Sylvie Augustin , Michel Chantereau , Michel Chevalier , Olivier Denux
3. conférence internationale I.S Rivers. Recherches et actions au service des fleuves et grandes rivières. Integrative sciences and sustainable development of rivers, Jun 2018, Lyon, France. , 2018, Recherches et actions au service des fleuves et grandes rivières. Integrative sciences and sustainable development of rivers. Programme et résumés. Programme and abstacts
Poster de conférence hal-02736217v1
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Consequences of fluvial maintenance operations on the biodiversity and landscape in the Mareau-aux-Prés islands (National Reserve of Saint-Mesmin, Loire River, France)

Marc Villar , Sylvie Augustin , Michel Chantereau , Marie Baltzinger , Jean Menanteau
Second Garden Route Interface Meeting, Science and management co-learning to navigate social-ecological issues, Oct 2018, Sedgefield, South Africa. 2018
Poster de conférence hal-02736174v1

Five years study of consequences of fluvial maintenance operations on the biodiversity in the Mareau-aux-Prés islands (Loire river, France)

Marc M. Villar , Sylvie Augustin , Michel Chantereau , Richard Chevalier , Olivier Denux
I.S. Rivers, 3rd international conference « Integrative sciences and sustainable development of rivers », Jun 2018, Lyon, France. pp.1, 2018
Poster de conférence hal-02608524v1