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Valérie LABAS
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Identifiants chercheurs
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Présentation
Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI).
J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa).
Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics).
En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up).
Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques :
1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ;
2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ;
3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ;
4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI).
I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled).
My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics).
I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project).
To carry out these projects, I use different analytical strategies:
1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence;
2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections;
3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and
4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.
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The PPILOW project: Innovations improving welfare in low input and organic pig and poultry farms73. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), EAAP, Sep 2022, Porto, Portugal. pp.350
Communication dans un congrès
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Lipidomique de l’ovaireJournées d'Animation Scientifique du département Phase, Apr 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
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Comparison of lipid profiles and gene expression in granulosa and cumulus cells in bovine33. Annual Meeting of the European Embryo Transfer Association (AETE), Association Européenne de Transfert Embryonnaire - European Embryo Transfer Association (AETE). FRA., Sep 2017, Bath, United Kingdom. 541 p
Communication dans un congrès
hal-01605433v1
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Lipid metabolism and female reproduction: role at the ovary level1 Journées du GdR 3606 Repro, Université de Haute Bretagne ( Rennes 2 ) (UR 2). Rennes, FRA., Apr 2015, Rennes, France. 105 p
Communication dans un congrès
hal-02739043v1
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Oocytomics: combining transcriptomics and proteomics to understand post-transcriptional regulation in bovine oocytes1. International Symposium of Microgenomics, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Génétique Animale et Biologie Intégrative (1313)., May 2014, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02740352v1
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Global transcriptome and proteome analysis of bovine cumulus cells in relation to maturation and developmental competence of enclosed oocyte4. Mammalian Embryo Genomics Meeting, EmbryoGene Network. CAN., Oct 2014, Québec, Canada. 94 p
Communication dans un congrès
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MALDI-TOF profiling des fluides folliculaires de diverses espèces de mammifères29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.133
Communication dans un congrès
hal-01019051v1
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MALDI-TOF profiling of follicular fluids from various mammalian species.29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans, France. 256 p
Communication dans un congrès
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Differential and quantitative analysis of bovine cumulus cells proteomes in relation to developmental potential of enclosed oocyte29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Sep 2012, Orléans, France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-02745234v1
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Profiling MALDI-TOF de cellules entières et identification de biomarqueurs de la qualité ovocytaire par Top Down29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.100
Communication dans un congrès
hal-02749864v1
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Intact cell MALDI-TOF mass spectrometry and top-down proteomic to identify biomarkers29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). PALAISEAU, FRA., Sep 2012, Orléans, France. pp.69
Communication dans un congrès
hal-02744407v1
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Top-down proteomic strategy to identify oocyte quality biomarkers revealed by intact cells MALDI-TOF profiling.29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). Orléans, FRA., Sep 2012, Orléans, France. 256 p
Communication dans un congrès
hal-02745646v1
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Transcript and protein stockpiles, lipid content and ultrastructure of bovine oocytes enclosed or not within cumulus cells are differently affected by in vitro maturation: implications for developmental competence17. International Congress on Animal Reproduction, Society for the Study of Reproduction (SSR). Labo/service de l'auteur, USA., Jul 2012, Vancouver, Canada. 613 p
Communication dans un congrès
hal-02745228v1
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Analyses différentielles et quantitatives des protéomes de cellules de cumulus bovines en relation avec la compétence de l'ovocyte au développement29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP), Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique (SFEAP). FRA., Oct 2012, Rouen, France. pp.136
Communication dans un congrès
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Protéomique par Intact Cells Maldi-Tof Mass Spectrometry sur cumulus humain. Une aide à la décision pour le transfert mono-embryonnaire en Assistance Médicale à la Procréation ?Demi-journée scientifique : La protéomique et Métabolomique au Service de la Recherche Biomédicale, Groupement de Moyens Scientifiques et Techniques (GMSTT). Labo/service de l'auteur, Tours, FRA., Jun 2011, Tours, France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-02804624v1
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Proteomic ICM-MS profiling of single bovine oocytes and surrounding cumulus cells as a novel approach to access potential biomarkers of oocyte quality4. General Meeting of GEMINI, Sep 2011, Gijon, Spain
Communication dans un congrès
hal-02748353v1
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Differences of developmental potential, transcriptome, proteome and ultrastructure between cumulus denuded and cumulus enclosed bovine oocytes after in vitro maturationGEMINI Group III Workshop, May 2011, Jerusalem, Israel
Communication dans un congrès
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From single cell MALDI-TOF profiling to protein identification in mammalian egg: integrative approach to study the oocyte qualityCongrès Français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP), Sep 2011, Avignon, France
Communication dans un congrès
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Marqueurs protéiques de la qualité de l'ovocyte identifiés dans les cellules de cumulus par la spectrométrie de masse MALDI-TOF (ICM-MS). Une aide à la décision pour le transfert mono-embryonnaire en Assistance Médicale à la Procréation ?Axe Ovocyte et Développement, Ecole Nationale Vétérinaire (ENV). Labo/service de l'auteur, Maisons Alfort, FRA., Jul 2011, Maisons Alfort, France
Communication dans un congrès
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Single cell MALDI-TOF mass spectrometry analysis: mammalian oocyte profiling could reflect its quality10. World Congress HUPO 2011, Sep 2011, Genève, Switzerland. 1 p
Communication dans un congrès
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Analyse protéomique du cumulus humain : une approche indirecte de la viabilité de l’embryon23. Colloque Biotechnocentre, Oct 2010, Seillac, France. 1 p
Communication dans un congrès
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ICM-MS profiling of cumulus cells as a non-invasive method to access potential markers of oocyte maturation in bovine, equine and humanCongrès de Spectrométrie de Masse et Analyse Protéomique, Sep 2009, Dijon, France. n.p
Communication dans un congrès
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Recherche de marqueurs de la maturation méiotique et de la qualité des gamètes femelles bovines, par ICM-MS, à partir de l'ovocyte unique22. Colloque Biotechnocentre, Oct 2009, Seillac, France
Communication dans un congrès
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Approches non invasives de l'embryon : protéomique, métabolomique, dialogue ovocyte-cumulus14. Journées Nationales de la FFER, Nov 2009, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès
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Recherche de biomarqueurs de la maturation ovocytaire par spectrométrie de masse sur cellules folliculaires entières : apport d'une analyse comparative multi-espèces22. Colloque Biotechnocentre, Oct 2009, Seillac, France
Communication dans un congrès
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Mammalian single cell analysis: Intact oocyte MALDI-TOF mass spectrometry to display biomarkers25. Congrès de la Société d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique, Oct 2008, Tours, France
Communication dans un congrès
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Plateforme PAIB2 : Dossier de labellisation[0] 2013
Rapport
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