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Valérie LABAS
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Identifiants chercheurs
- valerie-labas
- 0000-0002-5094-6844
Présentation
Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI).
J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa).
Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics).
En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up).
Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques :
1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ;
2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ;
3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ;
4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI).
I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled).
My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics).
I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project).
To carry out these projects, I use different analytical strategies:
1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence;
2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections;
3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and
4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.
Publications
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A quantitative proteomic comparison of epididymal and ejaculated ram spermatozoa18th International Congress on Animal Reproduction (ICAR), International Organisation on Animal Reproduction. FRA., Jun 2016, Tours, France. 676 p
Communication dans un congrès
hal-02738866v1
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Sperm storage in female reproductive tract: study of molecules involved41. Annual Conference of the International Embryo Transfer Society, International Embryo Transfer Society (IETS). USA., Jan 2015, Versailles, France
Communication dans un congrès
hal-02741083v1
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Sperm storage in female reproductive tract: study of molecules involved12. International Symposium on Spermatology, Association for Animal Andrology. AUS., Aug 2014, Newcastle, Australia
Communication dans un congrès
hal-02738618v1
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Intact cell MALDI-TOF mass spectrometry and top-down proteomic to identify biomarkers29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). PALAISEAU, FRA., Sep 2012, Orléans, France. pp.69
Communication dans un congrès
hal-02744407v1
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Seminal plasma-spermatozoa interactions in the boar16. Annual Conference of the European Society for Domestic Animal, European Society for Domestic Animals. Dublin, IRL., Aug 2012, Dublin, Ireland. ⟨10.1111/j.1439-0531.2012.02110.x⟩
Communication dans un congrès
hal-02747004v1
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Analyse différentielle et quantitative du plasma de verrat et caractérisation de biomarqueurs protéiques liés à la fertilité25. Colloque Biotechnocentre, Biotechnocentre. FRA., Oct 2012, Seillac, France. pp.59
Communication dans un congrès
hal-02744497v1
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Differential and quantitative analysis of seminal plasma using bottom-up, MALDI-TOF profiling and top-down approaches.29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans (FRA), France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-02744391v1
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Analyse protéomique du plasma séminal par Bottom-up, Profiling MALDI-TOF et Top-down pour la caractérisation de biomarqueurs de la fertilité29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.99
Communication dans un congrès
hal-02746042v1
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Post-epididymal maturation of boar spermatozoa7. International Conference on Boar Semen Preservation, Aug 2011, Bonn, Germany
Communication dans un congrès
hal-02746261v1
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ICM-MS analysis to display specific protein interactions between cells (spermatozoa) and biologic fluid (seminal plasma)Congrès Français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP), Sep 2011, Avignon, France
Communication dans un congrès
hal-02747162v1
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Biomarkers of chicken sperm quality displayed by intact cells MALDI-TOF mass spectrometryCongrès Français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP), Sep 2011, Avignon, France
Communication dans un congrès
hal-02749466v1
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Seminal plasma and spermatozoa quality in the boar: identification of novel biomarkers61. Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Aug 2010, Heraklion, Greece
Communication dans un congrès
hal-02753189v1
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Maturation post épididymaire du spermatozoide de verratJournées d’Animation des Crédits Incitatifs du Département de Physiologie Animale et Systèmes d’Elevage (JACI Phase), Oct 2010, Tours, France. 2 p
Communication dans un congrès
hal-02819592v1
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Rôle de la composition protéique du plasma séminal dans la résistance osmotique des spermatozoïdesJournées d’Animation des Crédits Incitatifs du Département de Physiologie Animale et Systèmes d’Elevage (JACI Phase), Oct 2010, Tours, France. 2 p
Communication dans un congrès
hal-02815357v1
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Mammalian epididymal proteome15. European Workshop on Molecular and Cellular Endocrinology of the Testis, Jun 2008, Naantali, Finland. ⟨10.1016/j.mce.2009.03.007⟩
Communication dans un congrès
hal-02758330v1
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Purification and identification of sperm surface proteins related to sperm maturation18. Colloque Biotechnocentre, Nov 2005, Fondjouan, France
Communication dans un congrès
hal-02761715v1
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Seminal plasma components differ between “good freezer” and “poor freezer” stallions10. Biennial Conference of the Association for Applied Animal Andrology, Jun 2016, Tours, France. Elsevier, Animal Reproduction Science, 169 (Special Issue), 2016, 10th Biennial Conference of the Association for Applied Animal Andrology. ⟨10.1016/j.anireprosci.2016.03.047⟩
Poster de conférence
hal-02742989v1
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Interception of exosomal messages between the oviduct and the embryo: What are they tweeting about?42. Annual Conference of the IETS, Jan 2016, Louisville, Kentucky, United States. CSIRO Publishing, Reproduction, Fertility and Development, 28 (2), 267 p., 2016, 42nd Annual Conference of the International Embryo Transfer Society
Poster de conférence
hal-02739176v1
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IMPAIC Factor : Innovations méthodologiques pour l’analyse des interactions cellulaires : application au β-Nerve Growth FactorJournées d’Animation des Crédits Incitatifs du Département de Physiologie Animale et Systèmes d’Elevage (JACI Phase 2016), Apr 2016, Tours, France. , 115 p., 2016, Crédits Incitatifs financés entre 2011 et 2014
Poster de conférence
hal-02744279v1
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Projet OVISPERM : conservation des gamètes mâles dans l'oviducte de poule29e Colloque Biotechnocentre, Oct 2016, Seillac, France. , 97 p., 2016, 29e Colloque Biotechnocentre
Poster de conférence
hal-01602196v1
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Ram seminal plasma proteome and impact on sperm liquid preservation1 Journées du GdR 3606 Repro, Apr 2015, Rennes, France. 105 p., 2015, 1ères Journées Scientifiques du GdR Repro
Poster de conférence
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Sperm storage in female reproductive tract: study of molecules involved1 Journées du GdR 3606 Repro, Apr 2015, Rennes, France. 105 p., 2015, 1ères Journées Scientifiques du GdR Repro
Poster de conférence
hal-02739803v1
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Proteomic analysis of fluids from the genital tract of ewes during the oestrous cycle12. International Symposium on Spermatology, Aug 2014, Newcastel, Australia. 2014, 12th International Symposium on Spermatology
Poster de conférence
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Proteomic analysis of fluids from the genital tract of ewes during the oestrous cycle26. Colloque Biotechnocentre, Oct 2013, Seillac, France. 2013, 26ème Colloque Biotechnocentre
Poster de conférence
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Bottom-up analysis of Gallus gallus uterine fluid: comparison of two lines of hens and effect of artificial insemination7. European Proteomics Association Eupa 2013, Oct 2013, Saint Malo, France. 2013, EuPA 2013. Scientific Meeting
Poster de conférence
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Proteomic analysis of fluids from the genital tract of ewes during the oestrous cycle7. Congrès Annuel de Protéomique (EuPA), Oct 2013, Saint Malo, France. 2013, EuPA 2013. Scientific Meeting
Poster de conférence
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Biomarqueurs protéiques de la qualité du sperme de coq caractérisés par ICM-MS (Intact Cells MALDI-TOF Mass Spectrometry)24. Colloque Biotechnocentre, Oct 2011, Seillac, France. 2011, 24ème Colloque Biotechnocentre
Poster de conférence
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Apport de l'ICM-MS dans l'étude des protéines impliquées dans les interactions cellules (spermatozoïdes) et fluide biologique (plasma séminal)24. Colloque Biotechnocentre, Oct 2011, Seillac, France. 2011, 24ème Colloque Biotechnocentre
Poster de conférence
hal-02749354v1
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Purification et identification de protéines membranaires de spermatozoïdes par marquage de surfaceCongrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Sep 2005, Montpellier, France. n.p., 2005
Poster de conférence
hal-02832842v1
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