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Generalization of the normal-exponential model: exploration of a more accurate parametrisation for the signal distribution on Illumina BeadArrays.

 Sandra Plancade , Yves Rozenholc , Eiliv Lund
BMC Bioinformatics, 2012, 13, pp.16. ⟨10.1186/1471-2105-13-329⟩
Article dans une revue hal-00712345v1
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Unraveling the effects of the gut microbiota composition and function on horse endurance physiology

 Sandra Plancade , Allison Clark , Catherine Philippe , Jean-Christophe Helbling , Marie-Pierre Moisan , et al.
37. International Society for Animal Genetics, Jul 2019, Lleida, Spain. 208 p
Communication dans un congrès hal-02734533v1
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Inferring Aggregated Functional Traits from Metagenomic Data Using Constrained Non-negative Matrix Factorization: Application to Fiber Degradation in the Human Gut Microbiota

 Sébastien Raguideau , Sandra Plancade , Nicolas Pons , Marion Leclerc , Béatrice Laroche
PLoS Computational Biology, 2016, 12 (12), pp.1:29. ⟨10.1371/journal.pcbi.1005252⟩
Article dans une revue hal-01454674v1
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Guidelines for controlled trials of drugs in migraine: third edition. A guide for investigators.

 Peer Tfelt-Hansen , Julio Pascual , Nabih Ramadan , Carl Dahlöf , Domenico d'Amico , et al.
Cephalalgia, 2012, 32 (1), pp.6-38. ⟨10.1177/0333102411417901⟩
Article dans une revue hal-02649001v1
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A generic methodological framework for studying single cell motility in high-throughput time-lapse data

 Alice Schoenauer Sebag , Sandra Plancade , Céline Raulet-Tomkiewicz , Robert Barouki , Jean-Philippe Vert , et al.
Bioinformatics, 2015, 31 (12), pp.i320-i328. ⟨10.1093/bioinformatics/btv225⟩
Article dans une revue hal-01246689v1
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A combined test for feature selection on sparse metaproteomics data—an alternative to missing value imputation

 Sandra Plancade , Magali Berland , Mélisande Blein-Nicolas , Olivier Langella , Ariane Bassignani , et al.
PeerJ, 2022, 10, pp.e13525. ⟨10.7717/peerj.13525⟩
Article dans une revue hal-04146583v1
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Estimation de la fonction de répartition conditionnelle à partir de données censurées par intervalle, cas 1, par sélection de modèles

 Sandra Plancade
42èmes Journées de Statistique, 2010, Marseille, France. pp.USB-key
Communication dans un congrès inria-00494833v1
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Non parametric estimation of hazard rate in presence of censoring

 Sandra Plancade
2009
Pré-publication, Document de travail hal-00410799v1
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New genetic biomarkers to differentiate non-pathogenic from clinically relevant Bacillus cereus strains

 Devon Kavanaugh , Benjamin Glasset , Rozenn Dervyn , Cyprien Guérin , Sandra Plancade , et al.
Clinical Microbiology and Infection, 2022, 28 (1), pp.137.e1-137.e8. ⟨10.1016/j.cmi.2021.05.035⟩
Article dans une revue hal-03356344v1
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Modélisation du processus d'apparition des feuilles par des durées successives -alternative aux modèles de régression

 Sandra Plancade , Elodie Marchadier , Sylvie Huet , Adrienne Ressayre , Camille Noûs , et al.
Journées de Statistiques (JDS) 2023, SFdS, Jul 2023, Bruxelles, Belgium
Communication dans un congrès hal-04163940v1
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Lactobacillus paracasei CNCM I-3689 reduces vancomycin-resistant Enterococcus persistence and promotes Bacteroidetes resilience in the gut following antibiotic challenge

 Laureen Crouzet , Muriel Derrien , Claire Cherbuy , Sandra Plancade , Mélanie Foulon , et al.
Scientific Reports, 2018, 8 (1), ⟨10.1038/s41598-018-23437-9⟩
Article dans une revue hal-02623143v1

Benefits of Iterative Searches of Large Databases to Interpret Large Human Gut Metaproteomic Data Sets

 Ariane Bassignani , Sandra Plancade , Magali Berland , Melisande Blein-Nicolas , Alain Guillot , et al.
Journal of Proteome Research, 2021, 20 (3), pp.1522-1534. ⟨10.1021/acs.jproteome.0c00669⟩
Article dans une revue hal-03135575v1
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Model selection for hazard rate estimation in presence of censoring

 Sandra Plancade
Metrika, 2010, 74, pp.313-347. ⟨10.1007/s00184-010-0305-9⟩
Article dans une revue istex hal-02056881v1
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Estimation of the density of regression errors by pointwise model selection

 Sandra Plancade
2009
Pré-publication, Document de travail hal-00364334v1
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A successive time-to-event model of phyllochron dynamics for hypothesis testing: application to the analysis of genetic and environmental effects in maize

 Sandra Plancade , Elodie Marchadier , Sylvie Huet , Adrienne Ressayre , Camille Noûs , et al.
Plant Methods, 2023, 19 (1), pp.54. ⟨10.1186/s13007-023-01029-7⟩
Article dans une revue hal-04146598v1

Nonparametric estimation of the density of the regression noise

 Sandra Plancade
Comptes rendus de l'Académie des sciences. Série I, Mathématique, 2008, 346 (7-8), pp.461-466
Article dans une revue hal-00718500v1
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Infering an ontology of single cell motions from high-throughput microscopy data

 Alice Schoenauer Sebag , Sandra Plancade , Céline Raulet-Tomkiewicz , Robert Barouki , Jean-Philippe Vert , et al.
IEEE 12th International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2015, New York, United States. pp.4, ⟨10.1109/ISBI.2015.7163840⟩
Communication dans un congrès hal-02742630v1

A combined test for feature selection on sparse metaproteomics data - alternative to missing value imputation

 Sandra Plancade , Magali Berland , Mélisande Blein-Nicolas , Olivier Langella , Ariane Bassignani , et al.
2021
Pré-publication, Document de travail hal-03276724v1
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Integrated mRNA and miRNA expression profiling in blood reveals candidate biomarkers associated with endurance exercise in the horse

 Núria Mach , Sandra Plancade , Alicja Pacholewska , Jerôme J. Lecardonnel , Julie Riviere , et al.
Scientific Reports, 2016, 6, pp.22932. ⟨10.1038/srep22932⟩
Article dans une revue hal-02489989v1

A constrained NMF approach to analyze quantitative metagenomic data

 Sébastien Raguideau , Béatrice Laroche , Marion Leclerc , Sandra Plancade
IFAC-PapersOnLine, 2016, 49 (26), pp.71-76. ⟨10.1016/j.ifacol.2016.12.105⟩
Article dans une revue hal-01455859v1

Characterization of blood biomarkers in endurance horses by integrating miRNA and mRNA expression profiling

 Núria Mach , Sandra Plancade , Marco Moroldo , Jerôme Lecardonnel , Celine Robert , et al.
11. Dorothy Russel Havemeyer Foundation International Equine Genome Mapping Workshop, Jul 2015, Hannover, Germany
Communication dans un congrès hal-01535370v1

Maize phyllochron : genotypic and environmental controls

 Sandra Plancade , Elodie Marchadier , Adrienne Ressayre , Sylvie Huet , C. Dillmann
Petit pois déridé (groupe de biologie et génétique des populations), Jun 2019, Gif-sur-Yvette, France
Communication dans un congrès hal-04458117v1

Modeling Fiber Degradation by Human Gut Microbiome

 Béatrice Laroche , Sébastien Raguideau , Sandra Plancade , Marion Leclerc
Mathematical Models in Ecology and Evolution (MMEE 2015), Jun 2015, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01357491v1

Estimation of the density of regression errors by pointwise model selection

 Sandra Plancade
Mathematical Methods of Statistics, 2009, 18 (4), pp.313-347. ⟨10.3103/S1066530709040036⟩
Article dans une revue hal-02657242v1
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A new statistical method for curve group analysis of longitudinal gene expression data illustrated for breast cancer in the NOWAC postgenome cohort as a proof of principle

 Eiliv Lund , Lars Holden , Hege Bøvelstad , Sandra Plancade , Nicolle Mode , et al.
BMC Medical Research Methodology, 2016, 16 (1), pp.28. ⟨10.1186/s12874-016-0129-z⟩
Article dans une revue hal-01284884v1
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Unraveling the effects of the gut microbiota composition and function on horse endurance physiology

 Sandra Plancade , Allison Clark , Catherine Philippe , Jean-Christophe Helbling , Marie-Pierre Moisan , et al.
Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.9620. ⟨10.1038/s41598-019-46118-7⟩
Article dans une revue hal-02489982v1

Model selection for hazard rate estimation in presence of censoring

 Sandra Plancade
Metrika, 2011, 74 (3), pp.313-347. ⟨10.1007/s00184-010-0305-9⟩
Article dans une revue istex hal-00718495v1
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Four functional profiles for fibre and mucin metabolism in the human gut microbiome

 Simon Labarthe , Sandra Plancade , Sébastien Raguideau , Florian Plaza Oñate , Emmanuelle Le Chatelier , et al.
Microbiome, 2023, 11 (1), pp.231. ⟨10.1186/s40168-023-01667-y⟩
Article dans une revue hal-03918193v2
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