Accéder directement au contenu

Valérie LABAS

14
Documents
Identifiants chercheurs

Présentation

Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI). J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa). Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics). En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up). Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques : 1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ; 2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ; 3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ; 4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI). I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled). My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics). I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project). To carry out these projects, I use different analytical strategies: 1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence; 2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections; 3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and 4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.

Publications

joellevinh

Platelet type III collagen binding protein (TIIICBP) presents high biochemical and functional similarities with kindlin-3.

Ibtissem Djaafri , Pascal Maurice , Valérie Labas , Joelle Vinh , Monique Lemesle
Biochimie, 2012, 94 (2), pp.416-26. ⟨10.1016/j.biochi.2011.08.009⟩
Article dans une revue hal-00858161v1

Platelet type III collagen binding protein (TIIICBP) presents high biochemical and functional similarities with kindlin-3

Ibtissem Djaafri , Pascal Maurice , Valérie Labas , Joelle Vinh , Monique Lemesle
Biochimie, 2012, 94 (2), pp.416-426. ⟨10.1016/j.biochi.2011.08.009⟩
Article dans une revue hal-02347760v1

Proteomic analysis of NME1/NDPK A null mouse liver: evidence for a post-translational regulation of annexin IV and EF-1Bα

Arnaud Bruneel , Dominique Wendum , Valérie Labas , Odile Mulner-Lorillon , Joelle Vinh
Archiv für Experimentelle Pathologie und Pharmakologie, 2011, 384 (4), pp.407-419. ⟨10.1007/s00210-011-0639-5⟩
Article dans une revue hal-00593825v1

Polyadenylation of a functional mRNA controls gene expression in Escherichia coli.

Géraldine Joanny , Jacques Le Derout , Dominique Bréchemier-Baey , Valérie Labas , Joelle Vinh
Nucleic Acids Research, 2007, 35 (8), pp.2494-502. ⟨10.1093/nar/gkm120⟩
Article dans une revue hal-00196100v1

Polyadenylation of a functional mRNA controls gene expression in E. coli.

G. Joanny , Le Derout J. , Valérie Labas , J. Vinh , P. Régnier
Nucleic Acids Research, 2007, 35, pp.2494-2502
Article dans une revue hal-00161602v1

Analysis of the dynamic Bacillus subtilis Ser/Thr/Tyr phosphoproteome implicated in a wide variety of cellular processes.

Alain Lévine , Françoise Vannier , Cédric Absalon , Lauriane Kuhn , Peter Jackson
Proteomics, 2006, 6 (7), pp.2157-73. ⟨10.1002/pmic.200500352⟩
Article dans une revue hal-00196143v1

Polycalin (chlorophyllid A binding protein): a novel, very large fluorescent lipocalin from the midgut of the domestic silkworm Bombyx mori L.

Bernard Mauchamp , Corinne Royer , Annie Garel , Audrey Jalabert , Martine da Rocha
Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2006, 36 (8), pp.623-33. ⟨10.1016/j.ibmb.2006.05.006⟩
Article dans une revue hal-00196115v1

PDMS-based microfluidics for proteomic analysis.

Arash Dodge , Edouard Brunet , Suelin Chen , Jacques Goulpeau , Valérie Labas
Analyst, 2006, 131 (10), pp.1122-8. ⟨10.1039/b606394b⟩
Article dans une revue hal-00196106v1

Polycalin (chlorophyllid A binding protein): a novel, very large fluorescent lipocalin from the midgut of the domestic silkworm Bombyx mori L

B. Mauchamp , C. Royer , A. Garel , A. Jalabert , M. da Rocha
Insect Biochemistry and Molecular Biology, 2006, 36, pp.623-633
Article dans une revue hal-00391457v1

Proteomics of human umbilical vein endothelial cells applied to etoposide-induced apoptosis

Arnaud Bruneel , Valérie Labas , Agnès Mailloux , Sanjiv Sharma , Nicolas Royer
Proteomics, 2005, 5 (15), pp.3876 - 3884. ⟨10.1002/pmic.200401239⟩
Article dans une revue hal-01636916v1

Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2/B1 identified as an autoantigen in autoimmune hepatitis by proteome analysis

Stéphanie Huguet , Valérie Labas , Jean-Charles Duclos-Vallée , Arnaud Bruneel , Joelle Vinh
Proteomics, 2004, 4 (5), pp.1341 - 1345. ⟨10.1002/pmic.200300757⟩
Article dans une revue hal-01636940v1
Image document

Fe$^{2+}$ -catalyzed oxidative cleavages of Ca$^{2+}$ -ATPase reveal novel features of its pumping mechanism

Cédric Montigny , Christine Jaxel , Alla Shainskaya , Joelle Vinh , Valérie Labas
Journal of Biological Chemistry, 2004, 279 (42), pp.43971 - 43981. ⟨10.1074/jbc.M407142200⟩
Article dans une revue hal-01636936v1

Proteomic study of human umbilical vein endothelial cells in culture

Arnaud Bruneel , Valérie Labas , Agnès Mailloux , Sanjiv Sharma , Joelle Vinh
Proteomics, 2003, 3 (5), pp.714 - 723. ⟨10.1002/pmic.200300409⟩
Article dans une revue hal-01637026v1

Novel Target Sequences for Pax-6 in the Brain-specific Activating Regions of the Rat Aldolase C Gene

Henriette Skala-Rubinson , Joelle Vinh , Valérie Labas , Axel Kahn , Françoise Phan Dinh Tuy
Journal of Biological Chemistry, 2002, 277 (49), pp.47190 - 47196. ⟨10.1074/jbc.M209349200⟩
Article dans une revue hal-01637043v1