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Pierre Casadebaig

Pierre Casadebaig
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I am a research scientist at the French National Institute for Agriculture, Food, and Environment (INRAE), in Toulouse, France, specializing in understanding how crop species interact with their biophysical environment. My research, initially focusing on homogeneous crop stands, has evolved to explore the complexities of diverse crop systems. I started by working with plant breeders and extension services. I measured, analyzed, and modeled how various sunflower cultivars respond and adapt to their cropping environment by using concepts and tools from plant ecophysiology. I relied on computational experiments to identify combinations of plant characteristics and management options that improved crop performance and stability in given production situations. Such systems approach have the advantage to apply both to the management of actual genetic material (cultivar choice) and to the breeding of new material through genome-wide association studies. The need for more sustainable and probably diverse cropping systems presents unique challenges, particularly in scaling dynamical models. To address this, I am exploring how community ecology principles and data science methodologies can help to understand less controlled and more species-varied cropping systems.
Je suis chercheur à l'Institut national de l'agriculture, de l'alimentation et de l'environnement (INRAE), à Toulouse, en France, et je me spécialise dans la compréhension des interactions entre les espèces cultivées et leur environnement biophysique. Mes recherches, initialement axées sur des peuplements homogènes, ont évoluées pour considérer des peuplements plus diversifiés mobilisés dans un système de culture. J'ai commencé par travailler en lien avec les secteurs de l'amélioration variétale et du developpement agricole. J'ai mesuré, analysé et modélisé la manière dont divers cultivars de tournesol réagissent et s'adaptent à leur environnement de culture en utilisant des concepts et des outils issus de l'écophysiologie végétale. Je me suis appuyé sur des expériences numériques pour identifier les combinaisons de caractéristiques végétales et d'options de gestion qui améliorent les performances et la stabilité des cultures dans des situations de production données. Cette approche systémique a l'avantage de s'appliquer à la fois à la gestion du matériel génétique actuel (choix des cultivars) et à la sélection de nouveau matériel par le biais d'études d'association à l'échelle du génome. La nécessité de mettre en place des systèmes de culture plus durables et probablement plus diversifiés présente des défis uniques, notamment en ce qui concerne la mise à l'échelle des modèles dynamiques. Pour y répondre, j'étudie comment les principes de l'écologie des communautés et les méthodologies de la science des données peuvent aider à comprendre des systèmes de culture moins contrôlés et plus variés en termes d'espèces.

Publications

"philippe-debaeke"

Tournesol : un progrès génétique continu

Pierre Casadebaig , P Debaeke , Céline Bial
Perspectives Agricoles, 2023, 507, pp.30-31
Article dans une revue hal-03969137v1
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Optimized cultivar deployment improves the efficiency and stability of sunflower crop production at national scale

Pierre Casadebaig , Arnaud Gauffreteau , Amélia Landré , Nicolas Langlade , Emmanuelle Mestries
TAG Theoretical and Applied Genetics, 2022, ⟨10.1007/s00122-022-04072-5⟩
Article dans une revue hal-03617020v1
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New challenges for sunflower ideotyping in changing environments and more ecological cropping systems

Philippe Debaeke , Pierre Casadebaig , Nicolas B Langlade
OCL Oilseeds and fats crops and lipids, 2021, 28, pp.1-23. ⟨10.1051/ocl/2021016⟩
Article dans une revue hal-03238316v1

SUNFLO, un modèle au service de l'amélioration des tournesols

Xavier Pinochet , Philippe Debaeke , Pierre Casadebaig , Emmannelle Mestries , Nicolas B. Langlade
Perspectives Agricoles, 2020, 480, pp.55-57
Article dans une revue hal-02952590v1
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Forecasting Sunflower Grain Yield by Assimilating Leaf Area Index into a Crop Model

Ronan Trépos , Luc Champolivier , Jean-François Dejoux , Al Bitar Ahmad , Pierre Casadebaig
Remote Sensing, 2020, 12 (22), pp.3816. ⟨10.3390/rs12223816⟩
Article dans une revue hal-03108921v1
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Sunflower agronomy: 10 years of research in partnership within the “Sunflower” Technological Joint Unit (UMT) in Toulouse

Philippe P. Debaeke , Emmanuelle Bret-Mestries , Jean-Noel J.-N. Aubertot , Pierre Casadebaig , Luc Champolivier
OCL Oilseeds and fats crops and lipids, 2020, 27, pp.14. ⟨10.1051/ocl/2020006⟩
Article dans une revue hal-02874837v1
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A new approach to crop model calibration

Pierre Casadebaig , Philippe Debaeke , Daniel Wallach
Crop Science, 2020, ⟨10.1002/csc2.20016⟩
Article dans une revue hal-02622891v1
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Outils, références et méthodes pour la construction d’un simulateur pour la prévision du rendement et de la qualité du tournesol à l’échelle territoriale mobilisant la télédétection satellitaire

Luc Champolivier , Philippe Debaeke , Jean-François Dejoux , Caroline Dizien , Arnaud Micheneau
Innovations Agronomiques, 2019, 71, pp.15-34. ⟨10.15454/qmd4zh⟩
Article dans une revue hal-02105013v1
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Data describing the eco-physiological responses of twenty-four sunflower genotypes to water deficit

Nicolas Blanchet , Pierre Casadebaig , Philippe Debaeke , Harold Duruflé , Louise Gody
Data in Brief, 2018, 21, pp.1296-1301. ⟨10.1016/j.dib.2018.10.045⟩
Article dans une revue hal-02625452v1
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Sunflower crop and climate change: vulnerability, adaptation, and mitigation potential from case-studies in Europe

Philippe Debaeke , Pierre Casadebaig , Francis Flénet , Nicolas Langlade
OCL Oilseeds and fats crops and lipids, 2017, 24 (1), 15 p. ⟨10.1051/ocl/2016052⟩
Article dans une revue hal-01605844v1
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A model-based approach to assist variety evaluation in sunflower crop

Pierre Casadebaig , Emmanuelle Mestries , Philippe Debaeke
European Journal of Agronomy, 2016, 81, pp.92-105. ⟨10.1016/j.eja.2016.09.001⟩
Article dans une revue hal-01385150v1
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Using plant phenotypic plasticity to improve crop performance and stability regarding climatic uncertainty: a computational study on sunflower

Pierre Casadebaig , Bastien Poublan , Ronan Trépos , Victor Picheny , Philippe P. Debaeke
Procedia Environmental Sciences, 2015, 29, pp.142-143. ⟨10.1016/j.proenv.2015.07.229⟩
Article dans une revue hal-02636172v1
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Prediction of sunflower grain oil concentration as a function ofvariety, crop management and environment using statistical models

Fety Nambinina Andrianasolo , Pierre Casadebaig , Elie Maza , Luc Champolivier , Pierre Maury
European Journal of Agronomy, 2014, vol. 54, pp. 84-96. ⟨10.1016/j.eja.2013.12.002⟩
Article dans une revue hal-01186524v1
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Agronomic model uses to predict cultivar performance in various environments and cropping systems. A review

Marie-Helene Jeuffroy , Pierre Casadebaig , Philippe Debaeke , Chantal Loyce , Jean-Marc Meynard
Agronomy for Sustainable Development, 2014, 34 (1), pp.121-137. ⟨10.1007/s13593-013-0170-9⟩
Article dans une revue hal-01173293v1

A biomarker based on gene expression indicates plant water status in controlled and natural environments.

Gwenaëlle Marchand , Baptiste Mayjonade , Didier Vares , Nicolas Blanchet , Marie-Claude Boniface
Plant, Cell and Environment, 2013, 36 (12), pp.2175-2189. ⟨10.1111/pce.12127⟩
Article dans une revue hal-02643216v1
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SUNFLO, a model to simulate genotype-specific performance of the sunflower crop in contrasting environments

Pierre Casadebaig , Lydie Guilioni , Jeremie Lecoeur , Angélique Christophe , Luc Champolivier
Agricultural and Forest Meteorology, 2011, 151 (2), pp.163 - 178. ⟨10.1016/j.agrformet.2010.09.012⟩
Article dans une revue hal-01506231v1

Quantifying physiological determinants of genetic variation for yield potential in sunflower. SUNFLO: a model-based analysis

Jérémie J. Lecoeur , Richard R. Lassus , Angélique A. Christophe , Benoît B. Pallas , Pierre P. Casadebaig
Functional Plant Biology, 2011, 38 (3), pp.246-259. ⟨10.1071/FP09189⟩
Article dans une revue hal-00964303v1
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Simulation dynamique des interactions génotype x environnement x conduite de culture : application à l'évaluation variétale en tournesol

Philippe P. Debaeke , Pierre Casadebaig , Emmanuelle Mestries , Jean-Pierre Palleau , Frédéric Salvi
Innovations Agronomiques, 2011, 15, pp.89-103
Article dans une revue hal-02641902v1
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Construire des stratégies de production adaptées aux débouchés à l’échelle du bassin de collecte

Luc Champolivier , Philippe P. Debaeke , Jérôme Thibierge , Jean-François Dejoux , Stéphanie Ledoux
Innovations Agronomiques, 2011, 14, pp.39-57
Article dans une revue hal-02651148v1
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Evaluer et valoriser les interactions variété-milieu-conduite en tournesol

Philippe P. Debaeke , Pierre Casadebaig , Emmanuelle Mestries , Jean-Pierre Palleau , Frédéric Salvi
Innovations Agronomiques, 2011, 14 (Juin), pp.77-90
Article dans une revue hal-02643919v1
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Simulation de la réponse variétale du tournesol à l’environnement à l’aide du modèle SUNFLO

Philippe P. Debaeke , Pierre Casadebaig , Bertrand Haquin , Emmanuelle Mestries , Jean-Pierre Palleau
Oléagineux, Corps Gras, Lipides, 2010, 17 (3), pp.143-151. ⟨10.1684/ocl.2010.0308⟩
Article dans une revue hal-02653504v1
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Raisonner les systèmes de culture en fonction de la disponibilité en eau

Philippe Debaeke , Magali Willaume , Pierre Casadebaig , Jean Marie Nolot
Innovations Agronomiques, 2008, 2, pp.19-36. ⟨10.17180/d4vp-8e98⟩
Article dans une revue hal-02667397v1

Could a crop model be useful for improving sunflower crop management ?

Francis Flénet , Philippe P. Debaeke , Pierre Casadebaig
Oléagineux, Corps Gras, Lipides, 2008, 15 (3), pp.158-161
Article dans une revue hal-02654074v1

Thresholds for leaf expansion and transpiration response to soil water deficit in a range of sunflower genotypes

Pierre Casadebaig , Philippe P. Debaeke , Jérémie Lecoeur
European Journal of Agronomy, 2008, 28 (4), pp.646-654. ⟨10.1016/j.eja.2008.02.001⟩
Article dans une revue hal-02664920v1

Tournesol et sécheresse : Évaluer les variétés par la simulation dynamique

Philippe P. Debaeke , Pierre Casadebaig
INRA Magazine, 2008, 5, pp.12-12
Article dans une revue hal-02653305v1
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Variety testing innovation for new challenges and a more resilient agriculture: The example of oilseeds and protein crops in Switzerland

Eve-Anne Laurent , Juan M. Herrera , Vuille-Dit-Bille Nicolas , Franck Boizard , Pierre Casadebaig
26e Edition Congrès international francophone 3R (Rencontres Recherches Ruminants). Wébinaire Satellite Projet CASDAR OtoP-3D, AFZ, INRAe, IDELE, Jan 2023, Par visioconférence, France. pp.69-70
Communication dans un congrès hal-03940649v1
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Optimized cultivar deployment improves the efficiency and stability of sunflower crop production at national scale

Pierre Casadebaig , Arnaud Gauffreteau , Nicolas Langlade , Mestries Emmanuelle , Sarron Julien
iCROPM 2020 Second International Crop Modelling Symposium, Feb 2020, Montpellier, France. pp.125-126
Communication dans un congrès hal-02956660v1
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Predicting sunflower grain yield using remote sensing data and models

Arnaud Micheneau , Luc Champolivier , Jean-François Dejoux , Al Bitar Ahmad , Ronan Trépos
15. ESA Congress, Aug 2018, Genève, Switzerland. 180 p
Communication dans un congrès hal-02734675v1
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HELIAPHEN: a high-throughput phenotyping platform to characterize plant responses to water stress from seedling stage to seed set

Nicolas Blanchet , Pierre Casadebaig , Philippe Burger , Didier Vares , Céline Colombet
19. International Sunflower Conference, May 2016, Edirne, Turkey
Communication dans un congrès hal-02739205v1
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A model-based approach to assist variety assessment in sunflower crop

Pierre Casadebaig , Philippe Debaeke , Emmanuelle Mestries
iCROPM2016 International Crop Modelling Symposium "Crop Modelling for Agriculture and Food Security under Global Change, Mar 2016, Berlin, Germany
Communication dans un congrès hal-02738872v1
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3D plant phenotyping in sunflower using architecture-based organ segmentation from 3D point clouds

William Gélard , Philippe Burger , Pierre Casadebaig , Nicolas Langlade , Philippe Debaeke
5th International Workshop on Image Analysis Methods for the Plant Sciences, Sep 2016, Angers, France
Communication dans un congrès hal-01380234v1
Image document

A source-sink based dynamic model for simulating oil and protein accumulation in sunflower achenes

Fety Andrianasolo Nambinina , François Brun , Pierre Casadebaig , Luc Champolivier , Pierre Maury
19. International Sunflower Conference, May 2016, Edirne, Turkey
Communication dans un congrès hal-02739034v1

Sunflower and climate change in Europe : crop vulnerability, adaptation, and mitigation potential

Philippe Debaeke , Pierre Casadebaig , Francis Flenet , Nicolas Langlade
19. International Sunflower Conference, May 2016, Edirne, Turkey
Communication dans un congrès hal-02741886v1

Using a crop model to evaluate and design combinations of genotypes X management X environments that improve sunflower crop performance

Pierre Casadebaig , Philippe P. Debaeke
18. International Sunflower Conference, Feb 2012, Mar del Plata, Argentina
Communication dans un congrès hal-02747666v1

Using a crop model to assess genotype-environment interactions in multi-environment trials

Pierre Casadebaig , Philippe P. Debaeke
Systems approaches to crop improvement. Rothamsted Research, Apr 2011, Harpenden, United Kingdom. pp.19-25
Communication dans un congrès hal-02750148v1
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Evaluer et valoriser les interactions variété-milieu-conduite en tournesol

Philippe P. Debaeke , Pierre Casadebaig , Emmanuelle Mestries , Jean-Pierre Palleau , Frédéric Salvi
CIAG Tournesol et agriculture Durable, Jun 2011, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02807121v1
Image document

Construire des stratégies de production adaptées aux débouchés à l’échelle du bassin de collecte

Luc Champolivier , Philippe P. Debaeke , Jérôme Thibierge , Jean-François Dejoux , Stéphanie Ledoux
CIAG Tournesol et agriculture Durable, Jun 2011, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-02810446v1

Application of a model to support variety evaluation and choice in sunflower

Philippe P. Debaeke , Pierre Casadebaig , Bertrand Haquin , Emmanuelle Mestries , Estelle Bonleu
Farming Systems Design 2009 : an international symposium on methodologies for integrated analysis of farm production systems, Aug 2009, Monterey, United States
Communication dans un congrès hal-02754575v1
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Sunflower yield response to crop density under climatic uncertainty: coupling an experimental and a simulation approach.

Pierre Casadebaig , Philippe Debaeke , Luc Champolivier , Vincent Lecomte , Gwenola Marage
19. International Sunflower Conference, May 2016, Edirne, Turkey. 2016, 19th International Sunflower Conference, Edirne, Turkey. ISC 2016
Poster de conférence hal-02739692v1