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Stéphanie DAVAL

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Présentation

Analyses fonctionnelles des interactions "Microbiote / Plante / Bio-agresseur"
Les plantes hébergent des communautés microbiennes (microbiotes) composées de bactéries, champignons, oomycètes, virus, archae et protistes. Ces organismes se trouvent notamment dans les racines et la rhizosphère (région du sol directement formée et influencée par les racines), ainsi que dans les feuilles et les graines. Les microbes sont attirés par les nutriments fournis par la plante et sont sélectionnés à partir du milieu environnant (sol, eau et air), vraisemblablement par le système immunitaire de la plante, les exsudats que la plante sécrète dans le sol à proximité immédiate de la racine et leur capacité de compétition vis-à-vis d’autres microbes. La structure et la composition des communautés microbiennes associées aux plantes, ainsi que le réseau complexe d'interactions entre les espèces microbiennes, sont cruciaux pour la tolérance au stress, la dynamique de développement des plantes, le rendement, la nutrition mais aussi la santé. Afin de mieux comprendre les interactions complexes tripartites entre les plantes, les parasites des racines et les microbiotes associés aux plantes, et plus particulièrement les mécanismes par lesquels les microbes du sol stimulent la croissance et la défense des plantes et/ou modulent le développement et la pathogénicité des agents pathogènes, un défi majeur consiste à coupler les études descriptives à des études fonctionnelles. Dans ce cadre, mon projet de recherche vise à identifier les gènes et fonctions (du microbiote, du bioagresseur et/ou de la plante) impliqués dans cette modulation du dialogue tripartite, valider leur(s) rôle(s) fonctionnel(s), par des approches de (méta)-transcriptomique, et mobiliser ces connaissances en santé des cultures.

Publications

maria-manzanares-dauleux
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Multi-omic investigation of low-nitrogen conditional resistance to clubroot reveals Brassica napus genes involved in nitrate assimilation

Y Aigu , Stéphanie Daval , Kévin Gazengel , Nathalie Marnet , C Lariagon
Frontiers in Plant Science, 2022, 13, pp.790563. ⟨10.3389/fpls.2022.790563⟩
Article dans une revue hal-03531145v1
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Nitrogen Supply and Host-Plant Genotype Modulate the Transcriptomic Profile of Plasmodiophora brassicae

Kévin Gazengel , Yoann Aigu , Christine Lariagon , Mathilde Humeau , Antoine Gravot
Frontiers in Microbiology, 2021, 12, pp.701067. ⟨10.3389/fmicb.2021.701067⟩
Article dans une revue hal-03336692v1
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Soil microbiota influences clubroot disease by modulating Plasmodiophora brassicae and Brassica napus transcriptomes

Stéphanie Daval , Kévin Gazengel , Arnaud Belcour , Juliette Linglin , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt
Microbial Biotechnology, 2020, 13 (5), pp.1648-1672. ⟨10.1111/1751-7915.13634⟩
Article dans une revue hal-02624824v2
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Computational analysis of the Plasmodiophora brassicae genome: mitochondrial sequence description and metabolic pathway database design

Stéphanie Daval , Arnaud Belcour , Kévin Gazengel , Ludovic Legrand , Jerome Gouzy
Genomics, 2019, 111 (6), pp.1629-1640. ⟨10.1016/j.ygeno.2018.11.013⟩
Article dans une revue hal-01943250v1
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Temporal dynamics of bacterial and fungal communities during the infection of Brassica rapa roots by the protist Plasmodiophora brassicae.

Lionel Lebreton , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Kévin Gazengel , Juliette Linglin , Morgane Ourry
PLoS ONE, 2019, 14 (2), pp.e0204195. ⟨10.1371/journal.pone.0204195⟩
Article dans une revue hal-02094715v1

Influence of nitrogen constraint on quantitative resistance to clubroot in Brassica napus

Antoine Gravot , Anne Laperche , Stéphanie Daval , Yoann Aigu , Solenn Guichard
21st Crucifer Genetics Conference - Brassica - Wokshop Clubroot, 2018, Saint-Malo, France
Communication dans un congrès hal-03348628v1

Influence of nitrogen constraint on quantitative resistance to clubroot in Brassica napus

Antoine Gravot , Yoann Aigu , Anne Laperche , Stéphanie Daval , Solenn Guichard
International Clubroot Workshop, 2018, Edmonton, Canada
Communication dans un congrès hal-03349054v1

Quantitative resistance to clubroot and interactions with abiotic stresses

Antoine Gravot , Anne Laperche , Stéphanie Daval , Yoann Aigu , Solenn Guichard
IOBC-WPRS WG 'Pesticides and Beneficial Organisms', 2018, Zagreb, Croatia. pp.25-26
Communication dans un congrès hal-03349115v1
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Does the soil microbiota diversity influence the interactions between Brassica napus and its bioagressors ?

Lionel Lebreton , Valérie Chaminade , Anne Marie Cortesero , Stéphanie Daval , Sylvain Fournet
Phytobiome, Dec 2018, Montpellier, France
Poster de conférence hal-03232457v1

The soil microbiota diversity influences clubroot disease by modulation of host plant and pathogen transcriptomes

Stéphanie Daval , Kévin Gazengel , Arnaud Belcour , Juliette Linglin , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt
Pathobiome, Mar 2018, Ajaccio, France
Poster de conférence hal-03348609v1

Does the soil microbiota modulate the interactions between Brassica napus and its bioagressors?

Lionel Lebreton , Anne-Marie Cortesero , Stéphanie Daval , Sylvain Fournet , Kévin Gazengel
Pathobiome, Mar 2018, Ajaccio, France
Poster de conférence hal-03348613v1

Influence of soil microbial diversity and host plant genotype on the structure and diversity of root microbiota of Brassica napus infected with Plasmodiophora brassicae

Alain Sarniguet , Lionel Lebreton , Kévin Gazengel , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Juliette Linglin
International Phytobiomes Conference, Dec 2018, Montpellier, France
Poster de conférence hal-03348615v1

Influence de la diversité du microbiome du sol sur l'agent pathogène tellurique responsable de la hernie des crucifères

Arnaud Belcour , Kévin Gazengel , Lionel Lebreton , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Juliette Linglin
Journées d'animation du réseau PhytoMic, Nov 2017, Paris, France
Poster de conférence hal-03348606v1