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Valérie LABAS

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Identifiants chercheurs

Présentation

Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI). J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa). Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics). En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up). Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques : 1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ; 2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ; 3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ; 4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI). I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled). My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics). I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project). To carry out these projects, I use different analytical strategies: 1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence; 2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections; 3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and 4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.

Publications

marie-saint-dizier
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The proteomic analysis of bovine embryos developed in vivo or in vitro reveals the contribution of the maternal environment to early embryo

Charles Banliat , Coline Mahé , R Lavigne , Emmanuelle Com , Charles Pineau
BMC Genomics, 2022, 23 (1), pp.839. ⟨10.1186/s12864-022-09076-5⟩
Article dans une revue hal-03923178v1
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Dynamic changes in the proteome of early bovine embryos developed in vivo

Charles Banliat , Coline Mahe , Régis Lavigne , Emmanuelle Com , Charles Pineau
Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2022, 10, pp.1-16. ⟨10.3389/fcell.2022.863700⟩
Article dans une revue hal-03658017v1
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Use of MALDI-TOF mass spectrometry to explore the peptidome and proteome of in-vitro produced bovine embryos pre-exposed to oviduct fluid

Charles Banliat , Valérie Labas , Daniel Tomas , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Benoît Guyonnet
Reproductive biology, 2021, 21 (4), pp.1-5. ⟨10.1016/j.repbio.2021.100545⟩
Article dans une revue hal-03511989v1
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Identification of 56 Proteins Involved in Embryo–Maternal Interactions in the Bovine Oviduct

Charles Banliat , Guillaume Tsikis , Valérie Labas , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Emmanuelle Com
International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21 (2), 17 p. ⟨10.3390/ijms21020466⟩
Article dans une revue hal-02448383v1
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Progesterone induces sperm release from oviductal epithelial cells by modifying sperm proteomics, lipidomics and membrane fluidity

Marina Ramal-Sanchez , Nicola Bernabo , Guillaume Tsikis , Marie-Claire Blache , Valérie Labas
Molecular and Cellular Endocrinology, 2020, 504, pp.1-10. ⟨10.1016/j.mce.2020.110723⟩
Article dans une revue hal-03151338v1
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Oviduct Fluid Extracellular Vesicles Change the Phospholipid Composition of Bovine Embryos Developed In Vitro

Charles Banliat , Daniel Le Bourhis , Ophélie Bernardi , Daniel Tomas , Valérie Labas
International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21 (15), pp.1-13. ⟨10.3390/ijms21155326⟩
Article dans une revue hal-03151188v1

Intraoviductal concentrations of steroid hormones during in vitro culture changed phospholipid profiles and cryotolerance of bovine embryos

Charles Banliat , Florine Dubuisson , Emilie Corbin , Julie Beurois , Daniel Tomas
Molecular Reproduction and Development, 2019, 86 (6), pp.661 - 672. ⟨10.1002/mrd.23144⟩
Article dans une revue hal-02628367v1
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Stage-dependent changes in oviductal phospholipid profiles throughout the estrous cycle in cattle

Charles Banliat , Daniel Tomas , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Svetlana Uzbekova , Benoît Guyonnet
Theriogenology, 2019, 135, pp.65-72. ⟨10.1016/j.theriogenology.2019.06.011⟩
Article dans une revue hal-02627338v1
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Graphene oxide: A glimmer of hope for Assisted Reproductive Technology

Marina Ramal-Sanchez , Luca Valbonetti , Guillaume Tsikis , Florine Dubuisson , Marie-Claire Blache
Carbon, 2019, 150, pp.518 - 530. ⟨10.1016/j.carbon.2019.05.055⟩
Article dans une revue hal-02619027v1

Identification by proteomics of oviductal sperm-interacting proteins

Julie Lamy , Perrine Nogues , Lucie Combes-Soia , Guillaume Tsikis , Valérie Labas
Reproduction -Cambridge- Supplement-, 2018, 155 (5), pp.457-466. ⟨10.1530/REP-17-0712⟩
Article dans une revue hal-02625186v1

Regulation of the bovine oviductal fluid proteome

Julie Lamy , Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Guillaume Tsikis , Pascal Mermillod
Reproduction, 2016, 152 (6), pp.629-644. ⟨10.1530/REP-16-0397⟩
Article dans une revue hal-01406211v1

Progesterone plays a critical role in canine oocyte maturation and fertilization

Karine Reynaud , Marie Saint-Dizier , Muhammad Zahid Tahir , Tiphaine Havard , Grégoire Harichaux
Biology of Reproduction, 2015, 93 (4), ⟨10.1095/biolreprod.115.130955⟩
Article dans une revue hal-01225259v1

Differential and quantitative analysis of dog oviductal fluid

Karine Reynaud , Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Sandra Thoumire , Muhammad Zahid Tahir
38. Annual Conference of the International Embryo Transfer Society, Jan 2012, Phoenix, United States. ⟨10.1071/RDv24n1Ab69⟩
Communication dans un congrès hal-01189591v1

Differential and quantitative analysis of dog oviductal fluid

Grégoire Harichaux , Valérie Labas , Marie Saint-Dizier , Sylvie Chastant-Maillard , Karine Reynaud
Congrès Français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP), Sep 2011, Avignon, France. pp.156-156
Communication dans un congrès hal-01019311v1

High throughput proteomic analysis of bovine oviductal fluid during estrous cycle

Julie Lamy , Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Guillaume Tsikis , Pascal Mermillod
18th International Congress on Animal Reproduction (ICAR), Jun 2016, Tours, France. 676 p., 2016, 18th International Congress on Animal Reproduction (ICAR)
Poster de conférence hal-02740733v1

Proteomic changes in the oviductal fluid at the time of meiosis resumption and fertilization following a progesterone receptor antagonist treatment in the bitch

Grégoire Harichaux , Karine K. Reynaud , Valérie Labas , Sandra S. Thoumire , Muhammad Zahid Tahir
7. European Proteomics Association Eupa 2013, Oct 2013, Saint Malo, France. 2013, Eupa 2013. Scientific Meeting
Poster de conférence hal-02748808v1