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TissueMiner: A multiscale analysis toolkit to quantify how cellular processes create tissue dynamics

 Raphael Etournay , Matthias Merkel , Marko Popović , Holger Brandl , Natalie A. Dye , et al.
eLife, 2016, eLife 2016 (5), pp.14334. ⟨10.7554/eLife.14334⟩
Article dans une revue pasteur-01545827v1
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Triangles bridge the scales: Quantifying cellular contributions to tissue deformation.

 Matthias Merkel , Raphael Etournay , Marko Popović , Guillaume Salbreux , Suzanne Eaton , et al.
Physical Review E , 2017, 95 (3), pp.032401. ⟨10.1103/PhysRevE.95.032401⟩
Article dans une revue pasteur-01545825v1
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Cochlear outer hair cells undergo an apical circumference remodeling constrained by the hair bundle shape.

 Raphael Etournay , Léa Lepelletier , Jacques Boutet de Monvel , Vincent Michel , Nadège Cayet , et al.
Development (Cambridge, England), 2010, 137 (8), pp.1373-83. ⟨10.1242/dev.045138⟩
Article dans une revue pasteur-01545828v1
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Shroom2, a myosin-VIIa- and actin-binding protein, directly interacts with ZO-1 at tight junctions.

 Raphael Etournay , Ingrid Zwaenepoel , Isabelle Perfettini , Pierre Legrain , Christine Petit , et al.
Journal of Cell Science, 2007, 120 (16), pp.2838-50. ⟨10.1242/jcs.002568⟩
Article dans une revue pasteur-01545829v1
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Active dynamics of tissue shear flow

 Marko Popović , Amitabha Nandi , Matthias Merkel , Raphael Etournay , Suzanne Eaton , et al.
New Journal of Physics, 2017, 19 (3), pp.033006. ⟨10.1088/1367-2630/aa5756⟩
Article dans une revue pasteur-01545826v1
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Extracting multiple surfaces from 3D microscopy images in complex biological tissues with the Zellige software tool

 Céline Trébeau , Jacques Boutet de Monvel , Gizem Altay , Jean-Yves Tinevez , Raphaël Etournay
BMC Biology, 2022, 20 (1), pp.183. ⟨10.1186/s12915-022-01378-0⟩
Article dans une revue pasteur-03983119v2
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SARS-CoV-2 infection induces the dedifferentiation of multiciliated cells and impairs mucociliary clearance

 Rémy Robinot , Mathieu Hubert , Guilherme Dias de Melo , Françoise Lazarini , Timothée Bruel , et al.
Nature Communications, 2021, 12 (1), pp.4354. ⟨10.1038/s41467-021-24521-x⟩
Article dans une revue pasteur-03319522v1
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SCRIB controls apical contractility during epithelial differentiation

 Batiste Boëda , Vincent Michel , Raphael Etournay , Patrick England , Stéphane Rigaud , et al.
Journal of Cell Biology, 2023, 222 (12), pp.e202211113. ⟨10.1083/jcb.202211113⟩
Article dans une revue pasteur-04284391v1

PreMosa: Extracting 2D surfaces from 3D microscopy mosaics.

 Corinna Blasse , Stephan Saalfeld , Raphael Etournay , Andreas Sagner , Suzanne Eaton , et al.
Bioinformatics, 2017, pp.Bioinformatics btx195. ⟨10.1093/bioinformatics/btx195⟩
Article dans une revue pasteur-01545824v1
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SARS-CoV-2 infection damages airway motile cilia and impairs mucociliary clearance

 Rémy Robinot , Mathieu Hubert , Guilherme Dias de Melo , Françoise Lazarini , Timothée Bruel , et al.
2021
Pré-publication, Document de travail pasteur-03244406v1
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Cell dynamics underlying oriented growth of the Drosophila wing imaginal disc

 Natalie A Dye , Marko Popović , Stephanie Spannl , Raphael Etournay , Dagmar Kainmüller , et al.
Development (Cambridge, England), 2017, 144 (23), pp.4406 - 4421. ⟨10.1242/dev.155069⟩
Article dans une revue pasteur-01678565v1
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DNABarcodeCompatibility: an R-package for optimizing DNA-barcode combinations in multiplex sequencing experiments

 Céline Trébeau , Jacques Boutet de Monvel , Fabienne Wong Jun Tai , Christine Petit , Raphael Etournay
Bioinformatics, 2019, ⟨10.1093/bioinformatics/bty1030⟩
Article dans une revue pasteur-02175109v1
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PHR1, an integral membrane protein of the inner ear sensory cells, directly interacts with myosin 1c and myosin VIIa.

 Raphael Etournay , Aziz El-Amraoui , Amel Bahloul , Stéphane Blanchard , Isabelle Roux , et al.
Journal of Cell Science, 2005, 118 (13), pp.2891-99. ⟨10.1242/jcs.02424⟩
Article dans une revue pasteur-01541848v1
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