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Stéphanie DAVAL

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Documents
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Présentation

Analyses fonctionnelles des interactions "Microbiote / Plante / Bio-agresseur"
Les plantes hébergent des communautés microbiennes (microbiotes) composées de bactéries, champignons, oomycètes, virus, archae et protistes. Ces organismes se trouvent notamment dans les racines et la rhizosphère (région du sol directement formée et influencée par les racines), ainsi que dans les feuilles et les graines. Les microbes sont attirés par les nutriments fournis par la plante et sont sélectionnés à partir du milieu environnant (sol, eau et air), vraisemblablement par le système immunitaire de la plante, les exsudats que la plante sécrète dans le sol à proximité immédiate de la racine et leur capacité de compétition vis-à-vis d’autres microbes. La structure et la composition des communautés microbiennes associées aux plantes, ainsi que le réseau complexe d'interactions entre les espèces microbiennes, sont cruciaux pour la tolérance au stress, la dynamique de développement des plantes, le rendement, la nutrition mais aussi la santé. Afin de mieux comprendre les interactions complexes tripartites entre les plantes, les parasites des racines et les microbiotes associés aux plantes, et plus particulièrement les mécanismes par lesquels les microbes du sol stimulent la croissance et la défense des plantes et/ou modulent le développement et la pathogénicité des agents pathogènes, un défi majeur consiste à coupler les études descriptives à des études fonctionnelles. Dans ce cadre, mon projet de recherche vise à identifier les gènes et fonctions (du microbiote, du bioagresseur et/ou de la plante) impliqués dans cette modulation du dialogue tripartite, valider leur(s) rôle(s) fonctionnel(s), par des approches de (méta)-transcriptomique, et mobiliser ces connaissances en santé des cultures.

Publications

anne-yvonne-guillerm-erckelboudt

pH effect on strain-specific transcriptomes of the take-all fungus

Kévin Gazengel , Lionel Lebreton , Nicolas Lapalu , Joëlle Amselem , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt
PLoS ONE, 2020, 15 (7), pp.e0236429. ⟨10.1371/journal.pone.0236429⟩
Article dans une revue hal-02979591v1
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Soil microbiota influences clubroot disease by modulating Plasmodiophora brassicae and Brassica napus transcriptomes

Stéphanie Daval , Kévin Gazengel , Arnaud Belcour , Juliette Linglin , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt
Microbial Biotechnology, 2020, 13 (5), pp.1648-1672. ⟨10.1111/1751-7915.13634⟩
Article dans une revue hal-02624824v2
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Temporal dynamics of bacterial and fungal communities during the infection of Brassica rapa roots by the protist Plasmodiophora brassicae.

Lionel Lebreton , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Kévin Gazengel , Juliette Linglin , Morgane Ourry
PLoS ONE, 2019, 14 (2), pp.e0204195. ⟨10.1371/journal.pone.0204195⟩
Article dans une revue hal-02094715v1

Sensitivity to pH and ability to modify ambient pH of the take-all fungus Gaeumannomyces graminis var. tritici

Lionel Lebreton , Stéphanie Daval , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Cécile Gracianne , Kévin Gazengel
Plant Pathology, 2014, 63 (1), pp.117-128. ⟨10.1111/ppa.12062⟩
Article dans une revue hal-01208757v1

Strain-specific variation in a soilborne phytopathogenic fungus for the expression of genes involved in pH signal transduction pathway, pathogenesis and saprophytic survival in response to environmental pH changes

Stéphanie Daval , Lionel Lebreton , Cécile Gracianne , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Morgane Boutin
Fungal Genetics and Biology, 2013, 61, pp.80-89. ⟨10.1016/j.fgb.2013.09.009⟩
Article dans une revue hal-01208686v1

Simultaneous monitoring of two fungal genotypes on plant roots by single nucleotide polymorphism quantification with an innovative KASPar quantitative PCR

Kévin Gazengel , Lionel Lebreton , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Muriel Marchi , Alain Sarniguet
Mycological Progress, 2013, 12 (4), pp.657 - 666. ⟨10.1007/s11557-012-0872-4⟩
Article dans une revue hal-01208672v1

Genomic analysis of the biocontrol strain Pseudomonas fluorescens Pf29Arp with evidence of T3SS and T6SS gene expression on plant roots

Muriel Marchi , Morgane Boutin , Kévin Gazengel , Claude Rispe , Jean-Pierre Gauthier
Environmental Microbiology Reports, 2013, 5 (3), pp.393 - 403. ⟨10.1111/1758-2229.12048⟩
Article dans une revue hal-01208629v1
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The biocontrol bacterium Pseudomonas fluorescens Pf29Arp strain affects the pathogenesis-related gene expression of the take-all fungus Gaeumannomyces graminis var. tritici on wheat roots

Stéphanie Daval , Lionel Lebreton , Kévin Gazengel , Morgane Boutin , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt
Molecular Plant Pathology, 2011, 12 (9), pp.839-854. ⟨10.1111/j.1364-3703.2011.00715.x⟩
Article dans une revue hal-02651447v1

Genetic evidence for differentiation of Gaeumannomyces graminis var. tritici into two major groups

Stéphanie Daval , Lionel Lebreton , Kévin Gazengel , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Alain A. Sarniguet
Plant Pathology, 2010, 59 (1), pp.165-178. ⟨10.1111/j.1365-3059.2009.02158.x⟩
Article dans une revue hal-02662269v1
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Does the soil microbiota diversity influence the interactions between Brassica napus and its bioagressors ?

Lionel Lebreton , Valérie Chaminade , Anne Marie Cortesero , Stéphanie Daval , Sylvain Fournet
Phytobiome, Dec 2018, Montpellier, France
Poster de conférence hal-03232457v1

The soil microbiota diversity influences clubroot disease by modulation of host plant and pathogen transcriptomes

Stéphanie Daval , Kévin Gazengel , Arnaud Belcour , Juliette Linglin , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt
Pathobiome, Mar 2018, Ajaccio, France
Poster de conférence hal-03348609v1

The soil microbiota diversity influences clubroot disease by modulation of Brassica napus and Plasmodiophora brassicae transcriptomes

Stéphanie Daval , Kévin Gazengel , Arnaud Belcour , Juliette Linglin , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt
International Phytobiomes Conference, Dec 2018, Montpellier, France
Poster de conférence hal-03348616v1

Does the soil microbiota modulate the interactions between Brassica napus and its bioagressors?

Lionel Lebreton , Anne-Marie Cortesero , Stéphanie Daval , Sylvain Fournet , Kévin Gazengel
Pathobiome, Mar 2018, Ajaccio, France
Poster de conférence hal-03348613v1

Influence of soil microbial diversity and host plant genotype on the structure and diversity of root microbiota of Brassica napus infected with Plasmodiophora brassicae

Alain Sarniguet , Lionel Lebreton , Kévin Gazengel , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Juliette Linglin
International Phytobiomes Conference, Dec 2018, Montpellier, France
Poster de conférence hal-03348615v1

Influence de la diversité du microbiome du sol sur l'agent pathogène tellurique responsable de la hernie des crucifères

Arnaud Belcour , Kévin Gazengel , Lionel Lebreton , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Juliette Linglin
Journées d'animation du réseau PhytoMic, Nov 2017, Paris, France
Poster de conférence hal-03348606v1
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Dynamics of bacterial and fungal rhizosphere communities during the infection of Brassica rapa roots by the protist Plasmodiophora brassicae

Lionel Lebreton , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Kévin Gazengel , Stéphanie Daval , Alain Sarniguet
Pathobiome, Jun 2015, Maison-Alfort, France
Poster de conférence hal-03231661v1

Dynamique des communautés bactériennes et fongiques de la rhizosphère au cours de l’infection de racines de Brassica rapa par le protiste obligatoire, agent de la hernie des crucifères, Plasmodiophora brassicae.

Lionel Lebreton , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Kévin Gazengel , Stéphanie Daval , Alain Sarniguet
9e Colloque de la Société Française de Phytopathologie., Jun 2015, Colmar, France
Poster de conférence hal-03348604v1

Influence of type VI secretion system (T6SS) on rhizosphere competence of a rhizobacterium.

Marchi Muriel , Charline Lecomte , Morgane Boutin , Kévin Gazengel , C. Rispe
ISME 15th conference., 2014, Séoul, South Korea
Poster de conférence hal-03347842v1

Role of the Type VI secretion system of Pseudomonas fluorescens Pf29Arp in biofilm process.

Marchi Muriel , Maxime R Hervé , Charline Lecomte , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Kévin Gazengel
14th International Symposium on Microbial Ecology., Aug 2012, Copenhague, Denmark
Poster de conférence hal-03347835v1

Multiple approach at gene, genome and transcriptome levels for deciphering biological mechanisms of soil suppressiveness of a plant root disease.

Alain Sarniguet , Lionel Lebreton , Stéphanie Daval , Morgane Boutin , Kévin Gazengel
28th New Phytologist Symposium Functions and ecology of the plant microbiome., 2012, Rhodes, Greece
Poster de conférence hal-03347848v1

Méthode innovante de real-time PCR développée à partir du système KASPar : application au suivi simultané de deux génotypes d’un champignon phytopathogène sur racines de blé par quantification de SNP.

Kévin Gazengel , Lionel Lebreton , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Marchi Muriel , Alain Sarniguet
9e Rencontres de Phytopathologie - Mycologie de la Société Française de Phytopathologie, Jan 2012, Aussois, France
Poster de conférence hal-03347741v1

Variabilité phénotypique de sensibilité et d’adaptation aux variations de pH des populations de Gaeumannomyces graminis var. tritici, champignon tellurique parasite des racines du blé.

Lionel Lebreton , Stéphanie Daval , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Cécile Gracianne , Kévin Gazengel
9e Rencontres de Phytopathologie - Mycologie de la Société Française de Phytopathologie, Jan 2012, Aussois, France
Poster de conférence hal-03347750v1

Variabilité du déterminisme génétique de la réponse au pH chez un champignon pathogène du blé, Gaeumannomyces graminis var. tritici

Stéphanie Daval , Lionel Lebreton , Cécile Gracianne , Kévin Gazengel , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt
9e Rencontres de Phytopathologie - Mycologie de la Société Française de Phytopathologie, Jan 2012, Aussois, France
Poster de conférence hal-03347496v1

Multiple approach at gene, genome and transcriptome levels for deciphering biological mechanisms of soil suppressiveness of a plant root disease.

Alain Sarniguet , Lionel Lebreton , Stéphanie Daval , Morgane Boutin , Kévin Gazengel
Ecole Thématique Expert Génomique Environnementale, Evolution, Diversité et Fonctionnement des Organismes et Ecosystes à l’ère des Nouvelles Technologies de Séquençage, 2012, Aussois, France
Poster de conférence hal-03347784v1

Diversité phénotypique et déterminisme génétique de l'adaptation aux variations de pH dans les populations du champignon tellurique responsable du piétin-échaudage du blé.

Lionel Lebreton , Stéphanie Daval , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Cécile Gracianne , Kévin Gazengel
8e colloque national de la Société Française de Phytopathologie, Jun 2012, Paris, France
Poster de conférence hal-03347819v1

Influence d’une bactérie antagoniste sur l’expression in planta de gènes du pouvoir pathogène de Gaeumannomyces graminis var. tritici.

Stéphanie Daval , Lionel Lebreton , Kévin Gazengel , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Morgane Boutin
8e Rencontres de Phytopathologie - Mycologie de la Société Française de Phytopathologie, 2010, Aussois, France
Poster de conférence hal-03347802v1

Existence de deux groupes de génotypes dans les populations de Gaeumannomyces graminis var tritici, agent du piétin-échaudage du blé.

Stéphanie Daval , Lionel Lebreton , Kévin Gazengel , Anne-Yvonne Guillerm-Erckelboudt , Alain Sarniguet
7e colloque national de la Société Française de Phytopathologie, Jun 2009, Lyon, France
Poster de conférence hal-03347808v1