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64 résultats
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Towards a high density SNP International Goat Chip

Gwenola Tosser-Klopp , Abdullah Johari Jiken , Philippe Bardou , Cédric Cabau , Patrice Dehais , et al.
Plant and Animal Genome, Jan 2011, San Diégo, United States
Communication dans un congrès hal-01194170v1
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A recessive stop-gain mutation in CCDC65 is associated with lamb mortality in French Lacaune dairy sheep

Maxime Ben Braiek , Carole C. Moreno , Charlotte Allain , Philippe Bardou , Arnaud Bordes , et al.
International Sheep Genomics and the International Goat Genome Consortiums combined virtual meeting, Jun 2021, On line, France
Communication dans un congrès hal-03360133v1
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Genome-Wide Identification of the Mutation Underlying Fleece Variation and Discriminating Ancestral Hairy Species from Modern Woolly Sheep

Julie Demars , Margarita Cano , Laurence Drouilhet , Florence Plisson-Petit , Philippe Bardou , et al.
Molecular Biology and Evolution, 2017, 34 (7), pp.1722-1729. ⟨10.1093/molbev/msx114⟩
Article dans une revue hal-01608205v1

Analysis of whole genome sequence data on a tropical admixed cattle breed, the Creole cattle of Guadeloupe

Gabrièle Adam , Diane Esquerré , Olivier Bouchez , Philippe Bardou , Christophe C. Klopp , et al.
International Symposium on environmental and agronomical genomics, Nov 2018, Paris, France. , 2018
Poster de conférence hal-02786834v1
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Livestock genome annotation: transcriptome and chromatin structure profiling in cattle, goat, chicken and pig

Sylvain Foissac , Sarah Djebali , Kylie Munyard , Nathalie Vialaneix , Andrea Rau , et al.
2018
Pré-publication, Document de travail hal-02791029v1

RNAspace

Marie-Josée Cros , Antoine de Monte , Jérôme J. Mariette , Philippe Bardou , Benjamin Grenier-Boley , et al.
2010
Logiciel hal-02819286v1
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EUGENE'HOM: a generic similarity-based gene finder using multiple homologous sequences

Sylvain Foissac , Philippe Bardou , Annick Moisan , Marie-Josée Cros , Thomas Schiex
Nucleic Acids Research, 2003, 31 (13), pp.3742-3745. ⟨10.1093/nar/gkg586⟩
Article dans une revue hal-02675508v1

Interoperability with Moby 1.0--it's better than sharing your toothbrush!

M.D. Wilkinson , M. Senger , E. Kawas , R. Bruskiewich , Jerome Gouzy , et al.
Briefings in Bioinformatics, 2008, 9, pp.220-231
Article dans une revue hal-02654526v1
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Author correction : A genome scan for milk production traits in dairy goats reveals two new mutations in Dgat1 reducing milk fat content

Pauline Martin , Isabelle Palhiere , Cyrielle Maroteau , Philippe Bardou , Kamila Canale-Tabet , et al.
Scientific Reports, 2017, 8, ⟨10.1038/s41598-018-22118-x⟩
Article dans une revue hal-02622800v1
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E-formations en bioinformatique

Sarah Maman Haddad , Frédérique F. Malipier , Catherine Herry , Philippe Bardou
Les journées Bioinformatique de l'Inra, Mar 2016, Toulouse, France. , 1p, 2016
Poster de conférence hal-02800765v1
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Initiation à la plateforme de traitement bioinformatique Galaxy - Instance Sigenae / BioInfo Genotoul

Sarah Maman Haddad , Philippe Bardou , Sabrina Legoueix
Master. Formation Master 2 Bioinformatique (Initiation à la plateforme de traitement bioinformatique Galaxy - Instance Sigenae / BioInfo Genotoul - Cours et TP.), 2016
Cours hal-02801693v1
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Searching for homozygous haplotype deficiency in Manech Tête Rousse dairy sheep revealed a nonsense variant in the MMUT gene affecting newborn lamb viability

Maxime Ben Braiek , Carole C. Moreno , Céline André , Jean-Michel Astruc , Philippe Bardou , et al.
Genetics Selection Evolution, 2024, 56 (1), pp.16. ⟨10.1186/s12711-024-00886-7⟩
Article dans une revue hal-04485067v1
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A genome scan for milk production traits in dairy goats reveals two new mutations in Dgat1 reducing milk fat content

Pauline Martin , Isabelle Palhiere , Cyrielle Maroteau , Philippe Bardou , Kamila Canale-Tabet , et al.
Scientific Reports, 2017, 7 (1), Non paginé. ⟨10.1038/s41598-017-02052-0;⟩
Article dans une revue hal-01605655v1
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Quelques résultats du programme VarGoats : « 1000 génomes caprins »

L Denoyelle , M Amills , Philippe Bardou , Maxime Ben Braiek , Thomas Faraut , et al.
Journées Scientifiques du Département de Génétique Animale, Sep 2022, Bordeaux, France
Poster de conférence hal-03812438v1
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In silico identification of variations in microRNAs with a potential impact on dairy traits using whole ruminant genome SNP datasets

Céline Bourdon , Mekki Boussaha , Philippe Bardou , Marie-Pierre Sanchez , Sandrine Le Guillou , et al.
Scientific Reports, 2021, 11, ⟨10.1038/s41598-021-98639-9⟩
Article dans une revue hal-03371440v1
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Interest of Genotyping-by-Sequencing technologies as an alternative to low density SNP chips for genomic selection in layer chicken

Florian Herry , Frédéric Herault , David Picard Druet , Philippe Bardou , Camille Eché , et al.
XIth European symposium on poultry genetics (ESPG), Oct 2019, Prague, Czech Republic. Guarant International spol. s r.o., 2019, Proceedings of the XIth European symposium on Poultry Genetics
Poster de conférence hal-02460147v1
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Whole genome sequencing reveals signals of adaptive admixture in Creole cattle

Slim Ben-Jemaa , Gabriele Adam , Mekki Boussaha , Philippe Bardou , Christophe C. Klopp , et al.
Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.12155. ⟨10.1038/s41598-023-38774-7⟩
Article dans une revue hal-04186791v1

Analysis of whole genome sequence data on a tropical admixed cattle breed: the creole cattle of Guadeloupe.

Gabrièle Adam , Diane Esquerre , Olivier Bouchez , Philippe Bardou , Christophe C. Klopp , et al.
Caribbean Science ans Innovation Meeting 2019, Oct 2019, Pointe-à-Pitre (Guadeloupe), France
Communication dans un congrès hal-02423161v1

RNAspace: an integrated environment for the prediction, annotation and analysis of non-coding RNA

Marie-Josée Cros , Antoine de Monte , Jérôme J. Mariette , Philippe Bardou , Daniel Gautheret , et al.
12.Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques - JOBIM 2011, Jun 2011, Paris, France. 2011
Poster de conférence hal-02810153v1
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A Nonsense Variant in CCDC65 Gene Causes Respiratory Failure Associated with Increased Lamb Mortality in French Lacaune Dairy Sheep

Maxime Ben Braiek , Carole C. Moreno , Charlotte Allain , Philippe Bardou , Arnaud Bordes , et al.
Genes, 2022, 13 (1), pp.45. ⟨10.3390/genes13010045⟩
Article dans une revue hal-03525204v1
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RumimiR: a detailed microRNA database focused on ruminant species

Céline Bourdon , Philippe Bardou , Etienne Aujean , Sandrine Le Guillou , Fabienne Le Provost , et al.
70. Annual Meeting of the European Federation of Animal Science (EAAP), European Federation of Animal Science (EAAP). INT., Aug 2018, Gand, Belgium
Communication dans un congrès hal-02738039v1

Jflow: a workflow management system for web applications

Jérôme J. Mariette , Frédéric Escudié , Philippe Bardou , Ibouniyamine Ibrahime , Céline Noirot , et al.
2016
Logiciel hal-02795849v1

Analysis of Polycerate Mutants Reveals the Evolutionary Co-option of HOXD1 to Determine the Number and Topology of Horns in Bovidae

Aurélie Allais-Bonnet , Aurélie Hintermann , Marie-Christine Deloche , Raphaël Cornette , Philippe Bardou , et al.
bioRxiv : the preprint server for biology, 2020, ⟨10.1101/2020.11.04.363069⟩
Article dans une revue hal-04426679v1
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RNA-Seq Data for Reliable SNP Detection and Genotype Calling

Frédéric Jehl , Fabien Degalez , Frédéric Lecerf , Maria Bernard , Laetitia Lagoutte , et al.
Frontiers in Genetics, 2021, 12, pp.655707. ⟨10.3389/fgene.2021.655707⟩
Article dans une revue hal-03276149v1
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VarGoats project: a dataset of 1159 whole-genome sequences to dissect Capra hircus global diversity

Laure Denoyelle , Estelle Talouarn , Philippe Bardou , Licia Colli , Adriana Alberti , et al.
Genetics Selection Evolution, 2021, 53 (1), 14 p. ⟨10.1186/s12711-021-00659-6⟩
Article dans une revue hal-03480970v1

Development of genomic resources for Medicago truncatula and related legume crops

Frederic Debellé , Marion Verdenaud , Anne-Marie Dudez , Nicolas Samson , Olivier Saurat , et al.
Model Legume Congress 2011, Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP). Castanet Tolosan, FRA., May 2011, Sainte Maxime, France
Communication dans un congrès hal-02746654v1
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RumimiR: a detailed microRNA database focused on ruminant species

Céline Bourdon , Philippe Bardou , Etienne Aujean , Sandrine Le Guillou , Gwenola Tosser-Klopp , et al.
Database - The journal of Biological Databases and Curation, 2019, 2019, pp.1-10. ⟨10.1093/database/baz099⟩
Article dans une revue hal-02627384v1

Construction d'une puce 50000 SNP pour l'espèce caprine

Gwenola Tosser-Klopp , Philippe Bardou
Séminaire NGS, organisé par Illumina et la plate-forme Get-PlaGe, Jun 2016, Auzeville, France
Communication dans un congrès hal-02801438v1

jvenn: an interactive Venn diagram viewer

Philippe Bardou , Jérôme J. Mariette , Frédéric Escudié , Christophe Djemiel , Christophe C. Klopp
2014
Logiciel hal-02795848v1
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RNAbrowse: RNA-Seq de novo assembly results browser.

Jérôme J. Mariette , Céline Noirot , Ibouniyamine Nabihoudine , Philippe Bardou , Claire Hoede , et al.
PLoS ONE, 2014, 9 (5), 7 p. ⟨10.1371/journal.pone.0096821⟩
Article dans une revue hal-02636622v1