Stéphanie DAVAL
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- stephanie-daval
- 0000-0001-8848-4190
Présentation
Analyses fonctionnelles des interactions "Microbiote / Plante / Bio-agresseur"
Les plantes hébergent des communautés microbiennes (microbiotes) composées de bactéries, champignons, oomycètes, virus, archae et protistes. Ces organismes se trouvent notamment dans les racines et la rhizosphère (région du sol directement formée et influencée par les racines), ainsi que dans les feuilles et les graines. Les microbes sont attirés par les nutriments fournis par la plante et sont sélectionnés à partir du milieu environnant (sol, eau et air), vraisemblablement par le système immunitaire de la plante, les exsudats que la plante sécrète dans le sol à proximité immédiate de la racine et leur capacité de compétition vis-à-vis d’autres microbes. La structure et la composition des communautés microbiennes associées aux plantes, ainsi que le réseau complexe d'interactions entre les espèces microbiennes, sont cruciaux pour la tolérance au stress, la dynamique de développement des plantes, le rendement, la nutrition mais aussi la santé. Afin de mieux comprendre les interactions complexes tripartites entre les plantes, les parasites des racines et les microbiotes associés aux plantes, et plus particulièrement les mécanismes par lesquels les microbes du sol stimulent la croissance et la défense des plantes et/ou modulent le développement et la pathogénicité des agents pathogènes, un défi majeur consiste à coupler les études descriptives à des études fonctionnelles. Dans ce cadre, mon projet de recherche vise à identifier les gènes et fonctions (du microbiote, du bioagresseur et/ou de la plante) impliqués dans cette modulation du dialogue tripartite, valider leur(s) rôle(s) fonctionnel(s), par des approches de (méta)-transcriptomique, et mobiliser ces connaissances en santé des cultures.
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Strain-specific variation in a soilborne phytopathogenic fungus for the expression of genes involved in pH signal transduction pathway, pathogenesis and saprophytic survival in response to environmental pH changesFungal Genetics and Biology, 2013, 61, pp.80-89. ⟨10.1016/j.fgb.2013.09.009⟩
Article dans une revue
hal-01208686v1
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Genomic analysis of the biocontrol strain Pseudomonas fluorescens Pf29Arp with evidence of T3SS and T6SS gene expression on plant rootsEnvironmental Microbiology Reports, 2013, 5 (3), pp.393 - 403. ⟨10.1111/1758-2229.12048⟩
Article dans une revue
hal-01208629v1
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Simultaneous monitoring of two fungal genotypes on plant roots by single nucleotide polymorphism quantification with an innovative KASPar quantitative PCRMycological Progress, 2013, 12 (4), pp.657 - 666. ⟨10.1007/s11557-012-0872-4⟩
Article dans une revue
hal-01208672v1
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Influence de T6SS sur la compétence rhizosphérique de la souche phytoprotectrice Pseudomonas fluorescens Pf29Arp.11e Rencontres Plantes-Bactéries, Feb 2014, Aussois, France
Communication dans un congrès
hal-03347772v1
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