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Sophie ALLAIS
Maître de conférences en génétique animale à L'Institut Agro Rennes-Angers, centre de Rennes.
Recherche au sein de l'UMR PEGASE et du département GA d'INRAE
48
Documents
Affiliations actuelles
- 1096415
Identifiants chercheurs
sophie-allais-
0000-0002-0138-331X
- IdRef : 117490784
Compétences
animal genetics
quantitative genetics
GWAS
genomic selection
Publications
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Variant calling and genotyping accuracy of ddRAD-seq: comparison with WGS in layers74. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), Aug 2023, Lyon, France. Wageningen Academic Publishers, Book of abstracts, 29, pp.796, 2023, Book of abstracts of the 74th annual meeting of the european federation of animal science
Poster de conférence
hal-04286708v1
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Genetic determinism of abdominal fat tissue and relationships with body weight and egg quality in Rhode Island RedXIth European symposium on poultry genetics (ESPG), Oct 2019, Prague, Czech Republic. Guarant International spol. s r.o., 2019, Proceedings of the XIth European symposium on Poultry Genetics
Poster de conférence
hal-02352490v1
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Accuracy of whole-genome sequence genotype imputation in a layer lineXIth European symposium on poultry genetics (ESPG), Oct 2019, Prague, Czech Republic. Guarant International spol. s r.o., 2019, Proceedings of the XIth European symposium on Poultry Genetics
Poster de conférence
hal-02500398v1
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Use of data from crossbred animals for a genomic evaluation of pure line layerXIth European symposium on poultry genetics (ESPG), Oct 2019, Prague, Czech Republic. Guarant International spol. s r.o., 2019, Proceedings of the XIth European symposium on Poultry Genetics
Poster de conférence
hal-02352494v1
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Interest of Genotyping-by-Sequencing technologies as an alternative to low density SNP chips for genomic selection in layer chickenXIth European symposium on poultry genetics (ESPG), Oct 2019, Prague, Czech Republic. Guarant International spol. s r.o., 2019, Proceedings of the XIth European symposium on Poultry Genetics
Poster de conférence
hal-02460147v1
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Estimation of additive and dominant variance of egg quality traits in pure-line layersXIth European symposium on poultry genetics (ESPG), Oct 2019, Prague, Czech Republic. Guarant International spol. s r.o., 2019, Proceedings of the XIth European symposium on Poultry Genetics
Poster de conférence
hal-02460149v1
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Design of a low density SNP chip for genomic selection in layer chicken10. European Symposium on Poultry Genetics (ESPG), Jun 2017, Saint-Malo, France. 2017, Proceedings of the 10th European symposium on poultry genetics
Poster de conférence
hal-01605421v1
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Création d’une puce basse-densité pour la sélection génomique en poule pondeuse12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 2017, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras
Poster de conférence
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Fine mapping of QTL for carcass and meat quality traits in a chicken slow-growing line10. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Aug 2014, Vancouver, Canada. 2014, 10. World Congress of Genetics Applied to Livestock Production
Poster de conférence
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Fine mapping of QTLs of meat quality in three French beef breeds using the Bovine SNP50® chip21. Plant and Animal Genome (PAG), Jan 2013, San Diego, United States. , 2013, Plant and Animal Genome XXI
Poster de conférence
hal-01189939v1
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Fine mapping of QTL of carcass and meat quality traits in a chicken slow-growing line64. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2013, Nantes, France. Wageningen Academic Publishers, Annual Meeting of the European Association for Animal Production, 64, 2013, Annual Meeting of the European Association for Animal Production
Poster de conférence
hal-01210523v1
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Détection fine de QTL de tendreté de la viande dans trois races allaitantes françaises14. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Nov 2012, Caen, France. 2012
Poster de conférence
hal-01193865v1
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The effects of polymorphisms in the calpastatin and µ-calpain genes on beef tenderness are breed-specific61. Annual meeting of the European Association for Animal Production, Aug 2010, Heraklion, Greece. Wageningen Academic Publishers, Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Book of Abstracts N°16, 398 p., 2010, Annual Meeting of the European Association for Animal Production
Poster de conférence
hal-01193772v1
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Apport des informations sur des croisées dans le cadre de l’évaluation génomique sur la qualité des œufs chez la poule13.Journées de la recherche avicole et des palmipèdes à foie gras, Mar 2019, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-02737371v1
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Étude du déséquilibre de liaison dans des lignées de poules de types génétiques "ponte" et "chair"13.Journées de la recherche avicole et des palmipèdes à foie gras, Mar 2019, Tours, France. pp.85-89
Communication dans un congrès
hal-02360227v1
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Intérêt de l’utilisation de l’imputation pour l’évaluation génomique en poule pondeuse13.Journées de la recherche avicole et des palmipèdes à foie gras, Mar 2019, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-02737801v1
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Impact of the size of the reference population and kinship degree on low density genotyping strategies for genotype imputation in layer chickens11. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Feb 2018, Auckland, New Zealand
Communication dans un congrès
hal-01794798v1
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A linkage disequilibrium study in layers and broiler commercial chicken populations11. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Feb 2018, Auckland, New Zealand
Communication dans un congrès
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Design of a low density SNP chip for genotype imputation in layer chickens11. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Feb 2018, Auckland, New Zealand
Communication dans un congrès
hal-01791813v1
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Accuracy of genomic evaluation in pure line layers11. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), Feb 2018, Auckland, New Zealand
Communication dans un congrès
hal-01791814v1
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Select SNP 4 Imputation (SS4I) : un outil simple de sélection de SNP en fonction du DLRéunion du projet Selgen INCoMINGS, Oct 2016, La Rochelle, France
Communication dans un congrès
hal-01455928v1
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Cartographie fine de QTL de qualité de la carcasse et de la viande dans une lignée de poulets à croissance lente11. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2015, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-01210952v1
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Using genomic information provided by selection schemes to assess French dairy breeds diversity63. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2012, Bratislava, Slovakia. 476 p., ⟨10.3920/978-90-8686-761-5⟩
Communication dans un congrès
hal-02745491v1
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La génomique : un travail de longue haleineSatellite 3T (Actualité, Technicité, Nouveauté) des 3R, Institut de l'Elevage (IDELE). Service qualité des viandes, Paris, FRA., Dec 2011, Paris (FRA), France
Communication dans un congrès
hal-01000788v1
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Effects of polymorphisms in the calpastatin and µ-calpain genes onmeat tenderness in three French beef breeds9. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany
Communication dans un congrès
hal-01193771v1
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A particular myosin heavy chain isoform variable between beef breeds61. Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), Aug 2010, Heraklion, Greece
Communication dans un congrès
hal-01193606v1
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Effets de marqueurs des gènes RORC, leptine, DGAT1, TG et FABP4 sur le gras de carcasse et de viande dans trois races bovines allaitantes françaises13. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Oct 2010, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès
hal-01193663v1
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Primo-localisation de QTL de qualité de la viande dans deux races bovines allaitantes françaises16. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2009, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-01193554v1
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Detection of quantitative trait loci affecting carcass and meat quality in two French beef breeds60. Annual Meeting of the European Association for Animal Production, Aug 2009, Barcelone, Spain
Communication dans un congrès
hal-01193459v1
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Une isoforme de chaîne lourde de myosine particulière, variable entre les races à viande bovines16. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2009, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-01193578v1
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Qualités des carcasses et des viandes de jeunes bovins hétérozygotes pour les mutations Q204x et nt821 du gène de la myostatine dans trois races allaitantes françaises15. Rencontres autour des Recherches sur les Ruminants, Dec 2008, Paris, France
Communication dans un congrès
hal-01211924v1
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Association de marqueurs du gène de la calpaïne 1 avec la tendreté de la viande dans trois races allaitantes françaises.12èmes Journées des Sciences du Muscle et Technologies de la Viande, Oct 2008, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-01211964v1
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L'aviculture, une filière d'avenirL'aviculture, une filière d'avenir, 2018
Autre publication scientifique
hal-04216732v1
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SS4I: select SNP subset for imputation2016
Autre publication scientifique
hal-01455929v1
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La sélection des bovins pour une amélioration génétique de la qualité de la viandeMuscle et viande de ruminant, Editions Quae, 2010, Synthèses (INRA), 978-2-7592-0877-7
Chapitre d'ouvrage
hal-01193671v1
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Détection et validation de marqueurs génétiques impliqués dans la qualité de la viande bovine.Génétique animale. AgroParisTech, 2011. Français. ⟨NNT : 2011AGPT0012⟩
Thèse
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