Valentin Loux
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Documents
Identifiants chercheurs
valentin-loux-
0000-0002-8268-915X
- Google Scholar : https://scholar.google.fr/citations?user=j4FDjDgAAAAJ&hl=fr&oi=ao
- IdRef : 253136016
Présentation
Valentin Loux is head of the INRAE Migale bioinformatics facility, part of the MaiAGE laboratory. [The Migale bioinformatics facility](https://migale.inrae.fr) provides storage, computational resources and standard bioinformatics analyses pipelines and software for sequence analyses.
Valentin Loux has an established expertise in the analysis of large scale metagenomics projects, annotation and comparison of bacterial genomes.
**POSTIONS**
**2015-Present :** Research Engineer in Bioinformatics, head of Migale Bioinformatics Facilty, INRAE, MaIAGE laboratory
**2013-2019 :** Member of steering comitee of [France-Genomique project](https://www.france-genomique.org) in charge of bionformatics development coordination
**2002-2015 :** Bioinformatics Staff Engineer , INRAE Mig laboratory
**CURSUS**
**2002**: Master's degree in Bioinformatics (DESS), Versailles Saint-Quentin University
Publications
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Complete genome sequence of the fish pathogen Flavobacterium psychrophilumNature Biotechnology, 2007, 25 (7), pp.763 - 769. ⟨10.1038/nbt1313⟩
Article dans une revue
hal-02666599v1
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AGMIAL: implementing an annotation strategy for prokaryote genomes as a distributed systemNucleic Acids Research, 2006, 34 (12), pp.3533-3545. ⟨10.1093/nar/gkl471⟩
Article dans une revue
hal-02665192v1
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The complete genome sequence of Lactobacillus bulgaricus reveals extensive and ongoing reductive evolutionProceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2006, 103 (24), pp.9274-9279. ⟨10.1073/pnas.0603024103⟩
Article dans une revue
hal-02668654v1
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The complete genome sequence of the meat-borne lactic acid bacterium Lactobacillus sakei 23KNature Biotechnology, 2005, 23 (12), pp.1527-1533. ⟨10.1038/nbt1160⟩
Article dans une revue
hal-02683108v1
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L'ontologie OntoBiotope pour l'étude de la biodiversité microbienneEGC'2018: 18èmes Conférence Internationale sur l'Extraction et la Gestion des Connaissances, Jan 2018, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02737399v1
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Florilège: a database gathering microbial phenotypes of food interest2017 Scientific MEM days: Journées scientifiques MEM (Métaomiques et écosystèmes microbiens), Jan 2017, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-01607327v1
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La séquence complète du génome de la bactérie de la viande Lactobacillus sakeiSymposium SFM, Interactions Bactériennes dans les Environnements Agroalimentaires : Apport des Nouvelles Approches., Société Française de Microbiologie (SFM). FRA., Nov 2006, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-02816850v1
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Genome project of the meat born lactic acid bacterium Lactobacillus sakei 23K: understanding bacterial adaptation to meat and paving the way to the development of biopreservative cultures2. European Conference on Prokaryotic Genomes, Oct 2005, Göttingen, Germany
Communication dans un congrès
hal-02828495v1
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Premiers regards sur le génome d’une bactérie lactique originale : structure, polymorphisme et analyse génétique ciblée du chromosome de Lactobacillus sakei 23K13. Colloque du Club des Bactéries Lactiques, Sep 2004, Nantes, France. 142 p
Communication dans un congrès
hal-02759825v1
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Omnicrobe : une base de données d’habitats et de phénotypes microbiensPoster de conférence hal-03694214v1 |
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FLORILEGE: an integrative database using text mining and ontologiesPoster de conférence hal-01827946v1 |
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Florilege : a database gathering microbial phenotypes of food interestPoster de conférence hal-01651302v1 |
Whole-genome sequence of the fish-pathogenic bacterium Flavobacterium psychrophilum2. FEMS Congress of European Microbiologists, Jul 2006, Madrid, Spain. 1 p., 2006
Poster de conférence
hal-02812810v1
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Omnicrobe, an open-access database of microbial habitats and phenotypes using a comprehensive text mining and data fusion approach2022
Pré-publication, Document de travail
hal-03828105v1
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