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Samuel Alizon

Directeur de Recherche CNRS, responsable de l'équipe Écologie et évolution de la santé
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Affiliations actuelles
  • 139750
Identifiants chercheurs
Site web
  • https://www.college-de-france.fr/personne/samuel-alizon

Présentation

Je suis Directeur de recherche au CNRS, affecté au [Centre Interdisciplinaire de Recherches en Biologie (CIRB)](https://www.college-de-france.fr/site/en-cirb/center-for-interdisciplinary-research-in-biology.htm) au Collège de France à Paris. Mes travaux portent sur l'écologie et l'évolution de la santé, notamment les virus humains tels que les papillomavirus humains (HPV), le VIH ou le SARS-CoV-2. Je développe en particulier des modèles mathématiques et des simulations numériques. Je suis l'auteur d'un livre grand public intitulé [Évolution, écologie et pandémies](https://www.editionspoints.com/ouvrage/evolution-ecologie-et-pandemies-samuel-alizon/9782757887233), publié en 2020 au Points Seuil. Pour plus de détails, voir mon [site internet personnel](https://alizon.ouvaton.org/index_fr.html).
CNRS research director, based at the [Centre for Interdisciplinary Research in Biology (CIRB)](https://www.college-de-france.fr/site/en-cirb/center-for-interdisciplinary-research-in-biology.htm) in Paris. Theoretical evolutionary ecologist specialised in the study of infectious diseases, with a particular interest in human viruses such as HIV, HCV, SARS-CoV-2, or HPV. For further details, see my [personal](https://alizon.ouvaton.org/) website.

Publications

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Does exposure to different menstrual products affect the vaginal environment?

Nicolas Tessandier , Ilkay Başak Uysal , Baptiste Elie , Christian Selinger , Sophie Grasset
Molecular Ecology, 2023, EVOLUTIONARY ECOLOGY OF HUMAN‐ASSOCIATED MICROBES, 32 (10), pp.2592-2601. ⟨10.1111/mec.16678⟩
Article dans une revue hal-03847887v1
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Concomitant and productive genital infections by HSV-2 and HPV in two young women: A case report

Ilkay Başak Uysal , Vanina Boué , Carmen Lia Murall , Christelle Graf , Christian Selinger
IDCases, 2022, 30, pp.e01604. ⟨10.1016/j.idcr.2022.e01604⟩
Article dans une revue hal-03795483v1
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Reconstructing contact network structure and cross-immunity patterns from multiple infection histories

Christian Selinger , Samuel Alizon
PLoS Computational Biology, 2021, 17 (9), pp.e1009375. ⟨10.1371/journal.pcbi.1009375⟩
Article dans une revue hal-03357549v1
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Cytokine response following perturbation of the cervicovaginal milieu during HPV genital infection

Christian Selinger , Massilva Rahmoun , Carmen Lia Murall , Claire Bernat , Vanina Boué
Immunologic Research, 2021, 69 (3), pp.255-263. ⟨10.1007/s12026-021-09196-2⟩
Article dans une revue hal-03354891v1
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Treating symptomatic infections and the co-evolution of virulence and drug resistance

Samuel Alizon
Peer Community Journal, 2021, 1, pp.e47. ⟨10.24072/pcjournal.38⟩
Article dans une revue hal-03001103v2
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Episome partitioning and symmetric cell divisions: Quantifying the role of random events in the persistence of HPV infections

Thomas Beneteau , Christian Selinger , Mircea T Sofonea , Samuel Alizon
PLoS Computational Biology, 2021, 17 (9), pp.e1009352. ⟨10.1371/journal.pcbi.1009352⟩
Article dans une revue hal-03357550v1
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HPV cervical infections and serological status in vaccinated and unvaccinated women

Carmen Lia Murall , Bastien Reyné , Christian Selinger , Claire Bernat , Vanina Boué
Vaccine, 2020, 38 (51), pp.8167-8174. ⟨10.1016/j.vaccine.2020.10.078⟩
Article dans une revue hal-03001077v2
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Detecting within-host interactions from genotype combination prevalence data

Samuel Alizon , Carmen Lia Murall , Emma Saulnier , Mircea T Sofonea
Epidemics, 2019, 29, pp.100349. ⟨10.1016/j.epidem.2019.100349⟩
Article dans une revue hal-02387765v1
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Modelling the evolution of viral oncogenesis

Carmen Lia Murall , Samuel Alizon
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 2019, Silent cancer agents: multi-disciplinary modelling of human DNA oncoviruses, 374 (1773), pp.20180302. ⟨10.1098/rstb.2018.0302⟩
Article dans une revue hal-02124893v1
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Epithelial stratification shapes infection dynamics

Carmen Lia Murall , Robert Jackson , Ingeborg Zehbe , Nathalie Boulle , Michel Segondy
PLoS Computational Biology, 2019, 15 (1), pp.e1006646. ⟨10.1371/journal.pcbi.1006646⟩
Article dans une revue hal-02069914v1
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Coevolution of virulence and immunosuppression in multiple infections

Tsukushi Kamiya , Nicole Mideo , Samuel Alizon
Journal of Evolutionary Biology, 2018, 31 (7), pp.995 - 1005. ⟨10.1111/jeb.13280⟩
Article dans une revue hal-01898496v1
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Reconciling Pasteur and Darwin to control infectious diseases

Samuel Alizon , Pierre-Olivier Méthot
PLoS Biology, 2018, 16 (1), pp.e2003815. ⟨10.1371/journal.pbio.2003815⟩
Article dans une revue hal-01737461v1
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Why Human Papillomavirus Acute Infections Matter

Samuel Alizon , Carmen Murall , Ignacio G Bravo
Viruses, 2017, 9 (10), pp.293. ⟨10.3390/v9100293⟩
Article dans une revue hal-01638068v1
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Invasions of Host-Associated Microbiome Networks

C. L. Murall , J. L. Abbate , M. Puelma Touzel , E. Allen-Vercoe , Samuel Alizon
Research, BT - Advances in Ecological. Networks of Invasion: Empirical Evidence and Case Studies, 57, Academic Press, 2017, Advances in Ecological Research, ⟨10.1016/bs.aecr.2016.11.002⟩
Chapitre d'ouvrage hal-01567903v1