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57 résultats

Le CIRM : préserver la biodiversité microbienne pour soutenir l'innovation

Sophie Roussel , Anne Favel , Emmanuelle Helloin , Perrine Portier , Marion Le Saux , et al.
Journées Recherche-Industrie Management des ressources microbiennes, May 2018, Narbonne, France
Communication dans un congrès hal-01806299v1

Xanthomonas bonasiae sp. nov. and Xanthomonas youngii sp. nov., isolated from crown gall tissues

Hamzeh Mafakheri , S. Mohsen Taghavi , Sadegh Zarei , Perrine Portier , Ivica Dimkić , et al.
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2022, 72 (6), pp.005418. ⟨10.1099/ijsem.0.005418⟩
Article dans une revue hal-03728267v1

Outil pour la détection et l'étude de l'épidémiologie de Pseudomonas syringae pathovar porri, agent de la graisse du poireau

Perrine Portier , Sophie Bonneau , Marion Le Saux , Charles Manceau
7. Colloque National de la Société Française de Phytopathologie, Jun 2009, Lyon, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-02824188v1
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High-Quality Draft Genome Sequence of the Xanthomonas translucens pv. cerealis Pathotype Strain CFBP 2541.

Céline Pesce , Stéphanie Bolot , Sébastien Cunnac , Perrine Portier , Marion Le Saux , et al.
Genome Announcements, 2015, 3 (1), ⟨10.1128/genomeA.01574-14⟩
Article dans une revue hal-01209993v1
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Draft Genome Sequences of the Type Strains of Three Clavibacter Subspecies and Atypical Peach-Colored Strains Isolated from Tomato

Ebrahim Osdaghi , Perrine Portier , Martial Briand , Geraldine Taghouti , Marie Agnes Jacques
Microbiology Resource Announcements, 2018, 7 (18), pp.e01357-18. ⟨10.1128/MRA.01357-18⟩
Article dans une revue hal-02623833v1

Genomic changes arising in long-term stab cultures of Escherichia coli

D. Faure , R. Frederick , D. Wloch , P. Portier , M. Blot , et al.
Journal of Bacteriology, 2004, 186 (19), pp.6437-6442. ⟨10.1128/JB.186.19.6437-6442.2004⟩
Article dans une revue hal-02569654v1
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Draft Genome Sequence of the Flagellated Xanthomonas fuscans subsp. fuscans Strain CFBP 4884

A. Indiana , M. Briand , Matthieu Arlat , Lionel Gagnevin , R. Koebnik , et al.
Genome Announcements, 2014, 2 (5), pp.e00966-14. ⟨10.1128/genomeA.00966-14⟩
Article dans une revue hal-01134880v1

Complete Genome Sequences of Six Copper-Resistant Xanthomonas Strains Causing Bacterial Spot of Solaneous Plants, Belonging to X. gardneri , X. euvesicatoria , and X. vesicatoria , Using Long-Read Technology

Damien Richard , Claudine Boyer , Pierre Lefeuvre , Blanca Canteros , Shyam Beni-Madhu , et al.
Genome Announcements, 2017, 5 (8), ⟨10.1128/genomeA.01693-16⟩
Article dans une revue hal-03577663v1
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Pectobacterium aquaticum sp. nov., isolated from waterways

Jacques J. Pedron , Claire Bertrand , Geraldine Taghouti , Perrine Portier , Marie-Anne Barny
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2019, 69 (3), pp.745-751. ⟨10.1099/ijsem.0.003229⟩
Article dans une revue hal-02294799v1
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The Broad Host Range Plant Pathogen Dickeya dianthicola Shows a High Genetic Diversity

Jacques Pédron , Jan van der Wolf , Perrine Portier , Emma Caullireau , Frédérique van Gijsegem
Microorganisms, 2022, 10 (5), pp.1024. ⟨10.3390/microorganisms10051024⟩
Article dans une revue hal-03700789v1

The complete genome sequence of Xanthomonas theicola, the causal agent of canker on tea plants, reveals novel secretion systems in clade-1 xanthomonads

Ralf Koebnik , Daiva Burokiene , Claude Bragard , Christine Chang , Marion Fischer-Le Saux , et al.
Phytopathology, 2020, 111 (4), pp.611-616. ⟨10.1094/PHYTO-07-20-0273-SC⟩
Article dans une revue hal-02976163v1
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Genomics and transcriptomics of Xanthomonas campestris species challenge the concept of core type III effectome.

Brice Roux , Stéphanie Bolot , Endrick Guy , Nicolas Denancé , Martine Lautier , et al.
BMC Genomics, 2015, 16 (1), pp.975. ⟨10.1186/s12864-015-2190-0⟩
Article dans une revue hal-01455988v1

Using Ecology, Physiology, and Genomics to Understand Host Specificity in Xanthomonas

Marie-Agnès Jacques , Matthieu Arlat , Alice Boulanger , Tristan Boureau , Sébastien Carrère , et al.
Annual Review of Phytopathology, 2016, 54 (1), pp.163-187. ⟨10.1146/annurev-phyto-080615-100147⟩
Article dans une revue hal-03383508v1

CIRM : préserver la biodiversité microbienne pour soutenir l’innovation

Sophie Roussel , Anne Favel , Emmanuelle Helloin , Perrine Portier , Marion Le Saux , et al.
14.congrès national de la Société Française de Microbiologie (SFM), Oct 2018, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01892952v1
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Genome Sequences of the Race 1 and Race 4 Xanthomonas campestris pv. campestris Strains CFBP 1869 and CFBP 5817.

Stéphanie Bolot , Aude Cerutti , Sebastien Carrere , Matthieu Arlat , Marion Le Saux , et al.
Genome Announcements, 2015, 3 (5), ⟨10.1128/genomeA.01023-15⟩
Article dans une revue hal-01455989v1
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Analysis of the Diversity of Xylophilus ampelinus Strains Held in CIRM-CFBP Reveals a Strongly Homogenous Species

Perrine Portier , Géraldine Taghouti , Paul-Emile Bertrand , Martial Briand , Cécile Dutrieux , et al.
Microorganisms, 2022, 10 (8), pp.1531. ⟨10.3390/microorganisms10081531⟩
Article dans une revue hal-03794351v1
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Clarifying the taxonomy of the causal agent of bacterial leaf spot of lettuce through a polyphasic approach reveals that Xanthomonas cynarae Trébaol et al. 2000 emend. Timilsina et al. 2019 is a later heterotypic synonym of Xanthomonas hortorum Vauterin et al. 1995

Lucas Morinière , Alexandre Burlet , Emma Rosenthal , Xavier Nesme , Perrine Portier , et al.
Systematic and Applied Microbiology, 2020, 43 (4), 126087 ; 16 p. ⟨10.1016/j.syapm.2020.126087⟩
Article dans une revue hal-02901694v1
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Complete genome sequencing of three clade-1 xanthomonads reveals genetic determinants for a lateral flagellin and the biosynthesis of coronatine-like molecules in Xanthomonas

Chloé Peduzzi , Angeliki Sagia , Daiva Burokiene , Ildikó Nagy , Marion Fischer-Le Saux , et al.
Phytopathology, 2023, pp.PHYTO-10-22-0373-SC. ⟨10.1094/phyto-10-22-0373-sc⟩
Article dans une revue hal-03978256v1
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Comparative Genomics and Phylogenetic Analyses Suggest Several Novel Species within Clavibacter sp. Including Non-Pathogenic Tomato-Associated Strains

Ebrahim Osdaghi , Touraj Rahimi , S. Mohsen Taghavi , Maryam Ansari , Sadegh Zarei , et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2020, ⟨10.1128/AEM.02873-19⟩
Article dans une revue hal-02624788v1

Taxonomic Refinement of Xanthomonas arboricola

Sadegh Zarei , S. Mohsen Taghavi , Touraj Rahimi , Hamzeh Mafakheri , Neha Potnis , et al.
Phytopathology, 2022, 118 (8), pp.1630-1639. ⟨10.1094/phyto-12-21-0519-r⟩
Article dans une revue hal-03623139v1

L'agent causal des broussins de la vigne, Agrobacterium vitis, est une espèce bactérienne génétiquement homogène sans écotype régional, en France

Fabiola Anzala , Perrine Portier , Charles Manceau
7. Colloque National de la Société Française de Phytopathologie, Jun 2009, Lyon, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-02823252v1

First Report of Cassava Bacterial Blight Caused by Xanthomonas axonopodis pv. manihotis in Burkina Faso

I. Wonni , L. Ouedraogo , S. Dao , C. Tekete , O. Koita , et al.
Plant Disease, 2015, 99 (4), pp.551 - 551. ⟨10.1094/PDIS-03-14-0302-PDN⟩
Article dans une revue hal-02640455v1
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Yeast Plasma Membrane Fungal Oligopeptide Transporters Display Distinct Substrate Preferences despite Their High Sequence Identity

Carmen Becerra-Rodríguez , Géraldine G. Taghouti , Perrine Portier , Sylvie Dequin , Margarida Casal , et al.
Journal of Fungi, 2021, 7 (11), pp.963. ⟨10.3390/jof7110963⟩
Article dans une revue hal-03495380v1
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Phenotypic and Molecular-Phylogenetic Analyses Reveal Distinct Features of Crown Gall-Associated Xanthomonas Strains

Hamzeh Mafakheri , S. Mohsen Taghavi , Sadegh Zarei , Touraj Rahimi , Mohammad Sadegh Hasannezhad , et al.
Microbiology Spectrum, 2022, 10 (1), 18 p. ⟨10.1128/spectrum.00577-21⟩
Article dans une revue hal-03576592v1
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Draft Genome Sequence of the Xanthomonas cassavae Type Strain CFBP 4642.

Stéphanie S. Bolot , Alejandra Munoz Bodnar , Sébastien Cunnac , Erika Ortiz , Boris Szurek , et al.
Genome Announcements, 2013, 1 (4), ⟨10.1128/genomeA.00679-13⟩
Article dans une revue hal-02642222v1

Démasquage des gènes spécifiques d'une espèce génomique du complexeAgrobacterium tumefaciens par AFLP et multicapteur à ADN

Perrine Portier , Denis Costechareyre , Daniel Muller , David Chapulliot , Christine Oger , et al.
7. Colloque national du Bureau des Ressources Génétiques, 2008, Strasbourg, France
Communication dans un congrès hal-02753900v1
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Sélection d'écotypes bactériens pathogènes et non-pathogènes par la plante en relation avec la différenciation en espèces génomiques chez Agrobacterium spp.

Perrine Portier
Ecologie, Environnement. Université Claude Bernard - Lyon I, 2004. Français. ⟨NNT : ⟩
Thèse tel-00350502v1

Elevation of Pectobacterium carotovorum subsp. odoriferum to species level as Pectobacterium odoriferum sp. nov., proposal of Pectobacterium brasiliense sp. nov. and Pectobacterium actinidiae sp. nov., emended description of Pectobacterium carotovorum and description of Pectobacterium versatile sp. nov., isolated from streams and symptoms on diverse plants

Perrine Portier , Jacques Pédron , Géraldine Taghouti , Marion Fischer-Le Saux , Emma Caullireau , et al.
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2019, 69 (10), pp.3207--3216. ⟨10.1099/ijsem.0.003611⟩
Article dans une revue hal-02335217v1
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Pathogenicity and molecular‐phylogenetic analysis revealed a distinct position of the banana finger‐tip rot pathogen among the Burkholderia cenocepacia genomovars

Maryam Ansari , S. Mohsen Taghavi , Sadegh Zarei , Khaled Miri , Perrine Portier , et al.
Plant Pathology, 2019, 68 (4), pp.804-815. ⟨10.1111/ppa.12976⟩
Article dans une revue hal-02626344v1
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Identification of Genomic Species in Agrobacterium Biovar 1 by AFLP Genomic Markers

Perrine Portier , Marion Fischer-Le Saux , Christophe Mougel , Catherine Lerondelle , David Chapulliot , et al.
Applied and Environmental Microbiology, 2006, 72 (11), pp.7123-7131. ⟨10.1128/AEM.00018-06⟩
Article dans une revue hal-00128068v1