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36

CV de Timothée Flutre


chercheur INRAE, UMR GQE - Le Moulon, équipe DEAP

page perso


Article dans une revue13 documents

  • Maud Fagny, Etienne Patin, Maxime Rotival, Julia L. Macisaac, Timothée Flutre, et al.. The epigenomic landscape of African rainforest hunter-gatherers and farmers. Nature Communications, Nature Publishing Group, 2015, 6, 11 p. ⟨10.1038/ncomms10047⟩. ⟨pasteur-01238387⟩
  • Berta Andújar, Gerard Campderrós, María García, Macarena Marino, Marta Mas, et al.. Twenty Tips for High-School Students Engaging in Research with Scientists. Frontiers for Young Minds, 2015, 3, 7 p. ⟨10.3389/frym.2015.00007⟩. ⟨hal-01235876⟩
  • Timothée Flutre. The Genotype-Tissue Expression (GTEx) pilot analysis: multitissue gene regulation in humans. Science, American Association for the Advancement of Science, 2015, 348 (6235), pp.648-660. ⟨10.1126/science.1262110⟩. ⟨hal-01157916⟩
  • Timothée Flutre, Xiaoquan Wen, Jonathan Pritchard, Matthew Stephens. A statistical framework for joint eQTL analysis in multiple tissues. PLoS Genetics, Public Library of Science, 2013, 9 (5), ⟨10.1371/journal.pgen.1003486⟩. ⟨hal-01190566⟩
  • John Lonsdale, Emile Thomas, Mike Salvatore, Phillip Phillips, Edmund Lo, et al.. The Genotype-Tissue Expression (GTEx) project. Nature Genetics, Nature Publishing Group, 2013, 45 (6), pp.580 - 585. ⟨10.1038/ng.2653⟩. ⟨hal-01374823⟩
  • John Lonsdale, Jeffrey Thomas, Mike Salvatore, Timothée Flutre. The Genotype-Tissue Expression (GTEx) project.. Nature Genetics, Nature Publishing Group, 2013, 45 (6), pp.580-5. ⟨10.1038/ng.2653⟩. ⟨hal-01190088⟩
  • Philippe Leroy, Nicolas Guilhot, Hiroaki Sakai, Aurélien Bernard, Frédéric Choulet, et al.. TriAnnot: A Versatile and High Performance Pipeline for the Automated Annotation of Plant Genomes.. Frontiers in Plant Science, Frontiers, 2012, 3, pp.5. ⟨10.3389/fpls.2012.00005⟩. ⟨hal-00753407⟩
  • Laure Segurel, Emma E. Thompson, Timothée Flutre, Jessica Lovstad, Aarti Venkat, et al.. The ABO blood group is a trans-species polymorphism in primates. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2012, 109 (45), pp.18493 - 18498. ⟨10.1073/pnas.1210603109⟩. ⟨hal-00956369⟩
  • Timothée Flutre, Thomas Julou, Livio Riboli-Sasco, Claire Ribrault. Research community: Pilot scheme for misconduct database. Nature, Nature Publishing Group, 2011, 478 (37), ⟨10.1038/478037c⟩. ⟨hal-02642815⟩
  • Timothée Flutre, Emmanuelle Permal, Hadi Quesneville. In search of lost trajectories: recovering the diversification of transposable elements. Mobile Genetic Elements, Taylor & Francis, 2011, 1 (2), pp.151-154. ⟨10.4161/mge.1.2.17094⟩. ⟨hal-00956371⟩
  • Timothee Flutre, Duprat Elodie, Catherine Feuillet, Hadi Quesneville. Considering Transposable Element Diversification in De Novo Annotation Approaches. PLoS ONE, Public Library of Science, 2011, sous presse. ⟨hal-00568705⟩
  • Timothée Flutre, Elodie Duprat, Catherine Feuillet, Hadi Quesneville. Considering transposable element diversification in de novo annotation approaches. PLoS ONE, Public Library of Science, 2011, 6 (1), pp.1-15. ⟨10.1371/journal.pone.0016526⟩. ⟨hal-00956366⟩
  • Pierre Abad, Jerome Gouzy, Jean-Marc Aury, Philippe Castagnone, Etienne Danchin, et al.. Genome sequence of the metazoan plant-parasitic nematode Meloidogyne incognita. Nature Biotechnology, Nature Publishing Group, 2008, 26 (8), pp.909-915. ⟨10.1038/nbt.1482⟩. ⟨hal-01189285⟩

Communication dans un congrès7 documents

  • Elisabeth Dirlewanger, Loïck Le Dantec, Teresa Barreneche, Bénédicte Wenden, Timothée Flutre, et al.. New sweet cherry genomic tools and their use in marker-assisted breeding. XXX. International Horticultural Congress, ISHS, Aug 2018, Istanbul, Turkey. ⟨hal-02877345⟩
  • Timothée Flutre. Croisement Syrah x Grenache: générateur de diversité entre recherche et application. Journée d’information et d’échanges sur la création de variétés résistantes organisée par l’Institut Rhodanien, Mar 2016, Orange, France. pp.19. ⟨hal-01291707⟩
  • Agnes Destrac, Timothée Flutre, Christel Renaud, Elena Morin, Louise Durand, et al.. The use of Fourier transform infrared spectroscopy in phenotyping berries from the grapevine Vitis Vinifera L.. 19. Journées Internationales de Viticulture GiESCO, May 2015, Gruissan, France. 810 p. ⟨hal-01269230⟩
  • Timothée Flutre. Projet EDGARR de sélection génomique chez la vigne pour la filière rosé. Séminaire du projet R2D2, Nov 2015, Le Teich, France. 34 p. ⟨hal-01235879⟩
  • Timothée Flutre, Xiaoquan Wen, Jonathan Pritchard, Matthew Stephens. Statistical inference of tissue-consistent and tissue-specific eQTLs. 62. Annual Meeting of the American Society of Human Genetics, Nov 2012, San Francisco, United States. ⟨hal-01190089⟩
  • Joelle Amselem, Timothée Flutre, Victoria Fabia Dominguez del Angel, Jonathan Kreplak, Sébastien Duplessis, et al.. Fungal genome analysis of transposable elements: expansion vs RIP silencing. Plant and Animal Genome: 19. Conference, Jan 2011, San Diego, United States. n.p. ⟨hal-00956370⟩
  • Timothée Flutre. REPET, pipelines for the detection and annotation of transposable elements in genomic sequences. 19. International Triticeae Mapping Initiative - 3rd COST Tritigen, Aug 2009, Clermont-Ferrand, France. ⟨hal-02821787⟩

Poster2 documents

  • Timothée Flutre, Xiaoquan Wen, Jonathan Pritchard, Matthew Stephens. Statistical inference of eQTL sharing among many tissues. 63rd Annual Meeting of the American Society of Human Genetic, Oct 2013, Boston, United States. 2013. ⟨hal-01268700⟩
  • Veronique Jamilloux, Olivier Inizan, Sandie Arnoux, Timothée Flutre, Claire Hoede, et al.. Use cases and improvements of REPET package : pipeline and tools to identify and annotate TEs in genomic sequences. 17. Congrès National des Elements Transposables, Jul 2011, Lyon, France. 2011. ⟨hal-01190364⟩

Chapitre d'ouvrage2 documents

Rapport1 document

  • Timothée Flutre. Réflexions sur la partie V du rapport du BAP sur l'agroécologie. 2016, pp.12. ⟨hal-02792408⟩

Thèse2 documents

  • Timothée Flutre. L'annotation des éléments transposables par la compréhension de leur diversification. Sciences du Vivant [q-bio]. Université Paris-Diderot - Paris VII, 2010. Français. ⟨tel-00560242⟩
  • Timothée Flutre. L'annotation des éléments transposables par la compréhension de leur diversification. Sciences du Vivant [q-bio]. Université Paris Diderot - Paris 7, 2010. Français. ⟨tel-02824845⟩

Cours8 documents

  • Timothée Flutre. Prédiction génomique. Master. Amélioration des plantes et ingénierie végétale méditerranéennes et tropicales (Atelier de prédiction et sélection génomique), 2016. ⟨hal-02793019⟩
  • Timothée Flutre, Marie Denis. model4all: une initiative collaborative pour la modélisation statistique. Master. 2016. ⟨hal-02795664⟩
  • Timothée Flutre. Pathogènes de la vigne et choix du matériel végétal: prévention et création variétale. Cursus ingénieur (Module "diagnostic agronomique"), 2016. ⟨hal-02798135⟩
  • Timothée Flutre. Premiers pas de modélisation statistique par simulation avec la régression linéaire simple. Master. Amélioration des plantes et ingénierie végétale méditerranéennes et tropicales (Atelier de prédiction et sélection génomique), 2016. ⟨hal-02798157⟩
  • Timothée Flutre. Bref état des lieux de la gestion des données au sein de la communauté "vigne". 2016. ⟨hal-02792961⟩
  • Timothée Flutre. Tutorial on (un)compressing files. 2015. ⟨hal-02792210⟩
  • Timothée Flutre. Tutoriel sur les tests multiples (et au-delà). 2015. ⟨hal-02792527⟩
  • Timothée Flutre. Caring about reproducibility in scientific research. 2014. ⟨hal-02795975⟩

Logiciel1 document