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Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré

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Identifiants chercheurs

Présentation

**Activités de Recherche** Au cours de ma thèse de doctorat, j’ai associé écologie microbienne des sols et cycles biogéochimiques (cycle du Carbone) et j’ai renforcé mes compétences en écologie microbienne au travers de mon post doctorat au sein de l’équipe BIOCOM (UMR Microbiologie du Sol et de l’Environnement, Dijon) sous la direction de L Ranjard. Suite à cela, j’ai été recruté à AgroSup Dijon en tant que maître de conférences et ai rejoint officiellement l’équipe BIOCOM lors de la création de l’UMR 1347 Agroécologie. Au sein de l’équipe BIOCOM, je développe deux thématiques de recherche en association avec L. Ranjard et P.A. Maron: 1) l’étude de la distribution spatiale, de la dynamique et du déterminisme de la diversité microbienne des sols 2) l’étude du lien entre diversité microbienne des sols et leur fonctionnement biologique. La première thématique met en jeu des approches d’écologie spatiale pour caractériser les patterns de distribution des communautés microbienne du sol et comprendre leur déterminisme (processus de diversification, filtre environnementaux : environnement, climat, communauté végétale, éloignement géographique). Ces approches appliquées en particulier à l’échelle des paysages agricoles pour déterminer si les filtres environnementaux et les processus de diversification des microorganismes du sol à cette échelle sont les même qu’à des échelles plus fines (parcelle) ou plus large (régionale, nationale). Ce travail fait actuellement l’objet de la thèse de Florentin Constancias que je co-encadre avec Lionel Ranjard. La seconde thématique, développée avec Pierre-Alain Maron, met en jeu des approches d’écologie des communautés avec des approches d’écologie fonctionnelle ciblées sur le turnover des matières organiques du sol et la stabilité de cette fonction face à des perturbations externes. Au-delà des débouchés fondamentaux liés à ces thématiques de recherche, ces dernières ont aussi des débouchés appliqués pour une meilleure évaluation environnementale des pratiques agricoles et en termes de formation pour les acteurs du monde agricole sur l’utilisation des indicateurs biologiques, et particulièrement microbiens, pour évaluer l’impact de leurs pratiques sur leurs sols (Projet CASDAR AgrInnov, en cours). **Activités d’enseignement** Je réalise la majeure partie de mes activités d’enseignement sur la thématique de la biologie des sols en lien avec leur fonctionnement au sein d’AgroSup Dijon et de l’Université de Bourgogne. Mes activités d’enseignement couvrent différents niveaux : Cursus ingénieur 1ère et 2e année, 3e année spécialisation Agronomie – Environnement ; Licence 3, Master 1 et Master 2. Au sein de l’université de Bourgogne, j’interviens particulièrement dans le cadre de la licence professionnelle Agriculture, Durabilité, Nouvelles Technologies dont je suis co-directeur avec PY Collin (UMR Biogéosciences, Université de Bourgogne), du Master BOP et du master BIIPPME. Outre des cours théoriques et des travaux dirigés sur la biologie des sols, j’interviens aussi dans le cadre d’activités pluridisciplinaires (Approche Globale de l’Exploitation Agricole, Diagnostic Agri-Environnemental, projets tuteurés) et dans l’encadrement des stages des étudiants d’AgroSup Dijon (mémoires de fin d’étude, stages en entreprise) et de licence professionnelle.

Publications

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Differential responses of soil microbial biomass, diversity and interactions to land use intensity at a territorial scale

Amélie Christel , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Samuel Dequiedt , Nicolas P. A. Saby , F. Mercier
Science of the Total Environment, 2024, 906, pp.art. 167454. ⟨10.1016/j.scitotenv.2023.167454⟩
Article dans une revue hal-04281882v1
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Urban land uses shape soil microbial abundance and diversity

Amélie Christel , Samuel Dequiedt , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Florian Mercier , Julie Tripied
Science of the Total Environment, 2023, 883, pp.art. 163455. ⟨10.1016/j.scitotenv.2023.163455⟩
Article dans une revue hal-04087393v1
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Short-Term PE Generation Processes in the Soils of a Farmer Plots Network in the Madagascar Highlands: Actors and Drivers

Kanto Razanamalala , Tantely Razafimbelo , Pierre‐alain Maron , Lionel Ranjard , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré
Microbiology Research, 2023, 14 (4), pp.1702-1719. ⟨10.3390/microbiolres14040117⟩
Article dans une revue hal-04281605v1
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Potential of Meta-Omics to Provide Modern Microbial Indicators for Monitoring Soil Quality and Securing Food Production

Christophe Djemiel , Samuel S. Dequiedt , Battle Karimi , Aurélien Cottin , Walid Horrigue
Frontiers in Microbiology, 2022, 13, pp.1-20. ⟨10.3389/fmicb.2022.889788⟩
Article dans une revue hal-03715998v1
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Le RMQS au service de l'écologie microbienne des sols français

Samuel S. Dequiedt , Battle Karimi , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Sébastien Terrat , Walid Horrigue
Étude et Gestion des Sols, 2020, 27 (1), pp.51-71
Article dans une revue hal-02540019v1

BIOCOM-PIPE: a new user-friendly metabarcoding pipeline for the characterization of microbial diversity from 16S, 18S and 23S rRNA gene amplicons

Christophe Djemiel , Samuel Dequiedt , Battle Karimi , Aurélien Cottin , Thibault Girier
BMC Bioinformatics, 2020, 21 (1), pp.1-21. ⟨10.1186/s12859-020-03829-3⟩
Article dans une revue hal-03014150v1
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Grassland-cropland rotation cycles in crop-livestock farming systems regulate priming effect potential in soils through modulation of microbial communities, composition of soil organic matter and abiotic soil properties

Marco Panettieri , Julien Guigue , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Mathieu Thévenot , Jean Lévêque
Agriculture, Ecosystems & Environment, 2020, 299, pp.106973. ⟨10.1016/j.agee.2020.106973⟩
Article dans une revue hal-03014052v1

ReClustOR: a re‐clustering tool using an open‐reference method that improves operational taxonomic unit definition

Sébastien Terrat , Christophe Djemiel , Corentin Journay , Battle Karimi , Samuel Dequiedt
Methods in Ecology and Evolution, 2020, 11 (1), pp.168-180. ⟨10.1111/2041-210x.13316⟩
Article dans une revue hal-03129732v1

Biogeography of soil microbial habitats across France

Battle Karimi , Jean Villerd , Samuel Dequiedt , Sébastien Terrat , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré
Global Ecology and Biogeography, 2020, 29 (8), pp.1399-1411. ⟨10.1111/geb.13118⟩
Article dans une revue hal-03014310v1
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Tillage intensity and pasture in rotation effectively shape soil microbial communities at a landscape scale

Cédric Le Guillou , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Battle Karimi , Nouraya Akkal-Corfini , Samuel S. Dequiedt
MicrobiologyOpen, 2019, 8 (4), ⟨10.1002/mbo3.676⟩
Article dans une revue hal-01817976v1
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Soil parameters, land use, and geographical distance drive soil bacterial communities along a European transect

Pierre Plassart , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Stéphane Uroz , Samuel S. Dequiedt , Dorothy Stone
Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.1-17. ⟨10.1038/s41598-018-36867-2⟩
Article dans une revue hal-02067245v1
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Biogeography of Soil Bacterial Networks along a Gradient of Cropping Intensity

Battle Karimi , Samuel S. Dequiedt , Sébastien Terrat , Claudy C. Jolivet , Dominique D. Arrouays
Scientific Reports, 2019, 9 (1), ⟨10.1038/s41598-019-40422-y⟩
Article dans une revue hal-02093081v1
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Biogeography of soil bacteria and archaea across France

Battle Karimi , Sébastien Terrat , Samuel S. Dequiedt , Nicolas Saby , Walid Horrigue
Science Advances , 2018, 4 (7), pp.eaat1808. ⟨10.1126/sciadv.aat1808⟩
Article dans une revue hal-01843961v1
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La caractérisation des communautés microbiennes du sol à l'échelle de la France pour évaluer l’effet de l’usage des sols

Sébastien Terrat , Battle Karimi , Samuel Dequiedt , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Walid Horrigue
Innovations Agronomiques, 2018, 69, pp.27-37. ⟨10.15454/IO3VXY⟩
Article dans une revue hal-02002766v1
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Appréhender l’impact des pratiques agricoles sur l’état biologique et le fonctionnement du sol. Quelles recommandations et pistes de R&D en matière de pilotage biologique des sols ?

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Mario Cannavacciuolo , Elisabeth D’oiron-Verame , Cécile Villenave , Daniel Cluzeau
Innovations Agronomiques, 2018, 69, pp.39-46. ⟨10.15454/OW3CJS⟩
Article dans une revue hal-02058230v1

Landscape-scale analysis of cropping system effects on soil quality in a context of crop-livestock farming

Valérie Viaud , Patricia Santillàn-Carvantes , Nouraya Akkal-Corfini , Cédric Le Guillou , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré
Agriculture, Ecosystems & Environment, 2018, 265, pp.166 - 177. ⟨10.1016/j.agee.2018.06.018⟩
Article dans une revue hal-01844309v1
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Mapping and predictive variations of soil bacterial richness across France

Sébastien Terrat , Walid Horrigue , Samuel Dequietd , Nicolas Saby , Mélanie M. Lelievre
PLoS ONE, 2017, 12 (0190128), pp.1-19. ⟨10.1371/journal.pone.0186766⟩
Article dans une revue hal-01843156v1

Soil microbial diversity drives the priming effect along climate gradients: a case study in Madagascar

Kanto Razanamalala , Tantely Razafimbelo , Pierre-Alain Maron , Lionel Ranjard , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré
The International Society of Microbiologial Ecology Journal, 2017, 12 (2), pp.451 - 462. ⟨10.1038/ismej.2017.178⟩
Article dans une revue hal-01844363v1

Microbial diversity and ecological networks as indicators of environmental quality

Battle Karimi , Pierre-Alain Maron , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Nadine Bernard , Daniel Gilbert
Environmental Chemistry Letters, 2017, 15 (2), pp.265-281. ⟨10.1007/s10311-017-0614-6⟩
Article dans une revue hal-01516976v1
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Validation d’un tableau de bord d’indicateurs sur un réseau national de fermes en grande culture et en viticulture pour diagnostiquer la qualité biologique des sols agricoles

M. Cannavacciulo , N. Cassagne , V. Riou , P. Mulliez , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré
Innovations Agronomiques, 2017, 55, pp.41-54. ⟨10.15454/1.5137753402510786E12⟩
Article dans une revue hal-01608354v1

Predictive model of soil molecular microbial biomass

Walid Horrigue , Samuel S. Dequiedt , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Claudy C. Jolivet , Nicolas P.A. Saby
Ecological Indicators, 2016, 64, pp.203 - 211. ⟨10.1016/j.ecolind.2015.12.004⟩
Article dans une revue hal-01844377v1
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Mapping and determinism of soil microbial community distribution across an agricultural landscape

Florentin Constancias , Sébastien Terrat , Nicolas Saby , Walid Horrigue , Jean Villerd
MicrobiologyOpen, 2015, 4 (3), pp.505-517. ⟨10.1002/mbo3.255⟩
Article dans une revue hal-01475927v1

Water-extractable organic matter linked to soil physico-chemistry and microbiology at the regional scale.

Julien Guigue , Jean Lévêque , Olivier Mathieu , P. Schmitt-Kopplin , M. Lucio
Soil Biology and Biochemistry, 2015, 84, pp.158-167. ⟨10.1016/j.soilbio.2015.02.016⟩
Article dans une revue hal-01132011v1
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Contrasting spatial patterns and ecological attributes of soil bacterial and archaeal taxa across a landscape

Florentin Constancias , Nicolas P.A. Saby , Sébastien Terrat , Samuel Dequiedt , Walid Horrigue
MicrobiologyOpen, 2015, 4 (3), pp.518-531. ⟨10.1002/mbo3.256⟩
Article dans une revue hal-02633674v1

Improving soil bacterial taxa–area relationships assessment using DNA meta-barcoding

Sebastien Terrat , Samuel S. Dequiedt , W Horrigue , Mélanie M. Lelievre , C. Cruaud
Heredity, 2015, 114 (5), pp.468 - 475. ⟨10.1038/hdy.2014.91⟩
Article dans une revue hal-01831578v1

Pyrosequencing evidences the impact of cropping on soil bacterial and fungal diversity in Laos tropical grassland.

Pascal Lienhard , Sébastien Terrat , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Virginie Nowak , Tiffanie Régnier
Agronomy for Sustainable Development, 2014, 34 (2), pp.525-533. ⟨10.1007/s13593-013-0162-9⟩
Article dans une revue hal-00977920v1
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Microscale evidence for a high decrease of soil bacterial density and diversity by cropping

Florentin Constancias , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Sébastien Terrat , Simon Aussems , Virginie Nowak
Agronomy for Sustainable Development, 2014, 34 (4), pp.831-840. ⟨10.1007/s13593-013-0204-3⟩
Article dans une revue hal-01234825v1
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Similar Processes but Different Environmental Filters for Soil Bacterial and Fungal Community Composition Turnover on a Broad Spatial Scale

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Samuel S. Dequiedt , Jean Thioulouse , Mélanie M. Lelievre , Nicolas Saby
PLoS ONE, 2014, 9 (11), pp.1-11. ⟨10.1371/journal.pone.0111667⟩
Article dans une revue hal-01831566v1

Turnover of soil bacterial diversity driven by wide-scale environmental heterogeneity.

L. Ranjard , S. Dequiedt , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , J. Thioulouse , N. P. A. Saby
Nature Communications, 2013, 4, pp.1434. ⟨10.1038/ncomms2431⟩
Article dans une revue hal-00965686v1
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No-till and cover crops shift soil microbial abundance and diversity in Laos tropical grasslands

Pascal Lienhard , Florent Tivet , André Chabanne , Samuel S. Dequiedt , Mélanie M. Lelievre
Agronomy for Sustainable Development, 2013, 33 (2), pp.375-384. ⟨10.1007/s13593-012-0099-4⟩
Article dans une revue hal-01201383v1

Soil microbial diversity and C turnover modified by tillage and cropping in Laos tropical grassland.

Pascal Lienhard , Sébastien Terrat , Olivier Mathieu , Jean Lévêque , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré
Environmental Chemistry Letters, 2013, 11 (4), pp.391-398. ⟨10.1007/s10311-013-0420-8⟩
Article dans une revue hal-00921631v1

Seasonal dynamics of the bacterial community in forest soils under different quantities of leaf litter

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Pierre-Alain Maron , Lionel Ranjard , Virginie Nowak , Eric Dufrene
Applied Soil Ecology, 2011, 47 (1), pp.14-23. ⟨10.1016/j.apsoil.2010.11.006⟩
Article dans une revue hal-02646057v1
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Validation and Application of a PCR Primer Set to Quantify Fungal Communities in the Soil Environment by Real-Time Quantitative PCR

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Richard Christen , Samuel S. Dequiedt , Christophe Mougel , Mélanie M. Lelievre
PLoS ONE, 2011, 6 (9), pp.e24166. ⟨10.1371/journal.pone.0024166⟩
Article dans une revue hal-01254016v1
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Biogeography of soil microbial communities: a review and a description of the ongoing french national initiative

Lionel Ranjard , Samuel S. Dequiedt , Claudy C. Jolivet , Nicolas P.A. Saby , Jean Thioulouse
Agronomy for Sustainable Development, 2010, 30 (2), pp.359-365. ⟨10.1051/agro/2009033⟩
Article dans une revue hal-00886549v1

Seasonal dynamics of the bacterial community in forest soils under different quantities of leaf litter

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Pierre-Alain Maron , Lionel Ranjard , Virginie Nowak , Eric Dufrene
Applied Soil Ecology, 2010, 47 (47), pp.14-23
Article dans une revue bioemco-00574895v1

Biogeographical patterns of soil bacterial communities

Samuel Dequiedt , Jean Thioulouse , Claudy C. Jolivet , Nicolas N. Saby , Mélanie Lelièvre
Environmental Microbiology Reports, 2009, 1 (4), pp.251 - 255. ⟨10.1111/j.1758-2229.2009.00040.x⟩
Article dans une revue hal-02668713v1
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ECOMIC-RMQS : biogéographie microbienne à l’échelle de la France. Etat d’avancement et premiers résultats

Samuel Dequiedt , Maud Lelièvre , Claudy C. Jolivet , Nicolas N. Saby , Manuel Pascal Martin
Étude et Gestion des Sols, 2009, 16 (3-4), pp.219-231
Article dans une revue hal-02656049v1

How build up soil bacterial co-occurrence networks from wide spatial scale sampling?

Battle Karimi , Samuel Dequiedt , Sébastien Terrat , Claudy Jolivet , Dominique Arrouays
JOBIM 2019 Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2019, Nantes, France
Communication dans un congrès hal-02953290v1

Biogeographical design of soil microbial habitats

Battle Karimi , Jean Villerd , Samuel Dequiedt , Sébastien Terrat , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré
5ème colloque du GDR de Génomique Environnementale, Oct 2019, La Rochelle, France
Communication dans un congrès hal-02951841v1

Mapping, understanding and predicting soil microbial diversity across France

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Sébastien Terrat , Battle Karimi , Samuel Dequiedt , Walid Horrigue
21st World Congress of Soil Science, Aug 2018, Rio de Janeiro, Brazil
Communication dans un congrès hal-03102542v1

Innovative tools to diagnose the impact of land use practices on soil microbial communities

Sébastien Terrat , Walid Horrigue , Battle Karimi , Samuel Dequiedt , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré
21st World Congress of Soil Science, Aug 2018, Rio de Janeiro, Brazil. pp.96
Communication dans un congrès hal-03103798v1

Ecological networks as a promising approach to decipher the role of microbial communities in soil ecosystems

Battle Karimi , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Sébastien Terrat , Pierre-Alain Maron , Lionel Ranjard
Journée Réseau du GDR Génomique Environnementales, Université de Nantes (UN). FRA., Jun 2017, Nantes, France
Communication dans un congrès hal-02735169v1

Bacterial social networks across the French National territory

Battle Karimi , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Sébastien Terrat , Samuel S. Dequiedt , Nicolas Saby
Journée d’Ecologie Fonctionnelle AnaEE, AnaEE Analyses et Expérimentations sur les Ecosystèmes - France., Mar 2017, La Grande Motte, France
Communication dans un congrès hal-01605623v1

Bacterial "social" network in french soils : a Metagenomics insight

Battle Karimi , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Sébastien Terrat , Samuel S. Dequiedt , Nicolas Saby
Journée d’Ecologie Fonctionnelle AnaEE, AnaEE Analyses et Expérimentations sur les Ecosystèmes - France., Mar 2017, La Grande Motte, France
Communication dans un congrès hal-01608367v1

Soil bacterial interaction networks on a wide scale

Battle Karimi , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Sébastien Terrat , Samuel Dequiedt , Claudy Jolivet
4. International Conference on Microbial Diversity 2017 (MD 2017), Oct 2017, Bari, Italy. pp.414-415
Communication dans un congrès hal-02735708v1
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Mapping and predictive variations of soil microbial richness, bacterial and archaeal phyla across France

Sébastien Terrat , Battle Karimi , Walid Horrigue , Samuel Dequiedt , Nicolas Saby
4. International Conference on Microbial Diversity 2017 (MD 2017), Oct 2017, Bari, Italy. pp.209-211
Communication dans un congrès hal-02738142v1

Biogeographical patterns of soil bacterial diversity at the scale of France

Sébastien Terrat , Samuel S. Dequiedt , Nicolas Saby , Walid Horrigue , Mélanie M. Lelievre
16. International Symposium on Microbial Ecology - ISME16, Aug 2016, Montréal, Canada
Communication dans un congrès hal-01603633v1

Predictive models of abundance and diversity of soil microbial communities

Walid Horrigue , Lionel Ranjard , Pierre-Alain Maron , Samuel Dequiedt , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré
16. International Symposium on Microbial Ecology - ISME16, ISME., Aug 2016, Montréal, Canada
Communication dans un congrès hal-02799970v1
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Inventaire et cartographie des communautés microbiennes des sols de la zone OPE ANDRA

Samuel Dequiedt , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Lionel Ranjard
Journée scientifique de l’Observatoire pérenne de l’environnement (OPE), Observatoire Pérenne de l'Environnement (OPE). FRA., Nov 2016, Paris, France
Communication dans un congrès hal-02740777v1

Is soil an island for bacteria ? Contribution of the soil bacterial taxa area relationship unsing new generation sequencing

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Sébastien Terrat , Samuel Dequiedt , Nicolas Saby , Claudy Jolivet
16. International Symposium on Microbial Ecology - ISME16, International Society for Microbial Ecology (ISME). INT., Aug 2016, Montréal, Canada
Communication dans un congrès hal-02798699v1
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Bacterial "social" network in french soils : a Metagenomics insight

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Lionel Ranjard
Sfécologie-2016, International Conference of Ecological Sciences, Société Française d'Ecologie (SFE). FRA., Oct 2016, Marseille, France
Communication dans un congrès hal-01604088v1

Journées Nationales de l'Innovation Agricole (JIAG 2015) 1ère édition colloque OFSV, Angers, France, 2-3 novembre 2015

Lionel Ranjard , Samuel Dequiedt , Pierre-Alain Maron , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré
1e. Edition Colloque OFSV "Journées Nationales de l'Innovation Agricole" (JIAG 2015), Observatoire Français des Sols Vivants (OFSV). FRA., Nov 2015, Angers, France
Communication dans un congrès hal-02738562v1

Caractérisation de la distribution spatiale des communautés microbiennes du sol et de ses déterminants à l’échelle du paysage

Florentin Constancias , Sébastien Terrat , Nicolas N. Saby , Walid Horrigue , Jean Villerd
7. Journées Françaises de l'Ecologie du Paysage (IALE), Oct 2014, Dijon, France. 61 p
Communication dans un congrès hal-02738587v1

Le séquençage massif pour caractériser la diversité microbienne des sols, standardisation et applications au sein de la plateforme GenoSol

Sébastien Terrat , Samuel Dequiedt , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Nicolas N. Saby , Mélanie M. Lelievre
Colloque Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux (EPGV), Jun 2014, Évry, France
Communication dans un congrès hal-02740417v1
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Turnover of soil microbial diversity is driven by wide-scale environmental heterogeneity

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Samuel S. Dequiedt , Lionel Ranjard
2. Thünen Symposium on Soil Metagenomics, Conventus Congressmanagement & Marketing GmbH. Jena, DEU., Dec 2013, Braunschweig, Germany. pp.39
Communication dans un congrès hal-01004768v1

Distribution spatiale et traduction fonctionnelle de la diversité microbienne des sols

Sébastien Terrat , Samuel Dequiedt , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Florentin Constancias , Vincent Tardy
Colloque de Génomique Environnementale Rennes 2013, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL). FRA., Nov 2013, Rennes, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-02806223v1

Distribution spatiale de la diversité microbienne des sols à l’échelle du territoire national

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Lionel Ranjard
Workshop Interactions des Microorganismes avec leurs Environnements : Circulation, Adaptation, Jun 2012, Dijon, France
Communication dans un congrès hal-02808136v1

Spatial patterns of microbial communities at a soil micro-scale

Florentin Constancias , Virginie Nowak , Samuel Dequiedt , Luc Biju-Duval , Jean-Philippe Guillemin
14. International Symposium on Microbial Ecology (ISME 14), Aug 2012, Copenhague, Denmark
Communication dans un congrès hal-02805352v1

Spatial processes driving soil microbial community assembly on a wide scale

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Samuel Dequiedt , Nicolas N. Saby , Jean Thioulouse , Claudy C. Jolivet
4. International Congress Eurosoil 2012 - Soil Science for the Benefit of Mankind and Environment, Jul 2012, Bari, Italy
Communication dans un congrès hal-02808311v1

Soil fungal communities ecology: a biogeographical approach

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Samuel Dequiedt , Nicolas N. Saby , Jean Thioulouse , Claudy C. Jolivet
Ecology of soil Microorganisms Conference, Apr 2011, Prague, Czech Republic. 1 p
Communication dans un congrès hal-02808083v1
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Biogeographical patterns of soil microbial communities at the scale of French metropolitan territory

Samuel S. Dequiedt , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Nicolas Saby , Jean Thioulouse , Mélanie M. Lelievre
13. International Symposium on Microbial Ecology ISME 13, Aug 2010, Seattle, United States. 1 p
Communication dans un congrès hal-01137003v1

Biogéographie Microbienne: mythe ou réalité ?

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Samuel Dequiedt , Nicolas N. Saby , Mélanie M. Lelievre , Claudy C. Jolivet
Ecologie 2010, Sep 2010, Montpellier, France. n.p
Communication dans un congrès hal-02758446v1
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Platform GenoSol: a new tool for conserving and exploring soil microbial diversity

Samuel S. Dequiedt , Mélanie M. Lelievre , Pierre-Alain Maron , Christophe Mougel , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré
4ème Colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne (AFEM), Aug 2009, Lyon, France. 1 p
Communication dans un congrès hal-01137004v1

Microbial-biogeography at the scale of France by the use of molecular tools applied to the French soil quality monitoring network (RMQS)

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Samuel Dequiedt , Jean Thioulouse , Claudy C. Jolivet , Nicolas N. Saby
BAGECO10, Saisissez le nom du laboratoire, du service ou du département., Ville service., Jun 2009, Uppsala, Sweden
Communication dans un congrès hal-02751274v1

Distribution et déterminisme de la diversité des communautés de champignons telluriques à l'échelle de trois régions françaises

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Samuel S. Dequiedt , Rémy Doyen , Mélanie M. Lelievre , Claudy C. Jolivet
4. Colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne, Association Francophone d'Ecologie Microbienne (AFEM). FRA., Aug 2009, Lyon, France. pp.91
Communication dans un congrès hal-01019301v1

Patterns biogéographiques de la diversité bactérienne des sols à l'échelle du territoire national

Samuel S. Dequiedt , Mélanie M. Lelievre , Claudy C. Jolivet , Manuel M. Martin , Nicolas N. Saby
Congrès AFEM (Association Francophone pour l'Ecologie Microbienne, Labo/service de l'auteur, Ville service., Aug 2009, Lyon, France. n.p
Communication dans un congrès hal-01001184v1

Short term bacterial community structure dynamics in forest soil and litter: an in situ study in a CarboEurope site.

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Lionel Ranjard , Virginie Nowak , Claire Damesin , Eric Dufrene
Short term bacterial community structure dynamics in forest soil and litter: an in situ study in a CarboEurope site., May 2008, Vienna, Austria. pp.52
Communication dans un congrès bioemco-00390583v1

Atlas français des bactéries du sol

Battle Karimi , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Samuel Dequiedt , Sébastien Terrat , Lionel Ranjard
Agriculture durable : diagnostics et solutions innovantes, Jun 2023, Romainville (93), France
Poster de conférence hal-04146700v1

Re-Clustering tool using an Open-Reference method that improves OTU definition

Christophe Djemiel , Corentin Journay , Battle Karimi , Samuel S. Dequiedt , Walid Horrigue
JOBIM 2019 Journées Ouvertes Biologie, Informatique et Mathématiques, Jul 2019, Nantes, France
Poster de conférence hal-02325994v1

L’usage des terres et les pratiques agricoles contrôlent la minéralisation du C par l’intermédiaire de la biomasse bactérienne et de quelques familles fongiques clés.

Kanto Razanamalala , Tantely Razafimbelo , Pierre-Alain Maron , Lionel Ranjard , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré
ResMO 2018 : "La matière organique dans tous ses étas", Feb 2018, Trégastel, France. , 2018
Poster de conférence hal-01785116v1

Contrasting Spatial Patterns and Ecological Attributes of Soil Bacterial Taxa across French National Territory

Battle Karimi , Sébastien Terrat , Samuel S. Dequiedt , Nicolas Saby , Walid Horrigue
Journée d’Ecologie Fonctionnelle AnaEE, Mar 2017, La Grande Motte, France. , 2017
Poster de conférence hal-01605429v1
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Contrasting Spatial Patterns and Ecological Attributes of Soil Bacterial Taxa across French National Territory

Battle Karimi , Sébastien Terrat , Samuel S. Dequiedt , Nicolas Saby , Walid Horrigue
Congrès de la Société Française d'Ecologie, Oct 2016, Marseille, France. 2016
Poster de conférence hal-01602852v1
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Predictive models of abundance and diversity of soil microbial communities

Walid Horrigue , Samuel Dequiedt , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Pierre-Alain Maron , Florentin Constancias
1. Global Soil Biodiversity Initiative Conference (GSBI), Dec 2014, Dijon, France. 703 p., 2014
Poster de conférence hal-02738869v1
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Spatial patterns of soil bacterial communities at the European scale

Pierre Plassart , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Sébastien Terrat , Samuel Dequiedt , Rachel Creamer
1. Global Soil Biodiversity Initiative Conference (GSBI), Dec 2014, Dijon, France. 703 p., 2014
Poster de conférence hal-02738908v1

Comparaison de l'arisa et du séquençage haut débit pour l'étude des processus de diversification des communautés microbiennes du sol

Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Sébastien Terrat , Samuel Dequiedt , Patrice Wincker , Mélanie M. Lelievre
6. ème Colloque de l'Association Francophone d'Ecologie Microbienne (AFEM) "Microbiologie Environnementale : du Gène à l’Ecosystème", Oct 2013, Parent, France. , 2013, Microbiologie environnementale : du gène à l'écosystème
Poster de conférence hal-02747780v1

Is there a microbial sub alpha-diversity at soil microscale ?

Florentin Constancias , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré , Samuel Dequiedt , Virginie Nowak , Jean-Philippe Guillemin
4. International Congress Eurosoil 2012-Soil Science for the Benefit of Mankind and Environment, Jul 2012, Bari, Italie. , 2012, Is there a microbial sub alpha-diversity at soil microscale?
Poster de conférence hal-02748453v1
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Platform GenoSol: a new tool for conserving and exploring soil microbial diversity

Samuel Dequiedt , Mélanie M. Lelievre , Pierre-Alain Maron , Christophe Mougel , Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré
10. Symposium on Bacterial Genetics and Ecology - Coexisting on a Changing Planet (BAGECO 10), Jun 2009, Uppsala, Sweden. 18 p., 2009
Poster de conférence hal-02752945v1

Biogeography of soil microbial communities: a review and a description of the ongoing french national initiative

Lionel Ranjard , Samuel Dequiedt , Claudy Jolivet , Nicolas Saby , Jean Thioulouse
Eric Lichtfouse; Marjolaine Hamelin; Mireille Navarrete; Philippe Debaeke. Sustainable Agriculture Volume 2, Springer, pp.857-865, 2011, 978-94-007-0393-3. ⟨10.1007/978-94-007-0394-0_37⟩
Chapitre d'ouvrage hal-00860770v1