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Valérie LABAS

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Identifiants chercheurs

Présentation

Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI). J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa). Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics). En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up). Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques : 1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ; 2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ; 3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ; 4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI). I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled). My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics). I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project). To carry out these projects, I use different analytical strategies: 1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence; 2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections; 3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and 4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.

Publications

daniel-tomas
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Extracellular Vesicles Contribute to the Difference in Lipid Composition between Ovarian Follicles of Different Size Revealed by Mass Spectrometry Imaging

Emilie Maugrion , Ekaterina N Shedova , Rustem Uzbekov , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Valérie Labas
Metabolites, 2023, 13 (9), pp.1001. ⟨10.3390/metabo13091001⟩
Article dans une revue hal-04214124v1
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Multifaceted roles of the egg perivitelline layer in avian reproduction: Functional insights from the proteomes of chicken egg inner and outer sublayers

Mégane Brégeon , Daniel Tomas , Benoît Bernay , Céline Zatylny-Gaudin , Sonia Georgeault
Journal of Proteomics, 2022, 258, pp.104489. ⟨10.1016/j.jprot.2022.104489⟩
Article dans une revue hal-03541518v1
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Use of MALDI-TOF mass spectrometry to explore the peptidome and proteome of in-vitro produced bovine embryos pre-exposed to oviduct fluid

Charles Banliat , Valérie Labas , Daniel Tomas , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Benoît Guyonnet
Reproductive biology, 2021, 21 (4), pp.1-5. ⟨10.1016/j.repbio.2021.100545⟩
Article dans une revue hal-03511989v1
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Proteomic Changes Associated With Sperm Fertilizing Ability in Meat-Type Roosters

Anais Vitorino Carvalho , Laura Soler , Aurore Thélie , Isabelle Grasseau , Luiz Cordeiro
Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2021, 9, 15 p. ⟨10.3389/fcell.2021.655866⟩
Article dans une revue hal-03213124v1

Acute pathophysiological myocardial changes following intra-cardiac electrical shocks using a proteomic approach in a sheep model

Alexandre Bodin , Valérie Labas , Arnaud Bisson , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Hélène Blasco
Scientific Reports, 2020, 10 (1), 12 p. ⟨10.1038/s41598-020-77346-x⟩
Article dans une revue hal-03151051v1
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Oviduct Fluid Extracellular Vesicles Change the Phospholipid Composition of Bovine Embryos Developed In Vitro

Charles Banliat , Daniel Le Bourhis , Ophélie Bernardi , Daniel Tomas , Valérie Labas
International Journal of Molecular Sciences, 2020, 21 (15), pp.1-13. ⟨10.3390/ijms21155326⟩
Article dans une revue hal-03151188v1

Intraoviductal concentrations of steroid hormones during in vitro culture changed phospholipid profiles and cryotolerance of bovine embryos

Charles Banliat , Florine Dubuisson , Emilie Corbin , Julie Beurois , Daniel Tomas
Molecular Reproduction and Development, 2019, 86 (6), pp.661 - 672. ⟨10.1002/mrd.23144⟩
Article dans une revue hal-02628367v1
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Stage-dependent changes in oviductal phospholipid profiles throughout the estrous cycle in cattle

Charles Banliat , Daniel Tomas , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Svetlana Uzbekova , Benoît Guyonnet
Theriogenology, 2019, 135, pp.65-72. ⟨10.1016/j.theriogenology.2019.06.011⟩
Article dans une revue hal-02627338v1

Characterization of large and small extracellular vesicles from follicular fluid in cow

Svetlana Uzbekova , Emilie Maugrion , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Daniel Tomas , Rustem Uzbekov
19th International Congress on Animal Reproduction, Jun 2022, Bologna, Italy. ICAR 2023 Abstract Book, T64, pp.124
Poster de conférence hal-04178127v1