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Sandrine Auger

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Documents

Présentation

**Etude de la régulation de l’expression génétique et de l’adaptation du métabolisme bactérien en réponse à des variations environnementales : de la microbiologie expérimentale à la bioinformatique intégrative.** -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- **Projets de recherche** ***2018-*** **Diversité des souches de *F. prausnitzii* dans le microbiote intestinal** **humain.** Responsable de la tâche bioinformatique WP1.2 dans le projet Carnot-Qualiment BP Acetate coordonné par E. Huillet. "Développement de co-cultures bactériennes pour potentialiser la biomasse et les effets santé de bactéries intestinales anaérobie strictes". ***2017-2018*** **Impact de la réponse nitrogène sur les bactéries du microbiote intestinal humain.** ***2010-2017* Interconnexions des réseaux de régulation de voies métaboliques chez *B. subtilis*.** Responsable de la tâche WP6 dans le programme Marie Curie Initial Training Network FP7/2012 AMBER coordonné par L. Hamoen. "Central carbon metabolism and main cellular processes in *B. subtilis*". *2013-2016*. Participation au projet européen BaSyntheccoordonné par P. Noirot. "Bacterial Synthetic minimal genomes for biotechnology". *2010-2013* Participation au projet européen BaSysBio coordonné par P. Noirot. "Towards an understanding of dynamic transcriptional regulation at global scale in bacteria: a systems biology approach". *2010-2011* ***2005-2009* Evolution des génomes au sein du groupe *B. cereus*.** Participation au projet national PNRA *B. cereus* coordonné par C. Nguyen. "Nouvelle approche et nouveaux outils pour étudier l’émergence d’une bactérie pathogène dans les filières alimentaires. Le cas de *B. cereus* dans les produits non stériles traités thermiquement". *2005-2008* ***2003-2005* Formation de biofilms par *B. cereus* sur substrats inertes.** ***1999-2003* Caractérisation de gènes impliqués dans le métabolisme du soufre chez *B. subtilis*.**

Publications

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Colorimetric aptasensor for detection of Bacillus cytotoxicus spores in milk and ready-to-use food

Francesco Rizzotto , Marco Marin , Christine Péchoux , Sandrine S. Auger , Jasmina Vidic
Heliyon, 2023, 9 (7), pp.e17562. ⟨10.1016/j.heliyon.2023.e17562⟩
Article dans une revue hal-04189190v1

The Tolerance of Gut Commensal Faecalibacterium to Oxidative Stress Is Strain Dependent and Relies on Detoxifying Enzymes

Tatiana Botin , Luis Ramirez-Chamorro , Jasmina Vidic , Philippe Langella , Isabelle Martin-Verstraete
Applied and Environmental Microbiology, 2023, 89 (7), pp.e00606-23. ⟨10.1128/aem.00606-23⟩
Article dans une revue hal-04189195v1

Faecalibacterium duncaniae A2-165 regulates the expression of butyrate synthesis, ferrous iron uptake, and stress-response genes based on acetate consumption

Sophie Verstraeten , Séverine Layec , Sandrine S. Auger , Catherine Juste , Céline Henry
Research Square - Preprint, 2023, 14 (1), pp. 987. ⟨10.1038/s41598-023-51059-3⟩
Article dans une revue hal-04443517v2

Faecalibacterium : a bacterial genus with promising human health applications

Rebeca Martín , David Rios-Covian , Eugénie Huillet , Sandrine S. Auger , Sarah Khazaal
FEMS Microbiology Reviews, 2023, 47 (4), pp. 1-18. ⟨10.1093/femsre/fuad039⟩
Article dans une revue hal-04189185v1
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Description of a Newly Isolated Blautia faecis Strain and Its Benefit in Mouse Models of Post-Influenza Secondary Enteric and Pulmonary Infections

Sophie Verstraeten , Valentin Sencio , Audrey Raise , Eugénie Huillet , Séverine Layec
Nutrients, 2022, 14 (7), pp.1478. ⟨10.3390/nu14071478⟩
Article dans une revue hal-03649191v1

Intraspecific Diversity of Microbial Anti-Inflammatory Molecule (MAM) from Faecalibacterium prausnitzii

Sandrine S. Auger , Camille Kropp , Esther Borras-Nogues , Wasaporn Chanput , Gwenaelle Andre-Leroux
International Journal of Molecular Sciences, 2022, 23 (3), pp.1705. ⟨10.3390/ijms23031705⟩
Article dans une revue hal-03752257v1
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Gene co-expression network analysis of the human gut commensal bacterium Faecalibacterium prausnitzii in R-Shiny

Sandrine Auger , Virginie Mournetas , Hélène Chiapello , Valentin Loux , Philippe Langella
PLoS ONE, 2022, 17 (11), pp. e0271847. ⟨10.1371/journal.pone.0271847⟩
Article dans une revue hal-04083924v1
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Impact of Dietary Arachidonic Acid on Gut Microbiota Composition and Gut–Brain Axis in Male BALB/C Mice

Katleen Pinchaud , Zeeshan Hafeez , Sandrine Auger , Jean-Marc Chatel , Sead Chadi
Nutrients, 2022, 14 (24), pp.5338. ⟨10.3390/nu14245338⟩
Article dans une revue hal-04083922v1
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Metal oxide nanoparticles for safe active and intelligent food packaging

Maria Vesna Nikolic , Zorka Vasiljevic , Sandrine Auger , Jasmina Vidic
Trends in Food Science and Technology, 2021, 116, pp.655-668. ⟨10.1016/j.tifs.2021.08.019⟩
Article dans une revue hal-03798880v1
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Synthesis and antibacterial activity of iron manganite (FeMnO 3 ) particles against the environmental bacterium Bacillus subtilis †

Zorka Z Vasiljevic , Milena P Dojcinovic , Jugoslav B Krstic , Vesna Ribic , Nenad B Tadic
RSC Advances, 2020, 10, ⟨10.1039/d0ra01809k⟩
Article dans une revue hal-02889105v1

Bacillus subtilis Regulators MntR and Zur Participate in Redox Cycling, Antibiotic Sensitivity, and Cell Wall Plasticity

Paola Randazzo , Jamila J. Anba-Mondoloni , Anne Aubert-Frambourg , Alain A. Guillot , Christine Péchoux
Journal of Bacteriology, 2020, 202 (5), ⟨10.1128/JB.00547-19⟩
Article dans une revue hal-02889085v1
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Prophylactic Faecalibacterium prausnitzii treatment prevents the acute breakdown of colonic epithelial barrier in a preclinical model of pelvic radiation disease

Alexia Lapiere , Mallia Geiger , Véronique Robert , Christelle Demarquay , Sandrine Auger
Gut microbes, 2020, 12 (1), pp.1-15. ⟨10.1080/19490976.2020.1812867⟩
Article dans une revue hal-03194901v1

Exploring the impact of Mg-doped ZnO nanoparticles on a model soil microorganism Bacillus subtilis

Sandrine S. Auger , Céline Henry , Christine Péchaux , Nathalie Lejal , Valentina Zanet
Ecotoxicology and Environmental Safety, 2019, 182, ⟨10.1016/j.ecoenv.2019.109421⟩
Article dans une revue hal-02889082v1

Activity evaluation of pure and doped zinc oxide nanoparticles against bacterial pathogens and saccharomyces cerevisiae

V. Zanet , Jasmina Vidic , Sandrine Auger , Priya Vizzini , G. Lippe
Journal of Applied Microbiology, 2019, pp.1-12. ⟨10.1111/jam.14407⟩
Article dans une revue hal-02617964v1
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Exploring multiple effects of Zn0.15Mg0.85O nanoparticles on Bacillus subtilis and macrophages

Sandrine Auger , Céline Henry , Christine Longin , Sneha Suman , Nathalie Lejal
Scientific Reports, 2018, 8 (1), ⟨10.1038/s41598-018-30719-9⟩
Article dans une revue hal-01867036v1

Termination factor Rho: From the control of pervasive transcription to cell fate determination in Bacillus subtilis

Vladimir Bidnenko , Pierre Nicolas , Aleksandra Grylak-Mielnicka , Olivier Delumeau , Sandrine Auger
PLoS Genetics, 2017, 13 (7), pp.e1006909. ⟨10.1371/journal.pgen.1006909⟩
Article dans une revue hal-03343062v1

Revisiting the in vivo GlnR-binding sites at the genome scale in Bacillus subtilis

Paola Randazzo , Anne Aucouturier , Olivier Delumeau , Sandrine S. Auger
BMC Research Notes, 2017, 10 (1), ⟨10.1186/s13104-017-2703-9⟩
Article dans une revue hal-02889071v1
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Termination factor Rho: From the control of pervasive transcription to cell fate determination in Bacillus subtilis.

Vladimir Bidnenko , Aleksandra Grylak-Mielnicka , Pierre Nicolas , Olivier Delumeau , Sandrine Auger
PLoS Genetics, 2017, 13 (7), 47 p. ⟨10.1371/journal.pgen.1006909⟩
Article dans une revue hal-01608054v1

Genetic engineering of the branched fatty acid metabolic pathway of Bacillus subtilis for the overproduction of surfactin C14 isoform

Debarun Dhali , François Coutte , Anthony Argüelles Arias , Sandrine S. Auger , Vladimir V. Bidnenko
Biotechnology Journal, 2017, 12 (7), pp.23. ⟨10.1002/biot.201600574⟩
Article dans une revue hal-01502183v1
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The MarR-like protein PchR (YvmB) regulates expression of genes involved in pulcherriminic acid biosynthesis and in the initiation of sporulation in Bacillus subtilis

Paola Randazzo , Anne Aubert , Alain Guillot , Sandrine S. Auger
BMC Microbiology, 2016, 16, ⟨10.1186/s12866-016-0807-3⟩
Article dans une revue hal-02637642v1
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Genome-wide mapping of TnrA-binding sites provides new insights into the TnrA regulon in Bacillus subtilis

Nicolas N. Mirouze , Elena E. Bidnenko , Philippe P. Noirot , Sandrine S. Auger
MicrobiologyOpen, 2015, 4 (3), pp.423-435. ⟨10.1002/mbo3.249⟩
Article dans une revue hal-02634282v1
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Genome-wide identification of [i]Bacillus subtilis[/i] Zur-binding sites associated with a Zur box expands its known regulatory network

Eric Prestel , Philippe Noirot , Sandrine Auger
BMC Microbiology, 2015, 15, ⟨10.1186/s12866-015-0345-4⟩
Article dans une revue hal-01204456v1

[i]Bacillus cytotoxicus[/i] sp. nov. is a novel thermotolerant species of the [i]Bacillus cereus[/i] Group occasionally associated with food poisoning

Marie Helene M. H. Guinebretière , Sandrine S. Auger , Nathalie N. Galleron , Matthias M. Contzen , Benoit B. de Sarrau
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013, 63, pp.31-40. ⟨10.1099/ijs.0.030627-0⟩
Article dans une revue hal-01000679v1

Bacillus cytotoxicus sp. nov. is a new thermotolerant species of the Bacillus cereus Group occasionally associated with food poisoning.

Marie Helene Guinebretière , Sandrine S. Auger , Nathalie N. Galleron , Matthias M. Contzen , Benoit B. de Sarrau
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2012
Article dans une revue hal-01329878v1

Complete Genome Sequence of the Highly Hemolytic Strain Bacillus cereus F837/76

Sandrine S. Auger , Nathalie N. Galleron , Béatrice Segurens , Carole C. Dossat , Alexandre A. Bolotine
Journal of Bacteriology, 2012, 194 (6), pp.1630 - 1630. ⟨10.1128/JB.06719-11⟩
Article dans une revue hal-01004271v1

Adaptation of Bacillus cereus, an ubiquitous worldwide-distributed foodborne pathogen, to a changing environment

Frederic Carlin , Julien Brillard , Veronique Broussolle , Thierry Clavel , Catherine Duport
Food Research International, 2009, 43 (7), pp.1885-1894. ⟨10.1016/j.foodres.2009.10.024⟩
Article dans une revue hal-01204240v1

Biofilm formation and cell surface properties among pathogenic and nonpathogenic strains of the Bacillus cereus group.

Sandrine Auger , Nalini Ramarao , Christine Faille , Agnès Fouet , Stéphane Aymerich
Applied and Environmental Microbiology, 2009, 75 (20), pp.6616-8. ⟨10.1128/aem.00155-09⟩
Article dans une revue pasteur-00512106v1

The genetically remote pathogenic strain NVH391-98 of the Bacillus cereus group is representative of a cluster of thermophilic strains

Sandrine S. Auger , Nathalie Galleron , Elena Bidnenko , S. Dusko Ehrlich , Alla Lapidus
Applied and Environmental Microbiology, 2008, 74 (4), pp.1276-1280. ⟨10.1128/AEM.02242-07⟩
Article dans une revue hal-02889116v1

Extending the Bacillus cereus group genomics to putative food-borne pathogens of different toxicity

Alla Lapidus , Eugene Goltsman , Sandrine Auger , Nathalie Galleron , Béatrice Ségurens
Chemico-Biological Interactions, 2008, 171 (2), pp.236-249. ⟨10.1016/j.cbi.2007.03.003⟩
Article dans une revue hal-04314336v1

Autoinducer 2 affects biofilm formation by Bacillus cereus

Sandrine S. Auger , Evelyne Krin , Stephane S. Aymerich , Michel M. Gohar
Applied and Environmental Microbiology, 2006, 72 (1), pp.937-941. ⟨10.1128/AEM.72.1.937-941.2006⟩
Article dans une revue hal-02663988v1

Autoinducer 2 affects biofilm formation by Bacillus cereus

Auger Sandrine , E. Krin , Aymerich Stéphane , Gohar Michel
Applied and Environmental Microbiology, 2006, 72, pp.937-941
Article dans une revue hal-00088709v1

Global Control of Cysteine Metabolism by CymR in Bacillus subtilis

Sergine Even , Pierre Burguière , Sandrine Auger , Olga Soutourina , Antoine Danchin
Journal of Bacteriology, 2006, 188 (6), pp.2184-2197. ⟨10.1128/JB.188.6.2184-2197.2006⟩
Article dans une revue hal-03292252v1

Regulation of the Bacillus subtilis ytmI operon, involved in sulfur metabolism

Pierre Burguière , Juliette Fert , Isabelle Guillouard , Sandrine S. Auger , Antoine Danchin
Journal of Bacteriology, 2005, 87 (17), pp.6019-6030. ⟨10.1128/JB.187.17.6019-6030.2005⟩
Article dans une revue hal-02681047v1

The PatB protein of Bacillus subtilis is a C-S-lyase

Sandrine S. Auger , M.P. Gomez , A. Danchin , I. Martin-Verstraete
Biochimie, 2005, 87 (2), pp.231-238. ⟨10.1016/j.biochi.2004.09.007⟩
Article dans une revue hal-02680864v1

Three different systems participate in l-Cystine uptake in Bacillus subtilis

Pierre Burguière , Sandrine S. Auger , Marie-Françoise Hullo , Antoine Danchin , Isabelle Martin-Verstraete
Journal of Bacteriology, 2004, 186 (15), pp.4875-4884. ⟨10.1128/JB.186.15.4875-4884.2004⟩
Article dans une revue hal-02889124v1

The metNPQ operon of Bacillus subtilis encodes an ABC permease transporting methionine sulfoxide, d- and l-methionine

Marie-Françoise Hullo , Sandrine S. Auger , Elie Dassa , Antoine Danchin , Isabelle Martin-Verstraete
Research in Microbiology, 2004, 155 (2), pp. 80-86. ⟨10.1016/j.resmic.2003.11.008⟩
Article dans une revue hal-04190266v1

The metNPQ operon of Bacillus subtilis encodes an ABC permease transporting methionine sulfoxide, D-and L-methionine.

Marie-Françoise Hullo , Sandrine S. Auger , Elie Dassa , Antoine Danchin , Isabelle Martin-Verstraete
Research in Microbiology, 2004, 155 (2), pp.80-86. ⟨10.1016/j.resmic.2003.11.008⟩
Article dans une revue hal-00020363v1

Conversion of methionine to cysteine in Bacillus subtilis and its regulation

Marie-Françoise Hullo , Sandrine S. Auger , Olga Soutourina , Octavian Barzu , Mireille Yvon
Journal of Bacteriology, 2004, 189 (1), pp 187-197. ⟨10.1128/JB.01273-06⟩
Article dans une revue hal-04190311v1

Identification of Bacillus subtilis CysL, a regulator of the cysJI Operon, which encodes sulfite reductase

Isabelle Guillouard , Sandrine S. Auger , Marie-Françoise Hullo , Farid Chetouani , Antoine Danchin
Journal of Bacteriology, 2002, 184 (17), pp.4681-4689. ⟨10.1128/jb.184.17.4681-4689.2002⟩
Article dans une revue hal-02889129v1

Global Expression Profile of Bacillus subtilis Grown in the Presence of Sulfate or Methionine

Sandrine S. Auger , Antoine Danchin , Isabelle Martin-Verstraete
Journal of Bacteriology, 2002, 184 (18), pp.5179-5186. ⟨10.1128/jb.184.18.5179-5186.2002⟩
Article dans une revue hal-02889134v1

The metIC operon involved in methionine biosynthesis in Bacillus subtilis is controlled by transcription antitermination

Sandrine S. Auger , W. Yuen , Antoine Danchin , Isabelle Martin-Verstraete
Microbiology, 2002, 148 (2), pp.507-518. ⟨10.1099/00221287-148-2-507⟩
Article dans une revue hal-02889132v1

Sulfur-limitation-regulated proteins in Bacillus subtilis: a two-dimensional gel electrophoresis study

Jean-Yves Coppée , Sandrine S. Auger , Evelyne Turlin , Agnieszka Sekowska , Jean-Pierre Le Caer
Microbiology, 2001, 147 (6), pp.1631-1640. ⟨10.1099/00221287-147-6-1631⟩
Article dans une revue hal-02889151v1