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Valérie LABAS

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Identifiants chercheurs

Présentation

Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI). J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa). Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics). En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up). Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques : 1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ; 2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ; 3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ; 4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI). I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled). My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics). I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project). To carry out these projects, I use different analytical strategies: 1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence; 2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections; 3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and 4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.

Publications

sebastien-elis

Metabolic exchanges between the oocyte and its environment: focus on lipids

Svetlana Uzbekova , Priscila Silvana Bertevello , Rozenn Dalbies-Tran , Sebastien Elis , Valerie Labas
Reproduction, Fertility and Development, 2022, 34 (2), pp.1-26. ⟨10.1071/RD21249⟩
Article dans une revue hal-03457344v1
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Effects of a n-3 polyunsaturated fatty acid-enriched diet on embryo production in dairy cows

Sandrine Freret , Mouhamad Oseikria , Daniel Le Bourhis , Alice Desmarchais , Eric Briant
Reproduction -Cambridge- Supplement-, 2019, 158 (1), pp.71-83. ⟨10.1530/REP-18-0644⟩
Article dans une revue hal-02623225v1
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Lipid Identification and Transcriptional Analysis of Controlling Enzymes in Bovine Ovarian Follicle

Priscila Bertevello , Ana-Paula Teixeira-Mechin , Alexandre Seyer , Anais Carvalho , Valérie Labas
International Journal of Molecular Sciences, 2018, 19 (10), pp.3261. ⟨10.3390/ijms19103261⟩
Article dans une revue hal-02628741v1
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Docosahexaenoic acid mechanisms of action on the bovine oocyte-cumulus complex

Sébastien Elis , Mouhamad Oseikria , Anais Vitorino Carvalho , Priscila Silvana Bertevello , Emilie Corbin
Journal of Ovarian Research, 2017, 10 (1), pp.1-14. ⟨10.1186/s13048-017-0370-z⟩
Article dans une revue hal-02620045v1

Effect of a long-chain n-3 polyunsaturated fatty acid enriched diet on adipose tissue lipid profiles and gene expression in Holstein dairy cows

Sébastien Elis , Alice Desmarchais , Sandrine Freret , Virginie Maillard , Valérie Labas
Journal of Dairy Science, 2016, 99 (12), pp.10109-10127. ⟨10.3168/jds.2016-11052⟩
Article dans une revue hal-01594517v1
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MALDI Mass Spectrometry Imaging of lipids and gene expression reveals differences in fatty acid metabolism between follicular compartments in porcine ovaries

Svetlana Uzbekova , Sébastien Elis , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Alice Desmarchais , Virginie Maillard
Biology, 2015, 4 (1), pp.216-236. ⟨10.3390/biology4010216⟩
Article dans une revue hal-02630020v1

Fatty acid synthesis and oxidation in cumulus cells support oocyte maturation in bovine

Laura Sanchez-Lazo , Daphné Brisard , Sébastien Elis , Virginie Maillard , Rustem Uzbekov
Molecular Endocrinology -Baltimore-, 2014, 28 (9), pp.1502-1521. ⟨10.1210/me.2014-1049⟩
Article dans une revue hal-01129856v1
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Lipidomique de l’ovaire

Priscila Bertevello , Valérie Labas , Ana Paula Teixeira , Virginie Maillard , Sébastien Elis
Journées d'Animation Scientifique du département Phase, Apr 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02737816v1
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Comparison of lipid profiles and gene expression in granulosa and cumulus cells in bovine

Priscila Bertevello , Charles Banliat , Ana-Paula Teixeira-Mechin , Sébastien Elis , Virginie Maillard
33. Annual Meeting of the European Embryo Transfer Association (AETE), Association Européenne de Transfert Embryonnaire - European Embryo Transfer Association (AETE). FRA., Sep 2017, Bath, United Kingdom. 541 p
Communication dans un congrès hal-01605433v1

Lipid metabolism and female reproduction: role at the ovary level

Virginie Maillard , Sébastien Elis , Sandrine Freret , Valérie Labas , Ana-Paula Teixeira-Gomes
1 Journées du GdR 3606 Repro, Université de Haute Bretagne ( Rennes 2 ) (UR 2). Rennes, FRA., Apr 2015, Rennes, France. 105 p
Communication dans un congrès hal-02739043v1
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MALDI-TOF mass spectrometry analysis of lipids in single bovine oocytes during IVM

Priscila Bertevello , Olfa Ghazouani , Charles Banliat , Sébastien Elis , Ana-Paula Teixeira-Gomes
32. Scientific meeting of the AETE, Sep 2016, Barcelone, Spain. Brazilian College of Animal Reproduction, Animal Reproduction, 13 (3), 2016, 32nd Scientific meeting of the AETE
Poster de conférence hal-02740053v1

Effects of a long chain n-3 PUFA-enriched diet on production, metabolic and reproduction variables, on adipose tissue lipid profiles and gene expression in Holstein dairy cows

Sébastien Elis , Alice Desmarchais , Sandrine Freret , Virginie Maillard , Valérie Labas
18th International Congress on Animal Reproduction (ICAR), Jun 2016, Tours, France. 676 p., 2016, 18th International Congress on Animal Reproduction (ICAR)
Poster de conférence hal-02739979v1
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Mass spectrometry imaging of lipids reveals the differences in fatty acid metabolism between ovarian and follicular compartments in porcine, bovine and ovine ovaries

Svetlana Uzbekova , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Sébastien Elis , Alice Desmarchais , Virginie Maillard
1 Journées du GdR 3606 Repro, Apr 2015, Rennes, France. 105 p., 2015, 1ères Journées Scientifiques du GdR Repro
Poster de conférence hal-02742916v1

Analyse lipidomique par Imagerie MALDI de tissus ovariens et ICM-MS de cellules folliculaires pour la recherche de marqueurs de qualité ovocytaire

Svetlana Uzbekova , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Sébastien Elis , Alice Desmarchais , Virginie Maillard
Congrès français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP 2015), Sep 2015, Ajaccio, France. , 2015
Poster de conférence hal-02741888v1