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Use of environmental DNA in assessment of fish functional and phylogenetic diversity

Virginie Marques , Paul Castagne , Andrea Polanco Fernandez , Giomar Helena Borrero-Perez , Régis Hocdé , et al.
Conservation Biology, 2021, ⟨10.1111/cobi.13802⟩
Article dans une revue hal-03451172v1
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Global determinants of freshwater and marine fish genetic diversity

Stéphanie Manel , Pierre-Edouard Guerin , David Mouillot , Simon Blanchet , Laure Velez , et al.
Nature Communications, 2020, 11 (1), ⟨10.1038/s41467-020-14409-7⟩
Article dans une revue hal-03043658v1
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Blind assessment of vertebrate taxonomic diversity across spatial scales by clustering environmental DNA metabarcoding sequences

Virginie Marques , Pierre-Edouard Guerin , Mathieu Rocle , Alice Valentini , Stephanie Manel , et al.
Ecography, 2020, pp.1779-1790. ⟨10.1111/ecog.05049⟩
Article dans une revue hal-03411045v1
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Cross-ocean patterns and processes in fish biodiversity on coral reefs through the lens of eDNA metabarcoding

Laëtitia Mathon , Virginie Marques , David Mouillot , Camille Albouy , Marco Andrello , et al.
Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2022, 289 (1973), pp.20220162. ⟨10.1098/rspb.2022.0162⟩
Article dans une revue hal-03669624v1

Circumglobal distribution of fish environmental DNA in coral reefs

Laetitia Mathon , Virginie Marques , David Mouillot , Camille Albouy , Marco Andrello , et al.
ARPHA Conference Abstracts, 2021, 4, e64792 [3 p.]. ⟨10.3897/aca.4.e64792⟩
Article dans une revue hal-03414805v1
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The distribution of coastal fish eDNA sequences in the Anthropocene

Laetitia Mathon , Virginie Marques , Stéphanie Manel , Camille Albouy , Marco Andrello , et al.
Global Ecology and Biogeography, 2023, ⟨10.1111/geb.13698⟩
Article dans une revue hal-04146566v1

Climate differently influences the genomic patterns of two sympatric marine fish species

Emilie Boulanger , Laura Benestan , Pierre-Edouard Guerin , Alicia Dalongeville , David Mouillot , et al.
Journal of Animal Ecology, 2021, ⟨10.1111/1365-2656.13623⟩
Article dans une revue hal-03589729v1
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New genomic resources for three exploited Mediterranean fishes

Katharina Fietz , Elena Trofimenko , Pierre-Edouard Guerin , Véronique Arnal , Montserrat Torres-Oliva , et al.
Genomics, 2020, 112 (6), pp.4297-4303. ⟨10.1016/j.ygeno.2020.06.041⟩
Article dans une revue hal-02997412v1

Benchmarking bioinformatic tools for fast and accurate eDNA metabarcoding species identification

Laetitia Mathon , Alice Valentini , Pierre-Edouard Guerin , Eric Normandeau , Cyril Noel , et al.
Molecular Ecology Resources, 2021, ⟨10.1111/1755-0998.13430⟩
Article dans une revue hal-03415607v1

Predicting genotype environmental range from genome-environment associations

Stéphanie Manel , Marco Andrello , Karine Henry , Daphné Verdelet , Aude Darracq , et al.
Molecular Ecology, 2018, 27 (13), pp.2823-2833. ⟨10.1111/mec.14723⟩
Article dans une revue hal-02625273v1