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Pratiques et représentations induites par la mise en banque de la part ontologique informationnelle du vivant

 Sonia Dheur , Sven J Saupe
Biobanques : Quelles reconfigurations pour le vivant ? Approches interdisciplinaires et comparatives, Fabien Milanovic (Sup’Biotech Paris), Noémie Merleau-Ponty (MIT-LAIOS) et Perig Pitrou (CNRS-LAS), May 2016, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01485998v1
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Identification of NLR-associated amyloid signaling motifs in bacterial genomes.

 Witold Dyrka , Virginie Coustou , Asen Daskalov , Alons Lends , Thierry Bardin , et al.
Journal of Molecular Biology, 2020, 432, pp.6005 - 6027. ⟨10.1016/j.jmb.2020.10.004⟩
Article dans une revue hal-02989877v1

Introductions, discussions et conclusions des Journées d'étude "Mutations du mythe de l'ADN

 Sonia Dheur , Sven J Saupe
Projet PEPS de la Mission pour l'interdisciplinarité, l'INSHS du CNRS et le Réseau national des Maisons des Sciences humaines, Dec 2016, Bordeaux, France
Communication dans un congrès halshs-02924000v1
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Les scores polygéniques pangénomiques comme nouvelle forme de mesure de l'humain

 Sonia Dheur , Sven J Saupe
Bulletin d’histoire et d’épistémologie des sciences de la vie , 2020, 27 (1), pp.67-83. ⟨10.3917/bhesv.271.0067⟩
Article dans une revue halshs-02283909v1

Theme and variations, musical transposition of prion protein sequences into music and retrotransposition of musical motifs into protein sequences

 Sonia Dheur , Clément Libes , Sven J Saupe
Rencontres Art & Sciences Neurosciences, Epistémologie et Nouveaux Paradigmes - GDR ESARS, Feb 2016, Paris, France
Poster de conférence halshs-02080460v1

Fungal gasdermin-like proteins are controlled by proteolytic cleavage

 Corinne Clavé , Witold Dyrka , Elizabeth Turcotte , Alexandra Granger-Farbos , Léa Ibarlosa , et al.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2022, 119 (7), ⟨10.1073/pnas.2109418119⟩
Article dans une revue hal-03812364v1
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Deciphering the language of fungal pathogen recognition receptors

 Witold Dyrka , Pascal Durrens , Sven J Saupe , Mathieu Paoletti , David James Sherman
EMBO Young Scientists Forum 2015, Jul 2015, Warsaw, Poland. , 2015
Poster de conférence hal-01171745v1
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Le vivant comme information. Une perspective subjective sur une crise en biologie

 Sonia Dheur , Sven J Saupe
Revue des Sciences sociales, 2016, Indiscipliné.e.s, 56, pp.1-15. ⟨10.4000/revss.411⟩
Article dans une revue halshs-01445806v2
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Protein Folding Activity of Ribosomal RNA Is a Selective Target of Two Unrelated Antiprion Drugs

 Déborah Tribouillard-Tanvier , Suzana dos Reis , Fabienne Gug , Cécile Voisset , Vincent Béringue , et al.
PLoS ONE, 2008, 3 (5), pp.e2174. ⟨10.1371/journal.pone.0002174⟩
Article dans une revue hal-02134950v1
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Overlapping Podospora anserina transcriptional responses to bacterial and fungal non self indicate a multilayered innate immune response

 Marina Lamacchia , Witold Dyrka , Annick Breton , Sven J Saupe , Mathieu Paoletti
Frontiers in Microbiology, 2016, 7, pp.471. ⟨10.3389/fmicb.2016.00471⟩
Article dans une revue hal-01293719v1

The Mechanism of Toxicity in HET-S/HET-s Prion Incompatibility.

 Carolin Seuring , Jason Greenwald , Christian Wasmer , Roger Wepf , Sven J Saupe , et al.
PLoS Biology, 2012, 10 (12), pp.e1001451. ⟨10.1371/journal.pbio.1001451⟩
Article dans une revue hal-00787324v1
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Diversity and variability of NOD-like receptors in fungi

 Witold Dyrka , Marina Lamacchia , Pascal Durrens , Bostjan Kobe , Asen Daskalov , et al.
Genome Biology and Evolution, 2014, in press. ⟨10.1093/gbe/evu251⟩
Article dans une revue hal-01083450v1
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Backbone and side-chain proton NMR assignment in fully protonated proteins: microcrystals, sedimented assemblies, and amyloid fibrils

 Jan Stanek , Loren B Andreas , Kristaps Jaudzems , Diane Cala , Daniela Lalli , et al.
Angewandte Chemie International Edition, 2016, 55 (50), pp.15504-15509. ⟨10.1002/anie.201607084⟩
Article dans une revue hal-01567784v1
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ADN, métabolisme et individualité dans la biologie philosophique de Hans Jonas

 Sonia Dheur , Sven J Saupe
Bulletin d’histoire et d’épistémologie des sciences de la vie , 2019, 26 (2), pp.223-238. ⟨10.3917/bhesv.262.0223⟩
Article dans une revue halshs-02283879v1

Proteins as monads

 Sonia Dheur , Sven J Saupe
Symposium "On Activity", "Symbolic Material" and “Weaving” projects of the Cluster of Excellence "Matters of Activity - Image Space Material", Humboldt University, Feb 2020, Berlin, Germany. ⟨10.1515/9783110562064-016⟩
Communication dans un congrès halshs-02444011v1
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Deciphering the language of fungal pathogen recognition receptors

 Witold Dyrka , Pascal Durrens , Mathieu Paoletti , Sven J Saupe , David J Sherman
2014
Pré-publication, Document de travail hal-01083421v1

The Transcriptional Response to Nonself in the Fungus Podospora anserina.

 Frédérique Bidard , Corinne Clavé , Sven J Saupe
G3, 2013, 3 (6), pp.1015-30. ⟨10.1534/g3.113.006262⟩
Article dans une revue hal-00843876v1

Detection of side-chain proton resonances of fully protonated biosolids in nano-litre volumes by magic angle spinning solid-state NMR

 James Tolchard , Manoj Kumar Pandey , Melanie Berbon , Abdelmajid Noubhani , Sven J. Saupe , et al.
Journal of Biomolecular NMR, In press, 70, pp.177-185. ⟨10.1007/s10858-018-0168-3⟩
Article dans une revue hal-02536705v1

Proteins as monads

 Sonia Dheur , Sven J Saupe
In Peter Fratzl, Michael Friedman, Karin Krauthausen and Wolfgang Schäffner. Active Materials, De Gruyter, pp.339-366, 2021, ISBN 978-3-11-056181-4. ⟨10.1515/9783110562064-016⟩
Chapitre d'ouvrage halshs-02283978v1

Side-Chain Protons are Back with > 100kHz MAS

 Jan Stanek , Loren B Andreas , Kristaps Jaudzems , Diane Cala - de Paepe , Daniela Lalli , et al.
ENC 2017 - 58th Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference , Mar 2017, Pacific Grove, United States, United States
Communication dans un congrès hal-01577264v1
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Theme and variations: evolutionary diversification of the HET-s functional amyloid motif

 Asen Daskalov , Witold Dyrka , Sven J Saupe
Scientific Reports, 2015, 5, pp.12494. ⟨10.1038/srep12494⟩
Article dans une revue hal-01202835v1

A gene responsible for vegetative incompatibility in the fungus Podospora anserina encodes a protein with a GTP-binding motif and Gβ homologous domain

 Sven J Saupe , Béatrice Turcq , Joël Bégueret
Gene, 1995, 162 (1), pp.135-139. ⟨10.1016/0378-1119(95)00272-8⟩
Article dans une revue istex hal-03155314v1
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Quand la biogéographie métagénomique reconfigure les spatialités

 Sonia Dheur , Sven J Saupe
EspacesTemps.net, 2019, in Matthieu Noucher, Irène Hirt et Xavier Arnaud de Sartre, Métrologies critiques de l’espace, ⟨10.26151/espacestemps.net-388a-dd19⟩
Article dans une revue halshs-02283892v2

The [Het-s] prion, an amyloid fold as a cell death activation trigger.

 Sven J Saupe , Asen Daskalov
PLoS Pathogens, 2012, 8 (5), pp.e1002687. ⟨10.1371/journal.ppat.1002687⟩
Article dans une revue hal-00735764v1
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Exploring a diverse world of effector domains and amyloid signaling motifs in fungal NLR proteins

 Jakub W Wojciechowski , Emirhan Tekoglu , Marlena Gąsior-Głogowska , Virginie Coustou , Natalia Szulc , et al.
PLoS Computational Biology, 2022, 18 (12), pp.e1010787. ⟨10.1371/journal.pcbi.1010787⟩
Article dans une revue hal-04295229v1

Le hasard, le hasard et la nécessité : la place des processus évolutifs non-adaptatifs dans une philosophie naturelle de la biologie

 Sonia Dheur , Sven J Saupe
Le hasard dans les sciences du vivant et la théorie de l’évolution, A paraître
Chapitre d'ouvrage halshs-03696957v1

NLR surveillance of essential SEC-9 SNARE proteins induces programmed cell death upon allorecognition in filamentous fungi

 Jens Heller , Corinne Clavé , Pierre Gladieux , Sven J. Saupe , N. Louise Glass
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2018, 115 (10), pp.E2292-E2301. ⟨10.1073/pnas.1719705115⟩
Article dans une revue hal-02624524v1

Thioflavin-T excimer formation upon interaction with amyloid fibers.

 Raimon Sabate , Luis Rodriguez-Santiago , Mariona Sodupe , Sven J Saupe , Salvador Ventura
Chemical Communications, 2013, 49 (51), pp.5745-7. ⟨10.1039/c3cc42040j⟩
Article dans une revue hal-00843882v1

Sur les traits spécifiques et partagés entre les plantes et les autres formes de vie

 Sven J Saupe , Sonia Dheur
Quelles Plantes sommes-nous ? Formes de vie partagées entre l’homme et la plante, Université de Franche Comté - Département de philosophie - EA 2274 Logiques de l'Agir - Sarah Carvallo et Arnaud Macé, Oct 2020, Besançon, La Saline Royale d'Arc-et-Senans, France
Communication dans un congrès halshs-02968495v1

Prion proteins : the différance in the fold

 Sonia Dheur , Sven J Saupe
The Fold (EnsAD/ESPCI), Peter Fratzl (MPI of Colloids and Interfaces, Potsdam) Michael Friedman (Humboldt University, Berlin) Benoît Roman (ESPCI, Paris) Dominique Peysson (EnsAD, Paris), Sep 2016, Paris, France
Communication dans un congrès halshs-01445907v1
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