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Vers une annotation RMN 1D et 2D ciblée à partir de matrices de référence

 Marie Lefebvre , Julie Pinelli , Nils Paulhe , Vanessa Zhendre , Claire Lopez , et al.
9. Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. 2015
Poster de conférence hal-02743576v1
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Suggesting disease associations for overlooked metabolites using literature from metabolic neighbors

 Maxime Delmas , Olivier Filangi , Christophe Duperier , Nils Paulhe , Florence Vinson , et al.
GigaScience, 2022, 12, pp.giad065. ⟨10.1093/gigascience/giad065⟩
Article dans une revue hal-04223426v1
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Untargeted metabolomic approach by GC-QTOF : From low to high resolution

 Carole Migné , Nils Paulhe , Yann Guitton , Franck Giacomoni , Mélanie Pétéra , et al.
SMMAP 2017 (Spectrométrie de Masse, Métabolomique et Analyse Protéomique), Oct 2017, Marne-La-Vallée, France. , pp.476, 2017, SMMAP 2017-Livre des résumés
Poster de conférence hal-01674479v1
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Optimization of metabolome extraction procedures and implementation of a PeakForest database for the identification of microorganisms compounds by LC-HRMS

 Wiam Mansouri , Cyril C. Jousse , Marie Lagrée , Nils Paulhe , Binta Diémé
Analytics 2022, Sep 2022, Nantes, France
Poster de conférence hal-03879175v1
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Update on technological developments and opportunities with Workflow4Metabolomics

 Lain Pavot , Mélanie Pétéra , Nils Paulhe , Yann Guitton , Gildas Le Corguillé , et al.
Analytics 2022, Sep 2022, Nantes, France.
Poster de conférence hal-03776462v1

Suggesting disease associations for overlooked metabolites using literature from metabolic neighbours

 M. Delmas , O. Filangi , C. Duperier , N. Paulhe , F. Vinson , et al.
2023
Pré-publication, Document de travail hal-04188519v1
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PeakForest: a spectral database and its toolbox, dedicated to the Metabolomics’ community

 Nils Paulhe , Christophe Duperier , Marie Lefebvre , Pierrick Roger-Mele , Christophe Junot , et al.
12. annual conference of the Metabolomics Society, Jun 2016, Dublin, United Kingdom. 2016
Poster de conférence hal-02744357v1

PeakForest: a spectral reference database made from metabolomic experts for metabolomic analyses

 Nils Paulhe , Pierrick Roger , Marie-Françoise Olivier , Marie Lefebvre , Christophe Duperier , et al.
9. Journées scientifiques du RFMF, Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique (RFMF). FRA., Jun 2015, Lille, France
Communication dans un congrès hal-02742965v1

Metavir: a web server dedicated to virome analysis.

 Simon Roux , Michaël Faubladier , Antoine Mahul , Nils Paulhe , Aurélien Bernard , et al.
Bioinformatics, 2011, 27 (21), pp.3074-5. ⟨10.1093/bioinformatics/btr519⟩
Article dans une revue hal-00841495v1
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A computational solution to automatically map metabolite libraries in the context of genome scale metabolic networks

 Benjamin Merlet , Nils Paulhe , Florence Vinson , Clément Frainay , Maxime Chazalviel , et al.
Frontiers in Molecular Biosciences, 2016, 3, ⟨10.3389/fmolb.2016.00002⟩
Article dans une revue hal-02631089v1

PeakForest: a spectral reference database made from metabolomic experts for metabolomic analyses

 Nils Paulhe , Pierrick Roger , Marie-Françoise Olivier , Marie Lefebvre , Christophe Duperier , et al.
9. Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. 2015
Poster de conférence hal-02742964v1
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New tools and workflows on W4M, the Galaxy metabolomic infrastructure

 Marion Landi , Claire Lopez , Marie Tremblay-Franco , Cécile Canlet , Yann Guitton , et al.
9e Journées scientifiques du RFMF, Jun 2015, Lille, France. , 2015
Poster de conférence hal-02743697v1
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FORUM: building a Knowledge Graph from public databases and scientific literature to extract associations between chemicals and diseases

 Maxime Delmas , Olivier Filangi , Nils Paulhe , Florence Vinson , Christophe Duperier , et al.
Bioinformatics, 2021, 37 (21), pp.3896-3904. ⟨10.1093/bioinformatics/btab627⟩
Article dans une revue hal-03361495v1
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Enrichissement de la base de données spectrale peakforest en LC-MS

 Sylvain Emery , Bernard Lyan , Charlotte Joly , Nils Paulhe , Franck Giacomoni , et al.
10. journées scientifiques du Réseau Francophone de Métabolomique et Fluxomique, May 2016, Montpellier, France. 158 p., 2016, Livret des résumés 10JS RFMF
Poster de conférence hal-01594987v1
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Spectral Database: from data model to web interface

 Nils Paulhe , Christophe Duperier , Daniel Jacob , Etienne Thévenot , Jean-Francois Martin , et al.
8. Journées Scientifiques du Réseau Français de Métabolomique et Fluxomique RFMF, May 2014, Lyon, France. 2014
Poster de conférence hal-02742064v1

FORUM: Building a Knowledge Graph from public databases and scientific literature to extract associations between chemicals and diseases

 Maxime Delmas , Olivier Filangi , Nils Paulhe , Florence Vinson , Christophe Duperier , et al.
2021
Pré-publication, Document de travail hal-03318295v1
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Metabolite reporting in large-scale studies within different metabolomics communities: DO WE SPEAK THE SAME LANGUAGE?

 Ghina Hajjar , David Benaben , Nils Paulhe , Christophe Duperier , Olivier Filangi , et al.
Analytics 2022, Sep 2022, Nantes, France
Poster de conférence hal-03775474v1
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PeakForest: a multi-platform digital infrastructure for interoperable metabolite spectral data and metadata management

 Nils Paulhe , Cécile Canlet , Annelaure Damont , Lindsay Peyriga , Stéphanie Durand , et al.
Metabolomics, 2022, 18 (6), pp.40. ⟨10.1007/s11306-022-01899-3⟩
Article dans une revue hal-03695453v1
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Developments and opportunities with Workflow4Metabolomics

 Lain Pavot , Mélanie Pétéra , Nils Paulhe , Yann Guitton , Gildas Le Corguillé , et al.
Analytics 2022, Sep 2022, Nantes, France
Poster de conférence hal-03781084v1
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