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Valérie LABAS

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Identifiants chercheurs

Présentation

Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI). J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa). Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics). En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up). Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques : 1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ; 2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ; 3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ; 4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI). I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled). My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics). I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project). To carry out these projects, I use different analytical strategies: 1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence; 2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections; 3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and 4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.

Publications

aurelien-brionne
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Avian uterine fluid proteome: exosomes and biological processes potentially involved in sperm survival

Cindy Riou , Aurélien Brionne , Luiz-Augusto Cordeiro , Grégoire Harichaux , Audrey Gargaros-Ratajczak
Molecular Reproduction and Development, 2020, acceptée (4), Acceptée. ⟨10.1002/mrd.23333⟩
Article dans une revue hal-01605894v1

Proteomic analysis of uterine fluid of fertile and subfertile hens before and after insemination

Cindy Riou , Aurélien Brionne , Luiz Cordeiro , Grégoire Harichaux , Audrey Gargaros
Reproduction -Cambridge- Supplement-, 2019, 158 (4), pp.335-356. ⟨10.1530/REP-19-0079⟩
Article dans une revue hal-02622969v1
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The unique features of proteins depicting the chicken amniotic fluid

Mylène da Silva , Clara Dombre , Aurélien Brionne , Philippe Monget , Magali Chessé
Molecular and Cellular Proteomics, 2019, 18 (3), pp.S174-S190. ⟨10.1074/mcp.RA117.000459⟩
Article dans une revue hal-02626106v1
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Guinea fowl eggshell quantitative proteomics yield new findings related to its unique structural characteristics and superior mechanical properties

Nathalie Le Roy , Lucie Combes-Soia , Aurélien Brionne , Valérie Labas , Alejandro B. Rodriguez-Navarro
Journal of Proteomics, 2019, 209, ⟨10.1016/j.jprot.2019.103511⟩
Article dans une revue hal-02623244v1
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Data set for the proteomic inventory and quantitative analysis of chicken eggshell matrix proteins during the primary events of eggshell mineralization and the active growth phase of calcification

Pauline Marie , Valérie Labas , Aurélien Brionne , Grégoire Harichaux , Christelle Hennequet-Antier
Data in Brief, 2015, 4, pp.430-436. ⟨10.1016/j.dib.2015.06.019⟩
Article dans une revue hal-01601560v1

Data set for the proteomic inventory and quantitative analysis of chicken eggshell matrix proteins during the primary events of eggshell mineralization and the active growth phase of shell calcification

Pauline Marie , Valérie Labas , Aurélien Brionne , Grégoire Harichaux , Christelle Hennequet-Antier
Data in Brief, 2015, 4, pp.430-436. ⟨10.1016/j.dib.2015.06.019⟩
Article dans une revue hal-02629430v1

Quantitative proteomics provides new insights into chicken eggshell matrix protein functions during the primary events of mineralisation and the active calcification phase

Pauline Marie , Valérie Labas , Aurélien Brionne , Grégoire Harichaux , Christelle Hennequet-Antier
Journal of Proteomics, 2015, 126, pp.140-154. ⟨10.1016/j.jprot.2015.05.034⟩
Article dans une revue hal-02638649v1

Quantitative proteomics and bioinformatic analysis provide new insight into protein function during avian eggshell biomineralization

Pauline Marie , Valérie Labas , Aurélien Brionne , Grégoire Harichaux , Christelle Hennequet-Antier
Journal of Proteomics, 2015, 113, pp.178-193. ⟨10.1016/j.jprot.2014.09.024⟩
Article dans une revue hal-01129881v1
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Data set for the proteomic inventory and quantitative analysis of chicken uterine fluid during eggshell biomineralization

Pauline Marie , Valérie Labas , Aurélien Brionne , Grégoire Harichaux , Christelle Hennequet-Antier
Data in Brief, 2014, 1, pp.65-69. ⟨10.1016/j.dib.2014.09.006⟩
Article dans une revue hal-02630052v1
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Ovalbumin-related Protein X Is a Heparin-binding Ov-Serpin Exhibiting Antimicrobial Activities.

Sophie Réhault-Godbert , Valérie Labas , Emmanuelle Helloin , Virginie Hervé-Grépinet , Cindy Slugocki
Journal of Biological Chemistry, 2013, 288 (24), pp.17285-95. ⟨10.1074/jbc.M113.469759⟩
Article dans une revue hal-00845174v1
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French avian cryobank: development of reproductive biotechnologies based on primordial germ cells (PGCs) and investigation of the impact of in vitro steps on PGCs integrity and reproductive capacity

Marina Govoroun , Sabine Alves , Laura Soler-Vasco , Sophie Fouchécourt , Nadine Gérard
26è World's Poultry Congress,, May 2022, Webinar, France
Communication dans un congrès hal-04276115v1
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Guinea fowl eggshell structural organization and particular organice matrix protein patterns to decipher its exceptional biomechanical properties

Joël Gautron , Nathalie Le Roy , Aurélien Brionne , Valérie Labas , Lucie Combes Soia
Journées françaises de la biologie des tissus minéralisés, SFBTM, Jun 2019, Boulogne sur mer, France
Communication dans un congrès hal-03254659v1
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Guinea fowl eggshell structural organization and particular organic matrix protein patterns to decipher its exceptional biomechanical properties

Nathalie Le Roy , Lucie Combes-Soia , Aurélien Brionne , Valérie Labas , Alejandro Rodriguez-Navarro
XVIII European on the quality of eggs and egg products and XXIV European symposium on the quality of poultry meat symposium, Jun 2019, Cezme, Turkey
Communication dans un congrès hal-02734825v1

About the avian UF proteome: exosomes significance and biological processes in regard to eggshell mineralization, immunity and reproduction

Cindy Riou , Aurélien Brionne , Luiz Cordeiro , Grégoire Harichaux , Audrey Gargaros
25. World's Poultry Congress 2016, World's Poultry Science Association (WPSA). INT., Sep 2016, Beijing, China
Communication dans un congrès hal-02739212v1

Change in calcium carbonate mineralogy and in organic matrix proteins quantified by proteomic analysis during the early stages of egg shell mineralization in hens

Joël Gautron , Alejandro Rodriguez-Navarro , Pauline Marie , Valérie Labas , Nazaret Dominguez-Gasca
25. World's Poultry Congress 2016, World's Poultry Science Association (WPSA). INT., Sep 2016, Beijing, China
Communication dans un congrès hal-02742876v1
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Avian eggshell formation: Presence of amorphous calcium carbonate associated with changes in some organic matrix proteins during initiation of mineralisation

Pauline Marie , Valérie Labas , Aurélien Brionne , Grégoire Harichaux , Christelle Hennequet-Antier
22. European Symposium on the Quality of Poultry Meat - 16. European Symposium on the Quality of Eggs and Egg Products, May 2015, Nantes, France
Communication dans un congrès hal-02738484v1
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Quantitative proteomics provides new insights into chicken eggshell matrix protein functions during pivotal stages of shell mineralization

Joël Gautron , Pauline Marie , Valérie Labas , Aurélien Brionne , Grégoire Harichaux
13. International Symposium on Biomineralization, Sep 2015, Granada, Spain. résumé 2 p
Communication dans un congrès hal-02738852v1

Sperm storage in female reproductive tract: study of molecules involved

Cindy Riou , Audrey Gargaros , Grégoire Harichaux , Aurélien Brionne , Joël Gautron
41. Annual Conference of the International Embryo Transfer Society, International Embryo Transfer Society (IETS). USA., Jan 2015, Versailles, France
Communication dans un congrès hal-02741083v1

Formation de la coquille de l'oeuf de poule : présence d'une phase de carbonate de calcium amorphe et variation associées de protéines de la matrice organique lors de l'initiation de la minéralisation

Pauline Marie , Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Aurélien Brionne , Christelle Hennequet-Antier
11. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA. Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), FRA. World's Poultry Science Association (WPSA). Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse (INPT - ENSAT)., Mar 2015, Tours, France
Communication dans un congrès hal-02740279v1

Sperm storage in female reproductive tract: study of molecules involved

Cindy Riou , Audrey Gargaros , Grégoire Harichaux , Aurélien Brionne , Joël Gautron
12. International Symposium on Spermatology, Association for Animal Andrology. AUS., Aug 2014, Newcastle, Australia
Communication dans un congrès hal-02738618v1

Quantification and characterization of proteins secreted by uterus during initiation, growth and arrest of eggshell biomineralisation

Pauline Marie , Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Aurélien Brionne , Yves Y. Nys
15. European Symposium on the Qaulity og Eggs and Egg Products. 21. European Symposium on the Quality of Poultry Meat, Sep 2013, Bergamo, Italy. 124 p
Communication dans un congrès hal-02747442v1

Characterization and quantification of proteins secreted by uterus during initiation, growth and arrest of eggshell biomineralisation

Pauline Marie , Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Aurélien Brionne , Yves Y. Nys
12. International Symposium of Biomineralization, Institute of Experimental Physics. DEU., Aug 2013, Frieberg, Germany
Communication dans un congrès hal-02744748v1

Analyse du fluide utérin de Gallus gallus par spectrométrie de masse ''bottom up'' : comparaison de deux lignées de poules et effet de l'insémination artificielle

Cindy Riou , Grégoire Harichaux , Kathy Soutonie , Aurélien Brionne , Joël Gautron
26. Colloque Biotechnocentre, Association pour le Développement des Biotechnologies en Région Centre (Biotechnocentre). FRA., Oct 2013, Seillac, France
Communication dans un congrès hal-02749802v1
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Guinea fowl eggshell quantitative proteomics yield new findings related to its unique structural characteristics and superior mechanical properties

Nathalie Le Roy , Aurélien Brionne , Valérie Labas , Lucie Combes-Soia , Joël Gautron
XVth Symposium on biomineralization, Sep 2019, Munich, Germany. 2019
Poster de conférence hal-02737797v1
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Projet PPILOW : des innovations pour améliorer le bien-être des porcs et volailles en élevage et expérimentation en systèmes de production plein air et biologiques à bas intrants (2019-2024)

Anne Collin , Claire Bonnefous , Elisabeth Le Bihan-Duval , Sandrine Mignon-Grasteau , Elodie Guettier
Défis scientifiques Phase, Nov 2019, Rennes, France. pp.83, Recueil des résumés
Poster de conférence hal-03502878v1

About the avian UF proteome: exosomes significance and biological processes in regard to eggshell mineralization, immunity and reproduction

Cindy Riou , Aurélien Brionne , Luiz-Augusto Cordeiro , Grégoire Harichaux , Audrey Gargaros-Ratajczak
2. Journées du GdR 3606 Repro, Apr 2017, Tours, France. 75 p., 2017, 2èmes Journées Scientifiques du GdR Repro
Poster de conférence hal-01605263v1

Projet OVISPERM : conservation des gamètes mâles dans l'oviducte de poule

Nadine Gérard , Cindy Riou , Aurélien Brionne , Luiz-Augusto Cordeiro , Joël Delaveau
29e Colloque Biotechnocentre, Oct 2016, Seillac, France. , 97 p., 2016, 29e Colloque Biotechnocentre
Poster de conférence hal-01602196v1

Sperm storage in hens: comprehensive proteomic analysis of uterine fluid and SST in relation to fertility lenght

Cindy Riou , Aurélien Brionne , Audrey Gargaros-Ratajczak , Luiz-Augusto Cordeiro , Grégoire Harichaux
2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group", Dec 2016, Brugge, Belgium. 2016, 2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group"
Poster de conférence hal-01608737v1

Exploring the role of the chicken amniotic fluid during embryonic development

Mylène da Silva , Aurélien Brionne , Valérie Labas , Lucie Combes Soia , Maryse Mills
2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group", Dec 2016, Brugge, Belgium. 2016, 2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group"
Poster de conférence hal-02742157v1

About the avian UF proteome: exosomes significance and biological processes in regard to eggshell mineralization, immunity and reproduction

Cindy Riou , Aurélien Brionne , Luiz-Augusto Cordeiro , Grégoire Harichaux , Audrey Gargaros-Ratajczak
2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group", Dec 2016, Brugge, Belgium. 2016, 2016 Meeting WPSA "Incubation and Fertility Research Group"
Poster de conférence hal-01602972v1

Sperm storage in female reproductive tract: study of molecules involved

Cindy Riou , Audrey Gargaros , Grégoire Harichaux , Aurélien Brionne , Joël Gautron
1 Journées du GdR 3606 Repro, Apr 2015, Rennes, France. 105 p., 2015, 1ères Journées Scientifiques du GdR Repro
Poster de conférence hal-02739803v1

Proteomic and bioinformatic analysis of avian uterine fluid

Cindy Riou , Aurélien Brionne , Audrey Gargaros , Luiz-Augusto Cordeiro , Grégoire Harichaux
Congrès français de Spectrométrie de Masse et d'Analyse Protéomique (SMAP 2015), Sep 2015, Ajaccio, France. , 2015, SMAP 2015
Poster de conférence hal-02738695v1
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Comprehensive proteomic analysis of Gallus gallus uterine fluid

Cindy Riou , Aurélien Brionne , Audrey Gargaros , Luiz-Augusto Cordeiro , Grégoire Harichaux
31. Scientific Meeting of the AETE, Sep 2015, Ghent, Belgium. Brazilian College of Animal Reproduction, Animal Reproduction, 12 (3), 2015, 31st Scientific Meeting of the AETE
Poster de conférence hal-02740039v1

Eggshell mineralisation: relationship between in situ observations and organic matrix composition

Pauline Marie , Alejandro Rodriguez Navarro , Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Christelle Hennequet-Antier
14. European Poultry Conference, Jun 2014, Stavanger, Norway. WPSA, Branche Norvégienne, 2014, XIVth European Poultry Conference
Poster de conférence hal-02738844v1
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Quantification et caractérisation des protéines sécrétées par l'utérus lors de l'initiation, de la croissance et de l'arrêt de la minéralisation de la coquille d'oeuf de poule

Pauline Marie , Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Aurélien Brionne , Yves Y. Nys
10. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2013, La Rochelle, France. Journées de la Recherche Avicole, 2013, 10èmes Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras
Poster de conférence hal-02749889v1

Quantification et caractérisation des protéines sécrétées par l'utérus lors de l'initiation, de la croissance et de l'arrêt de la minéralisation de la coquille d'oeuf de poule

Pauline Marie , Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Aurélien Brionne , Yves Y. Nys
15. Journées de la Société Française de Biologie des Tissus Minéralisés, May 2013, Poitiers, France. 2013
Poster de conférence hal-02805515v1

Bottom-up analysis of Gallus gallus uterine fluid: comparison of two lines of hens and effect of artificial insemination

Grégoire Harichaux , Cindy Riou , Kathy Soutonie , Aurélien Brionne , Joël Gautron
7. European Proteomics Association Eupa 2013, Oct 2013, Saint Malo, France. 2013, EuPA 2013. Scientific Meeting
Poster de conférence hal-02745845v1

Utilization of label free spectral counting to quantify the proteins involved in the various phases of chicken eggshell mineralisation

Pauline Marie , Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Aurélien Brionne , Yves Y. Nys
29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Sep 2012, Orléans (FRA), France. , 256 p., 2012, JFSM Orléans 2012
Poster de conférence hal-02745304v1