Accéder directement au contenu

Olivier Collin

13
Documents
Identifiants chercheurs

Présentation

Publications

yvan-le-bras
Image document

Scientific workflows for computational reproducibility in the life sciences: Status, challenges and opportunities

Sarah Cohen-Boulakia , Khalid Belhajjame , Olivier Collin , Jérôme Chopard , Christine Froidevaux
Future Generation Computer Systems, 2017, 75, pp.284-298. ⟨10.1016/j.future.2017.01.012⟩
Article dans une revue hal-01516082v1
Image document

Colib’read on galaxy: a tools suite dedicated to biological information extraction from raw NGS reads

Yvan Le Bras , Olivier Collin , Cyril Monjeaud , Vincent Lacroix , Eric Rivals
GigaScience, 2016, 5 (1), ⟨10.1186/s13742-015-0105-2⟩
Article dans une revue hal-01280238v1
Image document

The ReproGenomics Viewer: an integrative cross-species toolbox for the reproductive science community.

Thomas A Darde , Olivier Sallou , Emmanuelle Becker , Bertrand Evrard , Cyril Monjoeaud
Nucleic Acids Research, 2015, 43 (W1), pp.8. ⟨10.1093/nar/gkv345⟩
Article dans une revue hal-01146120v1
Image document

BioMAJ2Galaxy: automatic update of reference data in Galaxy using BioMAJ

Anthony Bretaudeau , Cyril Monjeaud , Yvan Le Bras , Fabrice Legeai , Olivier Collin
GigaScience, 2015, 4, pp.22. ⟨10.1186/s13742-015-0063-8⟩
Article dans une revue hal-01240449v1
Image document

BioShaDock: a community driven bioinformatics shared Docker-based tools registry

François Moreews , Olivier Sallou , Hervé Ménager , Yvan Le Bras , Cyril Monjeaud
Article dans une revue hal-01243520v1

LIMLE, a New Molecule Over-Expressed following Activation, Is Involved in the Stimulatory Properties of Dendritic Cells

Laëtitia Le Texier , Justine Durand , Amélie Lavault , Philippe Hulin , Olivier Collin
PLoS ONE, 2014, pp.10. ⟨10.1371/journal.pone.0093894⟩
Article dans une revue hal-01093223v1

LIME, a new molecule associated with cytoskeleton is involved in stimulatory properties of DC

Laëtitia Le Texier , Justine Durand , Amélie Lavault , Philippe Hulin , Olivier Collin
PLoS ONE, 2014, pp.10. ⟨10.1371/journal.pone.0093894⟩
Article dans une revue hal-01183591v1
Image document

A curated Domain centric shared Docker registry linked to the Galaxy toolshed

François Moreews , Olivier Sallou , Yvan Le Bras , Grosjean Marie , Cyril Monjeaud
Galaxy Community Conference 2015, Jul 2015, Norwich, United Kingdom
Communication dans un congrès hal-01160514v1

Automatic update of reference data in Galaxy using BioMAJ.

Anthony Bretaudeau , Yvan Le Bras , Cyril Monjeaud , Olivier Collin
Galaxy Day 2014, Institut Français de Bioinformatique, Dec 2014, Paris, France
Communication dans un congrès hal-01102421v1

Integrating GALAXY workflows in a metadata management environment

François Moreews , Yvan Le Bras , Olivier Dameron , Cyril Monjeaud , Olivier Collin
Galaxy Community Conference, Jul 2014, Baltimore, United States
Communication dans un congrès hal-01093058v1

Towards a Life Sciences Virtual Research Environment

Yvan Le Bras , Aurélien Roult , Cyril Monjoeaud , Bahin Mathieu , Olivier Quenez
JOBIM 2013 - Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2013, Toulouse, France
Communication dans un congrès hal-01102438v1