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Does Gene Expression Noise Play a Functional Role in Plants?

 Sandra Cortijo , James C. W. Locke
Trends in Plant Science, 2020, 25 (10), pp.1041-1051. ⟨10.1016/j.tplants.2020.04.017⟩
Article dans une revue hal-03196205v1

Molecular and epigenetic mechanisms during dormancy in sweet cherry flower buds

 Noémie Vimont , Mustapha Arkoun , Jean-Claude Yvin , Philip A. Wigge , Mathieu Fouché , et al.
8. International Rosaceae Genomics Conference (RGC8), Jun 2016, Angers, France. 2016
Poster de conférence hal-02743557v1
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Etude des variations épigénétiques liées aux séquences répétées comme source de changements phénotypiques héritables chez Arabidopsis thaliana

 Sandra Cortijo
Sciences agricoles. Université Paris Sud - Paris XI, 2012. Français. ⟨NNT : 2012PA112151⟩
Thèse tel-00742834v1

Molecular and epigenetic mechanisms during dormancy in sweet cherry flower buds

 Noémie Vimont , Mustapha Arkoun , Jean-Claude Yvin , Philip A. Wigge , Elisabeth Dirlewanger , et al.
27. International Conference on Arabidopsis Research (ICAR 2016), Jun 2016, Gyeongju, South Korea. 2016
Poster de conférence hal-02739199v1
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DEK influences the trade-off between growth and 1 arrest via H2A.Z-nucleosomes in Arabidopsis

 Anna Brestovitsky , Daphne Ezer , Sascha Waidmann , Sarah L Maslen , Martin Balcerowicz , et al.
2020
Pré-publication, Document de travail hal-02507673v1

Études biomoléculaires et tests en verger : les compatibilités polliniques des variétés de cerisier

 Muriel Millan , Stéphanie Mariette , Gaëlle Capdeville , Claire Thiery , Sandra Cortijo , et al.
Infos CTIFL, 2008, 241, pp.20-25
Article dans une revue hal-02660148v1
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ChIP-seq and RNA-seq for complex and low-abundance tree buds reveal chromatin and expression co-dynamics during sweet cherry bud dormancy

 Noémie Vimont , Fu Xiang Quah , David Guillaume-Schöpfer , François Roudier , Elisabeth Dirlewanger , et al.
2019
Pré-publication, Document de travail hal-02788335v1
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Genome-Wide Negative Feedback Drives Transgenerational DNA Methylation Dynamics in Arabidopsis

 Tasuku Ito , Yoshiaki Tarutani , Taiko Kim To , Mohamed Kassam , Evelyne Duvernois-Berthet , et al.
PLoS Genetics, 2015, 11 (4), pp.e1005154. ⟨10.1371/journal.pgen.1005154⟩
Article dans une revue hal-03370677v1

Mapping the epigenetic basis of complex traits

 Sandra Cortijo , Rene Wardenaar , Maria Colomé-Tatché , Arthur Gilly , Mathilde Etcheverry , et al.
Science, 2014, 343 (6175), pp.1145-1148. ⟨10.1126/science.1248127⟩
Article dans une revue hal-01193838v1
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Co-expression Networks From Gene Expression Variability Between Genetically Identical Seedlings Can Reveal Novel Regulatory Relationships.

 Sandra S. Cortijo , Marcel Bhattarai , James C. W. Locke , Sebastian E. Ahnert
Frontiers in Plant Science, 2021, 11, pp.599464. ⟨10.3389/fpls.2020.599464⟩
Article dans une revue hal-03095468v1

The presence of H3K4me3 histone mark is positively correlated with expression at the DAM loci in sweet cherry during dormancy

 Noémie Vimont , Rémi Beauvieux , Mustapha Arkoun , Jean-Claude Yvin , Elisabeth Dirlewanger , et al.
8. International Cherry Symposium, Jun 2017, Yamagata, Japan. ⟨10.17660/ActaHortic.2019.1235.57⟩
Communication dans un congrès hal-02734718v1

Le cerisier a trouvé ses compatibilités polliniques

 Muriel Millan , Stéphanie Mariette , Gaëlle Capdeville , Claire Thiery , Sandra Cortijo , et al.
Réussir Fruits et Légumes, 2008, 279, pp.54-56
Article dans une revue hal-02661186v1

Détection de QTL d'expression de gènes candidats pour le débourrement chez le chêne pédonculé (Quercus robur L.)

 Sandra Cortijo
[Stage] Université des Sciences et Technologies (Bordeaux 1), Talence, FRA.; Université de Bordeaux Ségalen (Bordeaux 2), Bordeaux, FRA. 2008, 20 p
Rapport hal-02820324v1

EpiRILs: Lessons From Arabidopsis

 Marco Catoni , Sandra S. Cortijo
Advances in Botanical Research, pp.87-116, 2018, ⟨10.1016/bs.abr.2018.08.002⟩
Chapitre d'ouvrage hal-02506120v1
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Transcriptomic profiles highlight the role of ABA signalling in the regulation of sweet cherry flower bud dormancy

 Noémie Vimont , Mathieu Fouché , José Antonio Campoy , Adrián Schwarzenberg , Mirela Domijan , et al.
10th International Rosaceae Genomics Conference (RGC 10), Dec 2020, Barcelone, Spain
Poster de conférence hal-03318896v1

The evening complex coordinates environmental and endogenous signals in $Arabidopsis$

 Daphne Ezer , Jae-Hoon Jung , Hui Lan , Surojit Biswas , Laura Gregoire , et al.
Nature Plants, 2017, 3 (7), pp.17087. ⟨10.1038/nplants.2017.87⟩
Article dans une revue hal-01582096v1
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Widespread inter‐individual gene expression variability in Arabidopsis thaliana

 Sandra S. Cortijo , Zeynep Aydin , Sebastian Ahnert , James C. W. Locke
Molecular Systems Biology, 2019, 15 (1), pp.e8591. ⟨10.15252/msb.20188591⟩
Article dans une revue hal-02503063v1

Transcriptomic profiles accurately predict the dormancy stages in sweet cherry flower buds

 Bénédicte Wenden , Noémie Vimont , Mathieu Fouche , José Antonio Campoy , Meixuezi Tong , et al.
SEB's Annual meeting, Jul 2019, Sevilla, Spain
Communication dans un congrès hal-02737891v1

ChIP-seq and RNA-seq for complex and low-abundance tree buds reveal chromatin and expression co-dynamics during sweet cherry bud dormancy

 Noémie Vimont , Fu Xiang Quah , David Guillaume Schöpfer , François Roudier , Elisabeth Dirlewanger , et al.
Tree Genetics and Genomes, 2020, 16 (1), pp.9. ⟨10.1007/s11295-019-1395-9⟩
Article dans une revue hal-02623341v1
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Editorial: Multi-Disciplinary Approaches to Plant Responses to Climate Change

 Varodom Charoensawan , Sandra S. Cortijo , Mirela Domijan , Sónia Negrão
Frontiers in Plant Science, 2022, 13, pp.876432. ⟨10.3389/fpls.2022.876432⟩
Article dans une revue hal-03632172v1
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Warm Temperature Promotes Shoot Regeneration in Arabidopsis thaliana

 Alice Lambolez , Ayako Kawamura , Tatsuya Takahashi , Bart Rymen , Akira Iwase , et al.
Plant and Cell Physiology, 2022, 63 (5), pp.618-634. ⟨10.1093/pcp/pcac017⟩
Article dans une revue hal-03578303v1
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Extensive natural epigenetic variation at a [i]De Novo[/i] originated gene

 Amanda Bortolini Silveira , Charlotte Trontin , Sandra Cortijo , Joan Barau , Luiz Eduardo Vieira del Bem , et al.
PLoS Genetics, 2013, 9 (4), ⟨10.1371/journal.pgen.1003437⟩
Article dans une revue hal-01190576v1
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From bud formation to flowering: transcriptomic state defines the cherry developmental phases of sweet cherry bud dormancy

 Noémie Vimont , Mathieu Fouche , José Antonio Campoy , Meixuezi Tong , Mustapha Arkoun , et al.
BMC Genomics, 2019, 20 (1), pp.974. ⟨10.1186/s12864-019-6348-z⟩
Article dans une revue hal-02503665v1

Molecular mechanism of cytokinin-activated cell division in Arabidopsis

 Weibing Yang , Sandra Cortijo , Niklas Korsbo , Pawel Roszak , Katharina Schiessl , et al.
Science, 2021, 371 (6536), pp.eabe2305. ⟨10.1126/science.abe2305⟩
Article dans une revue hal-03157935v1

Co-expression networks from gene expression variability between genetically identical seedlings can reveal novel regulatory relationships

 Sandra S. Cortijo , Marcel Bhattarai , James Cw Locke , Sebastian Ahnert
2020
Pré-publication, Document de travail hal-02873685v1

Epigenome and Transcriptome Studies during Dormancy in Sweet Cherry Flower Buds

 Noémie Vimont , Mustapha Arkoun , Jean-Claude Yvin , Philip A. Wigge , Elisabeth Dirlewanger , et al.
Plant and Animal Genome XXV, Jan 2017, San Diego, United States. 2017
Poster de conférence hal-01603065v1

Integrative epigenomic mapping defines four main chromatin states in Arabidopsis

 François Roudier , Ikhlak I. Ahmed , Caroline C. Berard , Alexis A. Sarazin , Tristan Mary-Huard , et al.
EMBO Journal, 2011, 30 (10), pp.1928 - 1938. ⟨10.1038/emboj.2011.103⟩
Article dans une revue hal-00999846v1

Compatibilités polliniques chez le cerisier : la biologie moléculaire au service du verger

 Muriel Millan , Stéphanie Mariette , Gaëlle Capdeville , Claire Thiery , Sandra Cortijo , et al.
Arboriculture Fruitière, 2009, 633, pp.38-40
Article dans une revue hal-02658108v1

Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-Seq) for Transcription Factors and Chromatin Factors in Arabidopsis thaliana Roots: From Material Collection to Data Analysis

 Sandra S. Cortijo , Varodom Charoensawan , François Roudier , Philip A. Wigge
Root Development, pp.231-248, 2018, ⟨10.1007/978-1-4939-7747-5_18⟩
Chapitre d'ouvrage hal-03142817v1
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The Evening Complex Establishes Repressive Chromatin Domains Via H2A.Z Deposition

 Meixuezi Tong , Kyounghee Lee , Daphne Ezer , Sandra Cortijo , Jaehoon Jung , et al.
Plant Physiology, 2020, 182 (1), pp.612-625. ⟨10.1104/pp.19.00881⟩
Article dans une revue hal-02503748v1
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