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Méthodes et outils logiciels pour la conception de sondes oligonucléotidiques pour puces à ADN. Applications aux biopuces transcriptomiques et aux biopuces de type phylogénétique

 Sébastien Rimour
Biotechnologie. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2006. Français. ⟨NNT : 2006CLF21691⟩
Thèse tel-00703396v1
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PhylArray: phylogenetic probe design algorithm for microarray

 Cécile Militon , Sébastien Rimour , Mohieddine Missaoui , Corinne Biderre , Vincent Barra , et al.
Bioinformatics, 2007, 23 (19), pp.2550-7. ⟨10.1093/bioinformatics/btm392⟩
Article dans une revue hal-00461398v1
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GoArrays: highly dynamic and efficient microarray probe design

 Sébastien Rimour , David R.C. Hill , Cécile Militon , Pierre Peyret
Bioinformatics, 2005, 21 (7), pp.1094-103. ⟨10.1093/bioinformatics/bti112⟩
Article dans une revue hal-00257859v1
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Détermination de sondes oligonucléotidiques pour biopuces phylogénétiques en environnement grille de calcul

 Faouzi Jaziri , Sébastien Cipière , Mohieddine Missaoui , Denonfoux Jérémie , Eric Dugat-Bony , et al.
Rencontres Scientifiques France Grilles 2011, Sep 2011, Lyon, France
Communication dans un congrès hal-00658712v1
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Detecting unknown sequences with DNA microarrays: explorative probe design strategies.

 Eric Dugat-Bony , Eric Peyretaillade , Nicolas Parisot , Corinne Biderre-Petit , Faouzi Jaziri , et al.
Environmental Microbiology, 2012, 14 (2), pp.356-71. ⟨10.1111/j.1462-2920.2011.02559.x⟩
Article dans une revue istex hal-00822134v1

Annotation of microsporidian genomes using transcriptional signals.

 Eric Peyretaillade , Nicolas Parisot , Valérie Polonais , Sébastien Terrat , Jérémie Denonfoux , et al.
Nature Communications, 2012, 3, pp.1137. ⟨10.1038/ncomms2156⟩
Article dans une revue hal-00813939v1
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