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Valérie LABAS

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Identifiants chercheurs

Présentation

Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI). J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa). Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics). En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up). Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques : 1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ; 2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ; 3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ; 4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI). I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled). My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics). I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project). To carry out these projects, I use different analytical strategies: 1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence; 2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections; 3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and 4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.

Publications

christelle-hennequet-antier

Quantitative proteomics and bioinformatic analysis provide new insight into protein function during avian eggshell biomineralization

Pauline Marie , Valérie Labas , Aurélien Brionne , Grégoire Harichaux , Christelle Hennequet-Antier
Journal of Proteomics, 2015, 113, pp.178-193. ⟨10.1016/j.jprot.2014.09.024⟩
Article dans une revue hal-01129881v1
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Data set for the proteomic inventory and quantitative analysis of chicken eggshell matrix proteins during the primary events of eggshell mineralization and the active growth phase of calcification

Pauline Marie , Valérie Labas , Aurélien Brionne , Grégoire Harichaux , Christelle Hennequet-Antier
Data in Brief, 2015, 4, pp.430-436. ⟨10.1016/j.dib.2015.06.019⟩
Article dans une revue hal-01601560v1

Quantitative proteomics provides new insights into chicken eggshell matrix protein functions during the primary events of mineralisation and the active calcification phase

Pauline Marie , Valérie Labas , Aurélien Brionne , Grégoire Harichaux , Christelle Hennequet-Antier
Journal of Proteomics, 2015, 126, pp.140-154. ⟨10.1016/j.jprot.2015.05.034⟩
Article dans une revue hal-02638649v1

Data set for the proteomic inventory and quantitative analysis of chicken eggshell matrix proteins during the primary events of eggshell mineralization and the active growth phase of shell calcification

Pauline Marie , Valérie Labas , Aurélien Brionne , Grégoire Harichaux , Christelle Hennequet-Antier
Data in Brief, 2015, 4, pp.430-436. ⟨10.1016/j.dib.2015.06.019⟩
Article dans une revue hal-02629430v1
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Data set for the proteomic inventory and quantitative analysis of chicken uterine fluid during eggshell biomineralization

Pauline Marie , Valérie Labas , Aurélien Brionne , Grégoire Harichaux , Christelle Hennequet-Antier
Data in Brief, 2014, 1, pp.65-69. ⟨10.1016/j.dib.2014.09.006⟩
Article dans une revue hal-02630052v1
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French avian cryobank: development of reproductive biotechnologies based on primordial germ cells (PGCs) and investigation of the impact of in vitro steps on PGCs integrity and reproductive capacity

Marina Govoroun , Sabine Alves , Laura Soler-Vasco , Sophie Fouchécourt , Nadine Gérard
26è World's Poultry Congress,, May 2022, Webinar, France
Communication dans un congrès hal-04276115v1

Change in calcium carbonate mineralogy and in organic matrix proteins quantified by proteomic analysis during the early stages of egg shell mineralization in hens

Joël Gautron , Alejandro Rodriguez-Navarro , Pauline Marie , Valérie Labas , Nazaret Dominguez-Gasca
25. World's Poultry Congress 2016, World's Poultry Science Association (WPSA). INT., Sep 2016, Beijing, China
Communication dans un congrès hal-02742876v1

Formation de la coquille de l'oeuf de poule : présence d'une phase de carbonate de calcium amorphe et variation associées de protéines de la matrice organique lors de l'initiation de la minéralisation

Pauline Marie , Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Aurélien Brionne , Christelle Hennequet-Antier
11. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA. Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), FRA. World's Poultry Science Association (WPSA). Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse (INPT - ENSAT)., Mar 2015, Tours, France
Communication dans un congrès hal-02740279v1
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Avian eggshell formation: Presence of amorphous calcium carbonate associated with changes in some organic matrix proteins during initiation of mineralisation

Pauline Marie , Valérie Labas , Aurélien Brionne , Grégoire Harichaux , Christelle Hennequet-Antier
22. European Symposium on the Quality of Poultry Meat - 16. European Symposium on the Quality of Eggs and Egg Products, May 2015, Nantes, France
Communication dans un congrès hal-02738484v1
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Quantitative proteomics provides new insights into chicken eggshell matrix protein functions during pivotal stages of shell mineralization

Joël Gautron , Pauline Marie , Valérie Labas , Aurélien Brionne , Grégoire Harichaux
13. International Symposium on Biomineralization, Sep 2015, Granada, Spain. résumé 2 p
Communication dans un congrès hal-02738852v1

Oocytomics: combining transcriptomics and proteomics to understand post-transcriptional regulation in bovine oocytes

Rozenn Dalbies-Tran , Christelle Hennequet-Antier , Cédric Cabau , Leslie Angulo , Sylvain Auclair
1. International Symposium of Microgenomics, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Génétique Animale et Biologie Intégrative (1313)., May 2014, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02740352v1

Use of high-throughput methods to identify novel egg components

Joël Gautron , Vincent Jonchère , Christelle Hennequet-Antier , Cédric Cabau , Valérie Labas
25. Congrès de la Société d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique, Oct 2008, Tours, France
Communication dans un congrès hal-02751763v1

Eggshell mineralisation: relationship between in situ observations and organic matrix composition

Pauline Marie , Alejandro Rodriguez Navarro , Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Christelle Hennequet-Antier
14. European Poultry Conference, Jun 2014, Stavanger, Norway. WPSA, Branche Norvégienne, 2014, XIVth European Poultry Conference
Poster de conférence hal-02738844v1