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Presence of the neonatal Staphylococcus capitis outbreak clone (NRCS-A) in prosthetic joint infections

 Staffan Tevell , Sharmin Baig , Bengt Hellmark , Patricia Martins Simoes , Thierry Wirth , et al.
Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.22389. ⟨10.1038/s41598-020-79225-x⟩
Article dans une revue hal-03213331v1

Juin 2006: Bacterial evolution and population genetics: from sex and virulence to human migrations

 T. Wirth
Après-midi d'Evolution (AME), Muséum National d'Histoire Naturelle, Paris, 2006, Paris, France. pas de page
Communication dans un congrès hal-00175024v1
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Emergence and global spread of Listeria monocytogenes main clinical clonal complex

 Alexandra Moura , Noémie Lefrancq , Thierry Wirth , Alexandre Leclercq , Vítor Borges , et al.
Science Advances , 2021, 7 (49), pp.eabj9805. ⟨10.1126/sciadv.abj9805⟩
Article dans une revue pasteur-03696138v2
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Exploring Semi-Quantitative Metagenomic Studies Using Oxford Nanopore Sequencing: A Computational and Experimental Protocol

 Rohia Alili , Eugeni Belda , Phuong Le , Thierry Wirth , Jean-Daniel Zucker , et al.
Genes, 2021, 12 (10), pp.1496. ⟨10.3390/genes12101496⟩
Article dans une revue hal-03405404v1
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Molecular diversity and biennial circulation of enterovirus D68: a systematic screening study in Lyon, France, 2010 to 2016

 Rolf Kramer , Marina Sabatier , Thierry Wirth , Maxime Pichon , Bruno Lina , et al.
Eurosurveillance, 2018, ⟨10.2807/1560-7917⟩
Article dans une revue hal-03591483v1

Recent advances in bacterial population genomics

 T. Wirth
Workshop on microbial systematics, population genetics and epidemiology, Charité Hospital, Berlin. October 2006, 2006, Berlin, Germany. pas de page
Communication dans un congrès hal-00175022v1

The Invasion Biology of the Invasive Earwig, Forficula Auricularia in Australasian Ecosystems

 Stephen R. Quarrell , Juliette Arabi , Arnaud Suwalski , Michel Veuille , Thierry Wirth , et al.
Biological Invasions, 2018, 20 (6), pp.1553--1565. ⟨10.1007/s10530-017-1646-3⟩
Article dans une revue hal-03854973v1

Mice and Men: an Evolutionary History of Lassa Fever

 Aude Lalis , Thierry Wirth
Biodiversity and Evolution, Elsevier, pp.189-212, 2018, ⟨10.1016/B978-1-78548-277-9.50011-5⟩
Chapitre d'ouvrage hal-02978240v1
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Genome-wide mosaicism within Mycobacterium abscessus: evolutionary and epidemiological implications

 Guillaume Sapriel , Julie Konjek , Mickael Orgeur , Laurent Bouri , Lise Frézal , et al.
BMC Genomics, 2016, 17 (1), pp.118. ⟨10.1186/s12864-016-2448-1⟩
Article dans une revue hal-01284527v1
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Sélection et neutralisme : évolution des pathogènes et biologie de la santé.

 Thierry Wirth , Elisabeth de Pablo , Lisette Winkler , Muriel Chemouny , Camille Bonnemazou
2009
Vidéo medihal-01947528v1

Inferring patterns of migration

 P. Bunje , T. Wirth
pas d'éditeur. Methods in Molecular Biology, Humana Press, sous presse, 2007
Chapitre d'ouvrage hal-00174059v1

Sex and virulence in Escherichia coli: an evolutionary perspective

 T. Wirth , D. Falush , R. Lan , F. Colles , P. Mensa , et al.
Molecular Microbiology, 2006, 60, pp.1136-1151
Article dans une revue hal-00174910v1
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A Timescale for Evolution, Population Expansion, and Spatial Spread of an Emerging Clone of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus

 Ulrich Nübel , Janina Dordel , Kevin Kurt , Birgit Strommenger , Henrik Westh , et al.
PLoS Pathogens, 2010, 6 (4), pp.e1000855. ⟨10.1371/journal.ppat.1000855⟩
Article dans une revue hal-02944185v1

Guns, germs and dogs: On the origin of Leishmania chagasi

 Raphaël Leblois , Katrin Kuhls , Olivier François , Gabriele Schönian , Thierry Wirth
Infection, Genetics and Evolution, 2011, 11 (5), pp.1091-1095. ⟨10.1016/j.meegid.2011.04.004⟩
Article dans une revue istex hal-02931001v1

The Evolutionary History, Demography, and Spread of the Mycobacterium tuberculosis Complex

 Maxime Barbier , Thierry Wirth
Microbiology Spectrum, 2016, 4 (4), ⟨10.1128/microbiolspec.TBTB2-0008-2016⟩
Article dans une revue hal-03054214v1

Guns, Germs and Dogs: on the origin of Leishmania chagasi

 Thierry Wirth , Raphaël Leblois , Katrin Kuhls , Gabriele Schönian
4th international symposium on Leishmania, Feb 2009, Lucknow, India
Communication dans un congrès hal-02932433v1

Isolation and characteritazation of short tandem repeats (STR) in an invasive swimbladder nematode, parasitic in Atlantic freshwater eels, Anguillicola crassus

 S. Wielgoss , M. Sanetra , A. Meyer , T. Wirth
Mol Ecol Notes, 2007, sous presse
Article dans une revue hal-00173844v1

Longitudinal Outbreak of Multidrug-Resistant Tuberculosis in a Hospital Setting, Serbia

 Irena Arandjelović , Matthias Merker , Elvira Richter , Thomas A. Kohl , Branislava Savić , et al.
Emerging Infectious Diseases, 2019, 25 (3), pp.555--558. ⟨10.3201/eid2503.181220⟩
Article dans une revue hal-03833219v1

Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage.

 Matthias Merker , Camille Blin , Stefano Mona , Nicolas Duforet-Frebourg , Sophie Lecher , et al.
Nature Genetics, 2015, 47 (3), pp.242-249. ⟨10.1038/ng.3195⟩
Article dans une revue pasteur-01153552v1
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Demography and Intercontinental Spread of the USA300 Community-Acquired Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Lineage.

 Philippe Glaser , Patrícia Martins-Simões , Adrien Villain , Maxime Barbier , Anne Tristan , et al.
mBio, 2016, 7 (1), pp.e02183-15. ⟨10.1128/mBio.02183-15⟩
Article dans une revue hal-01312831v1
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Transcontinental spread and evolution of Mycobacterium tuberculosis W148 European/Russian clade toward extensively drug resistant tuberculosis

 Matthias Merker , Jean-Philippe Rasigade , Maxime Barbier , Helen Cox , Silke Feuerriegel , et al.
Nature Communications, 2022, 13 (1), pp.5105. ⟨10.1038/s41467-022-32455-1⟩
Article dans une revue hal-03837079v1
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The Impact of Human Conflict on the Genetics of Mastomys natalensis and Lassa Virus in West Africa

 Aude Lalis , Raphaël Leblois , Emilie Lecompte , Christiane Denys , Jan ter Meulen , et al.
PLoS ONE, 2012, 7 (5), pp.e37068. ⟨10.1371/journal.pone.0037068⟩
Article dans une revue hal-02931012v1
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Strain-specific estimation of epidemic success provides insights into the transmission dynamics of tuberculosis

 Jean-Philippe Rasigade , Maxime Barbier , Oana Dumitrescu , Catherine Pichat , Gérard Carret , et al.
Scientific Reports, 2017, 7, pp.45326. ⟨10.1038/srep45326⟩
Article dans une revue hal-01911199v1
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Molecular and Functional Characterization of Lymphoid Progenitor Subsets Reveals a Bipartite Architecture of Human Lymphopoiesis.

 Kutaiba Alhaj Hussen , Thien-Phong Vu Manh , Fabien Guimiot , Elisabeth Nelson , Emna Chabaane , et al.
Immunity, 2017, 47 ((4)), pp.680-696.e8. ⟨10.1016/j.immuni.2017.09.009⟩
Article dans une revue inserm-01624830v1
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Yersinia pestis genome sequencing identifies patterns of global phylogenetic diversity.

 Giovanna Morelli , Yajun Song , Camila J Mazzoni , Mark Eppinger , Philippe Roumagnac , et al.
Nature Genetics, 2010, 42 (12), pp.1140-3. ⟨10.1038/ng.705⟩
Article dans une revue pasteur-00836130v1

Population genetics of microbial pathogens estimated from Multilocus Sequence Typing (MLST) data

 M. Perez-Losada , Browne Eb , A. Madsen , T. Wirth , Viscidi Rp , et al.
Infection, Genetics and Evolution, 2006, 6, pp.97-112
Article dans une revue hal-00174836v1

The rise and spread of a new pathogen: seroresistant Moraxella catarrhalis

 T. Wirth , G. Morelli , Van Belkum A , Van Der Scgee C , A. Meyer , et al.
Genome Research, 2007, sous presse
Article dans une revue hal-00173850v1
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Compensatory evolution drives multidrug-resistant tuberculosis in Central Asia

 Matthias Merker , Maxime Barbier , Helen Cox , Jean-Philippe Rasigade , Silke Feuerriegel , et al.
eLife, 2018, 7, pp.e38200. ⟨10.7554/eLife.38200⟩
Article dans une revue hal-01919482v1
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Demographic fluctuation of community-acquired antibiotic-resistant Staphylococcus aureus lineages: potential role of flimsy antibiotic exposure

 Claude-Alexandre Gustave , Anne Tristan , Patricia Martins-Simões , Marc Stegger , Yvonne Benito , et al.
The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2018, 12 (8), pp.1879-1894. ⟨10.1038/s41396-018-0110-4⟩
Article dans une revue hal-01910910v1
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Conservatism and novelty in the genetic architecture of adaptation in Heliconius butterflies.

 B. Huber , A. Whibley , Y. Le Poul , Nicolas Navarro , A. Martin , et al.
Heredity, 2015, 114 (5), pp.515-524. ⟨10.1038/hdy.2015.22⟩
Article dans une revue hal-01145612v1
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