Pascal CROISEAU

GABI, équipe G2B Domaine de Vilvert, 78352 Jouy en Josas 01-34-65-21-97 pascal.croiseau@inrae.fr FORMATIONS et EXPERIENCES PROFESSIONNELLES ------------------------------------------ ### Parcours professionnel **2008**: Recrutement CRCN à l’INRAE de Jouy en Josas, unité GABI, équipe G2B Mes travaux de recherches portent sur l’exploitation de données génomiques bovine. Je peux en isoler deux composantes complémentaires : (1) D’une part l’identification et la comparaison de méthodes statistiques pour la sélection génomique. La sélection génomique consiste à prédire la valeur génétique d’animaux candidats à la sélection en exploitant les informations apportées par une population de référence. Je contribue à la mise en place et à l’amélioration des modèles de sélection génomique utilisés pour les évaluations génétiques nationales. (2) D’autre part, la sélection génomique s’appuie sur la connaissance des régions QTL. Pour améliorer la qualité de prédiction de nos méthodes, l’identification et la localisation des QTL est une étape clé. Si durant la période 2008-2015, mes travaux ont été guidés par l’accès à de nouvelles technologies (exploitation de la puce 50K pour la mise en place d’une évaluation génomique officielle en France chez les grandes races bovines laitières ; exploitation d’une puce haute densité pour améliorer la précision des évaluations génomiques et étendre ces évaluations aux races régionales), depuis 2015, mes travaux visent à exploiter les propriétés des méthodes d’évaluation génomique ainsi que de la sélection génomique mise en place dans les entreprises de sélection pour répondre aux grands enjeux de demain tel que le maintien de la diversité génétique ou encore le développement d’une évaluation génomique en croisement. ### Diplômes ****2021**:** Habilitation à Diriger des Recherches (Université Paris-Saclay) **2004-2008**: Doctorat de l’Université de Paris-Sud, Ecole doctorale Gène Génome Cellule, spécialité : génétique statistique (Mention très honorable). Cette thèse a été réalisée sous la direction de E. Génin à l’unité INSERM 535 (Hôpital Paul Brousse, Villejuif, directrice : F. Clerget-Darpoux) et soutenue le 14 janvier 2008 devant le jury : - Mr De Vienne, professeur à l’université Paris Sud (Président) - Mme Bickeböller, professeur à l’université de Gottingen, Allemagne (Rapporteur) - Mr Tregouet, CR à l’unité INSERM U525 (Rapporteur) - Mr Alizadeh, CR à l’Etablissement Français du Sang (Examinateur) - Mme Le Roy, DR à l’Agrocampus INRA de Rennes (Examinateur) Sujet: Influence et traitement des données manquantes dans les études d’association en génétique: application à la Sclérose en Plaques. **2003-2004**: D.E.A. de génétique multifactorielle, Université Paris Sud. **2001-2003**: Licence-Maîtrise de Biologie Informatique, Université Paris VII. **1999-2001**: DEUG de biologie, Université Paris VII. ### Formations complémentaires en France **2004**: Déterminisme génétique de la Sclérose en Plaques : Rôle de 2 gène candidats (CTLA4 et HLA-DRB1). Directrice de stage : E. Génin ; INSERM U535, stage de DEA : 6 mois. **2004**: Analyse génétique de lignées de poules sélectionnées pour des réponses immunitaires. Directrice de stage : M.H. Pinard ; INRA (Jouy en Josas), stage de DEA, 3 mois. ### Formations complémentaires à l’étranger **2007**: Post-doctorat à l’Institut de Génétique Humaine de l’Université de Newcastle (Angleterre). Responsable : Heather Cordell. ENSEIGNEMENTS ------------- #### 2008-2020 : Master PRIAM - Responsable de la filière "animal breeding and genetics" - Intervenant dans le module "Genome Analysis" #### Encadrements : - Encadrement de 6 stages de niveau M2 - Encadrement de 7 doctorants EXPERTISES SCIENTIFIQUES ------------------------ - Membre de comités de thèse - Membre de jury de thèse - Membre de jury de recrutement de M2 et de thèses - Membre du jury pour les concours de Chargé de Recherche Classe Normal. - Membre nommé au sein de la section "production animale" de la Comission Nationale des Enseignants-Chercheurs relevant du ministre de l'Agriculture (CNECA) - Membre élu du Conseil Scientifique du département de Génétique Animale de l'INRAE. LANGUE et LANGAGES ------------------ #### Langue - Anglais (parlé, lu, écrit) #### Compétences informatiques - Système d’exploitation : Linux, Unix, Windows. - Langage de programmation : Awk, C, fortran, R COMPETENCES SCIENTIFIQUES ET GESTION DE PROJETS ----------------------------------------------- #### Compétences en génétique - Génétique quantitative - Détection de QTL - Sélection génomique #### Montage et Gestion de projets - Animateur de work package dans différents projets (projet ANR Gembal, projet CASDAR RT UniGeno, projet APIS-GENE ASAP, EvaGenoc, ...) - Animateur d'une tache du projet européen RUMIGEN - Porteur de projets (méta-programme SELGEN : INCOMINGS, GDivSelGen, méta-programme DigitBio : DeepPhenomic) #### Production scientifique : - 26 publications dans des revues avec comité de lecture - 71 publications dans des actes de congrès avec comité de lecture - 2 chapitres de livres - 2 licences de savoir-faire en tant que co-inventeur du procédé de sélection génomique en France.