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Valérie LABAS

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Identifiants chercheurs

Présentation

Après un parcours universitaire en physiologie animale, microbiologie et biochimie, j’ai obtenu un DEA « Structure et système biologique intégré » en1999 à l'Université d'Orsay (Paris XI). J’ai intégré le CNRS en 1999 à l'ESPCI Paris Tech en tant qu’ingénieur d’Etudes en Protéomique. Après 6 ans, en 2005, j’ai engagé une mobilité pour intégrer l’UMR PRC du Centre de recherche INRAE Val de Loire. Par voie de concours interne en 2007, j’ai intégré l’INRA en tant qu’Ingénieur de Recherche et évolué à différents postes de responsabilité au sein des plates-formes (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Actuellement, je suis directrice adjointe de la plate-forme PIXANIM (certifiée ISO 9001 v 2015, labellisée IBiSa). Mon domaine d'expertise est la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique et plus récemment, depuis 2015, à la lipidomique. Mon activité porte sur la spectrométrie de masse en tandem à haute résolution couplée à la nano-chromatographie liquide (spectromètre de masse LTQ VelosPro Orbitrap, Thermofisher) et la spectrométrie de masse MALDI-TOF (RapifleX, Bruker daltonics). En tant que responsable scientifique dans mon domaine d’expertise, je participe à la réalisation de ≈ 60 projets/an d’envergure régionale, nationale européenne et internationale dans le cadre de la recherche (projets Région Centre, ANR et Européens) et de l’innovation (2 projets de pré-maturation, projet de création d’une start-up). Pour mener à bien ces projets, j’emploie différentes stratégies analytiques : 1\) phénotypage moléculaire par MALDI-TOF à partir de l’analyse directe protéomique/lipidomique de fluides biologiques ou de cellules entières eucaryotes supérieures en association avec du « machine learning » pour la création de tests diagnostics en intelligence artificielle ; 2\) le phénotypage tissulaire ou imagerie moléculaire par MALDI-TOF à partir de coupes de tissus ; 3\) les approches Top-down pour l’identification des molécules endogènes intactes et entières (analyse structurale des protéines ou lipides) et ; 4\) les approches classiques de protéomique qualitative et quantitative de type label-free par bottom-up.
After a university training in animal physiology, microbiology and biochemistry, I obtained a DEA (post-graduate diploma) in "Structure and integrated biological system" in 1999 at the University of Orsay (Paris XI). I joined the CNRS in 1999 at the ESPCI Paris Tech as an engineer in Proteomics. After 6 years, in 2005, I moved to the UMR PRC of the INRAE Val de Loire Research Centre. In 2007, I joined INRAE as a Research Engineer and held various positions of responsibility within the platforms (PPAF >PAIB2>CIRE>PIXANIM). Currently, I am deputy director of the PIXANIM platform (ISO 9001 v 2015 certified, IBiSa labelled). My field of expertise is mass spectrometry applied to proteomics and more recently, since 2015, to lipidomics. My activity focuses on high resolution tandem mass spectrometry coupled to liquid nano-chromatography (LTQ VelosPro Orbitrap mass spectrometer, Thermofisher) and MALDI-TOF mass spectrometry (RapifleX, Bruker daltonics). I participate in the realization of ≈ 60 projects/year of regional, national, European and international scope in the framework of research (Région Centre, ANR and European projects) and innovation (2 pre-maturation projects, start-up project). To carry out these projects, I use different analytical strategies: 1\) molecular phenotyping by MALDI-TOF from direct proteomic/lipidomic analysis of biological fluids or higher eukaryotic whole cells in combination with machine learning for the creation of diagnostic tests in artificial intelligence; 2\) Tissue phenotyping or molecular imaging by MALDI-TOF from tissue sections; 3\) Top-down approaches for the identification of intact and whole endogenous molecules (structural analysis of proteins or lipids) and 4\) classical bottom-up label-free qualitative and quantitative proteomics approaches.

Publications

anne-christine-lalmanach

Intact cell MALDI-TOF mass spectrometry and top-down proteomic to identify biomarkers

Valérie Labas , Elisabeth Blesbois , Véronique Cadoret , Xavier Druart , Audrey Gargaros
29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Société Française de Spectrométrie de Masse (SFSM). PALAISEAU, FRA., Sep 2012, Orléans, France. pp.69
Communication dans un congrès hal-02744407v1

Avian beta-defensins in the control of bacterial pathogens of chicken digestive tract

Anne-Christine Lalmanach , Chrystelle Derache , Evelyne Esnault , Valérie Labas , V. Aucagne
2. International Symposium on Antimicrobial Peptides. Food Veterinary Medical and Novel Applications, Jun 2009, Saint-Malo, France
Communication dans un congrès hal-02751627v1

Identification, purification et caractérisation de la beta-defensine aviaire 11 dans l'oeuf de poule

Virginie Herve-Grepinet , Sophie Réhault-Godbert , Valérie Labas , Thierry Magallon , Marie-Christine Bourin
8. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2009, Saint-Malo, France
Communication dans un congrès hal-02753441v1

Avian beta-defensis in the control of bacterial pathogens of chicken digestive tract

Chrystelle Derache , Evelyne Esnault , Valérie Labas , V Aucagne , Amandine Delmas
Journées d’Animation Scientifique du Département Santé Animale, 2009, Port d'Albret, France. pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02814940v1

Avian beta-defensin 11: Identification, purification and characterization

Virginie Herve-Grepinet , Sophie Réhault-Godbert , Valérie Labas , Thierry Magallon , Marie-Christine Bourin
25. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique, Oct 2008, Tours, France
Communication dans un congrès hal-02755694v1

Avian defensins AvBD2 and AvBD7 encompass an unusual resistance to proteolysis: consequences for their antimicrobial activity

Geoffrey Bailleul , Alix Joulin-Giet , Amanda Kravtzoff , Fabien Lecaille , Valérie Labas
7. Colloque Protéolyse Cellulaire, May 2015, Sète, France. , 1 p., 2015
Poster de conférence hal-02800908v1

Évaluation de la résistance des défensines aviaires à la protéolyse par les enzymes intestinales

Geoffrey Bailleul , Alix Joulin-Giet , Amanda Kravtzoff , Fabien Lecaille , Valérie Labas
28. Colloque Biotechnocentre, Oct 2015, Seillac, France. 2015
Poster de conférence hal-02739244v1

The high resistance of avian defensins to proteolysis preserves their antibacterial activity

Geoffrey Bailleul , Alix Joulin-Giet , Amanda Kravtzoff , Fabien Lecaille , Grégoire Harichaux
Gordon Research Conferences - Antimicrobial Peptides : Basic and Translational Aspects, May 2015, Lucques (Barga), Italy. 1 p., 2015
Poster de conférence hal-02793000v1

Avian beta defensins are robust and efficient against pathogenic enterobacteriaceae

Geoffrey Bailleul , Alix Joulin-Giet , Amanda Kravtzoff , Fabien Lecaille , Grégoire Harichaux
1. Journées du GDR MuFoPAM « MultiFonction des Peptides antimicrobiens », Oct 2014, Dourdan, France. 2014
Poster de conférence hal-02797925v1

Robustness and efficiency of avian beta defensins as novel anti-infectious agents

Geoffrey Bailleul , Alix Joulin-Giet , Amanda Kravtzoff , Fabien Lecaille , Valérie Labas
Journées « Rencontres de recherche en Santé Animale » SIMV-ICSA, Dec 2014, Lille, France. 2014
Poster de conférence hal-02796248v1
Image document

Caractérisation structurale de nouvelles isoformes de β-défensines aviaires par top-down et détermination de leur activité antimicrobienne

Valérie Labas , Amanda Kravtzoff , Grégoire Harichaux , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Gilles Lalmanach
29. Journées Françaises de Spectrométrie de Masse (JFSM), Sep 2012, Orléans, France. , 256 p., 2012, JFSM Orléans 2012
Poster de conférence hal-02746021v1

Caractérisation structurale de nouvelles isoformes de β-défensines aviaires par Top Down et détermination de leur activité antimicrobienne

Valérie Labas , Amanda Kravtzoff , Grégoire Harichaux , Ana-Paula Teixeira-Gomes , Gilles Lalmanach
29. Congrès de la Société Française d'Electrophorèse et d'Analyse Protéomique, Oct 2012, Rouen, France. , pp.169, 2012, 29ème Congrès SFEAP
Poster de conférence hal-02748470v1

ICM-MS and Top down analysis to characterize biomarker

Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Chrystelle Derache , Thierry Magallon , Ana-Paula Teixeira-Gomes
SMAP 2011, Sep 2011, Avignon, France. , pp.110, 2011, Spectométrie de Masse et Analyse Protéomique
Poster de conférence hal-02750200v1

Analyse intégrative des biomarqueurs par ICM-MS et top down

Valérie Labas , Grégoire Harichaux , Chrystelle Derache , Thierry Magallon , Ana-Paula Teixeira-Gomes
24. Colloque Biotechnocentre, Oct 2011, Seillac, France. 2011, 24ème Colloque Biotechnocentre
Poster de conférence hal-02745445v1