Accéder directement au contenu

Valérie LABAS

8
Documents
Identifiants chercheurs

Présentation

Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI). J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa). Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics). En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up). Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques : 1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ; 2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ; 3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ; 4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI). I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled). My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics). I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project). To carry out these projects, I use different analytical strategies: 1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence; 2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections; 3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and 4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.

Publications

843079

Protein palmitoylation in bovine ovarian follicle

Svetlana Uzbekova , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Aurélie Marestaing , Peggy Jarrier-Gaillard , Pascal Papillier
International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22 (21), pp.1-27. ⟨10.3390/ijms222111757⟩
Article dans une revue hal-03457402v1
Image document

MALDI-TOF Mass Spectrometry Revealed Significant Lipid Variations in Follicular Fluid and Somatic Follicular Cells but Not in Enclosed Oocytes between the Large Dominant and Small Subordinate Follicles in Bovine Ovary

Priscila Silvana Bertevello , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Valérie Labas , Luiz Cordeiro , Marie-Claire Blache
International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21 (18), 30 p. ⟨10.3390/ijms21186661⟩
Article dans une revue hal-02959768v1
Image document

Protein Cargo of Extracellular Vesicles From Bovine Follicular Fluid and Analysis of Their Origin From Different Ovarian Cells

Svetlana Uzbekova , Carmen Alminana , Valérie Labas , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Lucie Combes-Soia
Frontiers in Veterinary Science, 2020, 7, 20 p. ⟨10.3389/fvets.2020.584948⟩
Article dans une revue hal-02995254v1
Image document

Deciphering the oviductal extracellular vesicles content across the estrous cycle: implications for the gametes-oviduct interactions and the environment of the potential embryo

Carmen Alminana , Guillaume Tsikis , Valérie Labas , Rustem Uzbekov , Juliano C. da Silveira
BMC Genomics, 2018, 19, ⟨10.1186/s12864-018-4982-5⟩
Article dans une revue hal-02623796v1
Image document

Oviduct extracellular vesicles protein content and their role during oviduct-embryo cross-talk

Carmen Alminana-Brines , Emilie Corbin , Guillaume Tsikis , Agostinho Soares de Alcantara Neto , Valérie Labas
Reproduction, 2017, 154 (4), pp.253-268. ⟨10.1530/REP-17-0054⟩
Article dans une revue hal-01604875v1

Fatty acid synthesis and oxidation in cumulus cells support oocyte maturation in bovine

Laura Sanchez-Lazo , Daphné Brisard , Sébastien Elis , Virginie Maillard , Rustem Uzbekov
Molecular Endocrinology -Baltimore-, 2014, 28 (9), pp.1502-1521. ⟨10.1210/me.2014-1049⟩
Article dans une revue hal-01129856v1