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Publications de Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré


Activités de Recherche

 

Au cours de ma thèse de doctorat, j’ai associé écologie microbienne des sols et cycles biogéochimiques (cycle du Carbone) et j’ai renforcé mes compétences en écologie microbienne au travers de mon post doctorat au sein de l’équipe BIOCOM (UMR Microbiologie du Sol et de l’Environnement, Dijon) sous la direction de L Ranjard. Suite à cela, j’ai été recruté à AgroSup Dijon en tant que maître de conférences et ai rejoint officiellement l’équipe BIOCOM lors de la création de l’UMR 1347 Agroécologie.

Au sein de l’équipe BIOCOM, je développe deux thématiques de recherche en association avec L. Ranjard et P.A. Maron:
 1) l’étude de la distribution spatiale, de la dynamique et du déterminisme de la diversité microbienne des sols
 2) l’étude du lien entre diversité microbienne des sols et leur fonctionnement biologique.

 La première thématique met en jeu des approches d’écologie spatiale pour caractériser les patterns de distribution des communautés microbienne du sol et comprendre leur déterminisme (processus de diversification, filtre environnementaux : environnement, climat, communauté végétale, éloignement géographique). Ces approches appliquées en particulier à l’échelle des paysages agricoles pour déterminer si les filtres environnementaux et les processus de diversification des microorganismes du sol à cette échelle sont les même qu’à des échelles plus fines (parcelle) ou plus large (régionale, nationale). Ce travail fait actuellement l’objet de la thèse de Florentin Constancias que je co-encadre avec Lionel Ranjard.
 La seconde thématique, développée avec Pierre-Alain Maron, met en jeu des approches d’écologie des communautés avec des approches d’écologie fonctionnelle ciblées sur le turnover des matières organiques du sol et la stabilité de cette fonction face à des perturbations externes.
 Au-delà des débouchés fondamentaux liés à ces thématiques de recherche, ces dernières ont aussi des débouchés appliqués pour une meilleure évaluation environnementale des pratiques agricoles et en termes de formation pour les acteurs du monde agricole sur l’utilisation des indicateurs biologiques, et particulièrement microbiens, pour évaluer l’impact de leurs pratiques sur leurs sols (Projet CASDAR AgrInnov, en cours).

 

Activités d’enseignement

Je réalise la majeure partie de mes activités d’enseignement sur la thématique de la biologie des sols en lien avec leur fonctionnement au sein d’AgroSup Dijon et de l’Université de Bourgogne. Mes activités d’enseignement couvrent différents niveaux : Cursus ingénieur 1ère et 2e année, 3e année spécialisation Agronomie – Environnement ;  Licence 3, Master 1 et Master 2. Au sein de l’université de Bourgogne, j’interviens particulièrement dans le cadre de la licence professionnelle Agriculture, Durabilité, Nouvelles Technologies dont je suis co-directeur avec PY Collin (UMR Biogéosciences, Université de Bourgogne), du Master BOP et du master BIIPPME. Outre des cours théoriques et des travaux dirigés sur la biologie des sols, j’interviens aussi dans le cadre d’activités pluridisciplinaires (Approche Globale de l’Exploitation Agricole, Diagnostic Agri-Environnemental, projets tuteurés) et dans l’encadrement des stages des étudiants d’AgroSup Dijon (mémoires de fin d’étude, stages en entreprise) et de licence professionnelle.


Jean-Philippe Guillemin   

Journal articles3 documents

  • Florentin Constancias, Sébastien Terrat, Nicolas Saby, Walid Horrigue, Jean Villerd, et al.. Mapping and determinism of soil microbial community distribution across an agricultural landscape. MicrobiologyOpen, Wiley, 2015, 4 (3), pp.505-517. ⟨10.1002/mbo3.255⟩. ⟨hal-01475927⟩
  • Florentin Constancias, Nicolas P.A. Saby, Sébastien Terrat, Samuel Dequiedt, Walid Horrigue, et al.. Contrasting spatial patterns and ecological attributes of soil bacterial and archaeal taxa across a landscape. MicrobiologyOpen, Wiley, 2015, 4 (3), pp.518-531. ⟨10.1002/mbo3.256⟩. ⟨hal-02633674⟩
  • Florentin Constancias, Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré, Sébastien Terrat, Simon Aussems, Virginie Nowak, et al.. Microscale evidence for a high decrease of soil bacterial density and diversity by cropping. Agronomy for Sustainable Development, Springer Verlag/EDP Sciences/INRA, 2014, 34 (4), pp.831-840. ⟨10.1007/s13593-013-0204-3⟩. ⟨hal-01234825⟩

Conference papers4 documents

  • Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré, Florentin Constancias, Sébastien Terrat, Samuel Dequiedt, Nicolas Saby, et al.. A spatial upscaling strategy to assess soil microbial community assembly and the impact of land-use. 1. Global Soil Biodiversity Initiative Conference (GSBI), INRA, Institut National de la Recherche Agronomique, France, Dec 2014, Dijon, France. pp.703. ⟨hal-01872361⟩
  • Florentin Constancias, Sébastien Terrat, Nicolas P.A. Saby, Walid Horrigue, Jean Villerd, et al.. Caractérisation de la distribution spatiale des communautés microbiennes du sol et de ses déterminants à l’échelle du paysage. 7èmes Journées Françaises de l'Ecologie du Paysage (IALE), Oct 2014, Dijon, France. p. 9. ⟨hal-01479013⟩
  • Florentin Constancias, Sébastien Terrat, Nicolas Saby, Walid Horrigue, Jean Villerd, et al.. Caractérisation de la distribution spatiale des communautés microbiennes du sol et de ses déterminants à l’échelle du paysage. 7. Journées Françaises de l'Ecologie du Paysage (IALE), Oct 2014, Dijon, France. 61 p. ⟨hal-02738587⟩
  • Florentin Constancias, Virginie Nowak, Samuel Dequiedt, Luc Biju-Duval, Jean-Philippe Guillemin, et al.. Spatial patterns of microbial communities at a soil micro-scale. 14. International Symposium on Microbial Ecology (ISME 14), Aug 2012, Copenhague, Denmark. ⟨hal-02805352⟩

Poster communications2 documents

  • Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré, Florentin Constancias, Sébastien Terrat, Samuel Dequiedt, Nicolas Saby, et al.. A spatial upscaling strategy to assess soil microbial community assembly and the impact of land-use. 1. Global Soil Biodiversity Initiative Conference (GSBI), Dec 2014, Dijon, France. 703 p., 2014. ⟨hal-02739204⟩
  • Florentin Constancias, Nicolas Chemidlin Prévost-Bouré, Samuel Dequiedt, Virginie Nowak, Jean-Philippe Guillemin, et al.. Is there a microbial sub alpha-diversity at soil microscale ?. 4. International Congress Eurosoil 2012-Soil Science for the Benefit of Mankind and Environment, Jul 2012, Bari, Italie. 2012, Is there a microbial sub alpha-diversity at soil microscale?. ⟨hal-02748453⟩