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Presence of the neonatal Staphylococcus capitis outbreak clone (NRCS-A) in prosthetic joint infections

 Staffan Tevell , Sharmin Baig , Bengt Hellmark , Patricia Martins Simoes , Thierry Wirth , et al.
Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.22389. ⟨10.1038/s41598-020-79225-x⟩
Article dans une revue hal-03213331v1

Juin 2006: Bacterial evolution and population genetics: from sex and virulence to human migrations

 T. Wirth
Après-midi d'Evolution (AME), Muséum National d'Histoire Naturelle, Paris, 2006, Paris, France. pas de page
Communication dans un congrès hal-00175024v1
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Exploring Semi-Quantitative Metagenomic Studies Using Oxford Nanopore Sequencing: A Computational and Experimental Protocol

 Rohia Alili , Eugeni Belda , Phuong Le , Thierry Wirth , Jean-Daniel Zucker , et al.
Genes, 2021, 12 (10), pp.1496. ⟨10.3390/genes12101496⟩
Article dans une revue hal-03405404v1
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Emergence and global spread of Listeria monocytogenes main clinical clonal complex

 Alexandra Moura , Noémie Lefrancq , Thierry Wirth , Alexandre Leclercq , Vítor Borges , et al.
Science Advances , 2021, 7 (49), pp.eabj9805. ⟨10.1126/sciadv.abj9805⟩
Article dans une revue pasteur-03696138v2
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Molecular diversity and biennial circulation of enterovirus D68: a systematic screening study in Lyon, France, 2010 to 2016

 Rolf Kramer , Marina Sabatier , Thierry Wirth , Maxime Pichon , Bruno Lina , et al.
Eurosurveillance, 2018, ⟨10.2807/1560-7917⟩
Article dans une revue hal-03591483v1

The Invasion Biology of the Invasive Earwig, Forficula Auricularia in Australasian Ecosystems

 Stephen R. Quarrell , Juliette Arabi , Arnaud Suwalski , Michel Veuille , Thierry Wirth , et al.
Biological Invasions, 2018, 20 (6), pp.1553--1565. ⟨10.1007/s10530-017-1646-3⟩
Article dans une revue hal-03854973v1

Recent advances in bacterial population genomics

 T. Wirth
Workshop on microbial systematics, population genetics and epidemiology, Charité Hospital, Berlin. October 2006, 2006, Berlin, Germany. pas de page
Communication dans un congrès hal-00175022v1

Mice and Men: an Evolutionary History of Lassa Fever

 Aude Lalis , Thierry Wirth
Biodiversity and Evolution, Elsevier, pp.189-212, 2018, ⟨10.1016/B978-1-78548-277-9.50011-5⟩
Chapitre d'ouvrage hal-02978240v1
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Genome-wide mosaicism within Mycobacterium abscessus: evolutionary and epidemiological implications

 Guillaume Sapriel , Julie Konjek , Mickael Orgeur , Laurent Bouri , Lise Frézal , et al.
BMC Genomics, 2016, 17 (1), pp.118. ⟨10.1186/s12864-016-2448-1⟩
Article dans une revue hal-01284527v1
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Sélection et neutralisme : évolution des pathogènes et biologie de la santé.

 Thierry Wirth , Elisabeth de Pablo , Lisette Winkler , Muriel Chemouny , Camille Bonnemazou
2009
Vidéo medihal-01947528v1

Inferring patterns of migration

 P. Bunje , T. Wirth
pas d'éditeur. Methods in Molecular Biology, Humana Press, sous presse, 2007
Chapitre d'ouvrage hal-00174059v1

Sex and virulence in Escherichia coli: an evolutionary perspective

 T. Wirth , D. Falush , R. Lan , F. Colles , P. Mensa , et al.
Molecular Microbiology, 2006, 60, pp.1136-1151
Article dans une revue hal-00174910v1

The Evolutionary History, Demography, and Spread of the Mycobacterium tuberculosis Complex

 Maxime Barbier , Thierry Wirth
Microbiology Spectrum, 2016, 4 (4), ⟨10.1128/microbiolspec.TBTB2-0008-2016⟩
Article dans une revue hal-03054214v1
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A Timescale for Evolution, Population Expansion, and Spatial Spread of an Emerging Clone of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus

 Ulrich Nübel , Janina Dordel , Kevin Kurt , Birgit Strommenger , Henrik Westh , et al.
PLoS Pathogens, 2010, 6 (4), pp.e1000855. ⟨10.1371/journal.ppat.1000855⟩
Article dans une revue hal-02944185v1

Guns, germs and dogs: On the origin of Leishmania chagasi

 Raphaël Leblois , Katrin Kuhls , Olivier François , Gabriele Schönian , Thierry Wirth
Infection, Genetics and Evolution, 2011, 11 (5), pp.1091-1095. ⟨10.1016/j.meegid.2011.04.004⟩
Article dans une revue istex hal-02931001v1

Guns, Germs and Dogs: on the origin of Leishmania chagasi

 Thierry Wirth , Raphaël Leblois , Katrin Kuhls , Gabriele Schönian
4th international symposium on Leishmania, Feb 2009, Lucknow, India
Communication dans un congrès hal-02932433v1

Isolation and characteritazation of short tandem repeats (STR) in an invasive swimbladder nematode, parasitic in Atlantic freshwater eels, Anguillicola crassus

 S. Wielgoss , M. Sanetra , A. Meyer , T. Wirth
Mol Ecol Notes, 2007, sous presse
Article dans une revue hal-00173844v1
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Demography and Intercontinental Spread of the USA300 Community-Acquired Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Lineage.

 Philippe Glaser , Patrícia Martins-Simões , Adrien Villain , Maxime Barbier , Anne Tristan , et al.
mBio, 2016, 7 (1), pp.e02183-15. ⟨10.1128/mBio.02183-15⟩
Article dans une revue hal-01312831v1

Longitudinal Outbreak of Multidrug-Resistant Tuberculosis in a Hospital Setting, Serbia

 Irena Arandjelović , Matthias Merker , Elvira Richter , Thomas A. Kohl , Branislava Savić , et al.
Emerging Infectious Diseases, 2019, 25 (3), pp.555--558. ⟨10.3201/eid2503.181220⟩
Article dans une revue hal-03833219v1

Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage.

 Matthias Merker , Camille Blin , Stefano Mona , Nicolas Duforet-Frebourg , Sophie Lecher , et al.
Nature Genetics, 2015, 47 (3), pp.242-249. ⟨10.1038/ng.3195⟩
Article dans une revue pasteur-01153552v1

Molecular Diversity and Biennial Circulation of Enterovirus D68: A Systematic Screening Study in Lyon, France, 2010 to 2016

 R. Kramer , M. Sabatier , T. Wirth , M. Pichon , B. Lina , et al.
Eurosurveillance, 2018, 23 (37), ⟨10.2807/1560-7917.ES.2018.23.37.1700711⟩
Article dans une revue hal-03868082v1
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Global genome diversity of the Leishmania donovani complex

 Susanne U Franssen , Caroline Durrant , Olivia Stark , Bettina Moser , Tim Downing , et al.
eLife, 2020, 9, ⟨10.7554/eLife.51243⟩
Article dans une revue hal-02557519v1
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“Epidemic Clones” of Listeria monocytogenes Are Widespread and Ancient Clonal Groups

 Thomas Cantinelli , Viviane Chenal-Francisque , Laure Diancourt , Lise Frezal , Alexandre Leclercq , et al.
Journal of Clinical Microbiology, 2013, 51 (11), pp.3770-3779. ⟨10.1128/JCM.01874-13⟩
Article dans une revue pasteur-02869829v1
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Changing patterns of human migrations shaped the global population structure of Mycobacterium tuberculosis in France

 Maxime Barbier , Oana Dumitrescu , Catherine Pichat , Gérard Carret , Anne-Sophie Ronnaux-Baron , et al.
Scientific Reports, 2018, 8 (1), pp.5855. ⟨10.1038/s41598-018-24034-6⟩
Article dans une revue hal-01908989v1

Globalization and Infectious Diseases

 Thierry Wirth
Biodiversity and Evolution, Elsevier, pp.123--137, 2018, 978-1-78548-277-9
Chapitre d'ouvrage hal-03854979v1
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Applied phyloepidemiology: Detecting drivers of pathogen transmission from genomic signatures using density measures

 Thierry Wirth
Evolutionary Applications, 2020, 13 (6), pp.1513-1525. ⟨10.1111/eva.12991⟩
Article dans une revue hal-03058017v1
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Emergence of enterovirus D68 clade D1, France, August to November 2018

 Antonin Bal , Marina Sabatier , Thierry Wirth , Marianne Coste-Burel , Mouna Lazrek , et al.
Eurosurveillance, 2019, 24 (3), pp.1800699. ⟨10.2807/1560-7917.es.2019.24.3.1800699⟩
Article dans une revue hal-02005811v1
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Niche specialization and spread of Staphylococcus capitis involved in neonatal sepsis

 Thierry Wirth , Marine Bergot , Jean-Philippe Rasigade , Bruno Pichon , Maxime Barbier , et al.
Nature Microbiology, 2020, 5 (5), pp.735-745. ⟨10.1038/s41564-020-0676-2⟩
Article dans une revue hal-03056509v1
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Molecular and Functional Characterization of Lymphoid Progenitor Subsets Reveals a Bipartite Architecture of Human Lymphopoiesis.

 Kutaiba Alhaj Hussen , Thien-Phong Vu Manh , Fabien Guimiot , Elisabeth Nelson , Emna Chabaane , et al.
Immunity, 2017, 47 ((4)), pp.680-696.e8. ⟨10.1016/j.immuni.2017.09.009⟩
Article dans une revue inserm-01624830v1
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Strain-specific estimation of epidemic success provides insights into the transmission dynamics of tuberculosis

 Jean-Philippe Rasigade , Maxime Barbier , Oana Dumitrescu , Catherine Pichat , Gérard Carret , et al.
Scientific Reports, 2017, 7, pp.45326. ⟨10.1038/srep45326⟩
Article dans une revue hal-01911199v1
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