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Valérie LABAS

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Identifiants chercheurs

Présentation

Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI). J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa). Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics). En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up). Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques : 1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ; 2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ; 3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ; 4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI). I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled). My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics). I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project). To carry out these projects, I use different analytical strategies: 1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence; 2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections; 3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and 4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.

Publications

nicolas-guyot
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Multifaceted roles of the egg perivitelline layer in avian reproduction: Functional insights from the proteomes of chicken egg inner and outer sublayers

Mégane Brégeon , Daniel Tomas , Benoît Bernay , Céline Zatylny-Gaudin , Sonia Georgeault
Journal of Proteomics, 2022, 258, pp.104489. ⟨10.1016/j.jprot.2022.104489⟩
Article dans une revue hal-03541518v1
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Three‐dimensional structures of avian beta‐microseminoproteins: insight from the chicken egg‐specific beta‐microseminoprotein 3 paralog

Franck Coste , Thierry Moreau , Valérie Labas , Magali Chessé , Mégane Brégeon
FEBS Open Bio, 2021, 11 (6), pp.1739-1756. ⟨10.1002/2211-5463.13166⟩
Article dans une revue hal-03216446v1
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Structure, function, and evolution of Gga -AvBD11, the archetype of the structural avian-double-β-defensin family

Nicolas Guyot , Sascha Trapp , Herve Meudal , Sophie Iochmann , Anne Silvestre
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2020, 117 (1), pp.337-345. ⟨10.1073/pnas.1912941117⟩
Article dans une revue hal-02522250v1
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The unique features of proteins depicting the chicken amniotic fluid

Mylène da Silva , Clara Dombre , Aurélien Brionne , Philippe Monget , Magali Chessé
Molecular and Cellular Proteomics, 2019, 18 (3), pp.S174-S190. ⟨10.1074/mcp.RA117.000459⟩
Article dans une revue hal-02626106v1
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Characterization of egg white antibacterial properties during the first half of incubation: A comparative study between embryonated and unfertilized eggs

Nicolas Guyot , Sophie Réhault-Godbert , Cindy Slugocki , Grégoire Harichaux , Valérie Labas
Poultry Science, 2016, 95, pp.2956-2970. ⟨10.3382/ps/pew271⟩
Article dans une revue hal-02632352v1
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Proteomic analysis of egg white heparin-binding proteins: towards the identification of natural antibacterial molecules

Nicolas Guyot , Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Magali Chessé , Jean-Claude Poirier
Scientific Reports, 2016, 6, ⟨10.1038/srep27974⟩
Article dans une revue hal-01409312v1

The family secrets of avian egg-specific ovalbumin and its related proteins Y and X

Mylène da Silva , Stéphane Beauclercq , Grégoire Harichaux , Valérie Labas , Nicolas Guyot
Biology of Reproduction, 2015, 93 (3), pp.1-7. ⟨10.1095/biolreprod.115.130856⟩
Article dans une revue hal-02638208v1
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Three-dimensional NMR Structure of Hen Egg Gallin (Chicken Ovodefensin) Reveals a New Variation of the β-Defensin Fold

Virginie Hervé , Hervé Meudal , Valérie Labas , Sophie Réhault-Godbert , Joël Gautron
Journal of Biological Physics and Chemistry, 2014, 289 (10), pp.7211-20. ⟨10.1074/jbc.M113.507046⟩
Article dans une revue hal-01118312v1
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Proteome and biological functions of inner and outer perivitelline layers in the chicken egg

Mégane Brégeon , Daniel Tomas , Benoit Bernay , Magali Chessé , Céline Zatylny-Gaudin
26. World’s Poultry Congress, Aug 2022, Paris, France. pp.ID: 1676
Communication dans un congrès hal-03750662v1

Gga-AvBD11, the archetype of a new structural family of defensins

H. Meudal , Nicolas Guyot , K. Loth , G. Jousset , S. Trapp
21e réunion du Groupe Français des Peptides et des Protéines (GFPP21), May 2019, Amboise, France
Communication dans un congrès hal-02892790v1

Proteomic study of inner and outer hen egg vitelline membranes: insights into the biological functions of vitelline membrane layers

Mégane Brégeon , B. Bernay , Valérie Labas , Magali Chessé , Céline Zatylny-Gaudin
Combined Worshop of "Fundamental Physiology and Perinatal development in Poultry" and "Incubation and Fertility Research Group", Aug 2019, Tours, France
Communication dans un congrès hal-03624410v1

1ère structure 3D d’une défensine à double motif β-défensine, Gga-AvBD11 du poulet Gallus gallus, et explorations fonctionnelles

Nicolas Guyot , Hervé Meudal , Karine Loth , Guillaume Jousset , Anne Silvestre
5es Journées GDR MuFoPAM, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). FRA., Oct 2018, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02788993v1

Egg ovalbumins revisited: investigating the specificities of ovalbumin, ovalbumin-related protein X and ovalbumin-related protein Y

Sophie Réhault-Godbert , Mylène da Silva , Stéphane Beauclercq , Grégoire Harichaux , Valérie Labas
Congres Eggmeat, May 2015, Nantes, France
Communication dans un congrès hal-02800219v1

L’ovalbumin-related protein X (OVAX) est une protéine apparentée à l'ovalbumine qui possède des activités antibactériennes

Sophie Réhault-Godbert , Valérie Labas , Magali Chessé , Joël Gautron , Franck Coste
11.Journées de la Recherche Avicole et Palmidèdes à Foie Gras, Apr 2015, Tours, France
Communication dans un congrès hal-02740850v1

Insights into the structure-function relationship of egg defensins

Nicolas Guyot , Virginie Hervé , Hervé Meudal , Jean-Baptiste Madinier , Valérie Labas
XIVth European Poultry Conference, World's Poultry Science Association (WPSA). INT., Jun 2014, Stavanger, Norway
Communication dans un congrès hal-02743609v1

Functional and structural characterization of egg defensins

Nicolas Guyot , Virginie Herve , Hervé Meudal , Jean-Baptiste Madinier , Valérie Labas
Banff Egg Forum, Jun 2014, Wroclaw, Poland. 12 diapositives
Communication dans un congrès hal-02797356v1

Possible functional clues for chicken egg VMO1 protein are provided by its gene expression pattern and the identification of conserved regions in avian and non­avian homologues

Océane Hervé , Magali Chessé , Valérie Labas , Thierry Moreau , Nicolas Guyot
47. FEBS Congress, Jul 2023, Tours, France
Poster de conférence hal-04183071v1

Etude protéomique et fonctionnelle des couches interne et externe de la membrane vitelline de l’œuf de poule

Mégane Brégeon , Benoit Bernay , Valérie Labas , Magali Chessé , Céline Zatylny-Gaudin
32. Colloque Biotechnocentre, Oct 2019, Seillac, France
Poster de conférence hal-03624477v1

Analyse protéomique des couches interne et externe de la membrane vitelline de l’œuf de poule (Gallus gallus)

Mégane Brégeon , Valérie Labas , Sophie Réhault-Godbert , Nicolas Guyot
31. Colloque Biotechnocentre, Oct 2018, Seillac, France
Poster de conférence hal-03624450v1

Identification de la β-défensine 11 aviaire (AvBD11) dans l’oeuf de cane (Anas platyrhynchos)

Henri Granel , Grégoire Harichaux , Valérie Labas , Joël Gautron , Yves Y. Nys
2. Journées du GDR MuFoPAM « MultiFonction des Peptides antimicrobiens », Oct 2015, Orléans, France. , 2015
Poster de conférence hal-02800807v1

Gallin is a chicken egg beta-defensin with a narrow antibacterial spectrum

Virginie Hervé , Nicolas Guyot , H. Meudal , Valérie Labas , Sophie Réhault-Godbert
4. International Symposium on Antimicrobial Peptides, Jun 2014, Lorient, France. 1 p., 2014
Poster de conférence hal-02793322v1