Pierrick Haffray

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0000-0001-8604-4562
IdRef : 236200054

Présentation

After 3 years as biologist in the INRA-Ifremer experimental station of marine salmonids (SEMII, Camaret, France) and in the rainbow trout companies Pisciculture Bellet (Angoulême, France) and Truite de Bretagne (Morlaix, France), I joined (1990) the French association of poultry and aquaculture breeders (SYSAAF, Rennes, France) to develop first commercial breeding programs in the French aquaculture, primarily in salmonids as rainbow trout or charrs, followed by marine fishes as sea bass, sea bream or meagre (1992), sturgeons (1996), Pacific or flat oyster and clam (2001) and shrimps (2009). I'm now managing a team of 6 geneticist and 3 PhD students at the Aquaculture section of SYSAAF that advise 25 breeding companies selecting 18 aquaculture species in France and in Madagascar, Mozambique, Mexico, Thailand and in the past in Indonesia. My main research interests were the adaptation of principles of domestication and genetic selection to aquaculture species in using DNA-parentage assignment in combining mass and sib-selection, the development of high through put technologies to phenotype quality traits (micro-wave, artificial vision, ultrasound, MRI, RMN), the optimisation of gametes collection and larval conservation and cryoconservation, the monosexing and the triploidisation and recently (since 2014) the improvement of disease resistances to nine different diseases based on challenge tests (OHsV1, IPN, VHS, VNN, F. psychrophilum, P. piscicidae, E. tarda, V. harveyi, V. tapetis) and sib selection. My current primary research interests are the development and the application of genomic tools in genomic selection in different species (rainbow trout, sea bass, sea bream, Pacific oyster, white leg shrimp), the application of spectrometry (NIR, Raman) to target new traits as fatty acid composition to improve aquaculture nutritional value and since the two years the breeding of pearl oyster. Past Board member of the European Forum for Farm Animal Breeders (EFFAB), the European platform on Farm Animal Breeding and REproduction (FABRE) and the Labogena genotyping laboratory, I'm co-authored over 100 scientific publications and I was awarded (2019) by the French Academy of Agriculture for my inputs in the development of breeding programs in aquaculture.

Publications

jerome-bugeon

	Potential of genomic selection for growth, meat content and colour traits in mixed-family breeding designs for the Pacific oyster Crassostrea gigas Antoine Jourdan , Romain Morvezen , Florian Enez , Pierrick Haffray , Adeline Lange Aquaculture, 2023, 576, pp.739878. ⟨10.1016/j.aquaculture.2023.739878⟩ Article dans une revue hal-04158060v1
	Prediction of fatty acids composition in the rainbow trout Oncorhynchus mykiss by using Raman micro-spectroscopy E. Prado , Christophe Eklouh-Molinier , Florian Enez , David Causeur , C. Blay Analytica Chimica Acta, 2022, 1191, ⟨10.1016/j.aca.2021.339212⟩ Article dans une revue hal-03445774v1
	Genetic architecture and genomic selection of fatty acid composition predicted by Raman spectroscopy in rainbow trout Carole Blay , Pierrick Haffray , Jonathan D’ambrosio , Enora Prado , Nicolas Dechamp BMC Genomics, 2021, 22 (1), pp.788. ⟨10.1186/s12864-021-08062-7⟩ Article dans une revue hal-03432316v1
	Genetic parameters and genome-wide association studies of quality traits characterised using imaging technologies in Rainbow trout, Oncorhynchus mykiss Carole Blay , Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Jonathan D’ambrosio , Nicolas Dechamp Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.1-17. ⟨10.3389/fgene.2021.639223⟩ Article dans une revue hal-03154333v1
	Morphological predictors of slaughter yields using 3D digitizer and their use in a common carp breeding program Martin Prchal , Martin Kocour , Marc Vandeputte , Antti Kause , Alain Vergnet Aquaculture, 2020, 520, pp.1-9. ⟨10.1016/j.aquaculture.2020.734993⟩ Article dans une revue hal-02627292v1
	First evidence of realized selection response on fillet yield in Rainbow trout Oncorhynchus mykiss, Using Sib selection or based on correlated ultrasound measurements Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Jean-Michel Allamellou Frontiers in Genetics, 2019, 10, pp.1-13. ⟨10.3389/fgene.2019.01225⟩ Article dans une revue hal-02627462v1
	Accuracy of BLUP breeding values in a factorial mating design with mixed families and marker-based parentage assignment in rainbow trout Oncorhynchus mykiss Pierrick Haffray , Florian Enez , Jérôme Bugeon , Hervé Chapuis , Mathilde Dupont-Nivet Aquaculture, 2018, 490, pp.350-354. ⟨10.1016/j.aquaculture.2018.03.003⟩ Article dans une revue hal-01764389v1
	Potential for genetic improvement of the main slaughter yields in Common Carp with in vivo morphological predictors Martin Prchal , Jérôme Bugeon , Marc Vandeputte , Antti Kause , Alain Vergnet Frontiers in Genetics, 2018, 9, pp.1-13. ⟨10.3389/fgene.2018.00283⟩ Article dans une revue hal-02625209v1
	Investigation of morphological predictors of fillet and carcass yield in European sea bass (Dicentrarchus labrax) for application in selective breeding Marc Vandeputte , Antonio Puledda , Anne Sophie Tyran , Anastasia Bestin , Céline Coulombet Aquaculture, 2017, 470, pp.40-49. ⟨10.1016/j.aquaculture.2016.12.014⟩ Article dans une revue hal-01595276v1
	Genetic parameters of in-vivo prediction of carcass, head and fillet yields by internal ultrasound and 2D external imagery in large rainbow trout Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Quentin Rivard , Benjamin Quittet , Sophie Puyo Aquaculture, 2013, 410-411, pp.236-244. ⟨10.1016/j.aquaculture.2013.06.016⟩ Article dans une revue hal-00877146v1
	Rapid quantification of muscle fat content and subcutaneous adipose tissue in fish using MRI Guylaine Collewet , Jérôme Bugeon , Jérôme Idier , Stéphane Quellec , Benjamin Quittet Food Chemistry, 2013, 138 (2-3), pp.2008-2015. ⟨10.1016/j.foodchem.2012.09.131⟩ Article dans une revue hal-00945541v1
	Negative genetic correlations between production traits and head or bony tissues in large all-female rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Cédric Pincent , Hervé Chapuis , Emmanuel Mazeiraud Aquaculture, 2012, 368-369, pp.145-152. ⟨10.1016/j.aquaculture.2012.09.023⟩ Article dans une revue hal-01000352v1
	Flesh quality in large rainbow trout with high or low fillet yield Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , Mireille Cardinal , Ayhan Uyanik , Armel Davenel Journal of Muscle Foods, 2010, 21 (4), pp.702-721. ⟨10.1111/j.1745-4573.2010.00214.x⟩ Article dans une revue hal-01205020v1

	Phenomic selection, an alternative to genomic selection in animal breeding? Faten Jaouahdou , Florian Enez , Christophe Eklouh-Molinier , Jérôme Doerflinger , Guylaine Collewet Workshop spectroscopie et microscopie du milieu marin, Feb 2023, Brest, France Communication dans un congrès hal-04185933v1
	Implementation of genomic selection on production and quality traits and linkage disequilibrium in Crassostrea gigas Antoine Jourdan , Pierre Boudry , Florian Enez , Pierrick Haffray , F Chenier 12. World congress on genetics applied to livestock production (WCGALP), Jul 2022, Rotterdam, Netherlands. ⟨10.3920/978-90-8686-940-4_567⟩ Communication dans un congrès hal-04013016v1
	Phenomic selection, an alternative to genomic selection in animal breeding? Faten Jaouahdou , Florian Enez , Christophe Eklouh-Molinier , Jérôme Doerflinger , Guylaine Collewet International Symposium on Genetics in Aquaculture XIV, Nov 2022, Puerto Varas, Chile Communication dans un congrès hal-04185835v1
	Successful realized selection response for fillet yield in rainbow trout Oncorhynchus mykiss Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Sébastien Courant World Aquaculture 2018, European Aquaculture Society (EAS)., Aug 2019, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-02264916v1
	Morphological predictors of slaughter yields using 3D digitizer and their utilization in common carp breeding program Martin Prchal , Jérôme Bugeon , Marc Vandeputte , A. Kause , Alain Vergnet Aquaculture Europe 2019, European Aquaculture Society (EAS). BEL., Oct 2019, Berlin, Germany Communication dans un congrès hal-02317178v1
	Réponse à la sélection sur le rendement de filet chez la truite arc-en-ciel Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Jean-Michel Allamelou 6. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2019, Paris, France Communication dans un congrès hal-02734410v1
	Mixed-family estimation of genetic parameters of growth, morphologic, immune and behavioral traits in the european abalone Haliotis tuberculata S. Lachambre , Sabine Roussel , S. Huchette , K. Chenevert , Christophe Lambert World Aquaculture 2018, European Aquaculture Society (EAS)., Aug 2018, Montpellier, France. pp.111 Communication dans un congrès hal-02011386v1
	Potential for genetic improvement of the main slaughter yields in common carp with in vivo morphological predictors Martin Prchal , Jérôme Bugeon , Marc Vandeputte , Antti Kause , Alain Vergnet World Aquaculture 2018, European Aquaculture Society (EAS)., Aug 2018, Montpellier, France. 848 p Communication dans un congrès hal-02012648v1
	A first demonstration of realized selection response for fillet yield in fish, in rainbow trout oncorhynchus mykiss Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Anastasia Bestin , Alexandre Desgranges , Sebastien Courant 13. International Symposium for Genetics in Aquaculture (ISGA XIII), Jul 2018, Cairns, Australia Communication dans un congrès hal-02264933v1
	Peut-on sélectionner sur le rendement de filet chez les poissons ? (et chez le bar en particulier) Marc Vandeputte , Clémence Fraslin , Jérôme Bugeon , François Allal , Antonio Puledda Journée du SFAMN (Syndicat Français de l'Aquaculture Marine et Nouvelle), Mar 2017, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-03155369v1
	Utilisation d'imagerie et d'ultrasons pour l'amélioration du rendement en chair par sélection génétique de la daurade Dofungo Ouatarra , Anastasia Bestin , Pierrick Haffray , Florian Enez , Sophie Cariou 5. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2016, Paris, France. pp.30 Communication dans un congrès hal-02741919v1
	Genetic parameters of indirect predictors of gutted and fillet yields in the gilthead sea bream Sparus aurata in using 2D camera, 3D digitizer and ultrasound technologies Pierrick Haffray , Dofungo Ouatarra , Sophie Cariou , Jean-Sébastien Bruant , Frederic Ventre Aquaculture Europe 2016, Sep 2016, Edinburgh, United Kingdom. 1146 p Communication dans un congrès hal-02741462v1
	Prédicteurs morphologiques du rendement chez le bar: projet BAR3 Marc Vandeputte , Antonio Puledda , Anne Sophie Tyran , Anastasia Bestin , Céline Coulombet Journée Technique Piscicole du Sysaaf, Feb 2016, Paris, France Communication dans un congrès hal-02800398v1
	Résistance génétique à l'entérite chez la truite ? Interaction avec la flavobactériose et les caractères de production Anne-Sophie Tyran , Alexandre Desgranges , Anastasia Bestin , Florian Enez , François Allal 5. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Institut Technique de l'Aviculture et des Elevages de Petits Animaux (ITAVI). FRA., Jul 2016, Paris, France Communication dans un congrès hal-02743196v1
	Can selective breeding for growth or fillet yield decrease environmental impact of fish farming? a gilthead sea bream (Sparus aurata) case study Pierrick Haffray , Ivonne Acosta Alba , Sophie Cariou , J.S. Bruant , Jérôme Bugeon 12. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Jun 2015, Santiago de Compostela, Spain Communication dans un congrès hal-01194132v1
	Genetic parameters of lipids heterogeneity estimated by direct (MRI) or indirect (artificial vision, Fat Meter) technologies in the fillet of large rainbow trout Pierrick Haffray , Antoine Chevrel , Benjamin Quittet , F. Cachelou , G. Collewet Aquaculture conference, Oct 2013, Gran Canaria, Spain Communication dans un congrès hal-02598817v1
	"Qualitytruite" : l'IRM comme méthode de quantification rapide du gras intramusculaire et du tissu adipeux sous cutané des darnes de truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) Guylaine G. Collewet , Jérôme Bugeon , Jérôme J. Idier , Stéphane S. Quellec , Benjamin Quittet 3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France. pp.83 Communication dans un congrès hal-01000325v1
	Quelles conséquences environnementales des objectifs de sélection génétique des poissons : le cas de la daurade. Programme Fild'Or Joël Aubin , Ivonne Acosta Alba , Sophie Cariou , Benjamin Quittet , Pierrick Haffray 3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France. pp.97 Communication dans un congrès hal-01019438v1
	Remplacement des matières premières de l'aliment : conséquences sur la qualité de la chair de truite et de bar Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , Françoise Médale , Laurent Labbé 3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France Communication dans un congrès hal-01191201v1
	Reprint of: Genetic parameters of in-vivo prediction of carcass, head and fillet yields by internal ultrasound and 2D external imagery in large rainbow trout [i](Oncorhynchus mykiss)[/i] Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Quentin Rivard , Benjamin Quittet , Sophie Puyo 11. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Jun 2012, Auburn, United States. ⟨10.1016/j.aquaculture.2014.01.016⟩ Communication dans un congrès hal-01193810v1
	Heart morphology and malformations genetic parameters in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), genetic correlations with production traits Benjamin Quittet , Pierrick Haffray , Hervé H. Chapuis , Paul P. Rault , Emmanuel E. Mazeiraud 11. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Auburn University. USA., Jun 2012, Auburn, United States. pp.24 Communication dans un congrès hal-01001225v1
	FILD'OR : Amélioration des programmes de sélection sur la croissance et la qualité chez la daurade Pierrick Haffray , Edwige Quillet , Cédric C. Pincent , E. E. Servan , Sophie S. Cariou Journées du SFAM, Mar 2012, Montpellier, France Communication dans un congrès hal-01000630v1
	Environmental consequences of genetic improvement by selective breeding: a gilthead sea bream aquaculture case study Joël Aubin , Ivonne I. Acosta Alba , Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Marc Vandeputte 8. International Conference on LCA in the Agri-Food Sector, Oct 2012, Saint-Malo, France. pp.694 Communication dans un congrès hal-01000950v1
	Selecting for processing yields: genetic parameters of non lethal indirect criteria in rainbow trout Oncorhynchus mykiss Pierrick Haffray , Jérôme Bugeon , Quentin Rivard , Benjamin Quittet , Marc Vandeputte 11. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Auburn University. USA., Jun 2012, Auburn, United States. pp.37 Communication dans un congrès hal-01019822v1
	Fild'Or : Bases génétiques pour l'amélioration de la qualité de la daurade royale d'élevage Sparus aurata Pierrick Haffray , Benjamin Quittet , Cédric Pincent , Elodie Servan , Sophie Cariou 3. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2012, Paris, France Communication dans un congrès hal-01191204v1
	Origine des matières premières de l'aliment : conséquences sur la qualité des chairs de truite et de bar Florence Lefèvre , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , Françoise Médale , Laurent Labbé 14. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Institut de l'Elevage (IDELE). FRA., Nov 2012, Caen, France Communication dans un congrès hal-01190249v1
	Comment sélectionner pour la qualité ? Quelles évolutions ? Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , H. H. Chavanne , Pierrick Haffray Rencontres de l'aquaculture, May 2011, Le Touquet, France. 14 p Communication dans un congrès hal-01001157v1
	Colour image analysis as a possible tool to quantify carcass and flesh quality in a rainbow trout selective breeding program Jérôme Bugeon , Georges Choubert , Cédric Pincent , Béatrice Chatain , Vincent Petit Digital imaging in fisheries biology, Sep 2010, Písek, Czech Republic Communication dans un congrès hal-01193650v1
	Genetic parameters for growth and flesh quality traits in large freshwater-reared rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) groups, mass selected or not for growth Pierrick Haffray , Cédric Pincent , Hervé Chapuis , Vincent Petit , Jérôme Bugeon 10. International Symposium on Genetics in Aquaculture (IAGA), Jun 2009, Bangkok, Thailand Communication dans un congrès hal-01193550v1
	Pas de modification de qualité technologique chez les poissons sélectionnés pour la croissance : exemples de la truite fario et du bar Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , H. Chavanne , Pierrick Haffray 2. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2009, Paris, France Communication dans un congrès hal-01193498v1
	Amélioration de la sélection individuelle par indexation sur collatéraux: application aux critères de qualité. Pierrick Haffray , Mathilde Dupont-Nivet , Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Cédric Pincent Congrès du SFAMN Syndicat Français de l'Aquaculture Marine et Nouvelle, Mar 2009, Montpellier, France. n.p Communication dans un congrès hal-01193566v1
	"Qualitytruite" : Élaboration d'une méthode de sélection sur les rendements de découpe et la qualité de la chair combinant sélection massale et familiale Pierrick Haffray , Cédric Pincent , Hervé Chapuis , Vincent Petit , Jérôme Bugeon 2. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2009, Paris, France Communication dans un congrès hal-01193466v1
	Processing quality of selected fish: quasi-absence of correlated responses to selection for growth in the brown trout [i]Salmo trutta[/i] and in the sea bass [i]Dicentrarchus labrax[/i] Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Mathilde Dupont-Nivet , H. Chavanne , Pierrick Haffray Aquaculture Europe 09, Aug 2009, Trondheim, Norway Communication dans un congrès hal-01193574v1
	Rendements de découpe et qualité de la chair chez trois espèces de salmonidés : la truite arc-en-ciel, la truite fario et le saumon atlantique Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , Armel Davenel , Pierrick Haffray 12. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Oct 2008, Tours, France Communication dans un congrès hal-02757185v1
	Déterminisme morphologique du rendement en filets chez la truite arc-en-ciel Jérôme Bugeon , Ayhan Uyanik , Florence Lefèvre , Pierrick Haffray 1. Journées de la recherche filière piscicole, Jul 2007, Paris, France Communication dans un congrès hal-02750996v1
	Flesh quality in rainbow trout with high or low fillet yield Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , Mireille Cardinal , Ayhan Uyanik , Armel Davenel Cost Action 925. Possible new technologies to estimate the muscle fiber number for use in animal production, Sep 2007, Viborg, Denmark Communication dans un congrès hal-02758272v1
	Rendements au filetage et qualité de la chair chez trois espèces de salmonidés : le saumon atlantique, la truite arc-en-ciel et la truite fario Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , Ayhan Uyanik , Laurent Labbé , Armel Davenel 1. Journées de la recherche filière piscicole, Jul 2007, Paris, France. pp.1 Communication dans un congrès hal-02758383v1
	Qualité de la chair chez des truites (Oncorhynchus mykiss) à haut et bas rendements en filet Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , M. Cardinal , Ayhan Uyanik , A. Davenel 11. Journées Sciences du Muscle et Technologies des Viandes, Oct 2006, Clermont-Ferrand, France. pp.203-204 Communication dans un congrès hal-02751156v1
	Amélioration des rendements au filetage et au parage en pisciculture Jérôme Bugeon , Marc Vandeputte , Mireille Cardinal , Florence Lefèvre , Ayhan Uyanik Journée technique du SYSAAF (Syndicat des Sélectionneurs Avicoles Aquacoles Français), Oct 2006, Paris, France. n.p Communication dans un congrès hal-02823010v1
	Prosper+/Qualitytruite : Evaluation et amélioration de la procédure de sélection PROSPER: optimisation des méthodes actuelles et introduction d'indexations sur collatéraux sur des critères de qualité. Pierrick Haffray , H. Chapuis , M. Jegaden , V. Petit , J. Doerflinger Journée Technique Piscicole du Sysaaf, Oct 2006, Paris, pp.Inconnu Communication dans un congrès hal-02823838v1
	Truitafilet: Effets de la sélection croissance sur la qualité de la truite commune. Marc Vandeputte , Jérôme Bugeon , Laurent Labbé , Pierrick Haffray Journée Technique Piscicole du Sysaaf, Oct 2006, Paris, pp.Inconnu Communication dans un congrès hal-02823901v1

	Interest of artificial intelligence to predict fillet yield in rainbow trout Jonathan D’ambrosio , Tarek Chalioui , Jean Ruche , Alexandre Desgranges , Marc Vandeputte XIV. International Symposium on Genetics in Aquaculture, Nov 2022, Puerto Varas, Chile Poster de conférence hal-04185903v1
	An image analysis pipeline for molluscs shells phenotyping: Development and validation on the pacific oyster Crassostrea gigas Antoine Jourdan , Jérôme Bugeon , Jean-Baptiste Lamy , Florian Enez , Lionel Dégremont Aquaculture Europe 2021, Oct 2021, Funchal, Madeira, Portugal Poster de conférence hal-03525958v1
	Genetic parameters for growth and colour traits in Pacific blue shrimp Litopenaeus stylirostris in a mixed family design with SNP parentage assignement in New-Caledonia Florian Enez , Bénédicte Lorgeoux , Mahunon H , Jérôme Bugeon , Marc Vandeputte 11. World Congress on Genetics Applied to Livestock Production, Feb 2018, Auckland, New Zealand Poster de conférence hal-03156790v1
	VISEGG : un système de comptage et mesure automatisé des oeufs de truite par analyse d'image Jérôme Bugeon , Jérôme Doerflinger , Chloé Bertin , Vincent Petit , Florian Enez 5. Journées de la Recherche Filière Piscicole, Jul 2016, Paris, France. , Journées de la Recherche Filière Piscicole, pp.45, 2016, JRFP 2016 Poster de conférence hal-02743289v1
	Quantification of intramuscular fat and subcutaneous adipose tissue in rainbow trout using MRI and vision G. Collewet , Jérôme Bugeon , J. Idier , S. Quellec , Benjamin Quittet 1. Annual Conference on Carcass Evaluation, Meat Quality, Software and Traceability, Sep 2012, Dublin, Ireland. 2012, First annual Conference on Carcass Evaluation, Meat Quality, Software and Traceability Poster de conférence hal-02600018v1
	Qualité de la chair chez des truites (Oncorhynchus mykiss) à haut et bas rendements en filet Jérôme Bugeon , Florence Lefèvre , M. Cardinal , Ayhan Uyanik , A. Davenel 2. Journées d'Animation Scientifique du Département PHASE, Oct 2007, Tours, France. 2007, 2èmes Journées d'Animation Scientifique du Département PHASE Poster de conférence hal-02590376v1

	FILD'OR - Bases génétiques et écologiques pour l'amélioration de la qualité de la daurade royale d'élevage Sparus aurata Pierrick Haffray , Benjamin Quittet , Cédric Pincent , Elodie Servan , Sophie Cariou [Rapport de recherche] SIVAL NL: 2009-1227 & FEP n°33073-2009, FranceAgriMer. 2012, 67 p Rapport hal-01193691v1
	QualityTruite 2. Optimisation des nouveaux programmes de sélection généalogique de type Prosper+ sur les rendements de découpe et la qualité de la chair Pierrick Haffray , Hervé Chapuis , Benjamin Quittet , Cédric Pincent , Frédéric Cachelou [Contrat] 083/08/C & 30900/2009, FranceAgriMer. 2011, 115 p Rapport hal-01193646v1
	QualityTruite. Introduction d'une évaluation généalogique qualitative en sélection de type PROSPER Pierrick Haffray , Hervé Chapuis , Bernard Coudurier , Cédric Pincent , Vincent Petit [Contrat] Ofimer n°037/05/C & Ifop n° 206/2005, 2007 Rapport hal-02823607v1
	Amélioration des rendements au filetage et au parage en pisciculture "TRUITAFILET" Jérôme Bugeon , Marc Vandeputte , Mireille Cardinal , Florence Lefèvre , Ayhan Uyanik [Rapport de recherche] Rapport final de la convention OFIMER 076/04/C, Office National Interprofessionnel des Produits de la Mer et de l’Aquaculture (France). 2006, 105 p Rapport hal-02823952v1

Pierrick Haffray

Présentation

Publications

Potential of genomic selection for growth, meat content and colour traits in mixed-family breeding designs for the Pacific oyster Crassostrea gigas

Prediction of fatty acids composition in the rainbow trout Oncorhynchus mykiss by using Raman micro-spectroscopy

Genetic architecture and genomic selection of fatty acid composition predicted by Raman spectroscopy in rainbow trout

Genetic parameters and genome-wide association studies of quality traits characterised using imaging technologies in Rainbow trout, Oncorhynchus mykiss

Morphological predictors of slaughter yields using 3D digitizer and their use in a common carp breeding program

First evidence of realized selection response on fillet yield in Rainbow trout Oncorhynchus mykiss, Using Sib selection or based on correlated ultrasound measurements

Accuracy of BLUP breeding values in a factorial mating design with mixed families and marker-based parentage assignment in rainbow trout Oncorhynchus mykiss

Potential for genetic improvement of the main slaughter yields in Common Carp with in vivo morphological predictors

Investigation of morphological predictors of fillet and carcass yield in European sea bass (Dicentrarchus labrax) for application in selective breeding

Genetic parameters of in-vivo prediction of carcass, head and fillet yields by internal ultrasound and 2D external imagery in large rainbow trout

Rapid quantification of muscle fat content and subcutaneous adipose tissue in fish using MRI

Negative genetic correlations between production traits and head or bony tissues in large all-female rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Flesh quality in large rainbow trout with high or low fillet yield

Phenomic selection, an alternative to genomic selection in animal breeding?

Implementation of genomic selection on production and quality traits and linkage disequilibrium in Crassostrea gigas

Phenomic selection, an alternative to genomic selection in animal breeding?

Successful realized selection response for fillet yield in rainbow trout Oncorhynchus mykiss

Morphological predictors of slaughter yields using 3D digitizer and their utilization in common carp breeding program

Réponse à la sélection sur le rendement de filet chez la truite arc-en-ciel

Mixed-family estimation of genetic parameters of growth, morphologic, immune and behavioral traits in the european abalone Haliotis tuberculata

Potential for genetic improvement of the main slaughter yields in common carp with in vivo morphological predictors

A first demonstration of realized selection response for fillet yield in fish, in rainbow trout oncorhynchus mykiss

Peut-on sélectionner sur le rendement de filet chez les poissons ? (et chez le bar en particulier)

Utilisation d'imagerie et d'ultrasons pour l'amélioration du rendement en chair par sélection génétique de la daurade

Genetic parameters of indirect predictors of gutted and fillet yields in the gilthead sea bream Sparus aurata in using 2D camera, 3D digitizer and ultrasound technologies

Prédicteurs morphologiques du rendement chez le bar: projet BAR3

Résistance génétique à l'entérite chez la truite ? Interaction avec la flavobactériose et les caractères de production

Can selective breeding for growth or fillet yield decrease environmental impact of fish farming? a gilthead sea bream (Sparus aurata) case study

Genetic parameters of lipids heterogeneity estimated by direct (MRI) or indirect (artificial vision, Fat Meter) technologies in the fillet of large rainbow trout

"Qualitytruite" : l'IRM comme méthode de quantification rapide du gras intramusculaire et du tissu adipeux sous cutané des darnes de truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss)

Quelles conséquences environnementales des objectifs de sélection génétique des poissons : le cas de la daurade. Programme Fild'Or

Remplacement des matières premières de l'aliment : conséquences sur la qualité de la chair de truite et de bar

Reprint of: Genetic parameters of in-vivo prediction of carcass, head and fillet yields by internal ultrasound and 2D external imagery in large rainbow trout [i](Oncorhynchus mykiss)[/i]

Heart morphology and malformations genetic parameters in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), genetic correlations with production traits

FILD'OR : Amélioration des programmes de sélection sur la croissance et la qualité chez la daurade

Environmental consequences of genetic improvement by selective breeding: a gilthead sea bream aquaculture case study

Selecting for processing yields: genetic parameters of non lethal indirect criteria in rainbow trout Oncorhynchus mykiss

Fild'Or : Bases génétiques pour l'amélioration de la qualité de la daurade royale d'élevage Sparus aurata

Origine des matières premières de l'aliment : conséquences sur la qualité des chairs de truite et de bar

Comment sélectionner pour la qualité ? Quelles évolutions ?

Colour image analysis as a possible tool to quantify carcass and flesh quality in a rainbow trout selective breeding program

Genetic parameters for growth and flesh quality traits in large freshwater-reared rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) groups, mass selected or not for growth

Pas de modification de qualité technologique chez les poissons sélectionnés pour la croissance : exemples de la truite fario et du bar

Amélioration de la sélection individuelle par indexation sur collatéraux: application aux critères de qualité.

"Qualitytruite" : Élaboration d'une méthode de sélection sur les rendements de découpe et la qualité de la chair combinant sélection massale et familiale

Processing quality of selected fish: quasi-absence of correlated responses to selection for growth in the brown trout [i]Salmo trutta[/i] and in the sea bass [i]Dicentrarchus labrax[/i]

Rendements de découpe et qualité de la chair chez trois espèces de salmonidés : la truite arc-en-ciel, la truite fario et le saumon atlantique

Déterminisme morphologique du rendement en filets chez la truite arc-en-ciel

Flesh quality in rainbow trout with high or low fillet yield

Rendements au filetage et qualité de la chair chez trois espèces de salmonidés : le saumon atlantique, la truite arc-en-ciel et la truite fario

Qualité de la chair chez des truites (Oncorhynchus mykiss) à haut et bas rendements en filet

Amélioration des rendements au filetage et au parage en pisciculture

Prosper+/Qualitytruite : Evaluation et amélioration de la procédure de sélection PROSPER: optimisation des méthodes actuelles et introduction d'indexations sur collatéraux sur des critères de qualité.

Truitafilet: Effets de la sélection croissance sur la qualité de la truite commune.

Interest of artificial intelligence to predict fillet yield in rainbow trout

An image analysis pipeline for molluscs shells phenotyping: Development and validation on the pacific oyster Crassostrea gigas

Genetic parameters for growth and colour traits in Pacific blue shrimp Litopenaeus stylirostris in a mixed family design with SNP parentage assignement in New-Caledonia

VISEGG : un système de comptage et mesure automatisé des oeufs de truite par analyse d'image

Quantification of intramuscular fat and subcutaneous adipose tissue in rainbow trout using MRI and vision

Qualité de la chair chez des truites (Oncorhynchus mykiss) à haut et bas rendements en filet

FILD'OR - Bases génétiques et écologiques pour l'amélioration de la qualité de la daurade royale d'élevage Sparus aurata

QualityTruite 2. Optimisation des nouveaux programmes de sélection généalogique de type Prosper+ sur les rendements de découpe et la qualité de la chair

QualityTruite. Introduction d'une évaluation généalogique qualitative en sélection de type PROSPER

Amélioration des rendements au filetage et au parage en pisciculture "TRUITAFILET"