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Sandrine Lagarrigue

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Présentation

Publications

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Epigenetics, genes and the environment: what importance for breeding practices and selection methods in poultry?

Vincent Coustham , Charlotte Andrieux , Chloé Cerutti , Anne Collin , Ingrid David
INRAE Productions Animales, 2023, 36 (4), pp.7384. ⟨10.20870/productions-animales.2023.36.4.7384⟩
Article dans une revue hal-04356432v1
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Fourth report on chicken genes and chromosomes 2022

Jacqueline Smith , James Alfieri , Nick Anthony , Peter Arensburger , Giridhar Athrey
Cytogenetic and Genome Research, 2023, 162 (8-9), pp.405-528. ⟨10.1159/000529376⟩
Article dans une revue hal-04217636v1
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Integrative study of diet-induced mouse models of NAFLD identifies PPARα as a sexually dimorphic drug target

Sarra Smati , Arnaud Polizzi , Anne Fougerat , Sandrine Ellero-Simatos , Yuna Blum
Gut, 2022, 71 (4), pp.807-821. ⟨10.1136/gutjnl-2020-323323⟩
Article dans une revue hal-03215969v1
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Difference in Pap test uptake between women who have sex with women and other women in France: A comparative survey of 2032 women

Camille Poupon , Maud Poirier , Yuna Blum , Sandrine Lagarrigue , Cécile Parléani
Preventive Medicine Reports, 2022, 30, pp.101990. ⟨10.1016/j.pmedr.2022.101990⟩
Article dans une revue hal-03811844v1
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LncRNAs in domesticated animals: from dog to livestock species

Sandrine Lagarrigue , Matthias Lorthiois , Fabien Degalez , David Gilot , Thomas Derrien
Mammalian Genome, 2022, 33 (2), pp.248-270. ⟨10.1007/s00335-021-09928-7⟩
Article dans une revue hal-03467210v1
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RNA-Seq Data for Reliable SNP Detection and Genotype Calling

Frédéric Jehl , Fabien Degalez , Frédéric Lecerf , Maria Bernard , Laetitia Lagoutte
Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.655707. ⟨10.3389/fgene.2021.655707⟩
Article dans une revue hal-03276149v1
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Watch out for a second SNP: focus on multi-nucleotide variants in coding regions and rescued stop-gained

Fabien Degalez , Frédéric Jehl , Kévin Muret , Maria Bernard , Frédéric Lecerf
Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.659287. ⟨10.3389/fgene.2021.659287⟩
Article dans une revue hal-03280040v1
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An integrative atlas of chicken long non-coding genes and their annotations across 25 tissues

Frédéric Jehl , Kévin Muret , Maria Bernard , Morgane Boutin , Laetitia Lagoutte
Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.1-17. ⟨10.1038/s41598-020-77586-x⟩
Article dans une revue hal-03039897v1
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Chicken adaptive response to low energy diet: main role of the hypothalamic lipid metabolism revealed by a phenotypic and multi-tissue transcriptomic approach

Frédéric Jehl , Colette Désert , Christophe C. Klopp , Mathias Brenet , Andrea Rau
BMC Genomics, 2019, 20 (1), ⟨10.1186/s12864-019-6384-8⟩
Article dans une revue hal-02463367v1
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Long noncoding RNAs in lipid metabolism: literature review and conservation analysis across species

Kévin Muret , Colette Désert , Laetitia Lagoutte , Morgane Boutin , Florence Gondret
BMC Genomics, 2019, 20, pp.882. ⟨10.1186/s12864-019-6093-3⟩
Article dans une revue hal-02387579v1
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Multi-species annotation of transcriptome and chromatin structure in domesticated animals

Sylvain Foissac , Sarah Djebali , Kylie Munyard , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau
BMC Biology, 2019, 17 (1), 25 p. ⟨10.1186/s12915-019-0726-5⟩
Article dans une revue hal-02437599v1
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Maternal high-protein and low-protein diets perturb hypothalamus and liver transcriptome and metabolic homeostasis in adult mouse offspring

Lisa J. Martin , Qingying Meng , Montgomery Blencowe , Sandrine Lagarrigue , Sheila Xiao
Frontiers in Genetics, 2018, 9, ⟨10.3389/fgene.2018.00642⟩
Article dans une revue hal-01977616v1
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Multi-tissue transcriptomic study reveals the main role of liver in the chicken adaptive response to a switch in dietary energy source through the transcriptional regulation of lipogenesis

Colette Désert , Elisabeth Baéza , Meziane Aite , Morgane Boutin , Aurélie Le Cam
BMC Genomics, 2018, 19 (1), pp.1-19. ⟨10.1186/s12864-018-4520-5⟩
Article dans une revue hal-01727161v1
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Muscle transcriptome analysis reveals molecular pathways and biomarkers involved in extreme ultimate pH and meat defect occurrence in chicken

Stéphane Beauclercq , Christelle Hennequet-Antier , Christophe Praud , Estelle Godet , Anne Collin
Scientific Reports, 2017, 7 (1), ⟨10.1038/s41598-017-06511-6⟩
Article dans une revue hal-01595496v1
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A transcriptome multi-tissue analysis identifies biological pathways and genes associated with variations in feed efficiency of growing pigs

Florence Gondret , Annie Vincent , Magalie Houée-Bigot , Anne Siegel , Sandrine Lagarrigue
BMC Genomics, 2017, 18 (1), pp.244. ⟨10.1186/s12864-017-3639-0⟩
Article dans une revue hal-01494107v1
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Long noncoding RNA repertoire in chicken liver and adipose tissue

Kévin Muret , Christophe C. Klopp , Valentin Wucher , Diane Esquerré , Fabrice Legeai
Genetics Selection Evolution, 2017, 49 (1), pp.6. ⟨10.1186/s12711-016-0275-0⟩
Article dans une revue hal-01431420v1
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Liver PPARα is crucial for whole-body fatty acid homeostasis and is protective against NAFLD

Alexandra Montagner , Arnaud Polizzi , Edwin Fouché , Simon Ducheix , Yannick Lippi
Gut, 2016, 65 (7), pp.1202-1214. ⟨10.1136/gutjnl-2015-310798⟩
Article dans une revue inserm-02339685v1
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Molecular alterations induced by a high-fat high-fiber diet in porcine adipose tissues: variations according to the anatomical fat location

Florence Gondret , Annie Vincent , Magalie Houée-Bigot , Anne Siegel , Sandrine Lagarrigue
BMC Genomics, 2016, 17 (1), pp.120. ⟨10.1186/s12864-016-2438-3⟩
Article dans une revue hal-01286555v1
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Thermal manipulation of the chicken embryo triggers differential gene expression in response to a later heat challenge

Thomas Loyau , Christelle Hennequet-Antier , Vincent Coustham , Cécile Berri , Marie Leduc
BMC Genomics, 2016, 17 (1), 15 p. ⟨10.1186/s12864-016-2661-y⟩
Article dans une revue hal-02636990v1
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The extent of mRNA editing is limited in chicken liver and adipose, but impacted by tissular context, genotype, age and feeding as exemplified with a conserved edited site in COG3

Pierre-François Roux , Laure Fresard , Morgane Boutin , Sophie Leroux , Christophe C. Klopp
G3, 2016, 6 (2), pp.321-335. ⟨10.1534/g3.115.022251⟩
Article dans une revue hal-01251260v1

Transcriptomes of whole blood and PBMC in chickens

Colette Désert , Elodie Merlot , Tatiana Zerjal , Bertrand Bed'Hom , Sonja Härtle
Comparative Biochemistry and Physiology - Part D: Genomics and Proteomics, 2016, 20, pp.1-9. ⟨10.1016/j.cbd.2016.06.008⟩
Article dans une revue hal-01341819v1
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Hepatic circadian clock oscillators and nuclear receptors integrate microbiome-derived signals

Alexandra Montagner , Agata Korecka , Arnaud Polizzi , Yannick Lippi , Yuna Blum
Scientific Reports, 2016, 6 (1), pp.1-14. ⟨10.1038/srep20127⟩
Article dans une revue hal-01482816v1
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Expanding Duplication of Free Fatty Acid Receptor-2 (GPR43) Genes in the Chicken Genome

C. Meslin , Colette Desert , I. Callebaut , A. Djari , C. Klopp
Genome Biology and Evolution, 2015, 7 (5), pp.1332-1348. ⟨10.1093/gbe/evv072⟩
Article dans une revue hal-01157691v1
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Combined QTL and selective sweep mappings with coding SNP annotation and cis-eQTL analysis revealed PARK2 and JAG2 as new candidate genes for adiposity regulation.

Pierre-François Roux , Simon Boitard , Anne Blum , Brian Parks , Alexandra Montagner
G3, 2015, 5, pp.517-529. ⟨10.1534/g3.115.016865⟩
Article dans une revue hal-01194040v1
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Pertinent plasma indicators of the ability of chickens to synthesize and store lipids

Elisabeth Baéza , Maëva Jégou , Florence Gondret , J Lalande-Martin , I Tea
Journal of Animal Science, 2015, 93 (1), pp.107-116. ⟨10.2527/jas.2014-8482⟩
Article dans une revue hal-01207761v1

The ability of genetically lean or fat slow-growing chickens to synthesize and store lipids is not altered by the dietary energy source

Elisabeth Baéza , Florence Gondret , Pascal P. Chartrin , Elisabeth Duval , Cécile Berri
Animal, 2015, 9 (10), pp.1643-1652. ⟨10.1017/S1751731115000683⟩
Article dans une revue hal-01211037v1

Comparison of whole-genome (13X) and capture (87X) resequencing methods for SNP and genotype callings

Pierre-François Roux , Sylvain Marthey , Anis Djari , Marco Moroldo , Diane Esquerre
Animal Genetics, 2015, 46 (1), pp.82-86. ⟨10.1111/age.12248⟩
Article dans une revue hal-01194013v1
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Genome-Wide Characterization of RNA Editing in Chicken Embryos Reveals Common Features among Vertebrates

Laure Fresard , Sophie Leroux , Pierre-François Roux , Christophe C. Klopp , Stéphane Fabre
PLoS ONE, 2015, 10 (5), pp.1-20. ⟨10.1371/journal.pone.0126776⟩
Article dans une revue hal-01207762v1
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Dietary energy sources affect the partition of body lipids and the hierarchy of energy metabolic pathways in growing pigs differing in feed efficiency

Florence Gondret , Isabelle Louveau , Jacques Mourot , Michel Jacques M.J. Duclos , Sandrine Lagarrigue
Journal of Animal Science, 2014, 92 (11), pp.4865-4877. ⟨10.2527/jas.2014-7995⟩
Article dans une revue hal-01207757v1
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Re-sequencing data for refining candidate genes and polymorphisms in QTL regions affecting adiposity in chicken

Pierre-François Roux , Morgane Boutin , Colette Désert , Anis Djari , Diane Esquerre
PLoS ONE, 2014, 9 (10), pp.e111299. ⟨10.1371/journal.pone.0111299⟩
Article dans une revue hal-01207758v1
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Using a large-scale knowledge database on reactions and regulations to propose key upstream regulators of various sets of molecules participating in cell metabolism

Pierre Blavy , Florence Gondret , Sandrine Lagarrigue , Jaap J. van Milgen , Anne Siegel
BMC Systems Biology, 2014, 8 (1), pp.32. ⟨10.1186/1752-0509-8-32⟩
Article dans une revue hal-00980499v1
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Transcriptome-wide investigation of genomic imprinting in chicken

Laure Fresard , Sophie Leroux , Bertrand Servin , David Gourichon , Patrice Dehais
Nucleic Acids Research, 2014, 42 (6), pp.3768-3782. ⟨10.1093/nar/gkt1390⟩
Article dans une revue hal-01019569v1

The loss of adipokine genes in the chicken genome and implications for insulin metabolism

Natasa Dakovic , Morgane Terezol , Frederique Pitel , Virginie Maillard , Sébastien Elis
Molecular Biology and Evolution, 2014, 31 (10), pp.2637-2646. ⟨10.1093/molbev/msu208⟩
Article dans une revue hal-01129850v1

Analysis of Allele-Specific Expression in Mouse Liver by RNA-Seq: A Comparison With Cis-eQTL Identified Using Genetic Linkage

Sandrine Lagarrigue , Lisa Martin , Farhad Hormozdiari , Pierre-François Roux , Calvin Pan
Genetics, 2013, 195 (3), pp.1157-1166. ⟨10.1534/genetics.113.153882⟩
Article dans une revue hal-01207753v1
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Farm feed findings

Florence Gondret , Sandrine Lagarrigue
International innovation - environment, 2013, 08/2013, pp.73-75
Article dans une revue hal-01210874v1
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Genome-wide interval mapping using SNPs identifies new QTL for growth, body composition and several physiological variables in an F-2 intercross between fat and lean chicken lines

Olivier Demeure , Michel Jacques M.J. Duclos , Nicola Bacciu , Guillaume Le Mignon , Olivier Filangi
Genetics Selection Evolution, 2013, 45, online (september), Non paginé. ⟨10.1186/1297-9686-45-36⟩
Article dans une revue hal-01207752v1

Limited RNA editing in exons of mouse liver and adipose

Sandrine Lagarrigue , Farhad Hormozdiari , Lisa Martin , Frédéric Lecerf , Yehudit Hasin
Genetics, 2013, 193 (4), pp.1107-1115. ⟨10.1534/genetics.112.149054⟩
Article dans une revue hal-01207749v1

Pleiotropic effects of polymorphism of the gene diacylglycerol-O-transferase 1 (DGAT1) in the mammary gland tissue of dairy cows

Núria Mach , Yuna Blum , A. Bannink , David Causeur , M. Houee-Bigot
Journal of Dairy Science, 2012, 95 (9), pp.4989-5000. ⟨10.3168/jds.2012-5348⟩
Article dans une revue hal-00841015v1

Genetically regulated metabolic networks: Gale-Nikaido modules and differential inequalities

Ovidiu Radulescu , Anne Siegel , Elisabeth Pecou , Clément Chatelain , Sandrine Lagarrigue
Transactions on Computational Systems Biology, 2011, Transactions on Computational Systems Biology XIII, 6575 (Lecture Notes in Computer Science 6575), pp.110-130. ⟨10.1007/978-3-642-19748-2_6⟩
Article dans une revue inria-00538136v1

Regulation of LPCAT3 by LXR.

O. Demeure , Frédéric Lecerf , C. Duby , Colette Désert , S. Ducheix
Gene, 2011, 470 (1-2), pp.7-11. ⟨10.1016/j.gene.2010.09.002⟩
Article dans une revue hal-00729271v1
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Complex trait subtypes identification using transcriptome profiling reveals an interaction between two QTL affecting adiposity in chicken

Yuna Blum , Guillaume Le Mignon , David Causeur , Olivier Filangi , Colette Désert
BMC Genomics, 2011, 12 (november), pp.8. ⟨10.1186/1471-2164-12-567⟩
Article dans une revue hal-00730144v1
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AnnotQTL: a new tool to gather functional and comparative information on a genomic region

Frédéric Lecerc , Anthony Bretaudeau , Olivier Sallou , Colette Désert , Yuna Blum
Nucleic Acids Research, 2011, 39 (Suppl 2), open access. ⟨10.1093/nar/gkr361⟩
Article dans une revue hal-00597398v1

New approaches of phenotyping for animal breeding

Sandrine Lagarrigue , M. Tixier-Boichard
Productions Animales, 2011, 24 (4), pp.10
Article dans une revue hal-00730158v1

E2F transcription factor-1 regulates oxidative metabolism

E. Blanchet , J. S. Annicotte , S. Lagarrigue , V. Aguilar , C. Clape
Nature Cell Biology, 2011, 13 (9), pp.1146--52. ⟨10.1038/ncb2309⟩
Article dans une revue hal-02193308v1
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Detection of a Cis eQTL Controlling BMCO1 Gene Expression Leads to the Identification of a QTG for Chicken Breast Meat Color

Elisabeth Le Bihan-Duval , Javad Nadaf , Cécile Berri , Frederique Pitel , Benoit Graulet
PLoS ONE, 2011, 6 (7), non paginé. ⟨10.1371/journal.pone.0014825⟩
Article dans une revue hal-00729320v1
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Nouvelles approches de phénotypage pour la sélection animale

Sandrine Lagarrigue , Michèle Tixier-Boichard
INRA Productions Animales, 2011, 24 (4), pp.377-386
Article dans une revue hal-01189574v1

[Emerging key role of cell cycle regulators in cell metabolism]

S. Lagarrigue , E. Blanchet , J. S. Annicotte , L. Fajas
Médecine/Sciences, 2011, 27 (5), pp.508--13. ⟨10.1051/medsci/2011275016⟩
Article dans une revue hal-02193321v1
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A factor model to analyze heterogeneity in gene expression.

Yuna Blum , Guillaume Le Mignon , Sandrine Lagarrigue , David Causeur
BMC Bioinformatics, 2010, 11 (368), pp.368. ⟨10.1186/1471-2105-11-368⟩
Article dans une revue hal-00729426v1
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Apports de la génomique fonctionnelle à la cartographie fine de QTL

Guillaume Le Mignon , Yuna Blum , Olivier Demeure , Christian Diot , Elisabeth Le Bihan-Duval
INRA Productions Animales, 2010, 23 (4), pp.343-358
Article dans une revue hal-00729443v1

A comprehensive analysis of QTL for abdominal fat and breast muscle weights on chicken chromosome 5 using a multivariate approach.

G. Le Mignon , Frederique Pitel , Hélène Gilbert , Elisabeth Le Bihan-Duval , F. Vignoles
Animal Genetics, 2009, 40 (2), pp.157-64. ⟨10.1111/j.1365-2052.2008.01817.x⟩
Article dans une revue hal-00729933v1
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Using transcriptome profiling to characterize QTL regions on chicken chromosome 5

G. Le Mignon , Colette Désert , Frederique Pitel , S. Leroux , O. Demeure
BMC Genomics, 2009, 10, non paginé. ⟨10.1186/1471-2164-10-575⟩
Article dans une revue hal-00730106v1
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Methods for interpreting lists of affected genes obtained in a DNA microarray experiment

Jakob Hedegaard , Cristina Arce , Silvio Bicciato , Agnès Bonnet , Bart Buitenhuis
BMC Proceedings, 2009, 3, online (Suppl.4), Non paginé. ⟨10.1186/1753-6561-3-S4-S5⟩
Article dans une revue hal-02665629v1

CXC ligand 5 is an adipose-tissue derived factor that links obesity to insulin resistance

C. Chavey , Gwendal Lazennec , S. Lagarrigue , C. Clape , I. Iankova
Cell Metabolism, 2009, 9 (4), pp.339--49. ⟨10.1016/j.cmet.2009.03.002⟩
Article dans une revue hal-02194094v1
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Pathway results from the chicken data set using GOTM, Pathway studio and ingenuity softwares

Agnès Bonnet , Sandrine Lagarrigue , Laurence Liaubet , Christèle Robert-Granié , Magali San Cristobal
BMC Proceedings, 2009, 3 (Suppl 4), pp.1-6. ⟨10.1186/1753-6561-3-S4-S11⟩
Article dans une revue hal-00730039v1

Detection of Turkey, Duck, and guinea fowl egg in hen egg products by species-specific PCR

Francoise Nau , Colette Désert , Marie-Françoise Cochet , Maryvonne Pasco , Sophie Jan
Food Analytical Methods, 2009, 2 (3), pp.231-238. ⟨10.1007/s12161-009-9077-0⟩
Article dans une revue hal-01454132v1

Liver X receptor alpha regulates fatty acid synthase expression in chicken.

O. Demeure , C. Duby , Colette Désert , S. Assaf , Dominique Hazard
Poultry Science, 2009, 88 (12), pp.2628-35. ⟨10.3382/ps.2009-00258⟩
Article dans une revue hal-00730008v1
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A minimal model for hepatic fatty acid balance during fasting: Application to PPAR alpha-deficient mice

Pierre Blavy , Florence Gondret , Hervé Guillou , Sandrine Lagarrigue , P.G.P. Martin
Journal of Theoretical Biology, 2009, 261 (2), pp.266. ⟨10.1016/j.jtbi.2009.07.025⟩
Article dans une revue hal-00559147v1

Methods for interpreting lists of affected genes obtained in a DNA microarray experiment

C. Arce , S. Bicciato , A. Bonnet , B. Buitenhuis , M. Collado-Romero
BMC Proceedings, 2009, 3, pp.1-7
Article dans une revue hal-00730017v1

Swelling kinetics of waxy maize and maize starches at high temperatures and heating rates

S. Lagarrigue , G. Alvarez , G. Cuvelier , D. Flick
Carbohydrate Polymers, 2008, 73 (1), pp.148-155. ⟨10.1016/j.carbpol.2007.11.018⟩
Article dans une revue hal-02594873v1
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Transcriptome profiling of the feeding-to-fasting transition in chicken liver.

Colette Désert , Michel Jacques M.J. Duclos , Pierre Blavy , Frédéric Lecerf , François Moreews
BMC Genomics, 2008, 9 (611), pp.611. ⟨10.1186/1471-2164-9-611⟩
Article dans une revue hal-00729919v1

Rheological characterisation of starch based food products under unsteady temperature conditions and high heating rate

S. Lagarrigue , G. Alvarez , D. Flick
Journal of Food Engineering, 2007, 81, pp.273-281
Article dans une revue hal-02589548v1

Microarray analysis of differential gene expression in the liver of lean and fat chickens.

Emmanuelle Bourneuf , Frédéric Hérault , Céline Chicault , Wilfrid Carré , Sirine Assaf
Gene, 2006, 372, pp.162-70. ⟨10.1016/j.gene.2005.12.028⟩
Article dans une revue hal-00085700v1

Qualitative analysis of the relation between DNA microarray data and behavioral models of regulation networks.

A. Siegel , O. Radulescu , Mathieu Le Borgne , Philippe Veber , - Ouy J
BioSystems, 2006, 84, pp.153-174
Article dans une revue hal-02656133v1
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Topology and static response of interaction networks in molecular biology

Ovidiu Radulescu , Sandrine Lagarrigue , Anne Siegel , Philippe Veber , Michel Le Borgne
Journal of the Royal Society Interface, 2006, 3 (6), pp.185 - 196. ⟨10.1098/rsif.2005.0092⟩
Article dans une revue inria-00178842v1

Topology and static response of interaction networks in molecular biology.

O. Radulescu , Sandrine Lagarrigue , A. Siegel , Philippe Veber , Mathieu Le Borgne
Journal of the Royal Society Interface, 2006, 3, pp.185-196
Article dans une revue hal-02654772v1
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Qualitative analysis of the relation between DNA microarray data and behavioral models of regulation networks

Anne Siegel , Ovidiu Radulescu , Michel Le Borgne , Philippe Veber , Julien Ouy
BioSystems, 2006, 84, pp.153-174
Article dans une revue inria-00178809v1
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Fatness QTL on chicken chromosome 5 and interaction with sex

Behnam Abasht , Frederique Pitel , Sandrine Lagarrigue , Elisabeth Le Bihan-Duval , Pascale P. Le Roy
Genetics Selection Evolution, 2006, 38, pp.297-311
Article dans une revue hal-02661352v1
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Mapping quantitative trait loci affecting fatness and breast muscle weight in meat-type chicken lines divergently selected on abdominal fatness

Sandrine Lagarrigue , Frederique Pitel , Wilfrid Carré , Behnam Abasht , Pascale Le Roy
Genetics Selection Evolution, 2006, 38 (1), pp.85-97
Article dans une revue hal-00894553v1
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Mapping quantitative trait loci affecting fatness and breast muscle weight in meat-type chicken lines divergently selected on abdominal fatness

Sandrine Lagarrigue , Frederique Pitel , Wilfrid Carré , Behnam Abasht , Pascale P. Le Roy
Genetics Selection Evolution, 2006, 38, pp.85-97
Article dans une revue hal-02658083v1

Complex Qualitative Models in Biology: a new approach

Philippe Veber , Michel Le Borgne , Anne Siegel , Sandrine Lagarrigue , Ovidiu Radulescu
Complexus, 2005, 2, pp.140-151
Article dans une revue inria-00178819v1
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A gene-based radiation hybrid map of chicken microchromosome 14 : comparison to human and alignment to the assembled chicken sequence

Mireille Morisson , Sophie S. Leroux , Carine Jiguet-Jiglaire , Sirine Assaf , Frederique Pitel
Genetics Selection Evolution, 2005, 37, pp.229-251. ⟨10.1051/gse:2004046⟩
Article dans une revue hal-02670446v1
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A high-resolution radiation hybrid map of chicken chromosome 5 and comparison with human chromosomes

Frederique Pitel , Behnam Abasht , Mireille Morisson , Richard Pma Crooijmans , Florence F. Vignoles
BMC Genomics, 2004, 5, pp.142E-U6. ⟨10.1186/1471-2164-5-66⟩
Article dans une revue hal-02678290v1

Genetic linkage and expression analysis of SREBP and lipogenic genes in fat and lean chickens

S. Assaf , Sandrine Lagarrigue , Stéphanie Daval , M. Sansom , B. Leclercq
Comparative Biochemistry and Physiology - Part B: Biochemistry and Molecular Biology, 2004, 137, pp.433-441
Article dans une revue hal-02670700v1

Cloning and characterization of HEP21, a new member of the uPAR/Ly6 protein superfamily predominantly expressed in hen egg white

F. Nau , C. Guerin-Dubiard , Colette Désert , Joël Gautron , S. Bouton
Poultry Science, 2003, 82, pp.242-250
Article dans une revue hal-02671060v1

Cloning of cDNA encoding the nuclear form of chicken sterol response element binding protein-2 (SREBP-2), chromosomal localization, and tissue expression of chicken SREBP-1 and -2 genes

S. Assaf , Dominique Hazard , Frederique Pitel , Mireille Morisson , M. Alizadeh
Poultry Science, 2003, 82, pp.54-61
Article dans une revue hal-02670802v1

A chicken lipid metabolism macroarray.

S. Assaf , Dominique Hazard , Madeleine Douaire , Sandrine Lagarrigue
Archiv für Geflügelkunde. Sonderheft, 2002, Special Issue, pp.96
Article dans une revue hal-02669670v1

The rheology of starch dispersions at high temperatures and high shear rates: a review

S. Lagarrigue , G. Alvarez
Journal of Food Engineering, 2001, 50, pp.189-202. ⟨10.1016/S0260-8774(00)00239-9⟩
Article dans une revue hal-02580048v1

Development of 112 unique expressed sequence tags from chicken liver using an arbitrarily primed reverse transcriptase-polymerase chain reaction and single strand conformation gel purification method

Wilfrid Carré , Christian Diot , R.P.M.A. Crooijmans , Sandrine Lagarrigue , Mark Morrisson
Animal Genetics, 2001, 32, pp.289-297
Article dans une revue hal-02674219v1
Image document

Hepatic lipogenesis gene expression in two experimental egg-laying lines divergently selected on residual food consumption

Sandrine Lagarrigue , Stéphanie Daval , André Bordas , Madeleine Douaire
Genetics Selection Evolution, 2000, 32 (2), pp.205-216. ⟨10.1051/gse:2000114⟩
Article dans une revue hal-00894307v1
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Messenger RNA levels and transcription rates of hepatic lipogenesis genes in genetically lean and fat chickens

Stéphanie Daval , Sandrine Lagarrigue , Madeleine Douaire
Genetics Selection Evolution, 2000, 32 (5), pp.521-531. ⟨10.1051/gse:2000134⟩
Article dans une revue hal-00894352v1
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Hepatic lipogenesis gene expression in two experimental egg-laying lines divergently selected on residual food consumption

Sandrine Lagarrigue , Stéphanie Daval , André A. Bordas , M. Douaire
Genetics Selection Evolution, 2000, 32 (2), pp.205-216
Article dans une revue hal-02690903v1
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Gènes associés à la lipogénèse chez le poulet

M. Douaire , Sandrine Lagarrigue
Productions Animales, 2000, HS 2000, pp.169-170
Article dans une revue hal-02685400v1

Cloning and mapping of the ACLY gene to a chicken microchromosome

Stéphanie Daval , Frederique Pitel , C. Le Nigen , M. Douaire , Alain Vignal
Animal Genetics, 2000, 31, pp.404-419
Article dans une revue hal-02686283v1
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Messenger RNA levels and transcription rates of hepatic lipogenesis genes in genetically lean and fat chickens

Stéphanie Daval , Sandrine Lagarrigue , M. Douaire
Genetics Selection Evolution, 2000, 32 (4), pp.521-531
Article dans une revue hal-02690958v1

Role of hepatic lipogenesis in the susceptibility to fatty liver in the goose (Anser anser)

Jacques Mourot , Gérard Guy , Sandrine Lagarrigue , P. Peiniau , Dominique D. Hermier
Comparative Biochemistry and Physiology Part B: Comparative Biochemistry, 2000, 126, pp.81-87
Article dans une revue hal-02691295v1
Image document

La stéatose hépatique des palmipèdes gavés : bases métaboliques et sensibilité génétique

Dominique D. Hermier , M.R. Salichon , Gérard Guy , Rosaria Peresson , Jacques Mourot
Productions Animales, 1999, 12 (4), pp.265-271
Article dans une revue hal-02697440v1
Image document

L'engraissement chez le poulet : aspects métaboliques et génétiques

Fabien Alleman , André A. Bordas , J.P. Caffin , Stéphanie Daval , Christian Diot
Productions Animales, 1999, 12 (4), pp.257-264
Article dans une revue hal-02697188v1

Mapping of the ME1 locus to chicken chromosome 3.

Frederique Pitel , Sandrine Lagarrigue , M. Moro , M. Douaire , Joel Gellin
Animal Genetics, 1998, 29 (6), pp.475-476
Article dans une revue hal-02685474v1
Image document

Analyse génétique d'un caractère quantitatif

M. Sourdioux , Sandrine Lagarrigue , M. Douaire
Productions Animales, 1997, 10 (3), pp.251-258
Article dans une revue hal-02693262v1

Expression of c-fos and jun protooncogenes in ovine trophoblasts in relation to interferon-tau expression and early implantation process

F. Xavier , Sandrine Lagarrigue , Michel M. Guillomot , I. Gaillard-Sanchez
Molecular Reproduction and Development, 1997, 46, pp.127-137
Article dans une revue hal-02690401v1

Apoprotein A1 mRNA levels differ in genetically lean and fat chickens.

Stéphanie Daval , Sandrine Lagarrigue , J.P. Caffin , B. Leclercq , Madeleine Douaire
Animal Genetics, 1996, suppl. 2, pp.107
Article dans une revue hal-02693248v1

The transformation of c-jun-overexpressing cells is correlated with IGFS-induced c-jun phosphorylation

Sandrine Lagarrigue , Christine Heberden , Paule Latino-Martel , I. Gaillard-Sanchez
Biochemical and Biophysical Research Communications, 1995, 217 (2), pp.501-508
Article dans une revue hal-02700455v1

Suppression of oncogene-induced transformation by quercetin and retinoic acid in rat liver epithelial cells

Sandrine Lagarrigue , Catherine C. Chaumontet , Christine Heberden , Paule Latino-Martel , I. Gaillard-Sanchez
Cellular and Molecular Biology Research, 1995, 41 (6), pp.551-560
Article dans une revue hal-02701405v1

Altered response to growth factors in rat epithelial liver cells overexpressing human c-Fos protein

Sandrine Lagarrigue , C. Seillan-Heberden , Paule Latino-Martel , I. Gaillard-Sanchez
FEBS Letters, 1992, 314 (3), pp.399-403
Article dans une revue hal-02711271v1

GEroNIMO : Genome and Epigenome eNabled breedIng in MOnogastrics

Frédérique Pitel , Tatiana Zerjal , Sandrine Lagarrigue
74. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), EAAP; INRAE, Aug 2023, Lyon, France. pp.930
Communication dans un congrès hal-04241497v1

A lncRNA gene-enriched atlas for GRCg7b chicken genome and its functional annotation across 47 tissues

Fabien Degalez , Mathieu Charles , Sylvain Foissac , Haijuan Zhou , Dailu Guan
39. Congress of the international society for animal genetics (ISAG), Jul 2023, Cape Town, South Africa. pp.47
Communication dans un congrès hal-04217589v1

A richer gut microbiota is related to better feed efficiency and diet adaptability in laying hens

Maria Bernard , Alexandre Lecoeur , Jean-Luc Coville , Nicolas Bruneau , Deborah Jardet
74. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), EAAP, Aug 2023, Lyon, France. pp.740
Communication dans un congrès hal-04199104v1
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Selective sweep mapping in the R+ R-chicken lines divergently selected for RFI (residual feed intake)

Frédéric Jehl , Simon Boitard , Jean-Noël Hubert , Denis Laloë , Sandrine Lagarrigue
26. World's Poultry Congress (WPC), Aug 2022, Paris, France. pp.407
Communication dans un congrès hal-03797331v1
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L’épigénétique à l’interface entre l’environnement et l'ADN : quelle importance pour les pratiques d’élevage et les méthodes de sélection ?

Vincent Coustham , Charlotte Andrieux , Anne Collin , Ingrid David , Julie Demars
14. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, ITAVI; INRAE; ANSES; WVPA; WPSA; CTCPA, Mar 2022, Tours, France. pp.628-629, ⟨10.1016/j.anscip.2022.05.028⟩
Communication dans un congrès hal-03616157v1
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Combined strategies for adapting poultry production to climate change

Anne Collin , Vincent Coustham , Jacob Kokou Tona , Sophie Tesseraud , Sandrine Mignon-Grasteau
26. World’s Poultry Congress (WPC), WPSA, Aug 2022, Paris, France. pp.122-146
Communication dans un congrès hal-04129464v1

RNA-SEQ data for reliable SNP detection and genotype calling in livestock species: interest for coding variant characterization and cis-regulation analysis by allele-specific expression

Frédéric Jehl , Fabien Degalez , Maria Bernard , Frédéric Lecerf , Laetitia Lagoutte
26. World's Poultry Congress (WPC), Aug 2022, Paris, France. pp.405
Communication dans un congrès hal-04132375v1
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Epigenetics as a mediator of genome x environment interactions

Frederique Pitel , Ingrid David , Julie Demars , Sandrine Mignon-Grasteau , Sandrine Lagarrigue
26. World's Poultry Congress (WPC), Aug 2022, Paris, France. pp.199-212
Communication dans un congrès hal-03797557v1

RNA-seq data for detecting reliable SNPs & genotypes in livestock species: interest for coding variant characterization and cis-regulation analysis by allele-specific expression !

Frédéric Jehl , Fabien Degalez , Maria Bernard , Frédéric Lecerf , Laetitia Lagoutte
World Poultry Congress (WPC) 2022, Aug 2022, Paris, France
Communication dans un congrès hal-04258396v1

Functional annotation of livestock genomes: chromatin structure and regulation of gene expression

Sylvain Foissac , Sarah Djebali , Kylie Munyard , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau
ASAS/ASDS Midwest Joint Meeting, Mar 2019, Omaha, United States. ⟨10.1093/jas/skz122.028⟩
Communication dans un congrès hal-02735898v1

Multi-level conservation of chromosome conformation across livestock species reveals evolutionary links between genome structure and function

Sylvain Foissac , Sarah Djebali Quelen , Nathalie Vialaneix , Matthias Zytnicki , Andrea Rau
Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG 2019), Jul 2019, Lleida, Spain
Communication dans un congrès hal-02788476v1

Integrated metabolomic and transcriptomic analysis evaluating heat and feed stress in layer chickens

Denis Laloë , Frédéric Jehl , Colette Désert , Morgane Boutin , Sophie Leroux
37. International Society for Animal Genetics (ISAG) Conference, Jul 2019, Lleida, Spain
Communication dans un congrès hal-02737948v1
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An atlas of chicken long non-coding RNAs gathering multiple sources : gene models and expression across more than twenty tissues

Frédéric Jehl , Kévin Muret , Maria Bernard , Diane Esquerré , Hervé Acloque
PAG XXVII - Plant & Animal Genome Conference, Jan 2019, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-02790912v1

Chromatin accessibility conservation across four livestock species

Sarah Djebali Quelen , Sylvain Foissac , Nathalie Vialaneix , Kylie Munyard , Andrea Rau
Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG 2019), Jul 2019, Llieda, Spain
Communication dans un congrès hal-02788732v1

FR-Agencode: An Update

Elisabetta Giuffra , Sarah Djebali , Andrea Rau , Sandrine Lagarrigue , Hervé Acloque
The Plant and Animal Genome XXVII Conference (PAG), Jan 2019, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-03364351v1

Spontaneous intake of essential oils after a negative postnatal experience in chicks and long-term effects on blood transcriptome

Laurence L.A. Guilloteau , Anne Collin , Aline Foury , Jean-Christophe Helbling , Alexia Koch
XVth EUROPEAN POULTRY CONFERENCE;EPC2018, Sep 2018, Dubrovnik, Croatia
Communication dans un congrès hal-02785657v1

Le MOOC un nouvel outil pédagogique au service de l’élevage

Sandrine Lagarrigue
Natural concept. La durabilité des filières animales au cœur des échanges, Dec 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02270128v1
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Layers response to a suboptimal diet through phenotype and transcriptome changes in four tissues

Frédéric Jehl , M. Brenet , Andrea Rau , Colette Désert , Morgane Boutin
69. Annual Meeting of the European Association of Animal Production, Aug 2018, Dubrovnik, Croatia
Communication dans un congrès hal-02734608v1

Effect of long-term heat stress on production, egg quality and physiological traits in four experimental lines of layers differing in heat tolerance and feed efficiency

Adelie Tholance , Dzidzo Nyuiadzi , Veerle M. Darras , Denis Laloë , Florence Jaffrezic
XVth EUROPEAN POULTRY CONFERENCE, Sep 2018, Dubrovnik, Croatia
Communication dans un congrès hal-02735488v1
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Effect of gut microbiota on production traits, interaction with genetics

Hélène Gilbert , Sandrine Lagarrigue , L.M.G. Verschuren , Olivier Zemb , M. Velasco
69. Annual Meeting of the European Association of Animal Production, Aug 2018, Dubrovnik, Croatia. 705 p
Communication dans un congrès hal-02738445v1

Transcriptomics data of liver and adipose tissue highlight lncRNAs as candidates for the lipid metabolism regulation in broilers

Kévin Muret , Christophe C. Klopp , Diane Esquerre , Morgane Boutin , Colette Désert
PAG XXVI - Plant and Animal Genome Conference, Jan 2018, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-01860010v1

Identification des fonctions biologiques, spécifiques d’un tissu ou partagées entre tissus, associées aux différences d’efficacité alimentaire chez le porc en croissance

Florence Gondret , Annie Vincent , Magalie Houee , Anne Siegel , Sandrine Lagarrigue
49. Journées de la Recherche Porcine, Jan 2017, Paris, France. pp.13-18
Communication dans un congrès hal-01602699v1

Spontaneous intake of essential oils during the early rearing phase of chicks and long-term effects on performance and transcriptome regulation

Laurence L.A. Guilloteau , Anne Collin , Aline Foury , Jean-Christophe Helbling , Alexia Koch
65. GA Congress. Society for Medicinal Plant and Natural Product Research., Sep 2017, Basel, Switzerland
Communication dans un congrès hal-01604161v1

Profiling the landscape of transcription and chromatin conformation reveals regulatory mechanisms involved in immune and metabolic functions

Sylvain Foissac , Sarah Djebali Quelen , Hervé Acloque , Marie-Hélène Pinard-van Der Laan , Sandrine Lagarrigue
3. Journée de Séminaires du Département Phase sur l'Epigénétique EpiPhase, May 2017, Jouy-en-Josas, France
Communication dans un congrès hal-01603057v1

Liver and whole blood transcriptome response to chronic heat exposure in laying hens

Frédéric Jehl , Andrea Rau , Colette Désert , Morgane Boutin , Kévin Muret
36. International Conference on Animal Genetics (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. pp.15
Communication dans un congrès hal-02463163v1

Effets durables d’un stress post-natal au cours de la vie du poulet d’élevage : recherche de marqueurs par analyse transcriptomique

Aline Foury , Jean-Christophe Helbling , Anne Collin , Sabine Crochet , Sandrine Lagarrigue
34. Colloque de la Société de Neuroendocrinologie, Oct 2016, Corte, France
Communication dans un congrès hal-01603535v1

Les métabolites plasmatiques peuvent-ils être des marqueurs du dépôt de gras dans les tissus périphériques chez le poulet ?

Maëva Jégou , Isabelle Louveau , Florence Gondret , J Lalande-Martin , Illa Téa
11. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2015, Tours, France
Communication dans un congrès hal-01210931v1
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Impact de la source énergétique alimentaire sur les métabolites digestifs microbiens chez le poulet

Irène Gabriel , Julie Lalande , Illa Téa , Florence Gondret , Sandrine Lagarrigue
11ème Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2015, Tours, France
Communication dans un congrès hal-01210972v1

RNA‐Seq in chicken with two focuses on long non coding RNA modeling (preliminary results) and RNA editing

Frederique Pitel , Sandrine Lagarrigue , Kévin Muret , Pierre-François Roux , Laure Fresard
Chick meeting du GDR 3604 "Modèle aviaire", Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). FRA., Jun 2015, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01211047v1
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Long-lasting effects of thermal manipulations during embryogenesis in broiler chickens

Thomas Loyau , Sonia Metayer-Coustard , Cécile Berri , Sandrine Grasteau , Christelle Hennequet-Antier
66. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2015, Varsovie, Poland
Communication dans un congrès hal-01211070v1
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Comparaison des cibles d’une matrice de score et d’une expression régulière. Application à la recherche de sites de fixation du facteur de transcription LXR

Aymeric Antoine-Lorquin , Sandrine Lagarrigue , Frédéric Lecerf , Jacques Nicolas , Catherine Belleannée
JOBIM 2015- 16e Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2015, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-01197050v1

Long-lasting effects of thermal manipulation during embryogenesis in broiler chickens

Thomas Loyau , Sonia Metayer-Coustard , Cécile Berri , Sandrine Grasteau , Christelle Hennequet-Antier
66. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2015, Warsaw, Poland. pp.538
Communication dans un congrès hal-01211058v1

RNA-seq: interests for research

Sandrine Lagarrigue
6. Annual meeting of the EFOR Network, réseau EFOR (Etude Fonctionnelle chez les Organismes Modèles). FRA., Mar 2015, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01455880v1
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Métabolites microbiens dans le tractus digestif du poulet. Exemple chez des poulets de status métabolique différent

Irène Gabriel , J Lalande , Illa Tea , Florence Gondret , Sandrine Lagarrigue
Journées du réseau NEM (Nutrition et Ecosystème Microbien), Apr 2014, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-03365428v1
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Sparse factor model for gene co-expression networks

Anne Blum , Magalie Houee , Aldons J. Lusis , Sandrine Lagarrigue , David Causeur
BioNetVisA Workshop, Sep 2014, Strasbourg, France
Communication dans un congrès hal-01210988v1

Transcriptome-wide investigation of genomic imprinting in chicken

Laure Fresard , Sophie Leroux , Bertrand Servin , David Gourichon , Patrice Dehais
22. International Plant and Animal Genome (PAG), Jan 2014, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-01193927v1
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Combining Genetics Mapping, Selective Sweeps, Genome Re-Requencing and Allele Specific Expression Reveals Several Serious Causative Genes for QTL Regions

Pierre-François Roux , Simon Boitard , Anis Djari , Diane Esquerre , Colette Désert
International Plant & Animal Genome XXII (PAG), Jan 2014, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-01193794v1

Performance, carcass traits and meat quality of genetically fat and lean broilers are unaffected by dietary energy source

Elisabeth Baéza , Pascal P. Chartrin , Anne Collin , Sonia Metayer-Coustard , Cécile Berri
14. European Poultry Conference, Jun 2014, Stavanger, Norway
Communication dans un congrès hal-01210608v1
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Spécificités évolutives du métabolisme des lipides chez le poulet

Philippe Monget , Joëlle Dupont , Elisabeth Baéza , Frederique Pitel , Sandrine Lagarrigue
10. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). Nouzilly, FRA. Institut National de la Recherche Agronomique (INRA). Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), FRA., Mar 2013, La Rochelle, France
Communication dans un congrès hal-01210391v1
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Using NGS data to characterize genetics of meet-type and egg-type chicken lines

Pierre-François Roux , Frédéric Lecerf , Anis Djari , Diane Esquerre , Sylvain Marthey
64th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2013, Nantes, France. pp.296
Communication dans un congrès hal-01019218v1

Utilisation des NGS pour la caractérisation génétique de lignées de poulet de chair et poules de ponte

Pierre-François Roux Roux , Frédéric Lecerf , Anis Djari , Diane D. Esquerre , Sylvain S. Marthey
10. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2013, La Rochelle, France. pp.556-561
Communication dans un congrès hal-01000659v1

Genome-wide interval mapping using SNP identifies new QTL for growth, body composition, meat quality and several physiological parameters in an F2 intercross between Fat and Lean chicken lines

Olivier Demeure , Michel Jacques M.J. Duclos , Nicola Bacciu , Guillaume Le Mignon , Olivier Filangi
XXI Plant & Animal Genome (PAG), Jan 2013, San Diego, United States
Communication dans un congrès hal-01210360v1

Utilisation de SNP pour la cartographie de QTL de croissance, composition de la carcasse et qualité de la viande dans un croisement F2 de lignées de poulet grasse et maigre

Olivier Demeure , Michel Jacques M.J. Duclos , Nicola Bacciu , Guillaume Le Mignon , Olivier Filangi
10. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2013, La Rochelle, France
Communication dans un congrès hal-01210361v1
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Identification of candidate polymorphism in a QTL region by combining eQTL mapping with NGS data

Pierre-François Roux , Yuna Blum , Colette Désert , Anis Djari , Diane Esquerre
64th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2013, Nantes, France. pp.300
Communication dans un congrès hal-01019609v1

Genetic analysis of a complex trait using transcriptomic data: contribution of gene regulatory network modeling

Yuna Blum , Magalie Houée , Chloé Friguet , Sandrine Lagarrigue , David Causeur
XX. Conference of the plant & animal genome (PAG), Jan 2012, San Diego, United States. 1 p
Communication dans un congrès hal-00841103v1
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Inferring gene networks using a sparse factor model approach, Statistical Learning and Data Science

Yuna Blum , Magali Houée , Chloé Friguet , Sandrine Lagarrigue , David Causeur
Learning and Data Science, May 2012, Florence (IT), Italy
Communication dans un congrès hal-00841017v1
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Transcriptome-wide investigation of genomic imprinting in chicken

Laure L. Fresard , Sophie S. Leroux , David Gourichon , Magali San Cristobal , Nathalie N. Marsaud
33. Conference of the International Society for Animal Genetics, Jul 2012, Cairns, Australia. pp.75
Communication dans un congrès hal-01000657v1
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Exploitation à large échelle de bases de données de connaissance sur les réactions et régulations pour trouver des régulateurs clés de groupe de gènes

Pierre Blavy , Florence Gondret , Sandrine Lagarrigue , Jaap J. van Milgen , Anne Siegel
Journées ouvertes en biologie, informatique et mathématiques, Jul 2012, Rennes, France. pp.161-170
Communication dans un congrès hal-01210385v1

Using large scale knowledge database about reactions and regulations to find key regulators of sets of genes

Pierre Blavy , Florence Gondret , Sandrine Lagarrigue , Jaap J. van Milgen , Anne Siegel
JOBIM 2012, Inria, 2012, Rennes, France. pp.123-132
Communication dans un congrès hal-00750512v1

Apport des NGS à la détection des mutations causales pour des caractères d’intérêt

Sandrine Lagarrigue
Réunion technique du Sysaaf : Apports des nouvelles technologies pour la sélection aquacole et avicole, Jun 2012, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01210949v1
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Inferring gene networks using a sparse factor model approach

Anne Blum , Magalie Houee , Chloé Friguet , Sandrine Lagarrigue , David Causeur
Statistical learning and data science, May 2012, Florence, Italy. 12 p
Communication dans un congrès hal-02806777v1

Du gène au phénotype - apports de la génomique fonctionnelle

Sandrine Lagarrigue
Comité thématique avicole AGENAVI, 2012, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01210950v1

AnnotQTL: a new tool to gather functional and comparative information on a genomic region

Frédéric Lecerf , Anthony Bretaudeau , Olivier Sallou , Colette Désert , Anne Blum
15th QTLMAS, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Génétique Animale (0598)., May 2011, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02746678v1
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Integrating QTL controlling fatness, lipid metabolites and gene expressions to genetically dissect the adiposity complex trait in a meat chicken cross

Yuna Blum , Olivier O. Demeure , Colette Désert , Hervé Guillou , J Bertrand-Michel
62. Annual Meeting of the European Association for Animal Production (EAAP), Aug 2011, Stavanger, Norway
Communication dans un congrès hal-02748764v1

Utilisation de la génétique et de la cartographie génétique pour l’intégration

Sandrine Lagarrigue
Ecole chercheurs en Biologie Intégrative et Génomique dans le Grand Ouest (BIGOU), Nov 2011, Auray, France
Communication dans un congrès hal-02802853v1
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Large-scale significance testing of high thoroughput Data with FAMT

Magalie Houée-Bigot , Chloé Friguet , Sandrine Lagarrigue , Anne Blum , David Causeur
14. Conference of the Applied Stochastic Models and Data Analysis International Society, Jun 2011, Rome, Italy
Communication dans un congrès hal-02746752v1
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Transcriptome profiling reveals interaction between two QTL for fatness in chicken

Yuna Blum , Guillaume Le Mignon , Frederique Pitel , David Causeur , Olivier Demeure
15th European workshop on QTL mapping and marker assisted selection (QTLMAS), May 2011, Rennes (FR), France. 1 p
Communication dans un congrès hal-00841016v1
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A new method for modeling reactions and regulations to analyze high-throughout data

Pierre Blavy , Florence Gondret , Sven Thiele , Carito Guziolowski , Sandrine Lagarrigue
4. International Symposium on Animal Functional Genomics, Sorcha De Gras; Sorcha De Gras, Oct 2011, Dublin, Ireland
Communication dans un congrès hal-02748096v1

Effect of the gene diacylglycerol-O-transferase 1 (DGAT1) polymorphism on the global expression pattern of genes in the mammary gland tissue of dairy cows

Núria Mach , Yuna Blum , David Causeur , Sandrine Lagarrigue , M. A. Smits
62. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), Aug 2011, Stavanger, Norway
Communication dans un congrès hal-02747109v1

A factor model to analyze heterogeneity in gene expression in a context of QTL mapping

Yuna Blum , Sandrine Lagarrigue , David Causeur
8th workshop " Statistical Methods for Post-Genomic Data ", Jan 2010, Marseille, France
Communication dans un congrès hal-00459362v1

A la croisée de la génomique positionnelle et fonctionnelle : application à l'identification d'une mutation chez le poulet et perspectives de recherches en qualité de la viande

Elisabeth Le Bihan-Duval , Cécile Berri , Frederique Pitel , J. Nadaf , Vonick Sibut
13. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Oct 2010, Clermont-Ferrand, France
Communication dans un congrès hal-02752823v1

Introduction aux concepts et outils de la génétique et génomique

Sandrine Lagarrigue
Journée thématique "génomique", Association de Coordination Technique Agricole (ACTA). FRA., Jan 2010, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02820677v1

Intérêts de la génomique dans les filières animales

Sandrine Lagarrigue
Journée de formation, Cooperl Arcatlantique. FRA., 2010
Communication dans un congrès hal-02820213v1
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Gene assisted selection for meat color in the chicken

Elisabeth Le Bihan-Duval , Javad Nadaf , Cécile Berri , Frederique Pitel , Estelle Godet
9. World Congress on genetics Applied to Livestock Production, Aug 2010, Leipzig, Germany
Communication dans un congrès hal-02754465v1

La génomique

Sandrine Lagarrigue
Séminaire de la société ALLTECH, 2010, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02820755v1

A la croisée de la génomique positionnelle et fonctionnelle : application à l'identification d'une mutation chez le poulet et perspectives de recherches en qualité de la viande

Elisabeth Le Bihan-Duval , Cécile Berri , Frederique Pitel , J. Nadaf , V. Sibut
13. Journées "Sciences du Muscle et Technologies des Viandes", Oct 2010, Clermont-Ferrand (FR), France. pp.201-207
Communication dans un congrès hal-00729428v1
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Inférence sur réseaux géniques par Analyse en Facteurs

Yuna Blum , Chloé Friguet , Sandrine Lagarrigue , David Causeur
42èmes Journées de Statistique, 2010, Marseille, France, France
Communication dans un congrès inria-00494802v1

Utilisation du transcriptome pour préciser la localisation d'un QTL responsable de la variabilité d'engraissement chez le poulet de chair.

Guillaume G. Le Mignon , Frederique Pitel , Colette Désert , Sophie S. Leroux , Olivier O. Demeure
8. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2009, Saint-Malo, France
Communication dans un congrès hal-02757979v1
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Génomique : réalisation et perspectives

Sandrine Lagarrigue , Elisabeth Le Bihan-Duval
8. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2009, Saint-Malo, France
Communication dans un congrès hal-02751410v1
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Utilisation du transcriptome pour préciser la localisation d'un QTL responsable de la variabilité d'engraissement chez le poulet de chair

Guillaume Le Mignon , Frederique Pitel , Colette Désert , Sophie Leroux , Olivier Demeure
Huitièmes Journées de la Recherche Avicole, Mar 2009, Paris (FR), France
Communication dans un congrès hal-00730108v1

Recherche de QTL responsables de l'engraissement chez le poulet

Sandrine Lagarrigue
2. Rencontres annuelles de génomique avicole, Nov 2009, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02820513v1

Génomique : réalisation et perspectives

Sandrine Lagarrigue , Elisabeth Le Bihan-Duval
8èmes Journées de la Recherche Avicole, Mar 2009, Paris (FR), France. pp.547-554
Communication dans un congrès hal-00729215v1

Eléments de compréhension de la génétique et génomique dans le contexte de la sélection animale

Sandrine Lagarrigue
Séminaire Génomique, Jul 2008, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02820222v1

A minimal and dynamical model for fatty acid metabolism in mouse liver

Pierre Blavy , Florence Gondret , Hervé Guillou , Sandrine Lagarrigue , Pascal G.P. Martin
Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, 2008, Lille, France. pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02817340v1

Intérêt de l'approche eQTL pour l'identification de gènes responsables de la variabilité de caractères quantitatifs.

Guillaume G. Le Mignon , Frederique Pitel , Florence F. Vignoles , M. Douaire , Pascale P. Le Roy
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau
Communication dans un congrès hal-02752935v1

LXRa : un gène candidat positionnel et fonctionnel pour un QTL d'engraissement chez le poulet de chair ?

S. Assaf , O. Demeure , C. Duby , Sandrine Lagarrigue , Frédéric Lecerf
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau (FR), France
Communication dans un congrès hal-00729764v1

Profils transcriptomiques de foies de poulet soumis au jeûne : utilisation d'une puce à ADN de 20000 oligonucléotides

Marc Aubry , Colette Désert , P. Blavy , Frédéric Lecerf , Michel Jacques M.J. Duclos
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau (FR), France
Communication dans un congrès hal-00729786v1

Pathway results from the chicken data set using several softwares

Agnès Bonnet , Sandrine Lagarrigue , Laurence Liaubet , Christèle Robert-Granié , Magali San Cristobal
EADGENE and SABRE Post-Analyses, Animal Sciences Group, 2008, Lelystad, Netherlands
Communication dans un congrès hal-02811912v1

Profils transcriptomiques de foies de poulet soumis au jeûne : utilisation d'une puce à ADN de 20000 oligonucléotides.

Colette Désert , Pierre Blavy , Frédéric Lecerf , Michel Jacques M.J. Duclos , François Moreews
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau
Communication dans un congrès hal-02757873v1
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Eléments de compréhension de la génétique et génomique dans le contexte de la sélection animale

Sandrine Lagarrigue
Séminaire génomique Bioporc, Nov 2008, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02813147v1

Pathway results from the chicken data set using several softwares

Agnès Bonnet , Sandrine Lagarrigue , Laurence Liaubet , Christèle Robert-Granié , Magali San Cristobal
EADGENE and SABRE Post-Analyses, Animal Sciences Group, Nov 2008, Lelystad (NL), Netherlands
Communication dans un congrès hal-00729781v1

Transcriptome profiling of feeding-to-fasting transition in chicken liver using a chicken 20K oligo microarray

Colette Désert , P. Blavy , François Moreews , Michel Jacques M.J. Duclos , P. Le Roy
Plant & Animal Genomes, XVI Conference, Jan 2008, San Diego (US), United States
Communication dans un congrès hal-00729810v1

Contribution To The Annotations Of The Chicken 20K Oligo Microarray Of ARK-Genomics

Christophe C. Klopp , François Moreews , Marc Aubry , Sandrine Lagarrigue
International Plant & Animal Genomes XVI Conference, Jan 2008, San Diego, United States
Communication dans un congrès inria-00329915v1

eQTL Mapping allows to refine abdominal fatness QTL in chicken

G. Le Mignon , Frederique Pitel , O. Demeure , S. Leroux , M. Douaire
Plant & Animal Genomes, XVI Conference, Jan 2008, San Diego (US), United States
Communication dans un congrès hal-00729130v1

Contribution to the annotation of the chicken 20K oligo microarray of ARK-genomics

C. Klopp , François Moreews , Marc Aubry , Sandrine Lagarrigue
Plant & Animal Genomes, XVI Conference, Jan 2008, San Diego (US), United States
Communication dans un congrès hal-00729110v1

Intérêt de l'approche eQTL pour l'identification de gènes responsables de la variabilité de caractères quantitatifs

G. Le Mignon , Frederique Pitel , F. Vignoles , M. Douaire , P. Le Roy
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau (FR), France
Communication dans un congrès hal-00729748v1
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A minimal and dynamic model for fatty acid metabolism in mouse liver

Pierre Blavy , Florence Gondret , Hervé Guillou , Sandrine Lagarrigue , Pascal G.P. Martin
Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique (JOBIM), Jun 2008, Lille (FR), France
Communication dans un congrès hal-00729742v1

A minimal and dynamic model for fatty acid metabolism in mouse liver

Pierre Blavy , Florence Gondret , Hervé Guillou , Sandrine Lagarrigue , Pascal G.P. Martin
Journées Ouvertes de Biologie, Informatique et Mathématique (JOBIM), Jun 2008, Lille, France
Communication dans un congrès hal-02756716v1

Contribution to the annotation of the chicken 20K oligo microarray of ARK-genomics.

Christophe C. Klopp , François Moreews , Michel Aubry , Sandrine Lagarrigue
Plant & Animal Genomes, XVI Conference, 2008, Inconnu, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02820463v1

LXRa : un gène candidat positionnel et fonctionnel pour un QTL d'engraissement chez le poulet de chair ?

Olivier O. Demeure , Cécile C. Duby , Frédéric Lecerf , S. Assaf , Sandrine Lagarrigue
Journées Scientifiques, Département de Génétique Animale, Apr 2008, Lacanau
Communication dans un congrès hal-02753163v1
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Intérêt de l’approche eQTL (QTL d’expression) pour l’identification de gènes responsables de la variabilité de caractères quantitatifs

Sandrine Lagarrigue , Michel Jacques M.J. Duclos
Séminaire AGENAE/GENANIMAL 2007, Oct 2007, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02755223v1

Localisation de QTL contrôlant les poids de gras abdominal et de filet sur le chromosome 5 du poulet

Guillaume G. Le Mignon , Frederique Pitel , Olivier O. Demeure , Hélène Gilbert , Florence F. Vignoles
7. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2007, Tours, France
Communication dans un congrès hal-02755614v1

Modélisation multi-organes et multi-espèces du métabolisme des lipides

Pierre Blavy , Anne Siegel , Ovidiu Radulescu , Florence Gondret , Jaap J. van Milgen
2. Journées d'Animation Scientifique du Département PHASE, Oct 2007, Tours, France
Communication dans un congrès hal-02756643v1

Mapping male-specific fatness QTL at the distal part of chicken chromosome 5.

Behnam Abasht , Frederique Pitel , Elisabeth Le Bihan-Duval , Sophie S. Leroux , Sandrine Lagarrigue
XII European Poultry Conference (EPC), 10-14 september 2006, Sep 2006, Verona, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02816346v1

Advanced backcross generations allowed refining sex-specific fatness QTL regions in a polygenic chicken model of fatness.

Behnam Abasht , Frederique Pitel , Sophie S. Leroux , Elisabeth Le Bihan-Duval , Sandrine Lagarrigue
Stadler Genetics Symposium Genomics of Disease, October 2-4, 2006, Columbia, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02817176v1

Différential gene expression in the liver of lean and fat chickens

Emmanuelle Bourneuf , Céline Chicault , Frédéric Herault , Wilfried Carré , Sirine Assaf
4th European Poultry Genetics Symposium, Oct 2005, Dubrovnik, Croatia
Communication dans un congrès hal-02649166v1

Former pour l'amélioration génétique : questions anciennes et nouveaux défis.

Etienne Verrier , R. Jussiau , Pascale P. Le Roy , P.L. Gastinel , A. Ducos
12èmes Rencontres Recherches Ruminants, Dec 2005, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02760296v1

Sex by fatness QTL interaction with transgressive variation in fat and lean lines.

Behnam Abasht , Sandrine Lagarrigue , Frederique Pitel , Elisabeth Le Bihan-Duval , Pascale P. Le Roy
Gordon Conference on Quantitative Genetics and Genomics, 2005, Ventura, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02830385v1

Characterisation of quantitative trait loci affecting fatness on chicken chromosome 5

Behnam Abasht , Frederique Pitel , Sandrine Lagarrigue , Elisabeth Le Bihan-Duval , Pascale P. Le Roy
22. World's Poultry Congress, Jun 2004, Istanbul, Turkey
Communication dans un congrès hal-02760168v1
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Extraction d'information appliquée au domaine biomédical : apprentissage et traitement automatique de la langue

Erick Alphonse , Sophie Aubin , Philippe Bessières , Gilles Bisson , Thierry Hamon
Conférence internationale de fouille de texte, CIFT-04, Jun 2004, La Rochelle, France
Communication dans un congrès hal-02762525v1
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Event-based Information Extraction for the biomedical domain: the Caderige project

Erick Alphonse , Sophie Aubin , Philippe Bessières , Gilles Bisson , Thierry Hamon
Proceedings of the International Joint Workshop on Natural Language Processing in Biomedicine and Its Applications (COLING'04), 2004, Geneva, Switzerland. pp.43-49
Communication dans un congrès hal-00098040v1

Analyse du transcriptome de poule (Gallus) ; profil d'expression des ARNm de différents tissus et analyse du métabolisme des lipides.

S. Assaf , Emmanuelle E. Bourneuf , Gérard Cabello , Patrick Chardon , Patrice Dehais
Colloque Génomique des animaux d'élevage, Seignosse-le-Penon, May 2003, Seignosse-le-Peignon, France
Communication dans un congrès hal-02759039v1

Approche transcriptomique de l'engraissement chez le poulet de chair

Emmanuelle E. Bourneuf , Frédéric Herault , Elodie Retout , Sandrine Lagarrigue , Madeleine Douaire
5. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2003, Tours, France
Communication dans un congrès hal-02764127v1

Identification of 3 new minor hen egg white proteins

F. Nau , C. Guerin-Dubiard , Colette Désert , Joël Gautron , Wilfrid Carre
16. European Symposium on the Quality of Poultry Meat & 10. European Symposium on the Quality of Eggs and Egg Products, Sep 2003, Saint Brieuc - Ploufragan, France
Communication dans un congrès hal-02762457v1

Identification de QTL pour l'état d'engraissement et le poids de filet chez le poulet de chair.

Sandrine Lagarrigue , Frederique Pitel , Wilfrid Carre , Pascale P. Le Roy , André Neau
5èmes Journées de la Recherche Avicole, 2003, Tours, France
Communication dans un congrès hal-02759148v1

A functional approach to fattening in chickens

E. Bourneuf , Frédéric Herault , E. Retout , S. Lagarrigue , M. Douaire
Spring Meeting of the WPSA French Branch, Mar 2003, Tours, France. pp.793-794, ⟨10.1080/00071660410001666826⟩
Communication dans un congrès hal-02648989v1

An initial QTL scan for abdominal fatness and breast muscle weight in broiler chickens.

Sandrine Lagarrigue , S. Pitel , Wilfrid Carre , Pascale P. Le Roy , André Neau
Plant and Animal Genome XI Conference, San Diego, Jan 2003, California, pp.Inconnu
Communication dans un congrès hal-02829511v1

A chicken lipid metabolism macroarray.

S. Assaf , Dominique Hazard , Madeleine Douaire , Sandrine Lagarrigue
11th European Poultry Conference, Sep 2002, Bremen, Germany
Communication dans un congrès hal-02825145v1

A two-step procedure for fat QTL identification in meat-type chickens

Frederique Pitel , Sandrine Lagarrigue , Pascale P. Le Roy , Florence Plisson-Petit , Yves Amigues
7. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Aug 2002, Montpellier, France
Communication dans un congrès hal-02762751v1

Comportement rhéologique évolutif de suspensions d'amidon soumises à des cinétiques rapides de température et de cisaillement

S. Lagarrigue , G. Alvarez , M. Ude , Denis Leducq , J. Andreu
Journée Jeunes Chercheurs UMR GENIAL, INAPG, 11 juin 2002, 2002, France. pp.1
Communication dans un congrès hal-02580723v1

Gradient de température radial dans un écoulement de Couette lors de cinétiques de température

S. Lagarrigue , G. Alvarez , D. Flick
Journée Jeunes Chercheurs UMR GENIAL, ENSIA, 2001, 2001, France. pp.1
Communication dans un congrès hal-02580724v1

Lipogenesis genes and fatness in the chicken.

Stéphanie Daval , Sandrine Lagarrigue , Frederique Pitel , C. Le Nigen , Alain Vignal
27th International Conference on Animal Genetics, Jul 2000, Minnesota, United States
Communication dans un congrès hal-02769050v1

Analyse fonctionnelle de gènes du métabolisme des lipides et association génétique avec l'état d'engraissement : deux analyses génétiques complémentaires d'un caractère quantitatif

Sandrine Lagarrigue , M. Douaire
3. Journées de la recherche avicole, Mar 1999, Saint-Malo, France
Communication dans un congrès hal-02771024v1

Activité transcriptionnelle de genes impliqués dans le métabolisme des lipides chez des lignées grasse et maigre de poulet

Stéphanie Daval , Sandrine Lagarrigue , M. Douaire
3. Journées de la recherche avicole, Mar 1999, Saint-Malo, France
Communication dans un congrès hal-02768808v1

Gènes associés à la lipogénèse chez le poulet

M. Douaire , Sandrine Lagarrigue
Séminaire du département de génétique animale, Sep 1999, Cap d'Agde, France
Communication dans un congrès hal-02766024v1

Lipogenesis gene expression in divergently selected lean and fat chickens

Stéphanie Daval , Sandrine Lagarrigue , J.P. Caffin , B. Leclercq , M. Douaire
10. European Poultry Congress, Jun 1998, Jérusalem, Israel
Communication dans un congrès hal-02768929v1

Analysis of genetical association between lipogenic genes and fatness in R+/Regg-laying lines

Sandrine Lagarrigue , Michèle Tixier-Boichard , André A. Bordas , M. Douaire
10. European poultry conference, Jun 1998, Jerusalem, Israel
Communication dans un congrès hal-02765536v1

Lipogenic gene expression in divergently selected egg-laying lines on residual food consumption

Sandrine Lagarrigue , André A. Bordas , Stéphanie Daval , A. Leduc , M. Douaire
10. European Poultry Congress, Jun 1998, Jérusalem, Israel
Communication dans un congrès hal-02769105v1

Comparison of liver lipogenic mRNA levels between two breeds of geese with different abilities to hepatic steatosis

Sandrine Lagarrigue , Gérard Guy , R. Rouvier , M. Douaire
11. European symposium, Sep 1997, Nantes, France
Communication dans un congrès hal-02768547v1

Apoprotein A1 mRNA levels differ in genetically lean and fat chickens.

Stéphanie Daval , Sandrine Lagarrigue , J.P. Caffin , B. Leclercq , Madeleine Douaire
XXV International Conference on Animal Genetics, Jul 1996, Tours, France
Communication dans un congrès hal-02768958v1

Suppression of oncogene-induced transformation by quercetin and retinoic acid in rat liver epithelial cells

Sandrine Lagarrigue , Catherine C. Chaumontet , Christine Heberden , Paule Latino-Martel , I. Gaillard-Sanchez
2. International congress, May 1996, Ede, Netherlands
Communication dans un congrès hal-02768469v1

Les insulin-like growth factors modifient l'état de phosphorylation de la protéine c-jun

Sandrine Lagarrigue , Christine Heberden , Paule Latino-Martel , I. Sanchez-Gaillard
4. Colloque de Biomatec, Mar 1996, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02764576v1

Active proliferation of adult chicken hepatocytes ex vivo

Sandrine Lagarrigue , Gwenola Tosser , I. Chauveau , Alain-Hervé Le Gall , J. Mallard
40. Meeting of the European Tissue Culture Society, Jul 1993, Rennes, France
Communication dans un congrès hal-02777795v1

Transgenerational response to endocrine disruptor : phenotypic, genotypic and epigenotypic analyses in quail

Stacy Rousse , Sophie Leroux , David Gourichon , Ludovic Calandreau , Chloé Cerutti
Environmental and Agronomical Genomics Symposium, Feb 2024, Toulouse, France. , pp.128, 2024, Book of abstracts
Poster de conférence hal-04474289v1
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Whole genome sequencing and epigenotyping for multiple generations of selection using Oxford Nanopore Technology

Sonia E Eynard , Cécile Donnadieu , Loïc Flatres-Grall , Carole Iampietro , Sandrine Lagarrigue
Environmental and Agronomical Genomics Symposium, Feb 2024, Toulouse, France. , pp.118, Book of abstracts
Poster de conférence hal-04473354v1

Variant calling and genotyping accuracy of ddRAD-seq: comparison with WGS in layers

Mathilde Doublet , Frédéric Lecerf , Fabien Degalez , Sandrine Lagarrigue , Laetitia Lagoutte
74. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), Aug 2023, Lyon, France. Wageningen Academic Publishers, Book of abstracts, 29, pp.796, 2023, Book of abstracts of the 74th annual meeting of the european federation of animal science
Poster de conférence hal-04286708v1

A lncRNA gene-enriched atlas for GRCg7b chicken genome using Ensembl, RefSeq and two FAANG databases

Fabien Degalez , Mathieu Charles , Sylvain Foissac , Zhou Haijuan , Guan Dailu
74. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), Aug 2023, Lyon, France. Wageningen Academic Publishers, Book of abstracts, 29, pp.932, 2023, Book of abstracts of the 74st annual meeting of the european federation of animal science
Poster de conférence hal-04217567v1
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Influence of early rearing system on later performance of commercial laying hens

Quentin Berger , Nicolas Bédère , Pascale Le Roy , Sandrine Lagarrigue , Thierry Burlot
74. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), Aug 2023, Lyon, France. Wageningen Academic Publishers, Book of abstracts, 29, pp.418, 2023, Book of abstracts of the 74th annual meeting of the european federation of animal science
Poster de conférence hal-04198453v1
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Gene orthology detection for long noncoding RNA (lncRNA)

Fabien Degalez , Coralie Alain , Laetitia Lagoutte , Sandrine Lagarrigue
39. Congress of the international society for animal genetics (ISAG), Jul 2023, Cape Town, South Africa. , pp.61, 2023, Abstracts
Poster de conférence hal-04217585v1
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A lncRNA gene-enriched atlas for GRCg7b chicken genome and its functional annotation across 47 tissues

Fabien Degalez , Mathieu Charles , Sylvain Foissac , Haijuan Zhou , Dailu Guan
39. Congress of the international society for animal genetics (ISAG), Jul 2023, Cape Town, South Africa. , pp.78, 2023, Abstracts
Poster de conférence hal-04217582v1
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The evolution of epigenetics across multiple generations

Sonia E Eynard , Cécile Donnadieu , Loïc Flatres-Grall , Carole Iampietro , Sandrine Lagarrigue
Epigenetic inheritance symposium, Aug 2023, Zurich, Switzerland. 2023
Poster de conférence hal-04195749v1
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The richer the better: 16S metabarcoding analysis of gut microbiota of laying hens in relation to feed efficiency and adaptation to diet change

Maria Bernard , Alexandre Lecoeur , Jean-Luc Coville , Nicolas Bruneau , Deborah Jardet
13. International Gut Microbiology Symposium 2023, Jun 2023, Aberdeen, United Kingdom. , 2023, Programme and book of abstracts
Poster de conférence hal-04127869v1

LncRNA analysis in response to diet changes in broiler chickens

Fabien Degalez , Coralie Alain , Laetitia Lagoutte , Sandrine Lagarrigue
39. Congress of the international society for animal genetics (ISAG), Jul 2023, Cape Town, South Africa. , pp.74, 2023, Abstracts
Poster de conférence hal-04217588v1
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Genetic architecture of the persistency of production, quality, and efficiency traits in laying hens

Quentin Berger , Nicolas Bédère , Pascale Le Roy , Thierry Burlot , Sandrine Lagarrigue
74. Annual meeting of the european federation of animal science (EAAP), Aug 2023, Lyon, France. Wageningen Academic Publishers, Book of abstracts, 29, pp.812, 2023, Book of abstracts of the 74th annual meeting of the european federation of animal science
Poster de conférence hal-04198555v1

Gene orthology detection for Long Non Coding RNA (LncRNA)

Fabien Degalez , Sandrine Lagarrigue
Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM), Jul 2022, Rennes, France. , pp.71, Proceedings
Poster de conférence hal-03880961v1
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Impact of host genetics and abiotic stresses on caecal microbiota composition in four different laying hen lines?

Maria Bernard , Jean-Luc Coville , Nicolas Bruneau , Deborah Jardet , Sandrine Lagarrigue
Journées Scientifiques du Département de Génétique Animale, Sep 2022, Bordeaux, France
Poster de conférence hal-03930049v1
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Evaluate the impact of abiotic stressors (heat and suboptimal diet) on the gut microbiota of two chicken lines diverging in feed efficiency, using the 16S rRNA high throughput sequence technology

Alexandre Lecoeur , Maria Bernard , Sandrine Lagarrigue , Tatiana Zerjal
JOBIM 2020, Jun 2020, Montpellier, France.
Poster de conférence hal-03176327v1

Layers response to suboptimal diet through phenotypic and transcriptomic changes in four tissues

Frédéric Jehl , M. Brenet , Andrea Rau , Colette Désert , Morgane Boutin
PAG XXVII - Plant & Animal Genome Conference, Jan 2019, San Diego, United States. , 2019
Poster de conférence hal-02789419v1

Consommation spontanée d'huiles essentielles pendant la phase de démarrage du poussin de chair et effets à long terme sur la performance et le transcriptome sanguin

Laurence L.A. Guilloteau , Anne Collin , Aline Foury , Jean-Christophe Helbling , Alexia Koch
Journées d'Animation Scientifique du département Phase (JAS Phase 2018), Apr 2018, Rennes, France. , 2018, Journées d’animation scientifiques du département Phase - Recueil des résumés
Poster de conférence hal-01859272v1

Integrative analyses of chromosome conformation, chromatin accessibility and gene expression in human and livestock genomes

Camille Mestre , Sarah Djebali Quelen , Thomas Faraut , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau
European Conference on Computational Biology (ECCB 2018), Sep 2018, Athènes, Greece. , 2018
Poster de conférence hal-02784857v1
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Phenotype and multi-tissue transcriptome response to diet changes in laying hens

M. Brenet , Andrea Rau , Colette Désert , Morgane Boutin , Kévin Muret
36. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book
Poster de conférence hal-01621916v1
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Long-non coding RNAs repertoires in liver and two T lymphocyte cell types in four livestock species

Kévin Muret , Sarah Djebali Quelen , Thomas Derrien , Cédric Cabau , Christophe C. Klopp
36. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book
Poster de conférence hal-01621915v1

Une nouvelle facette du génome de poule : les genes “longs non-codants"

Kévin Muret , Christophe C. Klopp , Valentin Wucher , Diane Esquerre , Fabrice Legeai
12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 2017, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras
Poster de conférence hal-01605848v1
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Liver and whole blood transcriptome response to chronic heat exposure in laying hens

Frédéric Jehl , Andrea Rau , Colette Désert , Morgane Boutin , Kévin Muret
36. Conference of the International Society for Animal Genetics (ISAG), Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, Proceedings of the 36th International Conference on Animal Genetics
Poster de conférence hal-01605567v1

Integrative and differential analysis of transcriptomes and chromatin accessibility regions reveals regulatory mechanisms involved in pig immune and metabolic functions

Sarah Djebali Quelen , Kylie Munyard , Nathalie Villa-Vialaneix , Cédric Cabau , Andrea Rau
36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book
Poster de conférence hal-01603033v1

Recherche de régions génomiques responsables du diabète insipide et de la couleur de la coquille celadon chez la Caille japonaise par RADseq

Sophie Leroux , Anna Marissal , Maria Bernard , Diane Esquerre , Johanna Barbieri
12. Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, Apr 2017, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 12, 2017, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras
Poster de conférence hal-01604801v1
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Profiling the landscape of transcription, chromatin accessibility and chromosome conformation of cattle, pig, chicken and goat genomes [FAANG pilot project]

Sylvain Foissac , Sarah Djebali Quelen , Hervé Acloque , Philippe Bardou , Fany Blanc
36th International Society for Animal Genetics Conference, Jul 2017, Dublin, Ireland. 2017, ISAG 2017 - Genomes to Phenomes - Abstract Book
Poster de conférence hal-01608449v1

Long-non coding RNAs repertoire in liver and adipose tissue in chicken

Kévin Muret , Christophe C. Klopp , Valentin Wucher , Diane D. Esquerre , Fabrice Legeai
XXIV International Plant & Animal Genome (Pag), Jan 2016, San Diego, United States. 2016
Poster de conférence hal-02799305v1
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THERMOCHICK : Acclimatation embryonnaire à la chaleur. Quels sont les mécanismes modifiés chez le poulet de chair en finition ?

Thomas Loyau , Christelle Hennequet-Antier , Sonia Metayer-Coustard , Marie Leduc , Sabine Crochet
Journées du Métaprogramme ACCAF, Mar 2016, Marne-La-Vallée, France. 2016
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La capacité de stockage des lipides par des poulets maigres ou gras n'est pas influencée par la source d'énergie de l'aliment

Elisabeth Baéza , Florence Gondret , Pascal P. Chartrin , Elisabeth Duval , Cécile Berri
11. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2015, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 2015, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras
Poster de conférence hal-01210973v1

Acclimatation embryonnaire à la chaleur : quels sont les mécanismes moléculaires modifiées chez le poulet de chair en finition ?

Thomas Loyau , Christelle Hennequet-Antier , Sonia Metayer-Coustard , Marie Leduc , Sabine Crochet
11. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2015, Tours, France. ITAVI, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 2015, Journées de la Recherche Avicole et Palmidèdes à Foie Gras
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Contributions des transcriptomes du foie, tissu adipeux et muscle aux mécanismes d'adaptation des poulets de chair face à une variation de la source d'énergie dans l'aliment

Colette Désert , Elisabeth Baéza , Meziane Aite , Morgane Boutin , Aurélie Le Cam
11. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2015, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 2015, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras
Poster de conférence hal-01210974v1

La combinaison de cartographie de signatures de sélection, de re-séquençage de génomes et d'analyses d'expression révèle PARK2 et JAG2 comme nouveaux genes candidats régulant l'adiposité

Pierre-François Roux , Simon Boitard , Anne Blum , Brian Parks , Alexandra Montagner
11. Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2015, Tours, France. ITAVI - Institut Technique de l'Aviculture, Journées de la Recherche Avicole et des Palmipèdes à Foie Gras, 2015, Journées de la Recherche Avicole et Palmipèdes à Foie Gras
Poster de conférence hal-01194116v1
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Integrative responses of pig adipose tissues to high-fat high-fiber diet: towards key regulators of energy flexibility

Florence Gondret , Annie Vincent , Magalie Houee , Sandrine Lagarrigue , Anne Siegel
ASAS/ADSA midwest meeting, Mar 2015, Des Moines, United States. Journal of Animal Science, 93 (Suppl. 2), 2015, Abstract book of the ASAS/ADSA midwest meeting
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Can plasma metabolites predict fat deposition in peripheral tissues of chicken?

Maëva Jégou , Isabelle Louveau , Florence Gondret , Julie Lalande-Martin , I Tea
14. European Poultry Conference, Jun 2014, Stavanger, Norway. WPSA, Branche Norvégienne, 2014, XIVTH EUROPEAN POULTRY CONFERENCE
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Long-lasting effects of thermal manipulation during embryogenesis on muscle gene expression profile in fast-growing chickens.

Thomas Loyau , Christelle Hennequet-Antier , Cécile Berri , Marco Moroldo , Patrice Martin
14. European Poultry Conference, Jun 2014, Stavanger, Norway. WPSA, Branche Norvégienne, 2014, 14. European Poultry Conference
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Age effect on liver trascriptome in chicken lines selected for residual feed consumption

Tatiana Zerjal , Sandrine Lagarrigue , Florence Jaffrezic , Marco Moroldo , Denis Laloë
14. European Poultry Conference, Jun 2014, Stavanger, Norway. , 2014
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The R package FANet: sparse factor analysis model for high dimensional gene co-expression networks

Anne Blum , Magalie Houee , Sandrine Lagarrigue , David Causeur
The International R Users Conference, Jun 2014, Los Angeles, United States. 2014, UserR contributed abstracts
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Selective sweeps using hapFLK combined with genome re-sequencing data reveals strong candidate mutations in QTL regions in divergent chicken lines

Pierre-François Roux , Simon Boitard , Anis Djari , Diane Esquerre , Sylvain Marthey
8th European Symposium on Poultry Genetics (ESPG), Sep 2013, Venise, Italy. 2013, Proceedings of the 8th European Symposium on Poultry Genetics
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Y a-t-il de l'empreinte chez la poule ?

Laure Fresard , Sophie Leroux , David Gourichon , Patrice Dehais , Bertrand Servin
10. Journées de la Recherche Avicoles et Palmipèdes à Foie Gras, Mar 2013, La Rochelle, France. pp.551-555, 2013
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Genome-wide transcriptomic analysis of liver from chicken lines selected for residual feed consumption

Tatiana Zerjal , Sandrine Lagarrigue , Florence Jaffrezic , Marco Moroldo , Denis Laloë
8. European Symposium on Poultry Genetics (ESPG), Sep 2013, Venise, Italy. 2013, Proceedings of the 8th European Symposium on Poultry Genetics
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Analysis of allele specific expression in mouse liver by RNA-Seq

Pierre-François Roux , Sandrine Lagarrigue , L. Martin , F. Hormozdiari , A. van Nas
63. Annual Meeting of the Amercian Society of Human Genetics (ASHG), Oct 2013, Boston, United States. , 2013, Poster book
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Genetic analysis of a complex trait using transcriptomic data: contribution of gene regulatory network modeling

Anne Blum , Magalie Houee , Chloé Friguet , Sandrine Lagarrigue , David Causeur
XX. Conference of the plant & animal genome (PAG), Jan 2012, San Diego, United States. 2012
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AnnotQTL: a new tool to gather functional and comparative information on a genomic region

Frédéric Lecerf , Anthony Bretaudeau , Olivier Sallou , Colette Désert , Yuna Blum
12. Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jun 2011, Paris, France. 2011, JOBIM 2011
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Transcriptome profiling reveals interaction between two QTL for fatness in chicken

Yuna Blum , Guillaume G. Le Mignon , Colette Désert , Frederique Pitel , David Causeur
XXXII International Conference on Animal Genetics (ISAG), Jul 2010, Edinburgh, United Kingdom. 2010, Proceedings of the 32nd International Conference on Animal Genetics
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A factor model to analyse heterogeneity in gene expression in a context of QTL characterization

Yuna Blum , Sandrine Lagarrigue , David Causeur
XXXII International Conference on Animal Genetics (ISAG), Jul 2010, Edinburgh, United Kingdom. 2010, Proceedings of the 32nd International Conference on Animal Genetics
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Genome-Wide QTL detection for growth, body composition and quality related traits in chicken

Olivier O. Demeure , Michel Jacques M.J. Duclos , Cécile Berri , Nicola Bacciu , Frederique Pitel
XXXII International Conference on Animal Genetics (ISAG), Jul 2010, Edinburgh, United Kingdom. 2010, Proceedings of the 32nd International Conference on Animal Genetics
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eQTL Mapping allows to refine abdominal fatness QTL in chicken

Guillaume G. Le Mignon , Frederique Pitel , Olivier O. Demeure , Sophie S. Leroux , M. Douaire
Plant & Animal Genomes, XVI Conference, Jan 2008, Inconnu, , 2008
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Transcriptome profiling of feeding-to-fasting transition in chicken liver using a chicken 20K oligo microarray.

Colette Désert , Pierre Blavy , François Moreews , Michel Jacques M.J. Duclos , Pascale P. Le Roy
Plant & Animal Genomes, XVI Conference, Jan 2008, Inconnu, , 2008
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Qualitative, integrated modeling of lipid metabolism in hepatocytes

O Radulescu , A Siegel , Mathieu Le Borgne , Philippe Veber , E Pécou
7th International Conference on Systems Biology - Yokohama, 2006, Japan. pp.Inconnu, 2006
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Réseaux d'ADNc pour l'analyse du transcriptome des animaux d'élevage

Agnès Bonnet , Severine S. Degrelle , Christian Diot , Madeleine Douaire , Marina Govoroun
Séminaire des programmes INRA de génomique animale, végétale et des microorganismes, Dec 2004, Paris, France. 2004
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Elaboration d'une puce à ADN en vue d'étudier la régulation du métabolisme hépatique des lipides chez le poulet.

Sirine Assaf , Dominique Hazard , Frédéric Herault , Christian Diot , François Piumi
5. Journées de la Recherche Avicole, Mar 2003, Tours, France. 2003, 5èmes Journées de la Recherche Avicole
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Expression and genetic association of SREBP and lipogenesis genes for effects on fatness in broiler chicken lines

Sirine Assaf , Sandrine Lagarrigue , Stéphanie Daval , C. Le Nigen , M. Sansom
11th European Poultry Conference, Sep 2002, Bremen, Germany
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Lipogenic gene expression and genetic association with fatness in broiler chicken lines.

S. Assaf , Sandrine Lagarrigue , Stéphanie Daval , C. Le Nigen , M. Sansom
11th European Poultry Conference, 2002, Bremen, Germany. pp.Inconnu, 2002
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Localisation de 10 genes sur la carte génétique de la poule

Frederique Pitel , Florence Plisson-Petit , Cédric Cabau , Sandrine Lagarrigue , Mohammed Taouis
Colloque annuel S.F.G. - Génomique Comparative, Apr 1999, Toulouse, France. 1 p., 1999
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Lipid metabolism and breed-related susceptibility to hepatic steatosis in the goose

Dominique D. Hermier , Gérard Guy , M.R. Salichon , Jacques Mourot , Sandrine Lagarrigue
Colloque Franco-Britannique de Nutrition, Sep 1998, Nancy, France. 1 p., 1998
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Genetical and nutritional regulation of lipogenesis in chicken

Frédéric Allemand , Jp Caffin , Stéphanie Daval , Christian Diot , Madeleine Douaire
3ème Colloque Franco-Britannique de Nutrition, Sep 1998, Nancy, France
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