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NP
Nicolas Parisot
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Affiliations actuelles
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Identifiants chercheurs
- nicolas-parisot
- ResearcherId : C-8116-2012
- 0000-0001-5217-8415
- IdRef : 181863030
- ResearcherId : http://www.researcherid.com/rid/C-8116-2012
Présentation
### Positions
- **2015-now: Assistant Professor at [INSA Lyon](https://www.insa-lyon.fr/) and [BF2I Lab](https://bf2i.insa-lyon.fr/)**
- 2014-2015: Fixed term Assistant Professor (French ATER) at [INSA Lyon](https://www.insa-lyon.fr/) and [BF2I Lab](https://bf2i.insa-lyon.fr/). "High-throughput genomics and transcriptomics to study insect symbioses"
- 2011-2014: PhD student, Université Blaise Pascal (Clermont-Ferrand II, France), [LMGE](https://lmge.uca.fr) and [CIDAM](https://www6.clermont.inrae.fr/medis/) labs. "Selection of oligonucleotide probes for high-throughput study of complex environments"
### Academic degrees
- 2011-2014: PhD thesis in Bioinformatics and Microbial Ecology, Université Blaise Pascal (Clermont-Ferrand II, France)
- 2010-2011: Master of Science in Biostatistics and Bioinformatics, Université Claude Bernard (Lyon I, France)
- 2008-2011: Master of Engineering degree in Bioinformatics and Modelling, INSA Lyon, France
- 2006-2008: Technology degree in Bioinformatics, Université d'Auvergne (Aurillac, France)
Publications
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Isolation of Insect as a Platform for Transcriptomic AnalysesRNA abundance analysis, 2170, pp.185-198, 2021, ⟨10.1007/978-1-0716-0743-5_13⟩
Chapitre d'ouvrage
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Genetic Diversity of the Apoptotic Pathway in InsectsEvolution, Origin of Life, Concepts ans Methods, Springer International Publishing, pp.253-285, 2019, 978-3-030-30363-1. ⟨10.1007/978-3-030-30363-1_13⟩
Chapitre d'ouvrage
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Probe design strategies for oligonucleotide microarraysMicroarray Technology, 1368, Editions Springer, 2016, Methods in Molecular Biology, 978-1-4939-3135-4. ⟨10.1007/978-1-4939-3136-1_6⟩
Chapitre d'ouvrage
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Targeted Gene Capture by Hybridization to Illuminate Ecosystem FunctioningMicrobial Environmental Genomics (MEG), 1399, Springer New York, pp.167-182, 2016, Methods in Molecular Biology, ⟨10.1007/978-1-4939-3369-3_10⟩
Chapitre d'ouvrage
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Software tools for the selection of oligonucleotide probes for microarrays.Microarrays: Current technology, Innovations and Applications, Caister Academic Press, 2014
Chapitre d'ouvrage
hal-03772798v1
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Peptides « Bacteriocyte-specific Cysteine Rich » (BCR) : un rôle dans le contrôle de la symbiose ? Focus sur BCR4 chez le puceron du pois12. Rencontre du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), May 2022, Nice, France
Communication dans un congrès
hal-03741305v1
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Analysis of the inhibitor of aPoptosis (IAP) repertoire in insects reveals a complex pattern of gene losses and amplificationsIncontri di diversità delle forme e degli animali, Università di Pisa, 2021, Pisa, Italy
Communication dans un congrès
hal-03514196v1
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Analysis of the Inhibitor of aPoptosis (IAP) repertoire in insects reveals a complex pattern of gene losses and amplificationsWebinaires BAPOA 2021, 2021, Villeurbanne (virtual), France
Communication dans un congrès
hal-03514209v1
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IAP (Inhibitor-of-Apoptosis Protein) gene family expansion and functional characterization in aphids8. international symposium on Molecular Insect Science, Jul 2019, Sitges, Spain
Communication dans un congrès
hal-03741297v1
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IAP (Inhibitor-of-Apoptosis Protein) gene family expansion and functional diversification in aphidsUK-France joint Meeting Aphid Special Interest Group – BAPOA, Apr 2019, Rothamsted, United Kingdom
Communication dans un congrès
hal-03512999v1
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Rôle clé du bactériocyte dans la résilience du puceron aux stress nutritionnels11ème Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-03514026v1
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Another way to die for bacteriocytes in the aphid/Buchnera symbiotic systemJournée des doctorants du département SPE, Jun 2018, Nice, France
Communication dans un congrès
hal-03510629v1
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Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03514051v1
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Amplification des gènes codant les protéines de la famille des IAP et leur rôle dans l'homéostasie bactériocytaire11. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2018, Rennes, France
Communication dans un congrès
hal-03741308v1
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Bacteriocyte reprogramming to cope with nutritional stress in a phloem sap feeding hemipteran, the pea aphid Acyrthosiphon pisumInternational Partner Days, Oct 2018, Villeurbanne (INSA-Lyon), France
Communication dans un congrès
hal-03514034v1
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Expansion of genes encoding Apoptosis Inhibitor Proteins (IAPs) and their role in a novel bacteriocyte cell death process in aphid symbiosis22. Evolutionary Biology Meeting, Sep 2018, Marseille, France
Communication dans un congrès
hal-03509938v1
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A novel cell death process is involved in the elimination of bacteriocytes and their symbionts through aphid agingFrance-Israel PRC Meeting – The role of metabolic interactions in shaping the bacterial endosymbiotic community of Hemyptera, Nov 2018, Villeurbanne, France
Communication dans un congrès
hal-03514078v1
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The long-term relationship with Buchnera aphidicola imposes another way to die for Acyrthosiphon pisum bacteriocytes9. Réunion annuelle du Réseau BAPOA (Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés), Nov 2016, Amiens, France
Communication dans un congrès
hal-03506794v1
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Une nouvelle forme de mort cellulaire impliquée dans la dégénérescence des cellules bactériocytaires chez le puceron du pois, Acyrthosiphon pisum18. Colloque Biologie de l'Insecte, Jun 2016, Tours, France
Communication dans un congrès
hal-03506790v1
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Life history traits and tissue-specific gene expression changes underlying the symbiotic pea aphid resilience to a tyrosine and phenylalanine depleted diet9. Réunion du Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons et Organismes Associés (BAPOA), Nov 2016, Amiens, France
Communication dans un congrès
hal-03506796v1
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Propositional Logic for Efficient Microbial Community Assessment by DNA Microarray Data AnalysisJOBIM, 2015, Clermont-Fd, France. pp.1-9
Communication dans un congrès
hal-02077182v1
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From SymbAphidBase to SymbAphidCyc: two companion databases to study and compare aphid symbionts from genomes to metabolic pathwaysJOBIM 2015 - Journées Ouvertes Biologie Informatique Mathématiques, Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA). FRA., Jul 2015, Clermont-Ferrand, France. 1 p
Communication dans un congrès
hal-01208786v1
|
Fungal secondary metabolites from Monascus spp. reduce methane production by affecting rumen methanogenic Archaea diversity in wethersGreenhouse Gases and Animal Agriculture Conference, 2013, Dublin, Ireland
Communication dans un congrès
hal-02746467v1
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MetaExploArrays: a large-scale oligonucleotide probe design software for explorative DNA microarrays13. International Conference on Parallel and Distributed Computing, Applications and Technologies, Dec 2012, Bejing, China. ⟨10.1109/PDCAT.2012.94⟩
Communication dans un congrès
hal-01393662v1
|
|
MetaExploArrays : a large-scale oligonucleotide probe design software for explorative DNA microarraysIEEE PDCAT 2012, 2012, Pekin, China. pp.664-671
Communication dans un congrès
hal-02077374v1
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Détermination de sondes oligonucléotidiques pour biopuces phylogénétiques en environnement grille de calculRencontres Scientifiques France Grilles 2011, Sep 2011, Lyon, France
Communication dans un congrès
hal-00658712v1
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Genomic analysis of the transport function in the symbiotic system of the pea aphid Acyrthosiphon pisum5. Meeting GDRE-RA "Comparative genomics", Institut d'Estudis Catalans (IEC). Barcelona, ESP., Nov 2010, Barcelone, Spain. n. p
Communication dans un congrès
hal-02823073v1
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Annotation et évolution des familles de transporteurs chez le puceron du pois (Acyrthosiphon pisum)3. Réunion Réseau Français de Biologie Adaptative des Pucerons, Institut National de Recherche Agronomique (INRA). UMR Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (0203)., Oct 2010, Lyon, France. n. p
Communication dans un congrès
hal-02818835v1
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The genome of the cereal pest Sitophilus oryzae : a transposable element haven2021
Pré-publication, Document de travail
hal-03320933v1
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Molecular evolutionary trends and feeding ecology diversification in the Hemiptera, anchored by the milkweed bug genome2020
Pré-publication, Document de travail
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Genome Wide Identification Of Bacterial Genes Required For Plant Infection By Tn-Seq2019
Pré-publication, Document de travail
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Détermination de sondes oligonucléotidiques pour l'exploration à haut débit de la diversité taxonomique et fonctionnelle d'environnements complexesSciences agricoles. Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2014. Français. ⟨NNT : 2014CLF22498⟩
Thèse
tel-01086970v1
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