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Sibel BERGER

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Publications

	Full‐length genome sequencing of RNA viruses—How the approach can enlighten us on hepatitis C and hepatitis E viruses Elodie Laugel , Cédric Hartard , Helene Jeulin , Sibel Berger , Véronique Venard Reviews in Medical Virology, 2020, ⟨10.1002/rmv.2197⟩ Article dans une revue hal-03149680v1
	Performance of genotypic algorithms for predicting tropism for HIV-1 CRF01_AE recombinant Cathia Soulié , Laurence Morand-Joubert , Jean-Michel Cottalorda , Charlotte Charpentier , Pantxika Bellecave Journal of Clinical Virology, 2018, 99-100, pp.57-60. ⟨10.1016/j.jcv.2017.12.014⟩ Article dans une revue hal-01984179v1
	nimH, a novel nitroimidazole resistance gene contributing to metronidazole resistance in Bacteroides fragilis Corentine Alauzet , Sibel Berger , Hélène Jean-Pierre , Luc Dubreuil , Estelle Jumas-Bilak Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2017, 72 (9), pp.2673 - 2675. ⟨10.1093/jac/dkx160⟩ Article dans une revue hal-01895500v1
	The variability of hepatitis B envelope is associated with HBs antigen persistence in either chronic or acute HBV genotype A infection Marine Eschlimann , Brice Malve , Aurélie Velay , Honorine Fenaux , Sibel Berger Journal of Clinical Virology, 2017, 94, pp.115-122. ⟨10.1016/j.jcv.2017.08.001⟩ Article dans une revue hal-01903775v1
	Optimising the diagnostic strategy for onychomycosis from sample collection to FUNGAL identification evaluation of a diagnostic kit for real-time PCR Dimitri Petinataud , Sibel Berger , Cyril Ferdynus , Anne Debourgogne , Nelly Contet-Audonneau Mycoses, 2016, 59 (5), pp.304-311. ⟨10.1111/myc.12471⟩ Article dans une revue hal-02902639v1
	Discrimination between Native and Tn 6010 -Associated oqxAB in Klebsiella spp., Raoultella spp., and other Enterobacteriaceae by Using a Two-Step Strategy Thomas Guillard , Anne-Laure Lebreil , Lars Hestbjerg Hansen , Aymric Kisserli , Sibel Berger Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2015, 59 (9), pp.5838 - 5840. ⟨10.1128/AAC.00669-15⟩ Article dans une revue hal-01481982v1
	Characterization of a new blaOXA-48-carrying plasmid in Enterobacteriaceae. Sibel Berger , Corentine Alauzet , Nejla Aissa , Sandrine Hénard , Christian Rabaud Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2013, 57 (8), pp.4064-7 Article dans une revue hal-01160100v1
	Interactions between Snow Chemistry, Mercury Inputs and Microbial Population Dynamics in an Arctic Snowpack Catherine Larose , Emmanuel Prestat , Sébastien Cecillon , Sibel Berger , Cédric Malandain PLoS ONE, 2013, 8 (11), pp.e79972. ⟨10.1371/journal.pone.0079972⟩ Article dans une revue hal-00925290v1
	Characterization of a New blaOXA-48-Carrying Plasmid in Enterobacteriaceae Sibel Berger , Corentine Alauzet , Nejla Aissa , Sandrine Henard , Christian Rabaud Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2013, 57 (8), pp.4064 - 4067. ⟨10.1128/AAC.02550-12⟩ Article dans une revue hal-01480994v1
	Human Pathogens Abundant in the Bacterial Metagenome of Cigarettes Amy R. Sapkota , Sibel Berger , Timothy M. Vogel Environmental Health Perspectives, 2010, 118 (3), pp.351-356. ⟨10.1289/ehp.0901201⟩ Article dans une revue hal-00476194v1
	Microbial sequences retrieved from environmental samples from seasonal Arctic snow and meltwater from Svalbard, Norway Catherine Larose , Sibel Berger , Christophe P. Ferrari , Elisabeth Navarro , Aurélien Dommergue Extremophiles, 2010, 14 (2), pp.205-212. ⟨10.1007/s00792-009-0299-2⟩ Article dans une revue hal-00476166v1
	Genetic instability of whiG gene during the aerial mycelium development of Streptomyces ambofaciens ATCC23877 under different conditions of nitrogen limitations. Magali Genay , Sibel Catakli , Alexandra Kleinclauss , Axelle Andrieux , Bernard Decaris Mutation Research - Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis, 2006, 595 (1-2), pp.80-90 Article dans une revue hal-01159911v1
	Sigma factor WhiG and its regulation constitute a target of a mutational phenomenon occurring during aerial mycelium growth in Streptomyces ambofaciens ATCC23877. Sibel Catakli , Axelle Andrieux , Bernard Decaris , Annie Dary Research in Microbiology, 2005, 156 (3), pp.328-40 Article dans une revue hal-01159932v1
	Spontaneous chromosome circularization and amplification of a new amplifiable unit of DNA belonging to the terminal inverted repeats in Streptomyces ambofaciens ATCC 23877. Sibel Catakli , Axelle Andrieux , Pierre Leblond , Bernard Decaris , Annie Dary Archives of Microbiology, 2003, 179 (6), pp.387-93. ⟨10.1007/s00203-003-0534-7⟩ Article dans une revue hal-01159934v1

	Hepatitis E virus emergence in north eastern France Honorine Fenaux , Manon Chassaing , Sibel Berger , H. Jeulin , Mouni Bensenane 20th Annual Meeting of the European Society for Clinical Virology, 2017, Stresa, Italy Communication dans un congrès hal-02111074v1
	Comparison of four commercial real-time PCR assays for detection of Mycobacterium tuberculosis complex, associated or not to detection of anti-tuberculosis drug-resistance genes Sibel Berger , Catherine Laurain , Christine Larcher , Alain Lozniewski , Corentine Alauzet ECCMID 2015 - 25th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, Apr 2015, Copenhagen, Denmark. page 75/P1194 Communication dans un congrès hal-01247221v1
	Comparaison des performances de quatre coffrets de PCR pour la détection du complexe tuberculeux associée ou non à la recherche de gènes de résistance aux antituberculeux Catherine Laurain , Sibel Berger , Christine Larcher , Florent Girardier , Alain Lozniewski 13èmes Journées de Mycobactériologie de Langue Française, Oct 2014, Dijon, France Communication dans un congrès hal-01247240v1
	Comparaison des performances de six coffrets de PCR pour la détection d'agents impliqués dans les pneumopathies atypiques communautaires. Sibel Berger , Julie Desroches , Alain Lozniewski , Corentine Alauzet RICAI 2014 - 34ème Réunion Interdisciplinaire de Chimiothérapie Anti-Infectieuse, Nov 2014, Paris, France Communication dans un congrès hal-01247191v1
	Seasonal changes in snow chemistry lead to new insights into mercury methylation in the Arctic Catherine Larose , Sébastien Cecillon , Emmanuel Prestat , Sibel Berger , Delina Y. Lyon International Polar Year Oslo Conference 2010, Norway: 'Polar Science - Global Impact', Jun 2010, Oslo, Norway Communication dans un congrès hal-00925324v1
	WHERE DO DEHALOGENASES COME FROM ? A MULTIDISCIPLINARY STUDY HIGHLIGHTS THE PRIMARY ROLE OF HORIZONTAL GENE TRANSFER DURING RECENT FUNCTIONAL ADAPTATION Maude M. David , Sibel Berger , Margaux Mesle , Pascal Simonet , Timothy M Vogel BAGECO 10 : Bacterial Genetics and Ecology – Coexisting on a Changing Planet, Jun 2009, Uppsala, Sweden Communication dans un congrès hal-00399233v1
	GENOME FLEXIBILITY ACROSS DIFFERENT STRAINS OF THE HEXACHLOROCYCLANE-DEGRADING BACTERIUM SPHINGOBIUM FRANCENSE SP+ IDENTIFIED BY A GLOBAL APPROACH OF GENOME SEQUENCING AND MICROARRAY COMPARATIVE GENOMIC HYBRIDIZATION Sibel Berger , Sébastien Cecillon , Cécile Thion , Maude M. David , Timothy M Vogel BAGECO 10 : Bacterial Genetics and Ecology – Coexisting on a Changing Planet, Jun 2009, Uppsala, Sweden Communication dans un congrès hal-00399182v1
	ASSESSING INTERACTIONS BETWEEN MERCURY AND MICROBIAL POPULATIONS IN THE SNOWPACK: A METAGENOMIC APPROACH Catherine Larose , Sibel Berger , Christophe P. Ferrari , Elisabeth Navarro , Aurélien Dommergue BAGECO 10 : Bacterial Genetics and Ecology – Coexisting on a Changing Planet, Jun 2009, Uppsala, Sweden Communication dans un congrès hal-00399256v1
	Modulation de l’instabilité génétique au cours du développement de Streptomyces ambofaciens et Streptomyces coelicolor par les nutriments Magali Genay , Sibel Catakli Rencontre du club des Actinomycètes, May 2004, Liège, Belgique Communication dans un congrès hal-01161680v1
	A mutational phenomenon affecting the regulation of the WhiG sigma factor takes place during the aerial mycelium growth in Streptomyces ambofaciens ATCC23877 Sibel Catakli , Axelle Andrieux , Bernard Decaris , Annie Dary Symposium on Biology of Streptomycetes and related Actinomycetes, Feb 2003, Munster, Germany Communication dans un congrès hal-01161676v1
	Les papilles dépigmentées produites au cours du développement chez Streptomyces ambofaciens ATCC23877 sont des mutants whi Sibel Catakli , Axelle André , Bernard Decaris , Annie Dary Rencontre du club des Actinomycètes, May 2002, Nancy, France Communication dans un congrès hal-01161672v1
	Genetic instability events ocuring during the development of the colony produce at high frequency a particular class of Whi mutants in Streptomyces ambofaciens ATCC23877 Sibel Catakli , Axelle André , Bernard Decaris , Annie Dary IUMS Congress: The World of Microbes (10th International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology, Jul 2002, Paris, France Communication dans un congrès hal-01161667v1
	Identification d’une nouvelle séquence amplifiable localisée aux extrémités du chromosome de Streptomyces ambofaciens ATCC23877 Sibel Catakli , Axelle André , Pierre Leblond , Bernard Decaris , Annie Dary 4ème colloque des 3R : Réplication, Recombinaison et Réparation, Jul 2001, Gif-sur-Yvette, France Communication dans un congrès hal-01161664v1
	Identification of a new amplifiable unit of DNA located in the Terminal Inverted repeats of the chromosomal DNA of Streptomyces ambofaciens ATCC23877 Sibel Catakli , Axelle André , Pierre Leblond , Bernard Decaris , Annie Dary 12th International Symposium on the Biology of Actinomycetes (ISBA), Aug 2001, Vancouver, Canada Communication dans un congrès hal-01161665v1

	Action de facteurs génétiques et environnementaux sur la dynamique mutationnelle au cours de la différenciation chez Streptomyces ambofaciens ATCC23877 Sibel Catakli Biochimie [q-bio.BM]. Université Henri Poincaré - Nancy I, 2004. Français. ⟨NNT : ⟩ Thèse tel-00576223v1