Valentin Loux
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Documents
Identifiants chercheurs
valentin-loux-
0000-0002-8268-915X
- Google Scholar : https://scholar.google.fr/citations?user=j4FDjDgAAAAJ&hl=fr&oi=ao
- IdRef : 253136016
Présentation
Valentin Loux is head of the INRAE Migale bioinformatics facility, part of the MaiAGE laboratory. [The Migale bioinformatics facility](https://migale.inrae.fr) provides storage, computational resources and standard bioinformatics analyses pipelines and software for sequence analyses.
Valentin Loux has an established expertise in the analysis of large scale metagenomics projects, annotation and comparison of bacterial genomes.
**POSTIONS**
**2015-Present :** Research Engineer in Bioinformatics, head of Migale Bioinformatics Facilty, INRAE, MaIAGE laboratory
**2013-2019 :** Member of steering comitee of [France-Genomique project](https://www.france-genomique.org) in charge of bionformatics development coordination
**2002-2015 :** Bioinformatics Staff Engineer , INRAE Mig laboratory
**CURSUS**
**2002**: Master's degree in Bioinformatics (DESS), Versailles Saint-Quentin University
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Représentation systémique multi-échelle des processus biologiques de la bactérieIC201: 27es Journées francophones d'Ingénierie des Connaissances, Jun 2016, Montpellier, France
Communication dans un congrès
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Représentation systémique multi-échelle des processus biologiques de la bactérieIC2016 - Ingénierie des Connaissances, Jun 2016, Montpellier, France
Communication dans un congrès
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Mapping reads on a genomic sequence: a practical comparative analysisKick-of meeting of PF7 RADIANT project, Jan 2013, Manchester, United Kingdom. 19 diapos
Communication dans un congrès
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Mapping reads on a genomic sequence: a practical comparative analysisJournées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques (JOBIM), Jul 2012, Rennes, France. pp.496
Communication dans un congrès
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Genomic diversity of 24 Propionibacterium freudenreichii 1 strains6 Conference on Functional Genomics of Gram-positive Microorganisms 16 International Conference on Bacilli, Jun 2011, Montecatini, Italy
Communication dans un congrès
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Web services for microbial genome annotation using data integrationJOBIM 2010 : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Sep 2010, Montpellier, France
Communication dans un congrès
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Evaluating Genome Browsers Using a Software Qualification Method EvaluationJOBIM 2010, Sep 2010, Montpellier, France. pp.196
Communication dans un congrès
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INSYGT : a multi-genes multi-genomes browser that highlights synteny conservation in prokaryotes.JOBIM 2008, Jun 2008, Lille, France. 2 p
Communication dans un congrès
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Towards a semi-automatic functional annotation tool based on decision tree techniquesMachine Learning in Systems Biology: MLSB 2007, Sep 2007, Evry, France
Communication dans un congrès
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Insyght : Analyse evolutionary conserved CDS, orthologs, syntenies, pan-genome, fusion, etc., for your bacteria of interestPoster de conférence hal-02736501v1 |
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The multiple-genomes browser of the IFB cloudPoster de conférence hal-02795851v1 |
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Mapdecode : inventory and benchmark of read mapping toolsPoster de conférence hal-02792306v1 |
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Insyght: Using symbols to visualize homologies, conserved syntenies and genomic insertions across multiple genomesJOBIM 2013 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2013, Toulouse, France. Société Française de Bio-Informatique -SFBI, pp.231, 2013, JOBIM TOULOUSE 2013 RÉSUMÉS COURS (affiches) - Volume 2/2
Poster de conférence
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IGO, Integration from Genomes to OrganismsJOBIM 2013, Jul 2013, Toulouse, France. , pp.246, 2013, JOBIM TOULOUSE 2013 - RÉSUMÉS COURTS (affiches)
Poster de conférence
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Bovine promoter annotation platform for the identification of transcription factor binding sites in genes involved in early pregnancyJOBIM 2010 : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Sep 2010, Montpellier, France. MABLI : Methods Algorithmes Bio-Informatique LIRMM, pp.176, 2010, proceeding of JOBIM 2010 Montpellier
Poster de conférence
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Comparison of mapping softwares for next generation sequencing dataJOBIM 2010, Sep 2010, Montpellier, France. MABLI : Methods Algorithmes Bio-Informatique LIRMM, pp.176, 2010, proceeding of JOBIM 2010 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques - Montpellier
Poster de conférence
hal-02751434v1
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Introduction à l'annotation fonctionnelle in silicoBio-informatique - principes d'utilisation des outils, Editions Quae, 2010, 978-2-7592-0870-8
Chapitre d'ouvrage
hal-02812661v1
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Insyght2014
Logiciel
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